Doublet Group distance statistics: 49291

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N1	A	0, -0.001, 0.016, 0.032, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.016 std_dev=0.017
C2	A	0, -0.003, 0.014, 0.031, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.014 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.005, 0.022, 0.040, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.022 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.004, 0.021, 0.039, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.021 std_dev=0.018
C1'	A	0, -0.003, 0.017, 0.036, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.017 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.004, 0.035, 0.066, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.035 std_dev=0.031
N9	A	0, 0.006, 0.037, 0.068, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.037 std_dev=0.031
C4'	A	0, 0.036, 0.146, 0.256, 0.264 max_d=0.264 avg_d=0.146 std_dev=0.110
C2'	A	0, 0.015, 0.137, 0.260, 0.303 max_d=0.303 avg_d=0.137 std_dev=0.122
O4'	A	0, 0.015, 0.189, 0.364, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.189 std_dev=0.175
C3'	A	0, 0.058, 0.260, 0.461, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.260 std_dev=0.202
C5'	A	0, -0.023, 0.311, 0.644, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.311 std_dev=0.334
N1	B	0, 0.073, 0.409, 0.746, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.409 std_dev=0.336
N2	B	0, 0.070, 0.408, 0.745, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.408 std_dev=0.337
C2	B	0, 0.086, 0.432, 0.779, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.432 std_dev=0.347
O6	B	0, 0.091, 0.448, 0.806, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.448 std_dev=0.358
C6	B	0, 0.096, 0.457, 0.817, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.457 std_dev=0.361
O2'	A	0, 0.048, 0.425, 0.802, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.425 std_dev=0.377
N3	B	0, 0.117, 0.502, 0.887, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.502 std_dev=0.385
C5	B	0, 0.120, 0.539, 0.959, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.539 std_dev=0.420
C4	B	0, 0.127, 0.560, 0.993, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.560 std_dev=0.433
N7	B	0, 0.141, 0.649, 1.157, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.649 std_dev=0.508
N9	B	0, 0.150, 0.678, 1.206, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.678 std_dev=0.528
O3'	A	0, 0.132, 0.668, 1.204, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.668 std_dev=0.536
C8	B	0, 0.154, 0.725, 1.296, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.725 std_dev=0.571
P	A	0, 0.083, 0.667, 1.251, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.667 std_dev=0.584
C1'	B	0, 0.184, 0.801, 1.418, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.801 std_dev=0.617
C2'	B	0, 0.182, 0.808, 1.435, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.808 std_dev=0.626
O5'	A	0, 0.183, 0.875, 1.566, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.875 std_dev=0.691
OP2	A	0, 0.156, 0.905, 1.654, 1.951 max_d=1.951 avg_d=0.905 std_dev=0.749
O4'	B	0, 0.219, 0.984, 1.748, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.984 std_dev=0.764
P	B	0, 0.225, 1.067, 1.910, 2.148 max_d=2.148 avg_d=1.067 std_dev=0.843
O2'	B	0, 0.212, 1.064, 1.916, 2.193 max_d=2.193 avg_d=1.064 std_dev=0.852
OP1	B	0, 0.246, 1.110, 1.973, 2.143 max_d=2.143 avg_d=1.110 std_dev=0.863
O5'	B	0, 0.243, 1.113, 1.982, 2.134 max_d=2.134 avg_d=1.113 std_dev=0.869
C3'	B	0, 0.262, 1.143, 2.023, 1.913 max_d=1.913 avg_d=1.143 std_dev=0.881
OP1	A	0, 0.150, 1.042, 1.935, 2.282 max_d=2.282 avg_d=1.042 std_dev=0.893
C4'	B	0, 0.293, 1.360, 2.426, 2.318 max_d=2.318 avg_d=1.360 std_dev=1.067
O3'	B	0, 0.318, 1.423, 2.528, 2.455 max_d=2.455 avg_d=1.423 std_dev=1.105
OP2	B	0, 0.187, 1.428, 2.669, 3.366 max_d=3.366 avg_d=1.428 std_dev=1.241
C5'	B	0, 0.340, 1.636, 2.931, 2.930 max_d=2.930 avg_d=1.636 std_dev=1.296

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.00	0.19	0.30	0.40	0.02
C2	0.04	0.00	0.06	0.08	0.02	0.10	0.02	0.12	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.25	0.10	0.33	0.51	0.22	0.23
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.16	0.04	0.05	0.05	0.06	0.04	0.05	0.03	0.00	0.06	0.01	0.11	0.13	0.55	0.17
C3'	0.04	0.08	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.06	0.08	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.27	0.33	0.06
C4	0.02	0.02	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.24	0.04	0.33	0.38	0.31	0.11
C4'	0.02	0.10	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.08	0.09	0.04	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.37	0.30	0.03
C5	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.24	0.04	0.38	0.34	0.32	0.10
C5'	0.05	0.12	0.16	0.02	0.05	0.01	0.05	0.00	0.05	0.13	0.09	0.11	0.04	0.11	0.08	0.09	0.14	0.01	0.01	0.45	0.28	0.03
C6	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.24	0.06	0.40	0.40	0.26	0.16
C8	0.01	0.03	0.05	0.03	0.02	0.04	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.18	0.21	0.05	0.33	0.22	0.44	0.05
N1	0.03	0.01	0.05	0.06	0.01	0.08	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.26	0.08	0.38	0.48	0.22	0.21
N3	0.04	0.00	0.06	0.08	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.25	0.10	0.30	0.48	0.26	0.18
N6	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.12	0.23	0.05	0.44	0.39	0.25	0.16
N7	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.18	0.23	0.05	0.38	0.25	0.39	0.04
N9	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.08	0.22	0.02	0.29	0.29	0.40	0.01
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.06	0.06	0.11	0.09	0.10	0.18	0.06	0.03	0.12	0.18	0.08	0.00	0.03	0.02	0.08	0.11	0.63	0.22
O3'	0.21	0.25	0.06	0.01	0.24	0.02	0.24	0.14	0.24	0.21	0.26	0.25	0.23	0.23	0.22	0.03	0.00	0.14	0.06	0.53	0.15	0.17
O4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.05	0.08	0.10	0.05	0.05	0.02	0.02	0.14	0.00	0.25	0.42	0.24	0.11
O5'	0.19	0.33	0.11	0.07	0.33	0.01	0.38	0.01	0.40	0.33	0.38	0.30	0.44	0.38	0.29	0.08	0.06	0.25	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.30	0.51	0.13	0.27	0.38	0.37	0.34	0.45	0.40	0.22	0.48	0.48	0.39	0.25	0.29	0.11	0.53	0.42	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.40	0.22	0.55	0.33	0.31	0.30	0.32	0.28	0.26	0.44	0.22	0.26	0.25	0.39	0.40	0.63	0.15	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.23	0.17	0.06	0.11	0.03	0.10	0.03	0.16	0.05	0.21	0.18	0.16	0.04	0.01	0.22	0.17	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.11	0.15	0.23	0.12	0.29	0.15	0.32	0.18	0.13	0.16	0.10	0.09	0.15	0.13	0.13	0.26	0.28	0.23	0.22	0.48	0.28	0.12
C2	0.11	0.05	0.11	0.11	0.08	0.16	0.11	0.23	0.14	0.09	0.10	0.05	0.05	0.12	0.08	0.13	0.13	0.20	0.33	0.20	0.31	0.41	0.12
C2'	0.15	0.13	0.15	0.26	0.14	0.33	0.18	0.40	0.21	0.17	0.19	0.13	0.09	0.19	0.14	0.12	0.28	0.28	0.20	0.26	0.58	0.20	0.18
C3'	0.13	0.12	0.14	0.23	0.10	0.28	0.13	0.35	0.15	0.13	0.14	0.14	0.08	0.14	0.10	0.15	0.26	0.24	0.31	0.18	0.45	0.35	0.11
C4	0.11	0.05	0.10	0.13	0.08	0.18	0.11	0.22	0.15	0.09	0.11	0.06	0.04	0.11	0.08	0.10	0.15	0.21	0.29	0.21	0.36	0.33	0.08
C4'	0.10	0.08	0.10	0.18	0.06	0.23	0.09	0.28	0.12	0.08	0.11	0.09	0.05	0.10	0.06	0.11	0.21	0.20	0.34	0.15	0.41	0.38	0.08
C5	0.09	0.02	0.09	0.09	0.07	0.12	0.11	0.20	0.15	0.09	0.10	0.06	0.02	0.12	0.07	0.10	0.11	0.17	0.31	0.21	0.29	0.31	0.05
C5'	0.18	0.19	0.19	0.27	0.17	0.30	0.18	0.34	0.21	0.15	0.21	0.20	0.17	0.17	0.16	0.12	0.28	0.29	0.34	0.23	0.52	0.27	0.06
C6	0.09	0.03	0.09	0.07	0.07	0.10	0.11	0.24	0.14	0.10	0.08	0.06	0.03	0.13	0.07	0.13	0.08	0.15	0.35	0.20	0.23	0.36	0.08
C8	0.11	0.05	0.10	0.14	0.09	0.19	0.14	0.21	0.18	0.11	0.13	0.07	0.03	0.14	0.09	0.08	0.17	0.21	0.25	0.23	0.39	0.21	0.09
N1	0.10	0.03	0.10	0.08	0.07	0.11	0.11	0.24	0.13	0.09	0.09	0.03	0.03	0.12	0.07	0.14	0.09	0.16	0.35	0.19	0.24	0.40	0.10
N3	0.12	0.06	0.11	0.14	0.08	0.19	0.11	0.24	0.14	0.09	0.11	0.06	0.06	0.11	0.08	0.12	0.17	0.22	0.29	0.20	0.37	0.38	0.11
N6	0.09	0.07	0.11	0.11	0.09	0.12	0.13	0.31	0.14	0.13	0.09	0.10	0.07	0.15	0.10	0.15	0.10	0.12	0.39	0.19	0.15	0.36	0.10
N7	0.09	0.02	0.08	0.09	0.07	0.13	0.13	0.18	0.17	0.10	0.11	0.10	0.01	0.14	0.07	0.09	0.11	0.18	0.28	0.24	0.31	0.23	0.06
N9	0.12	0.06	0.11	0.17	0.09	0.22	0.13	0.24	0.16	0.10	0.13	0.06	0.05	0.13	0.09	0.09	0.19	0.23	0.25	0.22	0.42	0.27	0.09
O2'	0.47	0.40	0.44	0.60	0.45	0.69	0.48	0.77	0.48	0.48	0.44	0.33	0.39	0.49	0.46	0.34	0.61	0.63	0.26	0.50	0.92	0.30	0.53
O3'	0.31	0.34	0.31	0.40	0.29	0.44	0.29	0.49	0.32	0.26	0.35	0.39	0.30	0.27	0.27	0.27	0.42	0.40	0.20	0.34	0.50	0.28	0.15
O4'	0.07	0.03	0.07	0.12	0.04	0.16	0.07	0.21	0.09	0.09	0.07	0.05	0.02	0.10	0.06	0.10	0.14	0.14	0.40	0.12	0.31	0.48	0.16
O5'	0.32	0.33	0.31	0.26	0.38	0.24	0.43	0.28	0.42	0.46	0.37	0.26	0.33	0.48	0.39	0.38	0.26	0.23	0.68	0.44	0.25	0.89	0.53
OP1	0.13	0.13	0.16	0.32	0.06	0.35	0.05	0.47	0.08	0.04	0.12	0.18	0.11	0.05	0.06	0.07	0.33	0.26	0.40	0.11	0.63	0.29	0.08
OP2	0.40	0.47	0.41	0.47	0.39	0.46	0.36	0.51	0.38	0.30	0.43	0.54	0.45	0.30	0.36	0.28	0.44	0.45	0.38	0.35	0.57	0.25	0.10
P	0.12	0.12	0.14	0.23	0.07	0.25	0.05	0.32	0.06	0.04	0.09	0.18	0.12	0.06	0.06	0.06	0.23	0.21	0.39	0.08	0.45	0.43	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.09	0.02	0.03	0.06	0.09	0.08	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.08	0.01	0.08	0.51	0.19
C2	0.08	0.00	0.06	0.05	0.02	0.09	0.02	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.10	0.09	0.17	0.24	0.02	0.22	0.30	0.13
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.06	0.04	0.07	0.05	0.06	0.06	0.07	0.04	0.00	0.04	0.04	0.24	0.04	0.08	0.62	0.27
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.01	0.10	0.03	0.09	0.14	0.04	0.08	0.06	0.14	0.07	0.02	0.01	0.01	0.34	0.13	0.09	0.60	0.26
C4	0.03	0.02	0.04	0.05	0.00	0.07	0.00	0.25	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.07	0.25	0.01	0.13	0.31	0.12
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.07	0.00	0.15	0.01	0.12	0.27	0.05	0.16	0.10	0.25	0.13	0.05	0.02	0.01	0.03	0.18	0.19	0.44	0.08
C5	0.01	0.02	0.04	0.10	0.00	0.15	0.00	0.40	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.03	0.35	0.02	0.08	0.23	0.06
C5'	0.09	0.13	0.06	0.03	0.25	0.01	0.40	0.00	0.37	0.53	0.24	0.09	0.11	0.55	0.30	0.05	0.03	0.02	0.01	0.45	0.18	0.31	0.03
C6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.12	0.01	0.37	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.07	0.05	0.35	0.00	0.09	0.27	0.04
C8	0.03	0.02	0.07	0.14	0.01	0.27	0.01	0.53	0.03	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.08	0.12	0.09	0.40	0.05	0.10	0.33	0.10
N1	0.06	0.01	0.05	0.04	0.02	0.05	0.02	0.24	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.10	0.04	0.12	0.30	0.02	0.17	0.29	0.08
N2	0.09	0.00	0.06	0.08	0.03	0.16	0.02	0.09	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.12	0.14	0.21	0.24	0.04	0.27	0.31	0.16
N3	0.08	0.01	0.06	0.06	0.01	0.10	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.09	0.10	0.17	0.19	0.01	0.20	0.33	0.16
N7	0.01	0.02	0.07	0.14	0.01	0.25	0.01	0.55	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.13	0.06	0.43	0.06	0.08	0.18	0.07
N9	0.01	0.03	0.04	0.07	0.01	0.13	0.01	0.30	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.04	0.04	0.02	0.24	0.02	0.10	0.39	0.15
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.06	0.05	0.08	0.05	0.08	0.08	0.10	0.12	0.09	0.09	0.04	0.00	0.08	0.14	0.15	0.09	0.17	0.55	0.14
O3'	0.04	0.09	0.04	0.01	0.04	0.02	0.08	0.03	0.07	0.12	0.04	0.14	0.10	0.13	0.04	0.08	0.00	0.04	0.34	0.12	0.19	0.56	0.19
O4'	0.01	0.17	0.04	0.01	0.07	0.01	0.03	0.02	0.05	0.09	0.12	0.21	0.17	0.06	0.02	0.14	0.04	0.00	0.17	0.04	0.07	0.51	0.19
O5'	0.08	0.24	0.24	0.34	0.25	0.03	0.35	0.01	0.35	0.40	0.30	0.24	0.19	0.43	0.24	0.15	0.34	0.17	0.00	0.40	0.01	0.04	0.01
O6	0.01	0.02	0.04	0.13	0.01	0.18	0.02	0.45	0.00	0.05	0.02	0.04	0.01	0.06	0.02	0.09	0.12	0.04	0.40	0.00	0.04	0.32	0.06
OP1	0.08	0.22	0.08	0.09	0.13	0.19	0.08	0.18	0.09	0.10	0.17	0.27	0.20	0.08	0.10	0.17	0.19	0.07	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01
OP2	0.51	0.30	0.62	0.60	0.31	0.44	0.23	0.31	0.27	0.33	0.29	0.31	0.33	0.18	0.39	0.55	0.56	0.51	0.04	0.32	0.03	0.00	0.03
P	0.19	0.13	0.27	0.26	0.12	0.08	0.06	0.03	0.04	0.10	0.08	0.16	0.16	0.07	0.15	0.14	0.19	0.19	0.01	0.06	0.01	0.03	0.00