Doublet Group distance statistics: 49292

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.006, 0.024, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.007, 0.026, 0.044, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.026 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.002, 0.022, 0.041, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.001, 0.022, 0.043, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.022 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.008, 0.031, 0.055, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.031 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.009, 0.034, 0.058, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.034 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.219, 0.753, 1.287, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.753 std_dev=0.534
C2'	A	0, 0.247, 0.842, 1.437, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.842 std_dev=0.595
OP2	A	0, 0.293, 1.016, 1.740, 1.630 max_d=1.630 avg_d=1.016 std_dev=0.724
C4	B	0, 0.301, 1.034, 1.766, 1.609 max_d=1.609 avg_d=1.034 std_dev=0.732
N9	B	0, 0.293, 1.027, 1.762, 1.674 max_d=1.674 avg_d=1.027 std_dev=0.734
N7	B	0, 0.304, 1.039, 1.774, 1.591 max_d=1.591 avg_d=1.039 std_dev=0.735
C8	B	0, 0.298, 1.035, 1.773, 1.665 max_d=1.665 avg_d=1.035 std_dev=0.738
N3	B	0, 0.304, 1.043, 1.782, 1.621 max_d=1.621 avg_d=1.043 std_dev=0.739
C5	B	0, 0.309, 1.057, 1.804, 1.590 max_d=1.590 avg_d=1.057 std_dev=0.747
C2	B	0, 0.319, 1.089, 1.859, 1.633 max_d=1.633 avg_d=1.089 std_dev=0.770
C1'	B	0, 0.281, 1.053, 1.825, 1.828 max_d=1.828 avg_d=1.053 std_dev=0.772
N2	B	0, 0.329, 1.123, 1.917, 1.702 max_d=1.702 avg_d=1.123 std_dev=0.794
C6	B	0, 0.328, 1.122, 1.917, 1.734 max_d=1.734 avg_d=1.122 std_dev=0.795
N1	B	0, 0.333, 1.139, 1.945, 1.752 max_d=1.752 avg_d=1.139 std_dev=0.806
O6	B	0, 0.343, 1.184, 2.024, 1.869 max_d=1.869 avg_d=1.184 std_dev=0.840
C3'	A	0, 0.366, 1.249, 2.132, 1.890 max_d=1.890 avg_d=1.249 std_dev=0.883
C4'	A	0, 0.367, 1.254, 2.142, 1.919 max_d=1.919 avg_d=1.254 std_dev=0.887
O2'	A	0, 0.412, 1.408, 2.403, 2.119 max_d=2.119 avg_d=1.408 std_dev=0.995
O5'	A	0, 0.425, 1.465, 2.506, 2.313 max_d=2.313 avg_d=1.465 std_dev=1.040
P	A	0, 0.469, 1.611, 2.753, 2.522 max_d=2.522 avg_d=1.611 std_dev=1.142
C5'	A	0, 0.488, 1.673, 2.859, 2.595 max_d=2.595 avg_d=1.673 std_dev=1.185
O3'	A	0, 0.517, 1.767, 3.016, 2.664 max_d=2.664 avg_d=1.767 std_dev=1.249
C2'	B	0, 0.519, 1.772, 3.026, 2.686 max_d=2.686 avg_d=1.772 std_dev=1.253
O2'	B	0, 0.544, 1.876, 3.208, 2.960 max_d=2.960 avg_d=1.876 std_dev=1.332
OP1	A	0, 0.711, 2.429, 4.146, 3.663 max_d=3.663 avg_d=2.429 std_dev=1.718
O4'	B	0, 0.772, 2.676, 4.581, 4.274 max_d=4.274 avg_d=2.676 std_dev=1.904
O3'	B	0, 0.830, 2.835, 4.840, 4.310 max_d=4.310 avg_d=2.835 std_dev=2.005
C3'	B	0, 0.855, 2.929, 5.004, 4.538 max_d=4.538 avg_d=2.929 std_dev=2.074
C4'	B	0, 0.918, 3.169, 5.420, 5.014 max_d=5.014 avg_d=3.169 std_dev=2.251
C5'	B	0, 1.493, 5.120, 8.746, 7.940 max_d=7.940 avg_d=5.120 std_dev=3.626
O5'	B	0, 1.603, 5.491, 9.378, 8.482 max_d=8.482 avg_d=5.491 std_dev=3.888
OP1	B	0, 2.093, 7.159, 12.225, 10.983 max_d=10.983 avg_d=7.159 std_dev=5.066
P	B	0, 2.106, 7.206, 12.305, 11.057 max_d=11.057 avg_d=7.206 std_dev=5.099
OP2	B	0, 2.411, 8.241, 14.071, 12.578 max_d=12.578 avg_d=8.241 std_dev=5.830

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.00	0.08	0.05	0.21	0.08
C2	0.05	0.00	0.20	0.13	0.02	0.08	0.02	0.08	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.15	0.15	0.03	0.24	0.18	0.10
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.05	0.12	0.10	0.10	0.17	0.19	0.07	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.25	0.51	0.45	0.38
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.15	0.00	0.21	0.01	0.22	0.21	0.18	0.10	0.24	0.24	0.14	0.01	0.00	0.01	0.05	0.44	0.06	0.16
C4	0.02	0.02	0.10	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.07	0.07	0.26	0.18	0.13
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.04	0.15	0.04	0.08	0.06	0.13	0.06	0.17	0.01	0.00	0.03	0.14	0.10	0.05
C5	0.01	0.02	0.05	0.21	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.03	0.03	0.15	0.42	0.17	0.24
C5'	0.04	0.08	0.12	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.16	0.02	0.08	0.07	0.15	0.04	0.06	0.12	0.02	0.01	0.04	0.22	0.01
C6	0.02	0.01	0.10	0.22	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.02	0.06	0.14	0.45	0.16	0.26
C8	0.01	0.03	0.10	0.21	0.01	0.15	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.09	0.09	0.20	0.40	0.17	0.24
N1	0.04	0.00	0.17	0.18	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.11	0.09	0.37	0.17	0.19
N3	0.04	0.01	0.19	0.10	0.00	0.08	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.18	0.14	0.01	0.17	0.19	0.06
N6	0.01	0.01	0.07	0.24	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.19	0.08	0.04	0.19	0.55	0.16	0.33
N7	0.01	0.02	0.05	0.24	0.00	0.13	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.12	0.05	0.22	0.51	0.16	0.32
N9	0.01	0.03	0.01	0.14	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.14	0.05	0.01	0.08	0.21	0.19	0.10
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.07	0.17	0.18	0.06	0.13	0.30	0.02	0.10	0.19	0.30	0.14	0.00	0.01	0.12	0.20	0.54	0.46	0.38
O3'	0.19	0.15	0.01	0.00	0.08	0.01	0.03	0.12	0.02	0.09	0.06	0.18	0.08	0.12	0.05	0.01	0.00	0.12	0.14	0.39	0.22	0.02
O4'	0.00	0.15	0.02	0.01	0.07	0.00	0.03	0.02	0.06	0.09	0.11	0.14	0.04	0.05	0.01	0.12	0.12	0.00	0.04	0.16	0.05	0.07
O5'	0.08	0.03	0.25	0.05	0.07	0.03	0.15	0.01	0.14	0.20	0.09	0.01	0.19	0.22	0.08	0.20	0.14	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.05	0.24	0.51	0.44	0.26	0.14	0.42	0.04	0.45	0.40	0.37	0.17	0.55	0.51	0.21	0.54	0.39	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.18	0.45	0.06	0.18	0.10	0.17	0.22	0.16	0.17	0.17	0.19	0.16	0.16	0.19	0.46	0.22	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.10	0.38	0.16	0.13	0.05	0.24	0.01	0.26	0.24	0.19	0.06	0.33	0.32	0.10	0.38	0.02	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.19	0.37	0.51	0.20	0.58	0.29	1.01	0.35	0.25	0.30	0.13	0.14	0.31	0.18	0.30	0.43	0.39	1.12	0.44	1.28	1.14	1.26
C2	0.05	0.11	0.15	0.12	0.08	0.23	0.14	0.47	0.15	0.16	0.07	0.21	0.11	0.20	0.09	0.22	0.11	0.16	0.54	0.25	0.71	0.23	0.57
C2'	0.36	0.39	0.59	0.79	0.39	0.91	0.43	1.41	0.46	0.41	0.44	0.36	0.37	0.43	0.38	0.46	0.67	0.70	1.51	0.48	1.69	1.61	1.70
C3'	0.03	0.08	0.27	0.49	0.09	0.59	0.15	1.11	0.19	0.13	0.14	0.08	0.06	0.17	0.07	0.19	0.36	0.37	1.20	0.25	1.36	1.38	1.41
C4	0.03	0.06	0.22	0.27	0.11	0.38	0.21	0.71	0.26	0.19	0.16	0.13	0.06	0.25	0.11	0.23	0.23	0.27	0.80	0.37	0.98	0.63	0.89
C4'	0.04	0.12	0.33	0.54	0.14	0.55	0.24	1.03	0.30	0.20	0.23	0.08	0.08	0.27	0.12	0.23	0.43	0.31	1.12	0.38	1.24	1.26	1.28
C5	0.02	0.07	0.16	0.18	0.09	0.33	0.19	0.63	0.24	0.19	0.11	0.20	0.07	0.25	0.10	0.19	0.14	0.26	0.72	0.37	0.91	0.48	0.80
C5'	0.05	0.11	0.36	0.59	0.14	0.57	0.24	1.07	0.30	0.20	0.23	0.05	0.07	0.27	0.12	0.24	0.47	0.31	1.14	0.38	1.22	1.32	1.29
C6	0.04	0.16	0.08	0.03	0.06	0.20	0.12	0.42	0.13	0.15	0.07	0.28	0.13	0.20	0.07	0.16	0.04	0.17	0.49	0.26	0.69	0.15	0.53
C8	0.10	0.15	0.29	0.40	0.19	0.53	0.30	0.94	0.37	0.25	0.31	0.09	0.11	0.32	0.17	0.23	0.32	0.40	1.06	0.46	1.24	1.01	1.20
N1	0.06	0.16	0.08	0.02	0.07	0.16	0.10	0.36	0.10	0.14	0.08	0.26	0.14	0.17	0.07	0.18	0.03	0.13	0.41	0.20	0.60	0.07	0.43
N3	0.02	0.06	0.21	0.24	0.09	0.33	0.17	0.63	0.21	0.17	0.11	0.14	0.07	0.22	0.09	0.25	0.21	0.22	0.71	0.32	0.88	0.49	0.78
N6	0.05	0.23	0.04	0.09	0.07	0.11	0.07	0.29	0.05	0.13	0.17	0.34	0.18	0.17	0.05	0.12	0.09	0.14	0.34	0.17	0.56	0.10	0.36
N7	0.06	0.06	0.20	0.26	0.14	0.43	0.26	0.77	0.33	0.23	0.22	0.17	0.05	0.29	0.14	0.19	0.20	0.35	0.89	0.44	1.08	0.73	1.00
N9	0.08	0.13	0.30	0.40	0.17	0.50	0.27	0.90	0.33	0.23	0.26	0.09	0.10	0.29	0.15	0.26	0.33	0.35	1.00	0.43	1.17	0.94	1.12
O2'	0.53	0.61	0.74	0.96	0.59	1.11	0.63	1.63	0.67	0.59	0.66	0.58	0.56	0.62	0.57	0.58	0.83	0.91	1.77	0.70	2.02	1.91	2.01
O3'	0.03	0.07	0.20	0.41	0.08	0.53	0.18	1.07	0.23	0.14	0.17	0.09	0.05	0.20	0.06	0.17	0.26	0.34	1.18	0.32	1.37	1.38	1.41
O4'	0.03	0.13	0.33	0.48	0.15	0.48	0.27	0.91	0.35	0.22	0.27	0.08	0.08	0.30	0.13	0.26	0.40	0.27	1.01	0.45	1.13	1.06	1.14
O5'	0.03	0.08	0.31	0.57	0.10	0.59	0.18	1.10	0.22	0.15	0.17	0.04	0.05	0.20	0.09	0.18	0.43	0.33	1.17	0.28	1.26	1.37	1.34
OP1	0.75	0.48	0.44	0.15	0.60	0.12	0.51	0.55	0.39	0.62	0.37	0.44	0.61	0.54	0.66	0.73	0.24	0.41	0.64	0.31	0.77	1.09	0.89
OP2	0.40	0.52	0.62	0.98	0.49	1.04	0.54	1.65	0.58	0.49	0.57	0.50	0.46	0.53	0.45	0.33	0.77	0.77	1.74	0.60	1.83	2.12	1.97
P	0.23	0.11	0.15	0.43	0.13	0.44	0.06	1.00	0.02	0.11	0.02	0.14	0.17	0.06	0.15	0.28	0.28	0.16	1.07	0.07	1.16	1.41	1.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.13	0.08	0.01	0.01	0.01	0.16	0.00	0.04	0.03	0.21	0.13	0.06
C2	0.08	0.00	0.17	0.23	0.01	0.43	0.01	0.76	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.18	0.18	0.38	0.84	0.03	0.95	0.63	0.89
C2'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.07	0.08	0.05	0.13	0.24	0.16	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.07	0.04	0.09	0.04
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.03	0.01	0.16	0.02	0.10	0.36	0.10	0.38	0.23	0.33	0.15	0.01	0.00	0.01	0.23	0.16	0.21	0.16	0.21
C4	0.04	0.01	0.08	0.03	0.00	0.15	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.15	0.08	0.19	0.29	0.00	0.43	0.12	0.26
C4'	0.01	0.43	0.01	0.01	0.15	0.00	0.00	0.01	0.10	0.31	0.29	0.59	0.41	0.23	0.06	0.18	0.01	0.00	0.03	0.04	0.10	0.12	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.16	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.20	0.09	0.09	0.07	0.01	0.19	0.49	0.11
C5'	0.02	0.76	0.07	0.02	0.27	0.01	0.05	0.00	0.21	0.49	0.53	1.03	0.69	0.37	0.09	0.10	0.11	0.02	0.01	0.09	0.10	0.21	0.03
C6	0.03	0.02	0.08	0.10	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.20	0.09	0.16	0.21	0.00	0.37	0.29	0.18
C8	0.01	0.01	0.05	0.36	0.00	0.31	0.01	0.49	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.22	0.15	0.19	0.60	0.01	0.35	1.03	0.67
N1	0.06	0.02	0.13	0.10	0.01	0.29	0.00	0.53	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.19	0.10	0.29	0.59	0.02	0.73	0.28	0.62
N2	0.13	0.00	0.24	0.38	0.02	0.59	0.01	1.03	0.05	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.24	0.28	0.46	1.14	0.07	1.24	1.08	1.25
N3	0.08	0.01	0.16	0.23	0.00	0.41	0.02	0.69	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.16	0.19	0.37	0.76	0.02	0.84	0.53	0.76
N7	0.01	0.01	0.04	0.33	0.00	0.23	0.00	0.37	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.18	0.10	0.48	0.00	0.28	1.06	0.60
N9	0.01	0.03	0.01	0.15	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.14	0.05	0.00	0.13	0.01	0.12	0.40	0.15
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.15	0.18	0.20	0.10	0.20	0.22	0.19	0.24	0.16	0.24	0.14	0.00	0.02	0.13	0.13	0.23	0.12	0.13	0.13
O3'	0.16	0.18	0.02	0.00	0.08	0.01	0.09	0.11	0.09	0.15	0.10	0.28	0.19	0.18	0.05	0.02	0.00	0.09	0.30	0.13	0.34	0.22	0.30
O4'	0.00	0.38	0.02	0.01	0.19	0.00	0.09	0.02	0.16	0.19	0.29	0.46	0.37	0.10	0.00	0.13	0.09	0.00	0.12	0.12	0.31	0.07	0.14
O5'	0.04	0.84	0.03	0.23	0.29	0.03	0.07	0.01	0.21	0.60	0.59	1.14	0.76	0.48	0.13	0.13	0.30	0.12	0.00	0.08	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.03	0.07	0.16	0.00	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.02	0.07	0.02	0.00	0.01	0.23	0.13	0.12	0.08	0.00	0.23	0.51	0.07
OP1	0.21	0.95	0.04	0.21	0.43	0.10	0.19	0.10	0.37	0.35	0.73	1.24	0.84	0.28	0.12	0.12	0.34	0.31	0.02	0.23	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.63	0.09	0.16	0.12	0.12	0.49	0.21	0.29	1.03	0.28	1.08	0.53	1.06	0.40	0.13	0.22	0.07	0.01	0.51	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.89	0.04	0.21	0.26	0.05	0.11	0.03	0.18	0.67	0.62	1.25	0.76	0.60	0.15	0.13	0.30	0.14	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00