Doublet Group distance statistics: 49311

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 6, 15, 15, 11, 5, 5, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.003, 0.020, 0.038, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.020 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.002, 0.020, 0.038, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.020 std_dev=0.018
N1	A	0, -0.003, 0.016, 0.034, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.016 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.002, 0.021, 0.040, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.021 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.007, 0.042, 0.077, 0.201 max_d=0.201 avg_d=0.042 std_dev=0.035
O4	A	0, 0.015, 0.080, 0.145, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.080 std_dev=0.065
C2'	A	0, 0.086, 0.196, 0.305, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.196 std_dev=0.109
O4'	A	0, 0.049, 0.178, 0.306, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.178 std_dev=0.128
O2'	B	0, 0.301, 0.448, 0.595, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.448 std_dev=0.147
C3'	A	0, 0.152, 0.316, 0.479, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.316 std_dev=0.164
O2'	A	0, 0.058, 0.225, 0.392, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.225 std_dev=0.167
C4'	A	0, 0.118, 0.291, 0.465, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.291 std_dev=0.173
O3'	A	0, 0.241, 0.459, 0.676, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.459 std_dev=0.218
C2'	B	0, 0.290, 0.515, 0.740, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.515 std_dev=0.225
C1'	B	0, 0.311, 0.571, 0.832, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.571 std_dev=0.260
C4'	B	0, 0.328, 0.605, 0.881, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.605 std_dev=0.277
C3'	B	0, 0.321, 0.608, 0.896, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.608 std_dev=0.288
O4'	B	0, 0.360, 0.674, 0.988, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.674 std_dev=0.314
O3'	B	0, 0.270, 0.600, 0.930, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.600 std_dev=0.330
C5'	A	0, 0.151, 0.485, 0.818, 2.565 max_d=2.565 avg_d=0.485 std_dev=0.333
N9	B	0, 0.332, 0.703, 1.074, 2.624 max_d=2.624 avg_d=0.703 std_dev=0.371
O5'	A	0, 0.234, 0.631, 1.028, 3.068 max_d=3.068 avg_d=0.631 std_dev=0.397
O5'	B	0, 0.377, 0.803, 1.230, 2.093 max_d=2.093 avg_d=0.803 std_dev=0.427
N3	B	0, 0.185, 0.621, 1.057, 3.458 max_d=3.458 avg_d=0.621 std_dev=0.436
C5'	B	0, 0.344, 0.784, 1.224, 2.572 max_d=2.572 avg_d=0.784 std_dev=0.440
C4	B	0, 0.245, 0.695, 1.145, 3.398 max_d=3.398 avg_d=0.695 std_dev=0.450
C8	B	0, 0.422, 0.878, 1.333, 2.911 max_d=2.911 avg_d=0.878 std_dev=0.455
P	B	0, 0.463, 0.941, 1.419, 2.296 max_d=2.296 avg_d=0.941 std_dev=0.478
OP2	A	0, 0.270, 0.777, 1.284, 3.817 max_d=3.817 avg_d=0.777 std_dev=0.507
OP1	B	0, 0.426, 0.955, 1.483, 3.047 max_d=3.047 avg_d=0.955 std_dev=0.529
OP2	B	0, 0.544, 1.075, 1.606, 2.834 max_d=2.834 avg_d=1.075 std_dev=0.531
N7	B	0, 0.420, 0.961, 1.503, 3.767 max_d=3.767 avg_d=0.961 std_dev=0.541
C2	B	0, 0.163, 0.706, 1.248, 4.315 max_d=4.315 avg_d=0.706 std_dev=0.543
C5	B	0, 0.300, 0.844, 1.387, 4.087 max_d=4.087 avg_d=0.844 std_dev=0.543
P	A	0, 0.221, 0.779, 1.336, 4.367 max_d=4.367 avg_d=0.779 std_dev=0.557
N2	B	0, 0.104, 0.708, 1.311, 4.561 max_d=4.561 avg_d=0.708 std_dev=0.604
N1	B	0, 0.179, 0.814, 1.449, 5.028 max_d=5.028 avg_d=0.814 std_dev=0.635
C6	B	0, 0.239, 0.886, 1.532, 4.985 max_d=4.985 avg_d=0.886 std_dev=0.647
OP1	A	0, 0.227, 0.886, 1.546, 5.217 max_d=5.217 avg_d=0.886 std_dev=0.660
O6	B	0, 0.264, 1.005, 1.746, 5.689 max_d=5.689 avg_d=1.005 std_dev=0.741

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.25	0.06	0.09
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.03	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.04	0.03	0.09	0.31	0.10	0.12
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.08	0.00	0.01	0.07	0.01	0.03	0.17	0.07	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.07	0.08	0.01	0.01	0.10	0.01	0.04	0.11	0.11	0.04
C4	0.02	0.03	0.06	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.02	0.01	0.04	0.07	0.10	0.01	0.03	0.19	0.44	0.14	0.22
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.08	0.03	0.04	0.06	0.04	0.02	0.07	0.00	0.01	0.12	0.08	0.04
C5	0.02	0.02	0.07	0.09	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.11	0.01	0.05	0.21	0.47	0.14	0.24
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.12	0.01	0.15	0.00	0.13	0.05	0.07	0.05	0.04	0.03	0.14	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02	0.06	0.18	0.40	0.11	0.19
N1	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.10	0.31	0.09	0.12
N3	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.09	0.03	0.02	0.14	0.37	0.12	0.16
O2	0.04	0.01	0.08	0.08	0.04	0.06	0.03	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.08	0.09	0.05	0.07	0.07	0.28	0.11	0.11
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.07	0.04	0.06	0.04	0.04	0.02	0.06	0.08	0.00	0.03	0.09	0.04	0.03	0.16	0.09	0.04
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.10	0.02	0.11	0.03	0.08	0.04	0.09	0.09	0.03	0.00	0.13	0.01	0.06	0.10	0.18	0.07
O4	0.03	0.04	0.07	0.10	0.01	0.07	0.01	0.14	0.02	0.02	0.03	0.05	0.09	0.13	0.00	0.03	0.21	0.47	0.16	0.25
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.07	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.23	0.08	0.11
O5'	0.05	0.09	0.03	0.04	0.19	0.01	0.21	0.01	0.18	0.10	0.14	0.07	0.03	0.06	0.21	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.25	0.31	0.17	0.11	0.44	0.12	0.47	0.07	0.40	0.31	0.37	0.28	0.16	0.10	0.47	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.10	0.07	0.11	0.14	0.08	0.14	0.13	0.11	0.09	0.12	0.11	0.09	0.18	0.16	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.12	0.04	0.04	0.22	0.04	0.24	0.01	0.19	0.12	0.16	0.11	0.04	0.07	0.25	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.14	0.07	0.09	0.14	0.11	0.15	0.16	0.15	0.16	0.15	0.15	0.14	0.16	0.14	0.10	0.20	0.17	0.25	0.16	0.27	0.24	0.22
C2	0.10	0.12	0.08	0.12	0.11	0.13	0.12	0.17	0.12	0.13	0.12	0.14	0.12	0.13	0.11	0.11	0.22	0.15	0.21	0.12	0.21	0.21	0.19
C2'	0.12	0.18	0.08	0.14	0.16	0.14	0.18	0.21	0.19	0.18	0.19	0.18	0.16	0.19	0.15	0.11	0.25	0.16	0.30	0.20	0.39	0.29	0.30
C3'	0.12	0.14	0.10	0.15	0.14	0.17	0.16	0.24	0.16	0.18	0.16	0.15	0.13	0.19	0.14	0.12	0.23	0.18	0.29	0.17	0.39	0.28	0.30
C4	0.14	0.15	0.11	0.11	0.13	0.17	0.13	0.21	0.13	0.17	0.14	0.18	0.13	0.16	0.14	0.16	0.19	0.22	0.15	0.14	0.17	0.15	0.15
C4'	0.13	0.13	0.07	0.08	0.14	0.13	0.16	0.19	0.15	0.18	0.14	0.14	0.13	0.18	0.15	0.09	0.17	0.19	0.23	0.16	0.27	0.22	0.21
C5	0.14	0.16	0.10	0.11	0.13	0.16	0.14	0.22	0.15	0.17	0.16	0.19	0.14	0.16	0.14	0.15	0.20	0.22	0.16	0.15	0.19	0.16	0.17
C5'	0.12	0.10	0.08	0.08	0.11	0.14	0.13	0.21	0.12	0.17	0.11	0.12	0.10	0.16	0.13	0.10	0.17	0.19	0.22	0.13	0.25	0.21	0.19
C6	0.12	0.14	0.09	0.12	0.12	0.15	0.13	0.21	0.14	0.16	0.14	0.17	0.13	0.15	0.13	0.13	0.22	0.19	0.20	0.14	0.23	0.19	0.20
N1	0.11	0.13	0.08	0.12	0.12	0.13	0.13	0.18	0.13	0.14	0.13	0.14	0.12	0.14	0.12	0.11	0.22	0.16	0.23	0.13	0.25	0.22	0.21
N3	0.11	0.12	0.09	0.11	0.11	0.15	0.12	0.19	0.12	0.14	0.12	0.14	0.11	0.13	0.12	0.14	0.19	0.18	0.15	0.12	0.17	0.15	0.14
O2	0.10	0.13	0.08	0.12	0.11	0.09	0.12	0.13	0.12	0.12	0.13	0.14	0.12	0.12	0.11	0.10	0.22	0.12	0.27	0.12	0.24	0.26	0.23
O2'	0.18	0.23	0.09	0.11	0.22	0.12	0.24	0.17	0.25	0.23	0.25	0.23	0.22	0.25	0.21	0.10	0.23	0.21	0.30	0.26	0.38	0.30	0.29
O3'	0.14	0.17	0.10	0.15	0.17	0.18	0.20	0.26	0.20	0.22	0.19	0.18	0.16	0.22	0.17	0.12	0.23	0.20	0.30	0.22	0.43	0.30	0.31
O4	0.17	0.18	0.13	0.11	0.15	0.17	0.15	0.21	0.15	0.19	0.17	0.22	0.16	0.18	0.16	0.18	0.18	0.25	0.16	0.15	0.18	0.15	0.17
O4'	0.13	0.13	0.07	0.07	0.13	0.12	0.14	0.17	0.14	0.16	0.13	0.14	0.12	0.16	0.14	0.10	0.17	0.19	0.22	0.15	0.23	0.22	0.20
O5'	0.14	0.12	0.14	0.16	0.11	0.18	0.12	0.23	0.11	0.17	0.11	0.15	0.11	0.16	0.14	0.17	0.23	0.20	0.27	0.11	0.31	0.26	0.26
OP1	0.37	0.35	0.38	0.37	0.35	0.37	0.35	0.37	0.34	0.36	0.35	0.36	0.35	0.35	0.36	0.39	0.38	0.39	0.34	0.34	0.32	0.34	0.32
OP2	0.19	0.17	0.11	0.11	0.18	0.18	0.19	0.23	0.18	0.22	0.18	0.17	0.17	0.21	0.19	0.11	0.11	0.24	0.21	0.19	0.27	0.20	0.21
P	0.20	0.13	0.16	0.17	0.16	0.23	0.18	0.27	0.16	0.23	0.13	0.12	0.14	0.21	0.20	0.16	0.18	0.26	0.22	0.16	0.24	0.22	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.16	0.02	0.18	0.13	0.12
C2	0.03	0.00	0.07	0.08	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.03	0.33	0.01	0.37	0.34	0.32
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.04	0.07	0.08	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.15	0.06	0.24	0.12	0.15
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.07	0.08	0.08	0.07	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.17	0.08	0.29	0.11	0.18
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.34	0.01	0.35	0.30	0.31
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.12	0.15	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.42	0.01	0.43	0.39	0.39
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.07	0.07	0.05	0.04	0.04	0.08	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.08	0.15	0.22	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.02	0.43	0.01	0.46	0.44	0.41
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.03	0.41	0.02	0.38	0.30	0.35
N1	0.03	0.01	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.12	0.02	0.39	0.01	0.43	0.40	0.38
N2	0.04	0.01	0.08	0.08	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.09	0.12	0.04	0.30	0.02	0.35	0.32	0.29
N3	0.03	0.00	0.07	0.07	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.29	0.01	0.32	0.28	0.27
N7	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.03	0.45	0.02	0.45	0.41	0.42
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.31	0.02	0.31	0.23	0.26
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.07	0.09	0.07	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.05	0.05	0.15	0.09	0.06
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.07	0.02	0.09	0.03	0.11	0.08	0.12	0.12	0.09	0.10	0.04	0.04	0.00	0.01	0.10	0.12	0.28	0.09	0.15
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.09	0.03	0.10	0.16	0.06
O5'	0.16	0.33	0.15	0.17	0.34	0.01	0.42	0.01	0.43	0.41	0.39	0.30	0.29	0.45	0.31	0.05	0.10	0.09	0.00	0.45	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.12	0.03	0.45	0.00	0.49	0.48	0.45
OP1	0.18	0.37	0.24	0.29	0.35	0.12	0.43	0.15	0.46	0.38	0.43	0.35	0.32	0.45	0.31	0.15	0.28	0.10	0.02	0.49	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.34	0.12	0.11	0.30	0.15	0.39	0.22	0.44	0.30	0.40	0.32	0.28	0.41	0.23	0.09	0.09	0.16	0.01	0.48	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.32	0.15	0.18	0.31	0.02	0.39	0.01	0.41	0.35	0.38	0.29	0.27	0.42	0.26	0.06	0.15	0.06	0.00	0.45	0.01	0.01	0.00