Doublet Group distance statistics: 49318

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.012, 0.037, 0.061, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.037 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.015, 0.043, 0.071, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.043 std_dev=0.028
C6	A	0, 0.015, 0.043, 0.071, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.043 std_dev=0.028
C2	A	0, 0.010, 0.040, 0.070, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.040 std_dev=0.030
C4	A	0, 0.007, 0.038, 0.069, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.038 std_dev=0.031
O2	A	0, 0.023, 0.085, 0.148, 0.165 max_d=0.165 avg_d=0.085 std_dev=0.062
O4	A	0, 0.028, 0.116, 0.203, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.116 std_dev=0.088
C1'	B	0, 0.139, 0.323, 0.507, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.323 std_dev=0.184
O4'	A	0, 0.191, 0.385, 0.578, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.385 std_dev=0.193
O2'	B	0, 0.130, 0.366, 0.603, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.366 std_dev=0.237
C2'	B	0, 0.083, 0.388, 0.693, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.388 std_dev=0.305
C2'	A	0, 0.099, 0.406, 0.712, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.406 std_dev=0.307
N9	B	0, 0.208, 0.550, 0.891, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.550 std_dev=0.342
O4'	B	0, 0.100, 0.450, 0.800, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.450 std_dev=0.350
C3'	B	0, 0.162, 0.572, 0.981, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.572 std_dev=0.410
C4'	B	0, 0.205, 0.617, 1.029, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.617 std_dev=0.412
O3'	B	0, 0.271, 0.687, 1.103, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.687 std_dev=0.416
C5'	A	0, 0.139, 0.561, 0.982, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.561 std_dev=0.421
C4	B	0, 0.402, 0.880, 1.358, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.880 std_dev=0.478
C4'	A	0, 0.119, 0.622, 1.125, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.622 std_dev=0.503
O5'	A	0, 0.344, 0.928, 1.511, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.928 std_dev=0.584
P	A	0, 0.128, 0.712, 1.296, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.712 std_dev=0.584
C5	B	0, 0.441, 1.047, 1.652, 1.649 max_d=1.649 avg_d=1.047 std_dev=0.605
O2'	A	0, 0.546, 1.169, 1.791, 1.705 max_d=1.705 avg_d=1.169 std_dev=0.623
C5'	B	0, 0.335, 1.004, 1.674, 1.752 max_d=1.752 avg_d=1.004 std_dev=0.670
C8	B	0, 0.124, 0.859, 1.595, 1.766 max_d=1.766 avg_d=0.859 std_dev=0.736
N3	B	0, 0.563, 1.303, 2.042, 2.034 max_d=2.034 avg_d=1.303 std_dev=0.739
N7	B	0, 0.281, 1.071, 1.862, 2.007 max_d=2.007 avg_d=1.071 std_dev=0.790
C3'	A	0, 0.117, 0.911, 1.705, 1.868 max_d=1.868 avg_d=0.911 std_dev=0.794
C6	B	0, 0.634, 1.439, 2.244, 2.217 max_d=2.217 avg_d=1.439 std_dev=0.805
O6	B	0, 0.702, 1.648, 2.595, 2.593 max_d=2.593 avg_d=1.648 std_dev=0.947
OP2	A	0, 0.119, 1.068, 2.017, 2.229 max_d=2.229 avg_d=1.068 std_dev=0.949
N1	B	0, 0.777, 1.770, 2.763, 2.736 max_d=2.736 avg_d=1.770 std_dev=0.993
OP1	A	0, 0.201, 1.217, 2.234, 2.437 max_d=2.437 avg_d=1.217 std_dev=1.016
C2	B	0, 0.751, 1.768, 2.786, 2.790 max_d=2.790 avg_d=1.768 std_dev=1.017
O3'	A	0, 0.499, 1.851, 3.203, 3.422 max_d=3.422 avg_d=1.851 std_dev=1.352
N2	B	0, 0.939, 2.350, 3.762, 3.827 max_d=3.827 avg_d=2.350 std_dev=1.412
OP1	B	0, 0.356, 2.122, 3.887, 4.235 max_d=4.235 avg_d=2.122 std_dev=1.765
O5'	B	0, 0.099, 1.896, 3.693, 4.099 max_d=4.099 avg_d=1.896 std_dev=1.797
P	B	0, 0.137, 2.393, 4.650, 5.164 max_d=5.164 avg_d=2.393 std_dev=2.257
OP2	B	0, 0.020, 3.594, 7.167, 7.982 max_d=7.982 avg_d=3.594 std_dev=3.574

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.02	0.00	0.13	0.78	0.78	0.41
C2	0.02	0.00	0.02	0.14	0.01	0.04	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.15	0.01	0.03	0.37	0.89	0.43	0.23
C2'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.16	0.02	0.22	0.09	0.21	0.09	0.07	0.13	0.01	0.04	0.17	0.02	0.18	0.64	0.56	0.37
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.41	0.00	0.50	0.02	0.45	0.23	0.26	0.03	0.03	0.02	0.44	0.01	0.03	0.28	0.36	0.18
C4	0.02	0.01	0.16	0.41	0.00	0.19	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.47	0.00	0.03	0.65	0.84	0.03	0.03
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.19	0.00	0.26	0.01	0.25	0.11	0.10	0.07	0.16	0.01	0.20	0.01	0.02	0.13	0.67	0.17
C5	0.01	0.01	0.22	0.50	0.01	0.26	0.00	0.39	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.60	0.01	0.04	0.69	0.84	0.04	0.04
C5'	0.04	0.15	0.09	0.02	0.33	0.01	0.39	0.00	0.33	0.18	0.23	0.07	0.13	0.08	0.36	0.01	0.01	0.31	0.53	0.01
C6	0.01	0.01	0.21	0.45	0.01	0.25	0.00	0.33	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.51	0.01	0.04	0.56	0.88	0.30	0.18
N1	0.01	0.00	0.09	0.23	0.01	0.11	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.23	0.01	0.01	0.36	0.88	0.52	0.28
N3	0.02	0.00	0.07	0.26	0.00	0.10	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.28	0.01	0.02	0.52	0.88	0.20	0.11
O2	0.02	0.00	0.13	0.03	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.40	0.19	0.02	0.05	0.26	0.88	0.53	0.28
O2'	0.01	0.24	0.01	0.03	0.13	0.16	0.13	0.13	0.13	0.08	0.21	0.40	0.00	0.05	0.14	0.12	0.15	0.42	0.57	0.25
O3'	0.09	0.15	0.04	0.02	0.47	0.01	0.60	0.08	0.51	0.23	0.28	0.19	0.05	0.00	0.53	0.07	0.11	0.25	0.20	0.13
O4	0.02	0.01	0.17	0.44	0.00	0.20	0.01	0.36	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.53	0.00	0.03	0.71	0.78	0.21	0.10
O4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.12	0.07	0.03	0.00	0.08	0.53	0.95	0.37
O5'	0.13	0.37	0.18	0.03	0.65	0.02	0.69	0.01	0.56	0.36	0.52	0.26	0.15	0.11	0.71	0.08	0.00	0.01	0.05	0.01
OP1	0.78	0.89	0.64	0.28	0.84	0.13	0.84	0.31	0.88	0.88	0.88	0.88	0.42	0.25	0.78	0.53	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.78	0.43	0.56	0.36	0.03	0.67	0.04	0.53	0.30	0.52	0.20	0.53	0.57	0.20	0.21	0.95	0.05	0.00	0.00	0.01
P	0.41	0.23	0.37	0.18	0.03	0.17	0.04	0.01	0.18	0.28	0.11	0.28	0.25	0.13	0.10	0.37	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.03	0.61	0.14	0.06	0.25	0.09	0.19	0.15	0.32	0.13	0.52	0.84	0.49	0.09	0.07	0.19	0.12	0.11	0.67	0.29	0.46	1.35	0.80
C2	0.03	0.48	0.10	0.03	0.20	0.10	0.14	0.15	0.24	0.14	0.39	0.64	0.40	0.10	0.06	0.16	0.08	0.12	0.58	0.21	0.36	1.10	0.66
C2'	0.09	0.79	0.18	0.08	0.38	0.12	0.33	0.19	0.50	0.02	0.71	1.04	0.63	0.11	0.15	0.20	0.10	0.11	0.67	0.48	0.47	1.37	0.85
C3'	0.09	0.79	0.01	0.16	0.29	0.34	0.24	0.46	0.45	0.19	0.70	1.09	0.58	0.10	0.06	0.05	0.15	0.31	1.06	0.43	0.87	1.93	1.29
C4	0.06	0.31	0.04	0.07	0.11	0.15	0.08	0.22	0.12	0.18	0.24	0.44	0.27	0.15	0.07	0.10	0.07	0.14	0.91	0.10	0.54	1.65	1.04
C4'	0.05	0.78	0.09	0.05	0.31	0.21	0.25	0.32	0.44	0.18	0.68	1.08	0.60	0.13	0.09	0.14	0.05	0.20	0.97	0.41	0.80	1.86	1.17
C5	0.06	0.37	0.05	0.06	0.12	0.16	0.09	0.25	0.14	0.22	0.28	0.53	0.31	0.18	0.08	0.14	0.08	0.17	1.03	0.11	0.68	1.98	1.23
C5'	0.23	0.63	0.11	0.23	0.20	0.40	0.19	0.54	0.28	0.43	0.52	0.94	0.46	0.35	0.22	0.06	0.17	0.41	1.32	0.26	1.15	2.38	1.57
C6	0.05	0.45	0.08	0.04	0.16	0.14	0.10	0.23	0.19	0.21	0.35	0.64	0.37	0.17	0.07	0.17	0.10	0.17	0.95	0.15	0.64	1.85	1.13
N1	0.04	0.51	0.10	0.04	0.19	0.11	0.13	0.18	0.24	0.17	0.41	0.71	0.42	0.13	0.06	0.18	0.10	0.14	0.75	0.20	0.50	1.45	0.88
N3	0.05	0.37	0.06	0.04	0.15	0.12	0.10	0.16	0.17	0.14	0.29	0.49	0.32	0.10	0.06	0.11	0.05	0.12	0.65	0.14	0.37	1.17	0.72
O2	0.03	0.54	0.12	0.06	0.24	0.07	0.19	0.10	0.30	0.09	0.45	0.72	0.46	0.08	0.08	0.16	0.10	0.09	0.37	0.27	0.22	0.72	0.42
O2'	0.46	1.22	0.55	0.43	0.80	0.28	0.77	0.21	0.94	0.43	1.15	1.46	1.04	0.55	0.56	0.53	0.43	0.29	0.20	0.93	0.05	0.80	0.36
O3'	0.16	1.08	0.16	0.17	0.53	0.32	0.52	0.45	0.76	0.21	1.02	1.40	0.82	0.29	0.26	0.12	0.18	0.25	1.02	0.77	0.87	1.91	1.29
O4	0.06	0.23	0.04	0.11	0.08	0.16	0.06	0.23	0.08	0.16	0.16	0.33	0.21	0.13	0.06	0.07	0.11	0.11	0.98	0.07	0.55	1.72	1.10
O4'	0.07	0.63	0.11	0.02	0.25	0.12	0.20	0.20	0.33	0.23	0.53	0.89	0.50	0.20	0.12	0.18	0.09	0.15	0.83	0.30	0.63	1.63	0.97
O5'	0.56	0.42	0.38	0.54	0.36	0.74	0.47	0.92	0.35	0.81	0.34	0.70	0.30	0.73	0.56	0.25	0.42	0.78	1.78	0.40	1.58	2.96	2.08
OP1	0.79	1.32	1.05	0.93	0.93	0.71	0.77	0.52	0.89	0.47	1.15	1.58	1.23	0.50	0.74	1.19	1.09	0.59	0.49	0.79	0.30	1.91	0.88
OP2	0.06	0.86	0.13	0.14	0.36	0.31	0.22	0.56	0.41	0.23	0.71	1.17	0.71	0.15	0.09	0.27	0.14	0.22	1.53	0.34	1.44	2.96	1.94
P	0.07	0.68	0.18	0.02	0.23	0.22	0.14	0.42	0.25	0.35	0.52	0.99	0.55	0.30	0.11	0.34	0.13	0.26	1.38	0.20	1.22	2.75	1.75

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.08	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.28	0.02	0.15	0.45	0.30
C2	0.07	0.00	0.04	0.08	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.06	0.56	0.00	0.24	1.16	0.66
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.05	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.33	0.01	0.28	0.47	0.28
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.06	0.09	0.07	0.05	0.02	0.02	0.00	0.00	0.39	0.03	0.35	0.48	0.28
C4	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02	0.57	0.01	0.24	1.15	0.68
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.03	0.02
C5	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.67	0.01	0.24	1.47	0.85
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.05	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.10	0.01	0.00
C6	0.03	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.68	0.00	0.24	1.57	0.88
C8	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.05	0.68	0.02	0.25	1.33	0.83
N1	0.06	0.00	0.02	0.06	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.04	0.63	0.01	0.24	1.41	0.79
N2	0.08	0.00	0.05	0.09	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.13	0.09	0.52	0.00	0.24	1.07	0.60
N3	0.07	0.00	0.04	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.07	0.51	0.01	0.24	0.99	0.58
N7	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.04	0.72	0.02	0.25	1.61	0.94
N9	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.54	0.01	0.23	0.99	0.62
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.07	0.08	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.06	0.18	0.04	0.02
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.09	0.08	0.13	0.09	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.24	0.04	0.39	0.24	0.10
O4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.09	0.07	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.02	0.05	0.16	0.15
O5'	0.28	0.56	0.33	0.39	0.57	0.01	0.67	0.00	0.68	0.68	0.63	0.52	0.51	0.72	0.54	0.07	0.24	0.09	0.00	0.71	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.04	0.02	0.71	0.00	0.22	1.74	0.95
OP1	0.15	0.24	0.28	0.35	0.24	0.11	0.24	0.10	0.24	0.25	0.24	0.24	0.24	0.25	0.23	0.18	0.39	0.05	0.02	0.22	0.00	0.01	0.00
OP2	0.45	1.16	0.47	0.48	1.15	0.03	1.47	0.01	1.57	1.33	1.41	1.07	0.99	1.61	0.99	0.04	0.24	0.16	0.01	1.74	0.01	0.00	0.00
P	0.30	0.66	0.28	0.28	0.68	0.02	0.85	0.00	0.88	0.83	0.79	0.60	0.58	0.94	0.62	0.02	0.10	0.15	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00