Doublet Group distance statistics: 49322

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.001, 0.011, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.010, 0.028, 0.046, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.028 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.001, 0.019, 0.037, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.018
O4	A	0, 0.011, 0.057, 0.104, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.057 std_dev=0.047
C3'	A	0, 0.011, 0.097, 0.182, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.097 std_dev=0.085
C4'	A	0, 0.014, 0.138, 0.263, 0.267 max_d=0.267 avg_d=0.138 std_dev=0.125
O4'	A	0, 0.005, 0.147, 0.289, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.147 std_dev=0.142
O3'	A	0, 0.010, 0.164, 0.317, 0.327 max_d=0.327 avg_d=0.164 std_dev=0.154
O2'	B	0, 0.041, 0.256, 0.470, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.256 std_dev=0.215
C2'	A	0, 0.008, 0.227, 0.445, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.227 std_dev=0.218
C5'	A	0, 0.020, 0.273, 0.525, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.273 std_dev=0.252
O3'	B	0, 0.033, 0.393, 0.753, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.393 std_dev=0.360
O5'	A	0, 0.022, 0.423, 0.823, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.423 std_dev=0.400
O2'	A	0, 0.013, 0.416, 0.820, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.416 std_dev=0.404
C2'	B	0, 0.036, 0.448, 0.860, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.448 std_dev=0.412
C3'	B	0, 0.035, 0.493, 0.951, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.493 std_dev=0.458
C1'	B	0, 0.035, 0.541, 1.046, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.541 std_dev=0.505
OP1	A	0, 0.027, 0.574, 1.122, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.574 std_dev=0.547
C8	B	0, 0.024, 0.583, 1.142, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.583 std_dev=0.559
P	A	0, 0.021, 0.581, 1.141, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.581 std_dev=0.560
O5'	B	0, 0.035, 0.616, 1.197, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.616 std_dev=0.581
N9	B	0, 0.034, 0.636, 1.239, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.636 std_dev=0.602
C5'	B	0, 0.041, 0.663, 1.284, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.663 std_dev=0.622
C4'	B	0, 0.037, 0.680, 1.322, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.680 std_dev=0.642
OP2	A	0, 0.023, 0.680, 1.336, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.680 std_dev=0.656
N7	B	0, 0.027, 0.739, 1.451, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.739 std_dev=0.712
P	B	0, 0.049, 0.764, 1.479, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.764 std_dev=0.715
OP1	B	0, 0.044, 0.798, 1.552, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.798 std_dev=0.754
OP2	B	0, 0.068, 0.845, 1.623, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.845 std_dev=0.778
C4	B	0, 0.044, 0.836, 1.628, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.836 std_dev=0.792
O4'	B	0, 0.044, 0.839, 1.633, 1.651 max_d=1.651 avg_d=0.839 std_dev=0.794
C5	B	0, 0.040, 0.887, 1.735, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.887 std_dev=0.848
N3	B	0, 0.053, 0.961, 1.868, 1.896 max_d=1.896 avg_d=0.961 std_dev=0.907
C6	B	0, 0.046, 1.086, 2.126, 2.138 max_d=2.138 avg_d=1.086 std_dev=1.040
C2	B	0, 0.057, 1.140, 2.223, 2.250 max_d=2.250 avg_d=1.140 std_dev=1.083
O6	B	0, 0.043, 1.169, 2.294, 2.300 max_d=2.300 avg_d=1.169 std_dev=1.125
N1	B	0, 0.053, 1.199, 2.345, 2.366 max_d=2.366 avg_d=1.199 std_dev=1.146
N2	B	0, 0.065, 1.287, 2.508, 2.538 max_d=2.538 avg_d=1.287 std_dev=1.222

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02
C2	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.02	0.09	0.07	0.09	0.09
C2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.07	0.06	0.07	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.06	0.04	0.05
C3'	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03
C4	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.09	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00
C5	0.01	0.01	0.07	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.11	0.01	0.05	0.05	0.07	0.10	0.06
C5'	0.02	0.05	0.06	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.09	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.11	0.01	0.05	0.08	0.09	0.11	0.09
N1	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01
N3	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.09	0.08	0.09	0.09
O2	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.03	0.01	0.06	0.14	0.11	0.16	0.14
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.08	0.01	0.16	0.06	0.16	0.03	0.01	0.12	0.00	0.01	0.08	0.01	0.05	0.11	0.06	0.08
O3'	0.08	0.06	0.02	0.01	0.09	0.00	0.11	0.02	0.11	0.08	0.07	0.03	0.01	0.00	0.10	0.05	0.03	0.01	0.04	0.02
O4	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.00	0.01	0.05	0.06	0.04	0.06
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01
O5'	0.02	0.09	0.04	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.09	0.14	0.05	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.01	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.09	0.00	0.08	0.11	0.11	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.01	0.09	0.04	0.04	0.01	0.02	0.10	0.02	0.11	0.01	0.09	0.16	0.06	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.09	0.05	0.03	0.03	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.09	0.14	0.08	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.08	0.06	0.10	0.08	0.14	0.05	0.15	0.04	0.06	0.06	0.08	0.10	0.03	0.10	0.05	0.15	0.26	0.02	0.02	0.15	0.05	0.05
C2	0.14	0.09	0.07	0.08	0.08	0.10	0.07	0.11	0.07	0.07	0.08	0.08	0.09	0.05	0.09	0.03	0.11	0.21	0.03	0.06	0.06	0.13	0.03
C2'	0.17	0.10	0.06	0.09	0.11	0.13	0.09	0.15	0.08	0.11	0.09	0.10	0.11	0.08	0.12	0.04	0.13	0.27	0.01	0.07	0.14	0.09	0.03
C3'	0.14	0.09	0.05	0.09	0.08	0.13	0.06	0.15	0.05	0.07	0.07	0.09	0.10	0.04	0.09	0.07	0.13	0.27	0.02	0.03	0.17	0.04	0.05
C4	0.06	0.04	0.02	0.04	0.04	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.06	0.04	0.03	0.07	0.02	0.04	0.09	0.11	0.08	0.08	0.03	0.23	0.11
C4'	0.15	0.11	0.06	0.11	0.10	0.15	0.07	0.15	0.07	0.07	0.09	0.12	0.12	0.05	0.11	0.06	0.14	0.30	0.03	0.04	0.17	0.02	0.06
C5	0.05	0.09	0.03	0.04	0.08	0.06	0.12	0.06	0.13	0.09	0.12	0.09	0.06	0.13	0.04	0.07	0.12	0.12	0.07	0.16	0.00	0.20	0.09
C5'	0.14	0.10	0.04	0.09	0.08	0.14	0.06	0.12	0.05	0.05	0.08	0.11	0.11	0.03	0.09	0.07	0.12	0.28	0.02	0.03	0.10	0.07	0.01
C6	0.07	0.06	0.02	0.05	0.05	0.08	0.09	0.08	0.11	0.07	0.09	0.06	0.04	0.11	0.02	0.08	0.12	0.15	0.05	0.13	0.04	0.16	0.06
N1	0.11	0.02	0.03	0.07	0.02	0.09	0.02	0.10	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.07	0.12	0.20	0.04	0.03	0.07	0.12	0.03
N3	0.11	0.05	0.05	0.06	0.05	0.08	0.03	0.08	0.03	0.03	0.04	0.04	0.06	0.02	0.06	0.03	0.09	0.16	0.06	0.02	0.01	0.18	0.08
O2	0.21	0.19	0.12	0.10	0.19	0.12	0.18	0.14	0.18	0.17	0.19	0.18	0.19	0.16	0.19	0.02	0.09	0.28	0.01	0.17	0.09	0.08	0.01
O2'	0.21	0.14	0.09	0.11	0.15	0.17	0.14	0.20	0.13	0.17	0.13	0.13	0.15	0.14	0.17	0.02	0.15	0.29	0.05	0.11	0.21	0.05	0.08
O3'	0.09	0.05	0.03	0.04	0.04	0.10	0.02	0.13	0.02	0.03	0.03	0.06	0.06	0.02	0.05	0.13	0.08	0.23	0.02	0.02	0.20	0.03	0.06
O4	0.05	0.05	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.03	0.07	0.05	0.06	0.06	0.04	0.07	0.02	0.03	0.06	0.07	0.10	0.08	0.09	0.28	0.16
O4'	0.14	0.09	0.06	0.10	0.08	0.14	0.05	0.14	0.05	0.05	0.07	0.10	0.10	0.03	0.09	0.06	0.14	0.28	0.02	0.02	0.14	0.03	0.04
O5'	0.07	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.11	0.04	0.19	0.12	0.01	0.04	0.22	0.12
OP1	0.07	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.04	0.17	0.15	0.03	0.11	0.30	0.19
OP2	0.07	0.03	0.03	0.01	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.10	0.03	0.20	0.15	0.01	0.11	0.26	0.17
P	0.07	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.10	0.03	0.18	0.15	0.02	0.09	0.27	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.01	0.01	0.14	0.03	0.03
C2	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.10	0.21	0.01	0.44	0.23	0.31
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.07	0.01
C3'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.01	0.01	0.12	0.07
C4	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.04	0.06	0.13	0.01	0.34	0.12	0.20
C4'	0.02	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.10	0.01	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.04	0.04	0.13	0.01	0.36	0.12	0.21
C5'	0.06	0.20	0.08	0.01	0.17	0.01	0.17	0.00	0.19	0.12	0.20	0.19	0.19	0.15	0.13	0.06	0.05	0.01	0.01	0.19	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.06	0.17	0.00	0.41	0.18	0.26
C8	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.03	0.02	0.04	0.00	0.24	0.03	0.11
N1	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.08	0.20	0.01	0.45	0.22	0.30
N2	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.12	0.24	0.01	0.47	0.28	0.35
N3	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.19	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.10	0.18	0.01	0.38	0.18	0.25
N7	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.04	0.01	0.08	0.00	0.31	0.07	0.16
N9	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.01	0.06	0.00	0.25	0.04	0.12
O2'	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.05	0.06	0.03	0.08	0.02	0.02	0.02	0.07	0.06	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.12	0.03
O3'	0.06	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.01	0.00	0.10	0.17	0.04	0.12	0.23	0.18
O4'	0.00	0.10	0.02	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.08	0.12	0.10	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.02	0.05	0.17	0.01	0.04
O5'	0.01	0.21	0.01	0.08	0.13	0.02	0.13	0.01	0.17	0.04	0.20	0.24	0.18	0.08	0.06	0.03	0.17	0.02	0.00	0.17	0.01	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.05	0.17	0.00	0.42	0.18	0.27
OP1	0.14	0.44	0.09	0.01	0.34	0.10	0.36	0.05	0.41	0.24	0.45	0.47	0.38	0.31	0.25	0.04	0.12	0.17	0.01	0.42	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.23	0.07	0.12	0.12	0.01	0.12	0.02	0.18	0.03	0.22	0.28	0.18	0.07	0.04	0.12	0.23	0.01	0.02	0.18	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.31	0.01	0.07	0.20	0.02	0.21	0.01	0.26	0.11	0.30	0.35	0.25	0.16	0.12	0.03	0.18	0.04	0.01	0.27	0.00	0.00	0.00