Doublet Group distance statistics: 49334

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 0, 2, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.002, 0.013, 0.023, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.016, 0.035, 0.053, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.035 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.014, 0.058, 0.101, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.058 std_dev=0.044
O3'	A	0, 0.114, 0.308, 0.501, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.308 std_dev=0.194
C3'	B	0, 0.350, 0.585, 0.819, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.585 std_dev=0.234
O3'	B	0, 0.336, 0.580, 0.825, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.580 std_dev=0.245
O2'	B	0, 0.351, 0.621, 0.892, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.621 std_dev=0.270
C2'	B	0, 0.360, 0.638, 0.917, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.638 std_dev=0.279
C3'	A	0, 0.091, 0.373, 0.656, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.373 std_dev=0.282
C2'	A	0, 0.058, 0.363, 0.667, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.363 std_dev=0.304
C4'	B	0, 0.319, 0.628, 0.938, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.628 std_dev=0.310
O4'	A	0, 0.033, 0.366, 0.700, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.366 std_dev=0.333
O5'	A	0, 0.173, 0.572, 0.972, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.572 std_dev=0.400
P	A	0, 0.229, 0.636, 1.043, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.636 std_dev=0.407
C4'	A	0, 0.038, 0.448, 0.857, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.448 std_dev=0.409
C1'	B	0, 0.358, 0.768, 1.178, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.768 std_dev=0.410
O4'	B	0, 0.327, 0.771, 1.215, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.771 std_dev=0.444
C5'	B	0, 0.315, 0.780, 1.246, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.780 std_dev=0.466
N9	B	0, 0.375, 0.843, 1.311, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.843 std_dev=0.468
C8	B	0, 0.361, 0.832, 1.302, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.832 std_dev=0.471
O5'	B	0, 0.350, 0.842, 1.333, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.842 std_dev=0.492
O2'	A	0, 0.084, 0.583, 1.081, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.583 std_dev=0.498
OP1	B	0, 0.299, 0.813, 1.326, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.813 std_dev=0.513
C4	B	0, 0.391, 0.949, 1.507, 1.798 max_d=1.798 avg_d=0.949 std_dev=0.558
P	B	0, 0.293, 0.863, 1.433, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.863 std_dev=0.570
N7	B	0, 0.336, 0.912, 1.488, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.912 std_dev=0.576
N3	B	0, 0.438, 1.026, 1.614, 1.913 max_d=1.913 avg_d=1.026 std_dev=0.588
OP2	B	0, 0.422, 1.012, 1.602, 1.691 max_d=1.691 avg_d=1.012 std_dev=0.590
C5	B	0, 0.354, 0.994, 1.633, 2.025 max_d=2.025 avg_d=0.994 std_dev=0.640
C2	B	0, 0.449, 1.154, 1.859, 2.288 max_d=2.288 avg_d=1.154 std_dev=0.705
C6	B	0, 0.354, 1.135, 1.915, 2.445 max_d=2.445 avg_d=1.135 std_dev=0.780
C5'	A	0, 0.093, 0.881, 1.668, 2.040 max_d=2.040 avg_d=0.881 std_dev=0.788
N1	B	0, 0.407, 1.217, 2.026, 2.574 max_d=2.574 avg_d=1.217 std_dev=0.809
N6	B	0, 0.313, 1.214, 2.116, 2.750 max_d=2.750 avg_d=1.214 std_dev=0.901
OP2	A	0, 0.296, 1.286, 2.276, 2.785 max_d=2.785 avg_d=1.286 std_dev=0.990
OP1	A	0, 0.044, 1.048, 2.051, 2.899 max_d=2.899 avg_d=1.048 std_dev=1.003

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.34	0.27	0.57	0.20
C2	0.02	0.00	0.12	0.08	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.08	0.01	0.07	0.42	0.54	0.87	0.25
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.02	0.02	0.11	0.07	0.14	0.01	0.08	0.23	0.00	0.02	0.02	0.01	0.57	0.21	0.68	0.37
C3'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.05	0.15	0.02	0.01	0.03	0.01	0.40	0.16	0.47	0.28
C4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.03	0.43	0.71	1.13	0.32
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.05	0.00	0.03	0.17	0.25	0.02
C5	0.01	0.01	0.11	0.10	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.05	0.00	0.06	0.44	0.68	1.14	0.36
C5'	0.04	0.08	0.07	0.01	0.12	0.00	0.14	0.00	0.13	0.07	0.10	0.08	0.06	0.03	0.13	0.01	0.01	0.33	0.37	0.02
C6	0.01	0.01	0.14	0.11	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.05	0.01	0.08	0.45	0.55	0.98	0.35
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.43	0.46	0.82	0.27
N3	0.01	0.00	0.08	0.05	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.07	0.01	0.05	0.43	0.65	1.02	0.28
O2	0.04	0.00	0.23	0.15	0.01	0.02	0.02	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.38	0.12	0.02	0.12	0.39	0.49	0.78	0.22
O2'	0.01	0.21	0.00	0.02	0.06	0.02	0.08	0.06	0.10	0.03	0.17	0.38	0.00	0.06	0.07	0.01	0.60	0.27	0.74	0.42
O3'	0.05	0.08	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.03	0.05	0.04	0.07	0.12	0.06	0.00	0.04	0.04	0.25	0.16	0.36	0.19
O4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.04	0.00	0.03	0.42	0.75	1.19	0.32
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.05	0.12	0.01	0.04	0.03	0.00	0.11	0.23	0.27	0.09
O5'	0.34	0.42	0.57	0.40	0.43	0.03	0.44	0.01	0.45	0.43	0.43	0.39	0.60	0.25	0.42	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.27	0.54	0.21	0.16	0.71	0.17	0.68	0.33	0.55	0.46	0.65	0.49	0.27	0.16	0.75	0.23	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.57	0.87	0.68	0.47	1.13	0.25	1.14	0.37	0.98	0.82	1.02	0.78	0.74	0.36	1.19	0.27	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.20	0.25	0.37	0.28	0.32	0.02	0.36	0.02	0.35	0.27	0.28	0.22	0.42	0.19	0.32	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.26	0.18	0.20	0.06	0.22	0.06	0.26	0.15	0.11	0.24	0.17	0.15	0.04	0.07	0.27	0.24	0.28	0.24	0.27	0.19	0.23
C2	0.06	0.42	0.17	0.13	0.22	0.19	0.19	0.28	0.27	0.05	0.37	0.36	0.25	0.08	0.08	0.27	0.15	0.25	0.23	0.29	0.17	0.23
C2'	0.07	0.41	0.20	0.19	0.19	0.15	0.21	0.17	0.31	0.06	0.40	0.30	0.32	0.13	0.07	0.25	0.25	0.18	0.14	0.17	0.12	0.14
C3'	0.08	0.36	0.20	0.20	0.15	0.14	0.17	0.17	0.27	0.04	0.36	0.25	0.28	0.09	0.05	0.25	0.26	0.19	0.14	0.17	0.12	0.15
C4	0.19	0.41	0.21	0.17	0.30	0.15	0.27	0.20	0.32	0.14	0.38	0.39	0.30	0.18	0.21	0.29	0.22	0.06	0.12	0.23	0.08	0.12
C4'	0.06	0.28	0.19	0.18	0.09	0.10	0.09	0.15	0.17	0.06	0.26	0.20	0.16	0.02	0.03	0.28	0.26	0.20	0.14	0.16	0.12	0.14
C5	0.12	0.35	0.20	0.22	0.23	0.17	0.21	0.18	0.26	0.10	0.33	0.31	0.25	0.14	0.14	0.30	0.30	0.08	0.12	0.20	0.09	0.11
C5'	0.11	0.42	0.29	0.25	0.24	0.09	0.22	0.06	0.30	0.11	0.39	0.35	0.29	0.14	0.14	0.37	0.34	0.13	0.07	0.11	0.07	0.07
C6	0.07	0.32	0.20	0.22	0.17	0.19	0.16	0.20	0.23	0.05	0.30	0.26	0.22	0.08	0.07	0.30	0.30	0.15	0.15	0.22	0.11	0.14
N1	0.07	0.34	0.17	0.18	0.15	0.19	0.14	0.24	0.22	0.05	0.31	0.27	0.21	0.06	0.04	0.28	0.23	0.22	0.20	0.25	0.15	0.20
N3	0.15	0.45	0.21	0.12	0.31	0.17	0.26	0.26	0.32	0.10	0.41	0.43	0.29	0.15	0.18	0.30	0.14	0.16	0.19	0.28	0.12	0.20
O2	0.09	0.47	0.15	0.08	0.21	0.21	0.17	0.31	0.27	0.08	0.40	0.40	0.24	0.06	0.06	0.24	0.10	0.31	0.27	0.31	0.22	0.28
O2'	0.11	0.45	0.20	0.21	0.23	0.17	0.27	0.18	0.38	0.11	0.46	0.31	0.40	0.19	0.10	0.25	0.25	0.17	0.15	0.16	0.14	0.15
O3'	0.17	0.22	0.19	0.20	0.06	0.20	0.08	0.23	0.17	0.10	0.24	0.11	0.19	0.06	0.10	0.25	0.25	0.27	0.21	0.23	0.18	0.21
O4	0.30	0.44	0.24	0.16	0.36	0.12	0.33	0.16	0.36	0.22	0.41	0.43	0.33	0.25	0.30	0.28	0.19	0.16	0.07	0.20	0.09	0.08
O4'	0.11	0.22	0.18	0.18	0.04	0.16	0.03	0.22	0.10	0.12	0.19	0.15	0.09	0.08	0.07	0.29	0.24	0.25	0.20	0.23	0.18	0.21
O5'	0.50	0.19	0.45	0.50	0.35	0.52	0.35	0.52	0.28	0.48	0.20	0.27	0.27	0.43	0.45	0.45	0.51	0.58	0.52	0.54	0.49	0.50
OP1	0.78	0.69	0.86	0.92	0.73	0.89	0.72	0.90	0.69	0.76	0.68	0.71	0.69	0.74	0.76	0.87	0.97	0.79	0.89	0.90	0.90	0.90
OP2	0.98	0.57	0.95	1.05	0.80	1.10	0.81	1.13	0.71	0.99	0.60	0.67	0.72	0.93	0.93	0.93	1.05	1.10	1.12	1.19	1.10	1.13
P	0.25	0.09	0.21	0.26	0.13	0.27	0.14	0.28	0.08	0.26	0.07	0.07	0.09	0.21	0.22	0.22	0.30	0.34	0.27	0.30	0.25	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.05	0.06	0.03
C2	0.02	0.00	0.11	0.09	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.12	0.02	0.10	0.11	0.15	0.13
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.01	0.05	0.06	0.09	0.12	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.11	0.06	0.04
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.11	0.06	0.09	0.04	0.09	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.13	0.08	0.06
C4	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01	0.11	0.12	0.12	0.12
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.05	0.11	0.02	0.04	0.07	0.10	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.08	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.03	0.17	0.18	0.19	0.19
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.13	0.17	0.08	0.03	0.16	0.18	0.08	0.05	0.04	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.03	0.18	0.20	0.23	0.21
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.11	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.12	0.03	0.19	0.18	0.12	0.16
N1	0.01	0.00	0.09	0.06	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.09	0.02	0.14	0.16	0.20	0.17
N3	0.02	0.00	0.12	0.09	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.11	0.01	0.07	0.08	0.11	0.09
N6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.03	0.04	0.22	0.24	0.28	0.26
N7	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.10	0.03	0.22	0.22	0.20	0.23
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.10	0.10	0.08	0.09
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.06	0.04	0.04	0.05	0.07	0.04	0.11	0.13	0.05	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.11	0.04	0.03
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.12	0.09	0.11	0.03	0.10	0.04	0.04	0.00	0.02	0.02	0.15	0.11	0.08
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.04	0.12	0.08
O5'	0.03	0.10	0.03	0.03	0.11	0.01	0.17	0.01	0.18	0.19	0.14	0.07	0.22	0.22	0.10	0.03	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.11	0.11	0.13	0.12	0.08	0.18	0.06	0.20	0.18	0.16	0.08	0.24	0.22	0.10	0.11	0.15	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.15	0.06	0.08	0.12	0.02	0.19	0.02	0.23	0.12	0.20	0.11	0.28	0.20	0.08	0.04	0.11	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.13	0.04	0.06	0.12	0.01	0.19	0.01	0.21	0.16	0.17	0.09	0.26	0.23	0.09	0.03	0.08	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00