Doublet Group distance statistics: 49346

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 7, 5, 3, 9, 4, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.004
N9	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.009, 0.023, 0.036, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.007, 0.021, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.008, 0.025, 0.043, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.025 std_dev=0.017
O2'	B	0, 0.276, 0.448, 0.620, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.448 std_dev=0.172
C2'	B	0, 0.239, 0.479, 0.719, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.479 std_dev=0.240
C1'	B	0, 0.202, 0.454, 0.706, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.454 std_dev=0.252
O3'	B	0, 0.332, 0.615, 0.898, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.615 std_dev=0.283
O4'	B	0, 0.214, 0.520, 0.825, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.520 std_dev=0.305
C3'	B	0, 0.271, 0.581, 0.892, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.581 std_dev=0.310
C4'	B	0, 0.245, 0.613, 0.981, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.613 std_dev=0.368
N1	B	0, 0.105, 0.610, 1.115, 1.835 max_d=1.835 avg_d=0.610 std_dev=0.505
O4'	A	0, -0.262, 0.376, 1.013, 1.770 max_d=1.770 avg_d=0.376 std_dev=0.638
O2	B	0, -0.001, 0.645, 1.291, 2.074 max_d=2.074 avg_d=0.645 std_dev=0.646
C2	B	0, 0.011, 0.666, 1.321, 2.158 max_d=2.158 avg_d=0.666 std_dev=0.655
C5'	B	0, 0.163, 0.821, 1.479, 2.238 max_d=2.238 avg_d=0.821 std_dev=0.658
C2'	A	0, -0.262, 0.405, 1.073, 1.888 max_d=1.888 avg_d=0.405 std_dev=0.668
C6	B	0, 0.057, 0.750, 1.443, 2.302 max_d=2.302 avg_d=0.750 std_dev=0.693
O2'	A	0, -0.235, 0.494, 1.223, 2.122 max_d=2.122 avg_d=0.494 std_dev=0.729
O5'	B	0, 0.099, 0.907, 1.715, 2.718 max_d=2.718 avg_d=0.907 std_dev=0.808
N3	B	0, -0.095, 0.818, 1.732, 2.805 max_d=2.805 avg_d=0.818 std_dev=0.914
C5	B	0, -0.052, 0.889, 1.829, 2.975 max_d=2.975 avg_d=0.889 std_dev=0.940
C4'	A	0, -0.369, 0.586, 1.542, 2.678 max_d=2.678 avg_d=0.586 std_dev=0.955
C4	B	0, -0.128, 0.921, 1.970, 3.237 max_d=3.237 avg_d=0.921 std_dev=1.049
C3'	A	0, -0.414, 0.643, 1.699, 2.973 max_d=2.973 avg_d=0.643 std_dev=1.056
P	B	0, -0.026, 1.162, 2.350, 3.679 max_d=3.679 avg_d=1.162 std_dev=1.188
O4	B	0, -0.223, 1.067, 2.356, 3.929 max_d=3.929 avg_d=1.067 std_dev=1.289
OP1	B	0, -0.088, 1.302, 2.691, 4.250 max_d=4.250 avg_d=1.302 std_dev=1.389
OP2	B	0, -0.130, 1.275, 2.680, 4.320 max_d=4.320 avg_d=1.275 std_dev=1.405
O3'	A	0, -0.588, 0.951, 2.490, 4.348 max_d=4.348 avg_d=0.951 std_dev=1.539
C5'	A	0, -0.622, 1.003, 2.628, 4.572 max_d=4.572 avg_d=1.003 std_dev=1.625
O5'	A	0, -0.703, 1.169, 3.041, 5.190 max_d=5.190 avg_d=1.169 std_dev=1.872
OP1	A	0, -0.400, 1.614, 3.629, 5.967 max_d=5.967 avg_d=1.614 std_dev=2.014
P	A	0, -0.687, 1.402, 3.490, 5.983 max_d=5.983 avg_d=1.402 std_dev=2.088
OP2	A	0, -0.682, 1.733, 4.147, 7.110 max_d=7.110 avg_d=1.733 std_dev=2.414

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.48	0.06	0.17
C2	0.02	0.00	0.44	0.39	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.42	0.54	0.21	0.09	0.30	0.12	0.11
C2'	0.00	0.44	0.00	0.00	0.23	0.01	0.11	0.01	0.20	0.22	0.35	0.44	0.14	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.37	0.16	0.10
C3'	0.01	0.39	0.00	0.00	0.21	0.00	0.13	0.01	0.22	0.19	0.33	0.36	0.17	0.09	0.04	0.02	0.00	0.00	0.10	0.26	0.22	0.04
C4	0.01	0.00	0.23	0.21	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.26	0.11	0.09	0.40	0.11	0.18
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.05	0.03	0.06	0.06	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.28	0.15	0.06
C5	0.01	0.00	0.11	0.13	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.16	0.04	0.15	0.46	0.21	0.27
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.08	0.17	0.06	0.06	0.11	0.16	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.14	0.13	0.01
C6	0.01	0.00	0.20	0.22	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.19	0.29	0.09	0.13	0.36	0.22	0.23
C8	0.01	0.01	0.22	0.19	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.24	0.16	0.23	0.76	0.23	0.40
N1	0.02	0.00	0.35	0.33	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.33	0.46	0.17	0.10	0.29	0.17	0.15
N3	0.02	0.00	0.44	0.36	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.40	0.48	0.21	0.08	0.31	0.09	0.11
N6	0.01	0.00	0.14	0.17	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.23	0.06	0.16	0.38	0.29	0.28
N7	0.01	0.01	0.11	0.09	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.13	0.09	0.22	0.68	0.28	0.40
N9	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.11	0.53	0.10	0.24
O2'	0.01	0.42	0.00	0.02	0.19	0.04	0.09	0.04	0.19	0.17	0.33	0.40	0.13	0.09	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.35	0.21	0.07
O3'	0.01	0.54	0.01	0.00	0.26	0.01	0.16	0.02	0.29	0.24	0.46	0.48	0.23	0.13	0.04	0.03	0.00	0.01	0.13	0.16	0.33	0.06
O4'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.11	0.00	0.04	0.01	0.09	0.16	0.17	0.21	0.06	0.09	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.45	0.08	0.16
O5'	0.06	0.09	0.07	0.10	0.09	0.01	0.15	0.01	0.13	0.23	0.10	0.08	0.16	0.22	0.11	0.04	0.13	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.48	0.30	0.37	0.26	0.40	0.28	0.46	0.14	0.36	0.76	0.29	0.31	0.38	0.68	0.53	0.35	0.16	0.45	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.12	0.16	0.22	0.11	0.15	0.21	0.13	0.22	0.23	0.17	0.09	0.29	0.28	0.10	0.21	0.33	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.11	0.10	0.04	0.18	0.06	0.27	0.01	0.23	0.40	0.15	0.11	0.28	0.40	0.24	0.07	0.06	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.29	0.13	0.21	0.21	0.36	0.14	0.51	0.15	0.15	0.30	0.42	0.16	0.24	0.24	0.27	0.39	0.61	0.25	0.37
C2	0.18	0.16	0.14	0.26	0.22	0.43	0.30	0.60	0.30	0.19	0.16	0.23	0.19	0.23	0.22	0.37	0.53	0.72	0.46	0.54
C2'	0.23	0.20	0.23	0.47	0.15	0.67	0.24	0.88	0.30	0.17	0.23	0.37	0.20	0.53	0.17	0.52	0.74	1.02	0.55	0.74
C3'	0.13	0.29	0.10	0.31	0.16	0.58	0.18	0.82	0.23	0.09	0.32	0.51	0.12	0.34	0.21	0.46	0.68	0.97	0.50	0.70
C4	0.13	0.23	0.12	0.18	0.16	0.33	0.15	0.45	0.16	0.14	0.23	0.35	0.16	0.20	0.17	0.26	0.36	0.51	0.22	0.32
C4'	0.15	0.43	0.26	0.11	0.28	0.29	0.13	0.50	0.11	0.20	0.44	0.62	0.34	0.13	0.32	0.23	0.37	0.64	0.23	0.40
C5	0.13	0.24	0.13	0.14	0.18	0.24	0.14	0.32	0.14	0.15	0.25	0.34	0.15	0.15	0.20	0.20	0.23	0.32	0.14	0.17
C5'	0.24	0.53	0.44	0.22	0.35	0.16	0.16	0.37	0.13	0.29	0.53	0.74	0.53	0.29	0.38	0.15	0.25	0.50	0.13	0.29
C6	0.12	0.18	0.12	0.13	0.15	0.22	0.16	0.30	0.16	0.13	0.17	0.25	0.16	0.12	0.16	0.21	0.24	0.30	0.15	0.18
C8	0.15	0.35	0.15	0.13	0.31	0.22	0.20	0.30	0.17	0.21	0.38	0.45	0.15	0.16	0.34	0.17	0.19	0.29	0.17	0.13
N1	0.17	0.16	0.13	0.20	0.22	0.35	0.28	0.47	0.28	0.19	0.17	0.21	0.19	0.17	0.22	0.33	0.42	0.52	0.32	0.38
N3	0.15	0.18	0.13	0.24	0.16	0.41	0.23	0.58	0.24	0.15	0.17	0.29	0.17	0.24	0.16	0.34	0.50	0.71	0.40	0.50
N6	0.13	0.17	0.14	0.12	0.15	0.13	0.14	0.15	0.14	0.14	0.17	0.21	0.16	0.12	0.15	0.13	0.14	0.14	0.23	0.17
N7	0.16	0.34	0.16	0.12	0.30	0.18	0.21	0.22	0.18	0.22	0.36	0.41	0.15	0.14	0.33	0.14	0.14	0.19	0.23	0.13
N9	0.13	0.29	0.13	0.17	0.22	0.30	0.14	0.42	0.14	0.16	0.31	0.41	0.15	0.19	0.25	0.23	0.31	0.47	0.17	0.27
O2'	0.30	0.18	0.32	0.57	0.16	0.75	0.30	0.96	0.36	0.22	0.20	0.32	0.28	0.65	0.17	0.56	0.83	1.14	0.66	0.84
O3'	0.21	0.25	0.15	0.45	0.11	0.74	0.27	1.03	0.33	0.13	0.29	0.50	0.11	0.48	0.16	0.59	0.88	1.23	0.70	0.93
O4'	0.23	0.45	0.34	0.19	0.33	0.16	0.20	0.29	0.18	0.28	0.45	0.59	0.40	0.21	0.35	0.14	0.20	0.40	0.14	0.20
O5'	0.29	0.59	0.53	0.31	0.38	0.13	0.19	0.32	0.17	0.34	0.57	0.82	0.63	0.39	0.41	0.14	0.20	0.43	0.11	0.24
OP1	0.39	0.60	0.66	0.52	0.44	0.32	0.30	0.34	0.30	0.41	0.59	0.78	0.71	0.64	0.47	0.30	0.28	0.36	0.31	0.27
OP2	0.20	0.50	0.47	0.26	0.30	0.18	0.12	0.40	0.11	0.24	0.50	0.74	0.56	0.37	0.33	0.22	0.28	0.49	0.15	0.32
P	0.25	0.54	0.52	0.32	0.35	0.16	0.15	0.33	0.13	0.29	0.54	0.77	0.59	0.43	0.38	0.19	0.20	0.39	0.11	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.12	0.09
C2	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.01	0.06	0.08	0.20	0.14
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.14	0.07	0.04
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.19	0.14	0.10
C4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.09	0.18	0.29	0.20
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.10	0.02	0.01
C5	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.10	0.19	0.30	0.20
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.04	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.08	0.13	0.23	0.17
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.07	0.18	0.13
N3	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.07	0.13	0.25	0.17
O2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.02	0.05	0.06	0.18	0.13
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.07	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.17	0.06	0.04
O3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.06	0.03	0.00	0.05	0.01	0.08	0.31	0.25	0.19
O4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.01	0.09	0.21	0.31	0.21
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.14	0.12
O5'	0.03	0.06	0.03	0.05	0.09	0.01	0.10	0.01	0.08	0.06	0.07	0.05	0.02	0.08	0.09	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.08	0.14	0.19	0.18	0.10	0.19	0.06	0.13	0.07	0.13	0.06	0.17	0.31	0.21	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.20	0.07	0.14	0.29	0.02	0.30	0.01	0.23	0.18	0.25	0.18	0.06	0.25	0.31	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.14	0.04	0.10	0.20	0.01	0.20	0.01	0.17	0.13	0.17	0.13	0.04	0.19	0.21	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00