Doublet Group distance statistics: 49350

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 8, 4, 5, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.008, 0.022, 0.035, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.012, 0.026, 0.039, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C2'	A	0, -0.011, 0.140, 0.290, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.140 std_dev=0.150
O4'	A	0, -0.034, 0.119, 0.273, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.119 std_dev=0.153
O2'	A	0, 0.006, 0.189, 0.372, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.189 std_dev=0.183
C4'	A	0, -0.032, 0.183, 0.398, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.183 std_dev=0.215
C3'	A	0, -0.014, 0.226, 0.466, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.226 std_dev=0.240
O5'	A	0, 0.088, 0.345, 0.603, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.345 std_dev=0.258
O2'	B	0, 0.057, 0.322, 0.588, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.322 std_dev=0.266
P	A	0, 0.145, 0.422, 0.699, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.422 std_dev=0.277
O4'	B	0, 0.124, 0.450, 0.775, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.450 std_dev=0.326
O3'	A	0, 0.019, 0.347, 0.676, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.347 std_dev=0.328
C1'	B	0, 0.054, 0.385, 0.716, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.385 std_dev=0.331
C2'	B	0, 0.001, 0.356, 0.712, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.356 std_dev=0.356
C4'	B	0, 0.058, 0.420, 0.781, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.420 std_dev=0.361
C5'	A	0, -0.084, 0.336, 0.757, 1.981 max_d=1.981 avg_d=0.336 std_dev=0.421
C3'	B	0, -0.017, 0.417, 0.850, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.417 std_dev=0.433
N1	B	0, -0.009, 0.433, 0.876, 1.822 max_d=1.822 avg_d=0.433 std_dev=0.442
C5'	B	0, 0.098, 0.547, 0.995, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.547 std_dev=0.449
O5'	B	0, 0.147, 0.601, 1.055, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.601 std_dev=0.454
P	B	0, -0.033, 0.484, 1.002, 1.875 max_d=1.875 avg_d=0.484 std_dev=0.517
OP1	B	0, 0.004, 0.539, 1.075, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.539 std_dev=0.536
OP2	B	0, 0.038, 0.591, 1.145, 2.340 max_d=2.340 avg_d=0.591 std_dev=0.553
O3'	B	0, -0.053, 0.504, 1.061, 2.374 max_d=2.374 avg_d=0.504 std_dev=0.557
C4	B	0, 0.015, 0.604, 1.193, 2.591 max_d=2.591 avg_d=0.604 std_dev=0.589
N3	B	0, 0.003, 0.593, 1.182, 2.107 max_d=2.107 avg_d=0.593 std_dev=0.589
O4	B	0, 0.089, 0.685, 1.281, 2.929 max_d=2.929 avg_d=0.685 std_dev=0.596
C2	B	0, -0.061, 0.543, 1.148, 2.266 max_d=2.266 avg_d=0.543 std_dev=0.605
OP2	A	0, 0.019, 0.636, 1.254, 2.363 max_d=2.363 avg_d=0.636 std_dev=0.617
OP1	A	0, -0.046, 0.712, 1.470, 3.114 max_d=3.114 avg_d=0.712 std_dev=0.758
C6	B	0, -0.135, 0.672, 1.480, 2.992 max_d=2.992 avg_d=0.672 std_dev=0.807
C5	B	0, -0.146, 0.753, 1.652, 3.291 max_d=3.291 avg_d=0.753 std_dev=0.899
O2	B	0, -0.298, 0.726, 1.751, 4.139 max_d=4.139 avg_d=0.726 std_dev=1.024

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.27	0.12	0.06
C2	0.03	0.00	0.07	0.11	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.02	0.14	0.33	0.36	0.09
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.05	0.08	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.14	0.20	0.18	0.08
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.06	0.13	0.08	0.10	0.06	0.11	0.06	0.02	0.00	0.01	0.21	0.24	0.23	0.15
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.15	0.35	0.32	0.08
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.15	0.16	0.03
C5	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.02	0.18	0.38	0.41	0.11
C5'	0.01	0.12	0.02	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.12	0.08	0.13	0.10	0.12	0.08	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.17	0.22	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.18	0.38	0.46	0.11
C8	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.15	0.03	0.20	0.40	0.32	0.11
N1	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.02	0.16	0.36	0.43	0.10
N3	0.03	0.00	0.08	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.03	0.13	0.32	0.30	0.07
N6	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.03	0.19	0.39	0.52	0.12
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.14	0.03	0.21	0.42	0.43	0.13
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.14	0.34	0.24	0.08
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.05	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.05	0.03	0.09	0.19	0.18	0.07
O3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.05	0.02	0.08	0.03	0.08	0.15	0.09	0.11	0.09	0.14	0.06	0.05	0.00	0.02	0.20	0.31	0.37	0.20
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.10	0.29	0.09	0.12
O5'	0.06	0.14	0.14	0.21	0.15	0.02	0.18	0.01	0.18	0.20	0.16	0.13	0.19	0.21	0.14	0.09	0.20	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.27	0.33	0.20	0.24	0.35	0.15	0.38	0.17	0.38	0.40	0.36	0.32	0.39	0.42	0.34	0.19	0.31	0.29	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.36	0.18	0.23	0.32	0.16	0.41	0.22	0.46	0.32	0.43	0.30	0.52	0.43	0.24	0.18	0.37	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.09	0.08	0.15	0.08	0.03	0.11	0.01	0.11	0.11	0.10	0.07	0.12	0.13	0.08	0.07	0.20	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.50	0.13	0.12	0.20	0.21	0.60	0.24	0.59	0.13	0.45	0.98	0.13	0.14	0.23	0.25	0.22	0.19	0.45	0.30
C2	0.14	0.45	0.14	0.19	0.17	0.25	0.35	0.29	0.38	0.13	0.40	0.81	0.16	0.24	0.20	0.25	0.26	0.22	0.49	0.35
C2'	0.14	0.46	0.11	0.13	0.19	0.23	0.61	0.28	0.60	0.12	0.41	0.92	0.13	0.19	0.21	0.27	0.25	0.23	0.47	0.33
C3'	0.14	0.48	0.11	0.13	0.18	0.24	0.63	0.30	0.61	0.11	0.42	0.95	0.13	0.18	0.21	0.28	0.27	0.27	0.48	0.35
C4	0.14	0.49	0.12	0.12	0.19	0.21	0.50	0.24	0.52	0.12	0.44	0.93	0.13	0.15	0.22	0.25	0.23	0.19	0.47	0.31
C4'	0.15	0.47	0.13	0.12	0.18	0.21	0.68	0.26	0.66	0.13	0.41	0.96	0.12	0.14	0.20	0.27	0.25	0.21	0.43	0.29
C5	0.15	0.48	0.12	0.11	0.19	0.19	0.50	0.22	0.54	0.13	0.43	0.93	0.11	0.12	0.22	0.25	0.22	0.17	0.46	0.29
C5'	0.21	0.44	0.19	0.18	0.20	0.24	0.74	0.29	0.71	0.18	0.37	0.93	0.14	0.18	0.20	0.30	0.30	0.26	0.42	0.30
C6	0.14	0.46	0.11	0.12	0.18	0.20	0.39	0.23	0.44	0.12	0.40	0.84	0.11	0.13	0.21	0.25	0.23	0.18	0.47	0.30
C8	0.16	0.49	0.14	0.12	0.22	0.18	0.63	0.21	0.64	0.14	0.44	0.97	0.11	0.12	0.24	0.25	0.22	0.16	0.43	0.26
N1	0.14	0.43	0.12	0.17	0.17	0.24	0.31	0.27	0.35	0.13	0.38	0.76	0.14	0.21	0.20	0.25	0.25	0.21	0.49	0.34
N3	0.14	0.48	0.13	0.16	0.18	0.24	0.44	0.27	0.46	0.12	0.43	0.89	0.15	0.21	0.21	0.25	0.24	0.21	0.48	0.33
N6	0.14	0.43	0.14	0.12	0.18	0.18	0.34	0.22	0.41	0.12	0.37	0.77	0.13	0.13	0.20	0.25	0.22	0.17	0.46	0.29
N7	0.16	0.48	0.16	0.13	0.21	0.18	0.61	0.21	0.62	0.14	0.44	0.95	0.12	0.13	0.24	0.25	0.23	0.16	0.43	0.25
N9	0.15	0.50	0.12	0.11	0.20	0.20	0.58	0.23	0.59	0.13	0.45	0.97	0.12	0.13	0.23	0.25	0.22	0.18	0.45	0.29
O2'	0.14	0.46	0.12	0.14	0.20	0.24	0.60	0.29	0.59	0.13	0.41	0.92	0.14	0.21	0.22	0.27	0.25	0.23	0.46	0.33
O3'	0.13	0.49	0.10	0.14	0.19	0.27	0.60	0.34	0.58	0.11	0.44	0.95	0.13	0.21	0.22	0.29	0.30	0.32	0.52	0.41
O4'	0.15	0.50	0.13	0.11	0.20	0.19	0.64	0.23	0.62	0.12	0.45	1.00	0.12	0.12	0.22	0.25	0.22	0.17	0.44	0.27
O5'	0.26	0.47	0.25	0.23	0.32	0.24	0.78	0.27	0.75	0.27	0.43	0.93	0.21	0.18	0.32	0.30	0.32	0.21	0.39	0.26
OP1	0.32	0.79	0.31	0.31	0.28	0.37	0.48	0.39	0.43	0.28	0.75	1.26	0.42	0.34	0.33	0.38	0.39	0.40	0.60	0.46
OP2	0.72	0.31	0.74	0.72	0.83	0.61	1.38	0.62	1.33	0.78	0.33	0.32	0.58	0.66	0.77	0.67	0.72	0.49	0.39	0.44
P	0.18	0.41	0.18	0.17	0.25	0.17	0.77	0.21	0.72	0.19	0.36	0.87	0.13	0.14	0.25	0.24	0.29	0.15	0.34	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.09	0.11	0.49	0.26
C2	0.01	0.00	0.11	0.32	0.01	0.30	0.01	0.43	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.30	0.01	0.22	0.56	0.45	0.43	0.42
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.09	0.18	0.00	0.03	0.06	0.01	0.06	0.06	0.41	0.19
C3'	0.01	0.32	0.00	0.00	0.14	0.00	0.15	0.02	0.20	0.07	0.28	0.55	0.01	0.01	0.16	0.03	0.05	0.13	0.30	0.13
C4	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.09	0.01	0.20	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.15	0.00	0.03	0.32	0.17	0.33	0.15
C4'	0.01	0.30	0.01	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.23	0.05	0.24	0.53	0.04	0.03	0.11	0.00	0.02	0.09	0.28	0.14
C5	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01	0.18	0.00	0.34	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.01	0.14	0.49	0.60	0.86	0.62
C5'	0.03	0.43	0.02	0.02	0.20	0.01	0.34	0.00	0.39	0.11	0.38	0.77	0.04	0.04	0.23	0.02	0.01	0.16	0.08	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.20	0.01	0.23	0.00	0.39	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.17	0.01	0.19	0.54	0.62	0.93	0.68
N1	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.01	0.01	0.19	0.13	0.46	0.21
N3	0.01	0.00	0.09	0.28	0.00	0.24	0.00	0.38	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.28	0.01	0.16	0.52	0.38	0.36	0.35
O2	0.02	0.00	0.18	0.55	0.01	0.53	0.01	0.77	0.01	0.01	0.01	0.00	0.31	0.50	0.01	0.38	0.98	0.93	0.87	0.88
O2'	0.02	0.19	0.00	0.01	0.08	0.04	0.06	0.04	0.07	0.05	0.16	0.31	0.00	0.05	0.09	0.05	0.05	0.10	0.39	0.16
O3'	0.02	0.30	0.03	0.01	0.15	0.03	0.13	0.04	0.17	0.07	0.28	0.50	0.05	0.00	0.18	0.02	0.09	0.24	0.24	0.09
O4	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.11	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.18	0.00	0.05	0.36	0.17	0.26	0.14
O4'	0.00	0.22	0.01	0.03	0.03	0.00	0.14	0.02	0.19	0.01	0.16	0.38	0.05	0.02	0.05	0.00	0.07	0.16	0.49	0.30
O5'	0.09	0.56	0.06	0.05	0.32	0.02	0.49	0.01	0.54	0.19	0.52	0.98	0.05	0.09	0.36	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.11	0.45	0.06	0.13	0.17	0.09	0.60	0.16	0.62	0.13	0.38	0.93	0.10	0.24	0.17	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.49	0.43	0.41	0.30	0.33	0.28	0.86	0.08	0.93	0.46	0.36	0.87	0.39	0.24	0.26	0.49	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.26	0.42	0.19	0.13	0.15	0.14	0.62	0.01	0.68	0.21	0.35	0.88	0.16	0.09	0.14	0.30	0.01	0.00	0.00	0.00