Doublet Group distance statistics: 49356

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.013, 0.029, 0.045, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.006, 0.022, 0.038, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.017, 0.033, 0.049, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.033 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.011, 0.028, 0.044, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.028 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.023, 0.043, 0.063, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.043 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.020, 0.043, 0.065, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.043 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.007, 0.029, 0.051, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.029 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.023, 0.050, 0.077, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.050 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.033, 0.067, 0.100, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.067 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.035, 0.106, 0.178, 0.214 max_d=0.214 avg_d=0.106 std_dev=0.072
C2'	A	0, 0.088, 0.206, 0.324, 0.348 max_d=0.348 avg_d=0.206 std_dev=0.118
O5'	A	0, 0.335, 0.611, 0.886, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.611 std_dev=0.275
C3'	A	0, 0.256, 0.536, 0.817, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.536 std_dev=0.280
C2'	B	0, 0.359, 0.661, 0.962, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.661 std_dev=0.301
C4'	A	0, 0.278, 0.593, 0.907, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.593 std_dev=0.315
O2'	A	0, 0.335, 0.686, 1.037, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.686 std_dev=0.351
O3'	A	0, 0.453, 0.915, 1.377, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.915 std_dev=0.462
P	A	0, 0.584, 1.083, 1.582, 1.462 max_d=1.462 avg_d=1.083 std_dev=0.499
OP2	A	0, 0.565, 1.085, 1.606, 1.463 max_d=1.463 avg_d=1.085 std_dev=0.521
O2'	B	0, 0.637, 1.159, 1.680, 1.455 max_d=1.455 avg_d=1.159 std_dev=0.521
C3'	B	0, 0.655, 1.197, 1.739, 1.615 max_d=1.615 avg_d=1.197 std_dev=0.542
C5'	A	0, 0.470, 1.031, 1.592, 1.600 max_d=1.600 avg_d=1.031 std_dev=0.561
C1'	B	0, 0.744, 1.349, 1.954, 1.695 max_d=1.695 avg_d=1.349 std_dev=0.605
C4'	B	0, 1.207, 2.194, 3.181, 2.772 max_d=2.772 avg_d=2.194 std_dev=0.987
O4'	B	0, 1.226, 2.223, 3.221, 2.772 max_d=2.772 avg_d=2.223 std_dev=0.997
OP1	A	0, 1.152, 2.151, 3.150, 2.769 max_d=2.769 avg_d=2.151 std_dev=0.999
OP2	B	0, 1.140, 2.190, 3.240, 3.325 max_d=3.325 avg_d=2.190 std_dev=1.050
O5'	B	0, 1.339, 2.472, 3.604, 3.326 max_d=3.326 avg_d=2.472 std_dev=1.132
N1	B	0, 1.447, 2.621, 3.796, 3.194 max_d=3.194 avg_d=2.621 std_dev=1.174
O3'	B	0, 1.569, 2.841, 4.113, 3.528 max_d=3.528 avg_d=2.841 std_dev=1.272
C6	B	0, 1.679, 3.051, 4.424, 3.794 max_d=3.794 avg_d=3.051 std_dev=1.372
C5'	B	0, 1.767, 3.213, 4.660, 4.096 max_d=4.096 avg_d=3.213 std_dev=1.446
P	B	0, 1.749, 3.218, 4.688, 4.401 max_d=4.401 avg_d=3.218 std_dev=1.470
O2	B	0, 2.020, 3.657, 5.294, 4.510 max_d=4.510 avg_d=3.657 std_dev=1.637
C2	B	0, 2.061, 3.729, 5.397, 4.522 max_d=4.522 avg_d=3.729 std_dev=1.668
OP1	B	0, 2.322, 4.222, 6.123, 5.490 max_d=5.490 avg_d=4.222 std_dev=1.901
C5	B	0, 2.334, 4.238, 6.141, 5.222 max_d=5.222 avg_d=4.238 std_dev=1.904
N3	B	0, 2.819, 5.101, 7.384, 6.208 max_d=6.208 avg_d=5.101 std_dev=2.282
C4	B	0, 2.969, 5.376, 7.783, 6.601 max_d=6.601 avg_d=5.376 std_dev=2.407
O4	B	0, 3.682, 6.667, 9.652, 8.193 max_d=8.193 avg_d=6.667 std_dev=2.985

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.02	0.05	0.06	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.23	0.27	0.20	0.11
C2	0.06	0.00	0.08	0.07	0.02	0.07	0.02	0.17	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.14	0.07	0.05	0.17	0.19	0.23	0.09
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.06	0.05	0.07	0.07	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.26	0.19	0.06
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.07	0.01	0.11	0.02	0.10	0.14	0.08	0.05	0.12	0.14	0.07	0.01	0.01	0.02	0.06	0.27	0.19	0.05
C4	0.03	0.02	0.04	0.07	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.06	0.03	0.22	0.17	0.24	0.07
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.12	0.17	0.09	0.06	0.14	0.17	0.08	0.05	0.02	0.00	0.01	0.28	0.24	0.03
C5	0.03	0.02	0.04	0.11	0.01	0.13	0.00	0.26	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.11	0.03	0.23	0.17	0.26	0.09
C5'	0.05	0.17	0.01	0.02	0.18	0.00	0.26	0.00	0.26	0.29	0.22	0.14	0.30	0.32	0.17	0.04	0.06	0.01	0.01	0.31	0.29	0.02
C6	0.03	0.01	0.06	0.10	0.01	0.12	0.00	0.26	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.10	0.03	0.21	0.21	0.26	0.11
C8	0.02	0.02	0.05	0.14	0.01	0.17	0.01	0.29	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.05	0.15	0.03	0.27	0.12	0.28	0.06
N1	0.05	0.00	0.07	0.08	0.02	0.09	0.01	0.22	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.12	0.07	0.05	0.19	0.21	0.24	0.10
N3	0.06	0.01	0.07	0.05	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.13	0.05	0.05	0.18	0.19	0.23	0.07
N6	0.03	0.02	0.05	0.12	0.01	0.14	0.01	0.30	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.13	0.03	0.22	0.27	0.27	0.15
N7	0.02	0.01	0.05	0.14	0.00	0.17	0.01	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.16	0.03	0.25	0.16	0.30	0.10
N9	0.01	0.03	0.02	0.07	0.01	0.08	0.02	0.17	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.26	0.19	0.23	0.08
O2'	0.02	0.14	0.01	0.01	0.07	0.05	0.05	0.04	0.08	0.05	0.12	0.13	0.06	0.03	0.02	0.00	0.02	0.07	0.04	0.26	0.20	0.05
O3'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.06	0.02	0.11	0.06	0.10	0.15	0.07	0.05	0.13	0.16	0.07	0.02	0.00	0.02	0.25	0.27	0.18	0.11
O4'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.27	0.34	0.18	0.16
O5'	0.23	0.17	0.06	0.06	0.22	0.01	0.23	0.01	0.21	0.27	0.19	0.18	0.22	0.25	0.26	0.04	0.25	0.27	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.27	0.19	0.26	0.27	0.17	0.28	0.17	0.31	0.21	0.12	0.21	0.19	0.27	0.16	0.19	0.26	0.27	0.34	0.01	0.00	0.03	0.02
OP2	0.20	0.23	0.19	0.19	0.24	0.24	0.26	0.29	0.26	0.28	0.24	0.23	0.27	0.30	0.23	0.20	0.18	0.18	0.03	0.03	0.00	0.02
P	0.11	0.09	0.06	0.05	0.07	0.03	0.09	0.02	0.11	0.06	0.10	0.07	0.15	0.10	0.08	0.05	0.11	0.16	0.01	0.02	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.56	0.10	0.24	0.81	0.17	0.74	0.20	0.57	0.47	0.72	0.50	0.19	0.52	0.92	0.21	0.19	0.43	0.09	0.15
C2	0.23	0.57	0.07	0.23	0.75	0.23	0.67	0.29	0.53	0.46	0.71	0.54	0.16	0.48	0.83	0.14	0.17	0.43	0.09	0.20
C2'	0.23	0.53	0.11	0.24	0.75	0.17	0.69	0.20	0.54	0.44	0.68	0.48	0.21	0.53	0.86	0.20	0.20	0.39	0.10	0.15
C3'	0.30	0.55	0.12	0.20	0.77	0.14	0.74	0.16	0.60	0.49	0.69	0.49	0.17	0.47	0.87	0.31	0.25	0.26	0.07	0.05
C4	0.24	0.55	0.07	0.22	0.76	0.15	0.70	0.19	0.56	0.46	0.68	0.49	0.17	0.51	0.85	0.21	0.17	0.40	0.07	0.14
C4'	0.31	0.57	0.14	0.22	0.81	0.16	0.77	0.18	0.63	0.51	0.71	0.50	0.17	0.48	0.92	0.32	0.28	0.28	0.07	0.06
C5	0.25	0.50	0.07	0.22	0.69	0.11	0.67	0.12	0.55	0.44	0.61	0.44	0.17	0.52	0.76	0.26	0.17	0.34	0.10	0.09
C5'	0.44	0.62	0.26	0.29	0.88	0.29	0.88	0.33	0.75	0.61	0.76	0.53	0.23	0.47	0.97	0.47	0.44	0.23	0.22	0.23
C6	0.25	0.48	0.07	0.22	0.64	0.12	0.63	0.13	0.53	0.43	0.58	0.42	0.17	0.52	0.69	0.26	0.15	0.32	0.06	0.07
C8	0.25	0.50	0.07	0.20	0.72	0.08	0.69	0.09	0.56	0.44	0.63	0.44	0.17	0.51	0.81	0.27	0.19	0.33	0.17	0.12
N1	0.24	0.53	0.06	0.23	0.68	0.20	0.63	0.24	0.53	0.45	0.64	0.48	0.16	0.49	0.73	0.18	0.15	0.37	0.05	0.15
N3	0.23	0.58	0.07	0.23	0.78	0.21	0.70	0.26	0.54	0.46	0.73	0.54	0.16	0.50	0.88	0.15	0.17	0.44	0.08	0.19
N6	0.24	0.40	0.10	0.21	0.54	0.07	0.56	0.09	0.50	0.39	0.48	0.35	0.18	0.52	0.57	0.31	0.20	0.21	0.12	0.08
N7	0.25	0.47	0.07	0.20	0.67	0.07	0.66	0.09	0.54	0.43	0.58	0.41	0.17	0.51	0.74	0.29	0.21	0.29	0.18	0.12
N9	0.25	0.54	0.08	0.22	0.77	0.14	0.72	0.16	0.57	0.46	0.69	0.49	0.18	0.52	0.87	0.23	0.18	0.39	0.10	0.12
O2'	0.16	0.49	0.15	0.30	0.72	0.25	0.63	0.28	0.46	0.37	0.65	0.45	0.26	0.57	0.84	0.12	0.22	0.48	0.16	0.24
O3'	0.29	0.53	0.11	0.19	0.75	0.13	0.71	0.15	0.58	0.48	0.67	0.48	0.16	0.45	0.84	0.30	0.24	0.24	0.07	0.05
O4'	0.26	0.56	0.09	0.22	0.81	0.13	0.75	0.15	0.59	0.47	0.72	0.49	0.18	0.52	0.93	0.24	0.19	0.38	0.10	0.11
O5'	0.30	0.52	0.14	0.19	0.69	0.13	0.64	0.15	0.53	0.45	0.63	0.48	0.20	0.48	0.77	0.35	0.21	0.32	0.43	0.34
OP1	0.53	0.64	0.28	0.27	0.81	0.41	0.83	0.49	0.76	0.65	0.73	0.57	0.21	0.31	0.86	0.63	0.55	0.29	0.37	0.40
OP2	0.44	0.56	0.19	0.18	0.78	0.30	0.83	0.39	0.73	0.59	0.66	0.46	0.13	0.34	0.85	0.55	0.49	0.16	0.33	0.36
P	0.39	0.53	0.12	0.12	0.72	0.22	0.73	0.30	0.64	0.53	0.63	0.46	0.09	0.35	0.79	0.48	0.38	0.11	0.28	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.16	0.06
C2	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.03	0.03	0.04	0.11	0.22	0.11
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.14	0.26	0.12
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.02	0.01	0.06	0.01	0.04	0.16	0.28	0.15
C4	0.02	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.02	0.10	0.13	0.18	0.14
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.10	0.14	0.05
C5	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.04	0.10	0.11	0.11	0.12
C5'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.06	0.03	0.04	0.04	0.03	0.02	0.08	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01
C6	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.05	0.07	0.09	0.10	0.09
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.09	0.16	0.08
N3	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.03	0.02	0.07	0.12	0.21	0.13
O2	0.05	0.00	0.05	0.05	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.05	0.04	0.06	0.04	0.12	0.25	0.11
O2'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.00	0.04	0.02	0.02	0.04	0.15	0.26	0.11
O3'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.07	0.01	0.06	0.02	0.05	0.03	0.06	0.05	0.04	0.00	0.08	0.01	0.05	0.23	0.37	0.21
O4	0.02	0.03	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.08	0.00	0.03	0.12	0.15	0.19	0.17
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01
O5'	0.01	0.04	0.03	0.04	0.10	0.01	0.10	0.01	0.07	0.04	0.07	0.04	0.04	0.05	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.08	0.11	0.14	0.16	0.13	0.10	0.11	0.04	0.09	0.09	0.12	0.12	0.15	0.23	0.15	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.22	0.26	0.28	0.18	0.14	0.11	0.04	0.10	0.16	0.21	0.25	0.26	0.37	0.19	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.11	0.12	0.15	0.14	0.05	0.12	0.01	0.09	0.08	0.13	0.11	0.11	0.21	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00