Doublet Group distance statistics: 49357

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.001, 0.007, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.002, 0.009, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N7	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C8	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.007, 0.022, 0.036, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.007, 0.023, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.023 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.001, 0.021, 0.041, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.021 std_dev=0.020
C2'	A	0, 0.048, 0.129, 0.211, 0.224 max_d=0.224 avg_d=0.129 std_dev=0.081
O4'	A	0, 0.033, 0.129, 0.226, 0.268 max_d=0.268 avg_d=0.129 std_dev=0.096
O2'	A	0, 0.074, 0.196, 0.317, 0.346 max_d=0.346 avg_d=0.196 std_dev=0.122
C3'	A	0, 0.048, 0.187, 0.327, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.187 std_dev=0.139
O3'	A	0, 0.038, 0.184, 0.331, 0.395 max_d=0.395 avg_d=0.184 std_dev=0.147
C6	B	0, 0.071, 0.234, 0.397, 0.437 max_d=0.437 avg_d=0.234 std_dev=0.163
C5	B	0, 0.096, 0.259, 0.422, 0.452 max_d=0.452 avg_d=0.259 std_dev=0.163
C4'	A	0, 0.070, 0.248, 0.427, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.248 std_dev=0.178
C2'	B	0, 0.050, 0.261, 0.472, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.261 std_dev=0.211
C4	B	0, 0.093, 0.313, 0.532, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.313 std_dev=0.220
N1	B	0, 0.021, 0.255, 0.489, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.255 std_dev=0.234
O4	B	0, 0.118, 0.366, 0.615, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.366 std_dev=0.249
C1'	B	0, 0.037, 0.302, 0.567, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.302 std_dev=0.265
O2'	B	0, 0.093, 0.368, 0.643, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.368 std_dev=0.275
C3'	B	0, 0.096, 0.385, 0.674, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.385 std_dev=0.289
N3	B	0, 0.051, 0.349, 0.647, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.349 std_dev=0.298
O4'	B	0, 0.046, 0.347, 0.647, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.347 std_dev=0.301
C2	B	0, 0.015, 0.333, 0.651, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.333 std_dev=0.318
C5'	A	0, 0.139, 0.486, 0.832, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.486 std_dev=0.347
C4'	B	0, 0.134, 0.500, 0.866, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.500 std_dev=0.366
O3'	B	0, 0.173, 0.563, 0.953, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.563 std_dev=0.390
O5'	A	0, 0.128, 0.525, 0.922, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.525 std_dev=0.397
O2	B	0, 0.000, 0.418, 0.837, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.418 std_dev=0.419
C5'	B	0, 0.221, 0.681, 1.141, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.681 std_dev=0.460
P	A	0, 0.124, 0.710, 1.296, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.710 std_dev=0.586
OP2	A	0, 0.159, 0.794, 1.429, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.794 std_dev=0.635
OP1	A	0, 0.168, 0.832, 1.497, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.832 std_dev=0.664
O5'	B	0, 0.289, 1.045, 1.802, 1.748 max_d=1.748 avg_d=1.045 std_dev=0.756
P	B	0, 0.415, 1.772, 3.130, 3.228 max_d=3.228 avg_d=1.772 std_dev=1.357
OP2	B	0, 0.441, 2.041, 3.641, 3.775 max_d=3.775 avg_d=2.041 std_dev=1.600
OP1	B	0, 0.522, 2.361, 4.201, 4.402 max_d=4.402 avg_d=2.361 std_dev=1.839

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.10	0.10	0.06	0.08
C2	0.03	0.00	0.05	0.04	0.01	0.12	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.12	0.07	0.11	0.16	0.17	0.22	0.18
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.08	0.06	0.05	0.05	0.04	0.07	0.05	0.03	0.00	0.01	0.02	0.14	0.15	0.10	0.12
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.06	0.03	0.04	0.04	0.05	0.03	0.02	0.00	0.00	0.04	0.10	0.08	0.04
C4	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.07	0.07	0.16	0.18	0.22	0.19
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.06	0.07	0.09	0.11	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.04	0.02
C5	0.01	0.00	0.05	0.03	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.07	0.05	0.21	0.25	0.31	0.26
C5'	0.05	0.17	0.08	0.01	0.12	0.00	0.15	0.00	0.15	0.20	0.16	0.15	0.16	0.19	0.12	0.06	0.04	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.03	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.07	0.07	0.19	0.24	0.32	0.25
C8	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.07	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.06	0.02	0.28	0.30	0.33	0.32
N1	0.02	0.00	0.05	0.03	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.07	0.09	0.17	0.20	0.27	0.21
N3	0.03	0.00	0.04	0.04	0.00	0.11	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.11	0.15	0.16	0.18	0.16
N6	0.01	0.00	0.07	0.04	0.01	0.05	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.12	0.08	0.05	0.21	0.28	0.37	0.29
N7	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.06	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.06	0.01	0.27	0.33	0.39	0.34
N9	0.00	0.02	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.06	0.02	0.18	0.19	0.20	0.19
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.09	0.01	0.10	0.06	0.12	0.05	0.13	0.10	0.12	0.07	0.05	0.00	0.01	0.01	0.15	0.19	0.15	0.15
O3'	0.06	0.07	0.01	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.07	0.06	0.07	0.07	0.08	0.06	0.06	0.01	0.00	0.06	0.03	0.13	0.10	0.06
O4'	0.00	0.11	0.02	0.00	0.07	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.09	0.11	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.04	0.07	0.06	0.04
O5'	0.10	0.16	0.14	0.04	0.16	0.02	0.21	0.01	0.19	0.28	0.17	0.15	0.21	0.27	0.18	0.15	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.10	0.17	0.15	0.10	0.18	0.08	0.25	0.07	0.24	0.30	0.20	0.16	0.28	0.33	0.19	0.19	0.13	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.06	0.22	0.10	0.08	0.22	0.04	0.31	0.01	0.32	0.33	0.27	0.18	0.37	0.39	0.20	0.15	0.10	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.18	0.12	0.04	0.19	0.02	0.26	0.01	0.25	0.32	0.21	0.16	0.29	0.34	0.19	0.15	0.06	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.21	0.23	0.27	0.14	0.30	0.17	0.33	0.21	0.23	0.17	0.22	0.21	0.28	0.10	0.31	0.21	0.43	0.86	0.46
C2	0.24	0.03	0.22	0.29	0.12	0.36	0.08	0.37	0.15	0.14	0.14	0.06	0.17	0.29	0.21	0.34	0.20	0.15	0.81	0.37
C2'	0.27	0.22	0.23	0.27	0.17	0.31	0.19	0.35	0.22	0.23	0.19	0.22	0.21	0.28	0.15	0.31	0.18	0.56	0.88	0.52
C3'	0.26	0.24	0.23	0.25	0.19	0.29	0.20	0.32	0.22	0.24	0.22	0.24	0.22	0.27	0.18	0.31	0.23	0.45	0.77	0.42
C4	0.24	0.13	0.22	0.27	0.04	0.31	0.11	0.34	0.18	0.18	0.08	0.13	0.18	0.26	0.12	0.30	0.20	0.36	0.89	0.45
C4'	0.27	0.25	0.23	0.25	0.22	0.27	0.22	0.28	0.23	0.25	0.24	0.26	0.24	0.27	0.21	0.30	0.33	0.26	0.62	0.27
C5	0.20	0.10	0.20	0.24	0.07	0.28	0.10	0.33	0.17	0.15	0.11	0.11	0.17	0.22	0.15	0.26	0.18	0.42	0.93	0.49
C5'	0.34	0.33	0.31	0.31	0.33	0.31	0.32	0.30	0.33	0.33	0.33	0.32	0.34	0.33	0.33	0.36	0.49	0.11	0.35	0.07
C6	0.18	0.10	0.20	0.25	0.14	0.29	0.06	0.35	0.12	0.09	0.19	0.14	0.15	0.22	0.21	0.26	0.18	0.31	0.91	0.45
C8	0.21	0.16	0.20	0.23	0.12	0.25	0.16	0.30	0.20	0.19	0.13	0.15	0.19	0.21	0.11	0.24	0.17	0.58	0.91	0.52
N1	0.20	0.10	0.21	0.28	0.17	0.35	0.08	0.38	0.13	0.09	0.22	0.14	0.15	0.26	0.24	0.32	0.19	0.16	0.82	0.37
N3	0.25	0.10	0.22	0.28	0.04	0.34	0.09	0.35	0.17	0.18	0.05	0.11	0.18	0.29	0.15	0.33	0.20	0.23	0.85	0.41
N6	0.11	0.17	0.16	0.22	0.18	0.25	0.07	0.33	0.07	0.04	0.22	0.20	0.13	0.17	0.21	0.18	0.15	0.36	0.95	0.49
N7	0.19	0.12	0.20	0.22	0.09	0.24	0.13	0.30	0.17	0.16	0.11	0.13	0.18	0.20	0.12	0.22	0.15	0.59	0.95	0.54
N9	0.24	0.17	0.22	0.26	0.11	0.29	0.16	0.32	0.20	0.21	0.13	0.17	0.20	0.25	0.08	0.29	0.19	0.46	0.89	0.48
O2'	0.29	0.21	0.26	0.32	0.14	0.36	0.18	0.40	0.23	0.24	0.17	0.21	0.23	0.32	0.12	0.35	0.14	0.72	1.03	0.67
O3'	0.30	0.26	0.26	0.29	0.20	0.34	0.21	0.36	0.24	0.26	0.23	0.27	0.24	0.30	0.18	0.34	0.17	0.47	0.85	0.49
O4'	0.26	0.24	0.21	0.23	0.16	0.26	0.16	0.26	0.19	0.23	0.21	0.25	0.21	0.26	0.12	0.29	0.30	0.29	0.70	0.33
O5'	0.33	0.30	0.30	0.30	0.30	0.32	0.31	0.32	0.32	0.32	0.30	0.29	0.31	0.31	0.29	0.37	0.50	0.17	0.33	0.07
OP1	0.38	0.34	0.37	0.37	0.36	0.38	0.39	0.38	0.40	0.37	0.33	0.32	0.39	0.37	0.35	0.42	0.59	0.19	0.20	0.10
OP2	0.48	0.44	0.47	0.46	0.44	0.45	0.48	0.43	0.49	0.47	0.42	0.42	0.50	0.47	0.42	0.51	0.71	0.17	0.11	0.22
P	0.41	0.37	0.39	0.38	0.38	0.38	0.41	0.38	0.41	0.40	0.37	0.36	0.41	0.39	0.38	0.44	0.63	0.15	0.14	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.36	0.60	0.13	0.29
C2	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.01	0.04	0.39	0.43	0.35	0.24
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.06	0.03	0.02	0.04	0.06	0.00	0.02	0.03	0.01	0.53	0.96	0.39	0.63
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.06	0.01	0.00	0.03	0.02	0.32	0.90	0.26	0.52
C4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.03	0.43	0.32	0.43	0.27
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.09	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.37	0.23	0.07
C5	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.09	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.03	0.00	0.02	0.46	0.31	0.34	0.27
C5'	0.05	0.09	0.06	0.01	0.18	0.01	0.23	0.00	0.22	0.12	0.13	0.03	0.05	0.01	0.19	0.02	0.01	0.20	0.33	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.09	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01	0.02	0.48	0.37	0.24	0.28
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.42	0.46	0.24	0.26
N3	0.03	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.41	0.36	0.43	0.26
O2	0.04	0.00	0.06	0.06	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.11	0.01	0.05	0.36	0.49	0.35	0.24
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.06	0.01	0.07	0.05	0.07	0.04	0.06	0.09	0.00	0.03	0.06	0.02	0.55	1.14	0.54	0.74
O3'	0.03	0.07	0.02	0.00	0.05	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.07	0.11	0.03	0.00	0.05	0.05	0.16	0.85	0.16	0.39
O4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.04	0.42	0.32	0.48	0.30
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.05	0.04	0.00	0.20	0.34	0.34	0.12
O5'	0.36	0.39	0.53	0.32	0.43	0.01	0.46	0.01	0.48	0.42	0.41	0.36	0.55	0.16	0.42	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.60	0.43	0.96	0.90	0.32	0.37	0.31	0.20	0.37	0.46	0.36	0.49	1.14	0.85	0.32	0.34	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.35	0.39	0.26	0.43	0.23	0.34	0.33	0.24	0.24	0.43	0.35	0.54	0.16	0.48	0.34	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.29	0.24	0.63	0.52	0.27	0.07	0.27	0.01	0.28	0.26	0.26	0.24	0.74	0.39	0.30	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00