Doublet Group distance statistics: 49363

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.002, 0.018, 0.034, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.001, 0.020, 0.038, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.020 std_dev=0.019
C2	A	0, -0.002, 0.018, 0.038, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.018 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.002, 0.023, 0.043, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.023 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.006, 0.028, 0.050, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.028 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N3	A	0, -0.001, 0.025, 0.051, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.025 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.007, 0.033, 0.060, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.033 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.000, 0.027, 0.053, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N6	A	0, -0.006, 0.036, 0.077, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.036 std_dev=0.041
C1'	B	0, 0.091, 0.232, 0.373, 0.363 max_d=0.363 avg_d=0.232 std_dev=0.141
O4'	A	0, 0.022, 0.172, 0.322, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.172 std_dev=0.150
N1	B	0, 0.110, 0.285, 0.460, 0.476 max_d=0.476 avg_d=0.285 std_dev=0.175
C2	B	0, 0.128, 0.304, 0.480, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.304 std_dev=0.176
O2	B	0, 0.109, 0.287, 0.465, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.287 std_dev=0.178
C2'	A	0, -0.017, 0.161, 0.340, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.161 std_dev=0.179
O2'	A	0, 0.037, 0.236, 0.435, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.236 std_dev=0.199
O4'	B	0, 0.083, 0.288, 0.492, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.288 std_dev=0.205
C4'	B	0, 0.156, 0.373, 0.591, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.373 std_dev=0.218
N3	B	0, 0.135, 0.377, 0.619, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.377 std_dev=0.242
C2'	B	0, 0.134, 0.380, 0.626, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.380 std_dev=0.246
C6	B	0, 0.078, 0.336, 0.593, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.336 std_dev=0.257
C4'	A	0, 0.042, 0.302, 0.561, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.302 std_dev=0.259
C5'	B	0, 0.178, 0.443, 0.709, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.443 std_dev=0.266
OP1	A	0, 0.132, 0.397, 0.663, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.397 std_dev=0.266
C3'	A	0, 0.054, 0.320, 0.586, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.320 std_dev=0.266
C3'	B	0, 0.164, 0.438, 0.713, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.438 std_dev=0.274
P	A	0, 0.143, 0.431, 0.719, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.431 std_dev=0.288
O5'	A	0, 0.021, 0.313, 0.606, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.313 std_dev=0.293
C4	B	0, 0.106, 0.435, 0.764, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.435 std_dev=0.329
O3'	A	0, 0.102, 0.434, 0.767, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.434 std_dev=0.332
C5	B	0, 0.082, 0.418, 0.753, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.418 std_dev=0.336
P	B	0, 0.215, 0.610, 1.005, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.610 std_dev=0.395
OP2	A	0, 0.199, 0.597, 0.996, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.597 std_dev=0.398
O5'	B	0, 0.203, 0.611, 1.019, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.611 std_dev=0.408
O4	B	0, 0.101, 0.527, 0.954, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.527 std_dev=0.427
OP1	B	0, 0.222, 0.712, 1.202, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.712 std_dev=0.490
O2'	B	0, 0.125, 0.615, 1.105, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.615 std_dev=0.490
OP2	B	0, 0.250, 0.759, 1.268, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.759 std_dev=0.509
C5'	A	0, -0.002, 0.518, 1.038, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.518 std_dev=0.520
O3'	B	0, 0.485, 1.160, 1.835, 1.647 max_d=1.647 avg_d=1.160 std_dev=0.675

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.11	0.12	0.10
C2	0.05	0.00	0.10	0.20	0.01	0.14	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.19	0.04	0.20	0.10	0.15	0.12
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.07	0.11	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.19	0.26	0.21
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.10	0.02	0.13	0.11	0.17	0.19	0.13	0.10	0.05	0.02	0.01	0.02	0.32	0.27	0.33	0.27
C4	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.10	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.22	0.11	0.16	0.14
C4'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.10	0.00	0.12	0.01	0.14	0.07	0.15	0.12	0.15	0.10	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.10	0.05	0.02
C5	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.02	0.24	0.10	0.19	0.16
C5'	0.03	0.28	0.02	0.02	0.21	0.01	0.24	0.00	0.29	0.12	0.30	0.23	0.31	0.20	0.12	0.05	0.04	0.02	0.01	0.16	0.06	0.02
C6	0.02	0.00	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.24	0.09	0.20	0.17
C8	0.03	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.11	0.04	0.25	0.13	0.20	0.19
N1	0.04	0.00	0.07	0.17	0.01	0.15	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.11	0.15	0.03	0.22	0.09	0.18	0.14
N3	0.05	0.00	0.11	0.19	0.01	0.12	0.02	0.23	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.17	0.04	0.20	0.11	0.14	0.12
N6	0.01	0.01	0.00	0.13	0.00	0.15	0.01	0.31	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.07	0.12	0.03	0.25	0.11	0.24	0.20
N7	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.11	0.04	0.26	0.12	0.21	0.19
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.22	0.13	0.17	0.15
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.08	0.03	0.11	0.12	0.07	0.03	0.02	0.00	0.04	0.02	0.14	0.12	0.18	0.13
O3'	0.02	0.19	0.01	0.01	0.09	0.01	0.08	0.04	0.10	0.11	0.15	0.17	0.12	0.11	0.03	0.04	0.00	0.02	0.27	0.28	0.37	0.28
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.09	0.04	0.05
O5'	0.15	0.20	0.25	0.32	0.22	0.02	0.24	0.01	0.24	0.25	0.22	0.20	0.25	0.26	0.22	0.14	0.27	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.11	0.10	0.19	0.27	0.11	0.10	0.10	0.16	0.09	0.13	0.09	0.11	0.11	0.12	0.13	0.12	0.28	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.15	0.26	0.33	0.16	0.05	0.19	0.06	0.20	0.20	0.18	0.14	0.24	0.21	0.17	0.18	0.37	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.12	0.21	0.27	0.14	0.02	0.16	0.02	0.17	0.19	0.14	0.12	0.20	0.19	0.15	0.13	0.28	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.13	0.16	0.14	0.22	0.22	0.21	0.28	0.17	0.13	0.17	0.08	0.43	0.33	0.26	0.21	0.21	0.28	0.10	0.18
C2	0.05	0.05	0.18	0.13	0.12	0.20	0.12	0.28	0.09	0.06	0.09	0.03	0.46	0.30	0.15	0.14	0.20	0.32	0.14	0.22
C2'	0.05	0.13	0.12	0.11	0.26	0.18	0.25	0.26	0.19	0.13	0.20	0.07	0.41	0.32	0.31	0.20	0.21	0.28	0.10	0.19
C3'	0.08	0.04	0.20	0.14	0.17	0.06	0.15	0.08	0.08	0.02	0.11	0.08	0.47	0.34	0.24	0.10	0.10	0.11	0.15	0.06
C4	0.06	0.11	0.16	0.13	0.19	0.21	0.19	0.27	0.15	0.11	0.15	0.06	0.43	0.32	0.23	0.20	0.20	0.27	0.10	0.18
C4'	0.09	0.05	0.18	0.13	0.12	0.07	0.12	0.08	0.08	0.07	0.08	0.08	0.44	0.34	0.18	0.15	0.14	0.09	0.25	0.12
C5	0.07	0.12	0.13	0.12	0.19	0.21	0.19	0.26	0.16	0.12	0.16	0.06	0.38	0.32	0.22	0.21	0.20	0.25	0.10	0.17
C5'	0.27	0.20	0.30	0.28	0.17	0.23	0.19	0.22	0.21	0.23	0.17	0.23	0.49	0.42	0.18	0.31	0.33	0.27	0.50	0.36
C6	0.05	0.07	0.13	0.12	0.14	0.21	0.14	0.26	0.12	0.08	0.10	0.02	0.38	0.31	0.16	0.19	0.19	0.26	0.10	0.18
C8	0.09	0.15	0.13	0.12	0.24	0.21	0.23	0.25	0.19	0.15	0.20	0.09	0.37	0.32	0.28	0.22	0.21	0.23	0.13	0.16
N1	0.05	0.04	0.16	0.12	0.10	0.21	0.11	0.28	0.09	0.05	0.07	0.03	0.42	0.30	0.13	0.14	0.20	0.30	0.14	0.21
N3	0.05	0.08	0.19	0.13	0.16	0.20	0.15	0.27	0.12	0.08	0.12	0.04	0.47	0.31	0.19	0.16	0.20	0.30	0.11	0.20
N6	0.05	0.04	0.08	0.13	0.10	0.22	0.12	0.26	0.11	0.08	0.06	0.06	0.29	0.33	0.11	0.22	0.20	0.24	0.10	0.17
N7	0.09	0.15	0.12	0.12	0.23	0.21	0.22	0.25	0.19	0.15	0.19	0.09	0.34	0.32	0.27	0.22	0.20	0.22	0.13	0.16
N9	0.08	0.13	0.15	0.13	0.23	0.21	0.22	0.27	0.18	0.13	0.18	0.08	0.42	0.32	0.27	0.21	0.21	0.26	0.11	0.17
O2'	0.11	0.17	0.11	0.16	0.28	0.27	0.28	0.35	0.24	0.18	0.22	0.10	0.38	0.33	0.32	0.27	0.29	0.39	0.16	0.28
O3'	0.08	0.08	0.19	0.13	0.20	0.06	0.18	0.10	0.11	0.05	0.14	0.10	0.46	0.34	0.26	0.08	0.09	0.15	0.12	0.08
O4'	0.06	0.10	0.17	0.13	0.19	0.18	0.18	0.22	0.14	0.10	0.15	0.07	0.43	0.33	0.23	0.17	0.17	0.20	0.13	0.12
O5'	0.28	0.30	0.32	0.29	0.38	0.37	0.39	0.41	0.36	0.31	0.33	0.26	0.45	0.36	0.41	0.33	0.33	0.36	0.13	0.27
OP1	0.14	0.16	0.20	0.17	0.22	0.21	0.22	0.21	0.19	0.16	0.18	0.14	0.35	0.33	0.25	0.17	0.15	0.12	0.16	0.08
OP2	0.22	0.22	0.27	0.21	0.30	0.26	0.31	0.27	0.28	0.23	0.25	0.21	0.43	0.25	0.34	0.20	0.17	0.21	0.08	0.14
P	0.20	0.22	0.26	0.20	0.30	0.26	0.30	0.27	0.27	0.23	0.25	0.20	0.41	0.29	0.34	0.21	0.19	0.20	0.07	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.15	0.03	0.01	0.08	0.11	0.10	0.07
C2	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.17	0.02	0.04	0.18	0.21	0.29	0.20
C2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.08	0.11	0.10	0.03	0.01	0.07	0.00	0.06	0.04	0.01	0.17	0.30	0.20	0.23
C3'	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.03	0.08	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.14	0.12	0.09
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.09	0.01	0.21	0.01	0.02	0.00	0.01	0.13	0.10	0.00	0.04	0.28	0.37	0.43	0.33
C4'	0.02	0.02	0.02	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.09	0.03	0.05	0.02	0.07	0.01	0.10	0.01	0.02	0.06	0.05	0.01
C5	0.01	0.01	0.08	0.08	0.01	0.10	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.07	0.00	0.02	0.29	0.38	0.40	0.32
C5'	0.04	0.10	0.11	0.03	0.21	0.01	0.23	0.00	0.19	0.11	0.16	0.06	0.06	0.11	0.23	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03
C6	0.01	0.01	0.10	0.08	0.01	0.09	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.07	0.01	0.01	0.24	0.29	0.26	0.23
N1	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.11	0.00	0.00	0.02	0.01	0.08	0.11	0.03	0.01	0.17	0.19	0.21	0.16
N3	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.16	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.14	0.02	0.05	0.24	0.30	0.38	0.27
O2	0.01	0.00	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.22	0.03	0.05	0.15	0.16	0.26	0.17
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.13	0.07	0.17	0.06	0.17	0.08	0.08	0.12	0.00	0.12	0.14	0.03	0.18	0.36	0.31	0.28
O3'	0.15	0.17	0.06	0.01	0.10	0.01	0.07	0.11	0.07	0.11	0.14	0.22	0.12	0.00	0.09	0.12	0.16	0.21	0.20	0.18
O4	0.03	0.02	0.04	0.05	0.00	0.10	0.00	0.23	0.01	0.03	0.02	0.03	0.14	0.09	0.00	0.05	0.30	0.42	0.49	0.37
O4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03	0.12	0.05	0.00	0.09	0.09	0.18	0.13
O5'	0.08	0.18	0.17	0.08	0.28	0.02	0.29	0.01	0.24	0.17	0.24	0.15	0.18	0.16	0.30	0.09	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.11	0.21	0.30	0.14	0.37	0.06	0.38	0.03	0.29	0.19	0.30	0.16	0.36	0.21	0.42	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.29	0.20	0.12	0.43	0.05	0.40	0.04	0.26	0.21	0.38	0.26	0.31	0.20	0.49	0.18	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.20	0.23	0.09	0.33	0.01	0.32	0.03	0.23	0.16	0.27	0.17	0.28	0.18	0.37	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00