Doublet Group distance statistics: 49364

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.007, 0.022, 0.038, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.010, 0.029, 0.047, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.029 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.008, 0.038, 0.069, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.038 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.008, 0.042, 0.075, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.042 std_dev=0.034
C8	A	0, 0.012, 0.055, 0.097, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.055 std_dev=0.043
N6	A	0, 0.015, 0.059, 0.104, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.059 std_dev=0.045
O4'	A	0, 0.005, 0.064, 0.123, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.064 std_dev=0.059
C2'	A	0, -0.014, 0.114, 0.242, 0.323 max_d=0.323 avg_d=0.114 std_dev=0.128
C2'	B	0, 0.002, 0.150, 0.299, 0.385 max_d=0.385 avg_d=0.150 std_dev=0.149
C1'	B	0, -0.030, 0.140, 0.310, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.140 std_dev=0.170
C3'	B	0, 0.023, 0.209, 0.396, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.209 std_dev=0.187
N1	B	0, 0.007, 0.194, 0.381, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.194 std_dev=0.187
C4'	A	0, 0.019, 0.215, 0.411, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.215 std_dev=0.196
O4'	B	0, 0.009, 0.204, 0.400, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.204 std_dev=0.196
C3'	A	0, 0.009, 0.215, 0.420, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.215 std_dev=0.205
O2'	A	0, -0.034, 0.179, 0.392, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.179 std_dev=0.213
C6	B	0, 0.021, 0.246, 0.472, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.246 std_dev=0.226
O3'	A	0, -0.025, 0.272, 0.569, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.272 std_dev=0.297
O3'	B	0, 0.023, 0.339, 0.656, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.339 std_dev=0.317
C4'	B	0, 0.014, 0.336, 0.658, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.336 std_dev=0.322
C2	B	0, -0.001, 0.340, 0.680, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.340 std_dev=0.340
C5	B	0, 0.020, 0.395, 0.770, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.395 std_dev=0.375
O2'	B	0, -0.090, 0.285, 0.661, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.285 std_dev=0.376
C5'	A	0, 0.011, 0.397, 0.782, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.397 std_dev=0.385
O2	B	0, -0.003, 0.435, 0.873, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.435 std_dev=0.438
N3	B	0, 0.009, 0.457, 0.906, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.457 std_dev=0.448
C4	B	0, 0.008, 0.489, 0.969, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.489 std_dev=0.480
C5'	B	0, 0.016, 0.541, 1.065, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.541 std_dev=0.524
OP2	A	0, 0.020, 0.584, 1.149, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.584 std_dev=0.564
O5'	B	0, 0.014, 0.593, 1.172, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.593 std_dev=0.579
O4	B	0, 0.015, 0.667, 1.319, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.667 std_dev=0.652
P	A	0, 0.007, 0.692, 1.376, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.692 std_dev=0.684
P	B	0, -0.043, 0.682, 1.407, 1.765 max_d=1.765 avg_d=0.682 std_dev=0.725
OP1	A	0, 0.012, 0.757, 1.503, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.757 std_dev=0.746
O5'	A	0, -0.056, 0.706, 1.467, 1.888 max_d=1.888 avg_d=0.706 std_dev=0.762
OP2	B	0, -0.108, 0.810, 1.727, 2.264 max_d=2.264 avg_d=0.810 std_dev=0.918
OP1	B	0, -0.147, 0.872, 1.892, 2.533 max_d=2.533 avg_d=0.872 std_dev=1.020

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.33	0.28	0.08	0.20
C2	0.02	0.00	0.05	0.11	0.01	0.10	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.02	0.21	0.14	0.21	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.02	0.05	0.04	0.07	0.04	0.07	0.05	0.08	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.16	0.21	0.05
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.09	0.01	0.13	0.02	0.15	0.09	0.15	0.09	0.17	0.14	0.05	0.01	0.01	0.02	0.08	0.13	0.30	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.10	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.31	0.19	0.15	0.15
C4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.10	0.00	0.14	0.00	0.15	0.13	0.14	0.08	0.17	0.17	0.09	0.05	0.01	0.00	0.01	0.21	0.28	0.02
C5	0.01	0.00	0.05	0.13	0.00	0.14	0.00	0.35	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.01	0.36	0.25	0.20	0.21
C5'	0.09	0.28	0.04	0.02	0.28	0.00	0.35	0.00	0.37	0.33	0.34	0.24	0.39	0.38	0.24	0.05	0.08	0.03	0.00	0.33	0.40	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.15	0.01	0.15	0.01	0.37	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.02	0.31	0.25	0.23	0.20
C8	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.13	0.01	0.33	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.51	0.37	0.16	0.33
N1	0.02	0.00	0.07	0.15	0.01	0.14	0.01	0.34	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.02	0.24	0.21	0.23	0.15
N3	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.08	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.23	0.11	0.17	0.08
N6	0.03	0.00	0.08	0.17	0.02	0.17	0.02	0.39	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.03	0.05	0.17	0.04	0.35	0.31	0.27	0.27
N7	0.00	0.00	0.06	0.14	0.01	0.17	0.00	0.38	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.13	0.01	0.46	0.34	0.23	0.31
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.09	0.01	0.24	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.38	0.28	0.11	0.21
O2'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.05	0.04	0.02	0.03	0.02	0.05	0.03	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.12	0.23	0.04
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.06	0.01	0.11	0.08	0.13	0.09	0.12	0.07	0.17	0.13	0.04	0.06	0.00	0.03	0.33	0.09	0.34	0.20
O4'	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.39	0.38	0.02	0.27
O5'	0.33	0.21	0.08	0.08	0.31	0.01	0.36	0.00	0.31	0.51	0.24	0.23	0.35	0.46	0.38	0.01	0.33	0.39	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.28	0.14	0.16	0.13	0.19	0.21	0.25	0.33	0.25	0.37	0.21	0.11	0.31	0.34	0.28	0.12	0.09	0.38	0.03	0.00	0.03	0.01
OP2	0.08	0.21	0.21	0.30	0.15	0.28	0.20	0.40	0.23	0.16	0.23	0.17	0.27	0.23	0.11	0.23	0.34	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01
P	0.20	0.09	0.05	0.08	0.15	0.02	0.21	0.01	0.20	0.33	0.15	0.08	0.27	0.31	0.21	0.04	0.20	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.09	0.04	0.06	0.05	0.09	0.10	0.12	0.10	0.03	0.09	0.18	0.05	0.08	0.11	0.06	0.28	0.07	0.46	0.23
C2	0.04	0.09	0.04	0.05	0.09	0.12	0.12	0.14	0.11	0.02	0.09	0.18	0.05	0.07	0.17	0.10	0.24	0.12	0.41	0.21
C2'	0.09	0.07	0.09	0.12	0.04	0.16	0.12	0.20	0.13	0.06	0.07	0.16	0.09	0.15	0.11	0.12	0.32	0.13	0.37	0.15
C3'	0.16	0.07	0.17	0.22	0.11	0.26	0.19	0.31	0.21	0.13	0.07	0.12	0.14	0.25	0.16	0.20	0.40	0.27	0.22	0.11
C4	0.04	0.09	0.04	0.06	0.03	0.09	0.10	0.13	0.10	0.02	0.08	0.17	0.04	0.08	0.10	0.06	0.28	0.09	0.42	0.21
C4'	0.16	0.10	0.17	0.23	0.13	0.26	0.21	0.31	0.22	0.14	0.11	0.14	0.13	0.26	0.17	0.20	0.42	0.23	0.24	0.11
C5	0.03	0.10	0.03	0.06	0.07	0.07	0.09	0.12	0.09	0.03	0.11	0.17	0.06	0.08	0.08	0.04	0.30	0.09	0.38	0.20
C5'	0.36	0.31	0.39	0.47	0.38	0.49	0.45	0.56	0.45	0.37	0.33	0.27	0.30	0.51	0.40	0.42	0.68	0.51	0.17	0.36
C6	0.03	0.12	0.02	0.07	0.06	0.09	0.05	0.13	0.06	0.03	0.12	0.18	0.04	0.08	0.02	0.05	0.31	0.13	0.38	0.21
C8	0.04	0.10	0.02	0.05	0.11	0.04	0.12	0.10	0.09	0.03	0.12	0.17	0.10	0.06	0.14	0.03	0.30	0.06	0.39	0.20
N1	0.03	0.11	0.03	0.05	0.07	0.11	0.07	0.13	0.07	0.01	0.12	0.19	0.03	0.07	0.10	0.08	0.26	0.13	0.39	0.21
N3	0.05	0.08	0.04	0.05	0.07	0.11	0.13	0.13	0.11	0.02	0.06	0.17	0.04	0.07	0.15	0.08	0.25	0.10	0.44	0.22
N6	0.02	0.13	0.03	0.09	0.13	0.08	0.10	0.14	0.07	0.07	0.15	0.17	0.05	0.10	0.10	0.05	0.35	0.16	0.35	0.22
N7	0.04	0.11	0.02	0.05	0.12	0.03	0.12	0.09	0.09	0.04	0.13	0.17	0.11	0.06	0.14	0.03	0.31	0.07	0.37	0.19
N9	0.04	0.09	0.03	0.05	0.06	0.07	0.11	0.11	0.10	0.02	0.09	0.18	0.06	0.07	0.11	0.04	0.29	0.07	0.43	0.21
O2'	0.07	0.10	0.07	0.09	0.03	0.14	0.08	0.17	0.09	0.02	0.10	0.19	0.08	0.12	0.08	0.10	0.28	0.08	0.45	0.20
O3'	0.14	0.05	0.15	0.20	0.07	0.24	0.16	0.31	0.18	0.10	0.04	0.13	0.14	0.24	0.13	0.18	0.39	0.30	0.21	0.11
O4'	0.04	0.09	0.03	0.05	0.06	0.06	0.10	0.10	0.09	0.02	0.09	0.17	0.07	0.07	0.11	0.04	0.27	0.07	0.46	0.23
O5'	0.28	0.31	0.26	0.19	0.33	0.17	0.32	0.11	0.31	0.29	0.33	0.33	0.30	0.14	0.34	0.24	0.12	0.21	0.62	0.39
OP1	0.28	0.15	0.29	0.29	0.19	0.30	0.25	0.31	0.27	0.23	0.15	0.10	0.30	0.33	0.24	0.27	0.32	0.34	0.15	0.11
OP2	0.23	0.12	0.22	0.20	0.18	0.21	0.24	0.21	0.25	0.20	0.12	0.05	0.23	0.21	0.23	0.22	0.27	0.20	0.18	0.06
P	0.22	0.12	0.22	0.18	0.15	0.20	0.20	0.18	0.22	0.18	0.12	0.12	0.24	0.21	0.20	0.20	0.21	0.20	0.28	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.21	0.28	0.14
C2	0.01	0.00	0.06	0.10	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.03	0.08	0.12	0.28	0.17
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.04	0.12	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.31	0.40	0.21
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.10	0.00	0.09	0.01	0.08	0.07	0.10	0.13	0.03	0.01	0.10	0.01	0.02	0.33	0.39	0.22
C4	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.13	0.00	0.02	0.13	0.23	0.47	0.29
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.05	0.04	0.07	0.01	0.07	0.00	0.02	0.24	0.20	0.09
C5	0.00	0.00	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.04	0.14	0.26	0.52	0.32
C5'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.11	0.06	0.09	0.06	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.15	0.04	0.01
C6	0.00	0.00	0.05	0.08	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.00	0.04	0.13	0.19	0.41	0.26
N1	0.00	0.01	0.01	0.07	0.02	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.00	0.09	0.14	0.30	0.18
N3	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.01	0.02	0.10	0.15	0.35	0.22
O2	0.03	0.01	0.12	0.13	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.12	0.14	0.01	0.06	0.07	0.12	0.23	0.13
O2'	0.01	0.07	0.01	0.03	0.02	0.07	0.04	0.08	0.04	0.02	0.05	0.12	0.00	0.04	0.03	0.06	0.07	0.31	0.39	0.18
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.13	0.01	0.12	0.01	0.11	0.07	0.12	0.14	0.04	0.00	0.14	0.01	0.09	0.39	0.47	0.26
O4	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.14	0.00	0.02	0.14	0.29	0.55	0.33
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.00	0.02	0.06	0.06	0.01	0.02	0.00	0.09	0.17	0.20	0.10
O5'	0.08	0.08	0.04	0.02	0.13	0.02	0.14	0.01	0.13	0.09	0.10	0.07	0.07	0.09	0.14	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.21	0.12	0.31	0.33	0.23	0.24	0.26	0.15	0.19	0.14	0.15	0.12	0.31	0.39	0.29	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.28	0.40	0.39	0.47	0.20	0.52	0.04	0.41	0.30	0.35	0.23	0.39	0.47	0.55	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.17	0.21	0.22	0.29	0.09	0.32	0.01	0.26	0.18	0.22	0.13	0.18	0.26	0.33	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00