Doublet Group distance statistics: 49366

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.007, 0.023, 0.040, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.007, 0.024, 0.042, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.024 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.007, 0.026, 0.044, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.026 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.010, 0.036, 0.061, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.036 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.010, 0.036, 0.061, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.036 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.012, 0.043, 0.073, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.043 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.014, 0.048, 0.082, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.048 std_dev=0.034
C8	A	0, 0.017, 0.060, 0.102, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.060 std_dev=0.042
O2'	B	0, 0.099, 0.339, 0.580, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.339 std_dev=0.240
O4'	A	0, 0.167, 0.572, 0.976, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.572 std_dev=0.404
C2'	A	0, 0.174, 0.593, 1.012, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.593 std_dev=0.419
C4'	A	0, 0.214, 0.731, 1.247, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.731 std_dev=0.517
O2'	A	0, 0.224, 0.766, 1.307, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.766 std_dev=0.541
C3'	A	0, 0.263, 0.897, 1.530, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.897 std_dev=0.634
C2'	B	0, 0.276, 0.943, 1.610, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.943 std_dev=0.667
O3'	A	0, 0.351, 1.200, 2.049, 1.803 max_d=1.803 avg_d=1.200 std_dev=0.849
C5'	A	0, 0.418, 1.425, 2.433, 2.139 max_d=2.139 avg_d=1.425 std_dev=1.008
C4'	B	0, 0.488, 1.667, 2.846, 2.509 max_d=2.509 avg_d=1.667 std_dev=1.179
C1'	B	0, 0.541, 1.849, 3.157, 2.799 max_d=2.799 avg_d=1.849 std_dev=1.308
C3'	B	0, 0.553, 1.887, 3.221, 2.835 max_d=2.835 avg_d=1.887 std_dev=1.334
O4'	B	0, 0.577, 1.971, 3.364, 2.981 max_d=2.981 avg_d=1.971 std_dev=1.394
O3'	B	0, 0.672, 2.294, 3.917, 3.449 max_d=3.449 avg_d=2.294 std_dev=1.622
O2	B	0, 0.734, 2.506, 4.277, 3.767 max_d=3.767 avg_d=2.506 std_dev=1.772
C5'	B	0, 0.780, 2.662, 4.544, 4.003 max_d=4.003 avg_d=2.662 std_dev=1.882
N1	B	0, 0.871, 2.973, 5.076, 4.488 max_d=4.488 avg_d=2.973 std_dev=2.103
O5'	A	0, 0.893, 3.050, 5.207, 4.579 max_d=4.579 avg_d=3.050 std_dev=2.157
C2	B	0, 0.898, 3.067, 5.235, 4.619 max_d=4.619 avg_d=3.067 std_dev=2.168
O5'	B	0, 1.049, 3.583, 6.117, 5.390 max_d=5.390 avg_d=3.583 std_dev=2.534
C6	B	0, 1.182, 4.037, 6.891, 6.084 max_d=6.084 avg_d=4.037 std_dev=2.854
N3	B	0, 1.197, 4.087, 6.977, 6.158 max_d=6.158 avg_d=4.087 std_dev=2.890
P	A	0, 1.342, 4.582, 7.821, 6.885 max_d=6.885 avg_d=4.582 std_dev=3.240
P	B	0, 1.435, 4.898, 8.361, 7.369 max_d=7.369 avg_d=4.898 std_dev=3.463
OP1	B	0, 1.438, 4.908, 8.379, 7.381 max_d=7.381 avg_d=4.908 std_dev=3.471
C5	B	0, 1.490, 5.089, 8.688, 7.668 max_d=7.668 avg_d=5.089 std_dev=3.599
C4	B	0, 1.496, 5.107, 8.718, 7.696 max_d=7.696 avg_d=5.107 std_dev=3.611
OP1	A	0, 1.647, 5.622, 9.597, 8.448 max_d=8.448 avg_d=5.622 std_dev=3.975
OP2	A	0, 1.677, 5.726, 9.775, 8.600 max_d=8.600 avg_d=5.726 std_dev=4.049
OP2	B	0, 1.750, 5.974, 10.199, 8.985 max_d=8.985 avg_d=5.974 std_dev=4.225
O4	B	0, 1.750, 5.975, 10.200, 9.008 max_d=9.008 avg_d=5.975 std_dev=4.225

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.97	0.16	0.45
C2	0.02	0.00	0.12	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.11	0.10	0.23	1.40	0.44	0.76
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.08	0.12	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.54	0.11	0.16
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.05	0.07	0.01	0.07	0.03	0.01	0.00	0.01	0.24	0.19	0.32	0.08
C4	0.01	0.00	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.05	0.15	1.20	0.23	0.60
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.46	0.02	0.17
C5	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	1.09	0.08	0.51
C5'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.06	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.16	0.01
C6	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.12	1.18	0.15	0.58
C8	0.01	0.00	0.09	0.09	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.11	0.07	0.02	0.79	0.16	0.29
N1	0.02	0.00	0.08	0.05	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.08	0.19	1.33	0.33	0.70
N3	0.02	0.00	0.12	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.10	0.10	0.22	1.36	0.43	0.73
N6	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	1.10	0.05	0.51
N7	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.09	0.04	0.01	0.85	0.15	0.33
N9	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.09	1.02	0.09	0.47
O2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.07	0.12	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.52	0.01	0.16
O3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.11	0.08	0.10	0.01	0.09	0.03	0.00	0.00	0.01	0.39	0.22	0.47	0.33
O4'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.07	0.08	0.10	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.20	1.01	0.25	0.53
O5'	0.10	0.23	0.10	0.24	0.15	0.01	0.09	0.00	0.12	0.02	0.19	0.22	0.08	0.01	0.09	0.07	0.39	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.97	1.40	0.54	0.19	1.20	0.46	1.09	0.17	1.18	0.79	1.33	1.36	1.10	0.85	1.02	0.52	0.22	1.01	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.44	0.11	0.32	0.23	0.02	0.08	0.16	0.15	0.16	0.33	0.43	0.05	0.15	0.09	0.01	0.47	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.45	0.76	0.16	0.08	0.60	0.17	0.51	0.01	0.58	0.29	0.70	0.73	0.51	0.33	0.47	0.16	0.33	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.59	0.05	0.18	0.51	0.01	0.36	0.09	0.32	0.42	0.61	0.72	0.03	0.45	0.54	0.26	0.03	0.30	0.26	0.15
C2	0.23	0.36	0.05	0.31	0.20	0.12	0.10	0.20	0.10	0.22	0.31	0.51	0.03	0.58	0.20	0.14	0.17	0.39	0.40	0.28
C2'	0.36	0.72	0.03	0.19	0.75	0.05	0.57	0.10	0.47	0.52	0.82	0.81	0.10	0.51	0.83	0.26	0.02	0.25	0.11	0.07
C3'	0.33	0.68	0.04	0.14	0.74	0.02	0.57	0.06	0.46	0.49	0.79	0.75	0.09	0.41	0.83	0.24	0.06	0.19	0.07	0.02
C4	0.28	0.47	0.03	0.18	0.36	0.03	0.24	0.10	0.22	0.32	0.47	0.62	0.03	0.42	0.37	0.20	0.05	0.27	0.27	0.16
C4'	0.31	0.55	0.05	0.15	0.51	0.01	0.37	0.07	0.32	0.39	0.60	0.65	0.01	0.39	0.56	0.24	0.01	0.26	0.23	0.13
C5	0.24	0.41	0.05	0.10	0.31	0.02	0.22	0.03	0.20	0.28	0.40	0.55	0.03	0.26	0.32	0.18	0.01	0.15	0.20	0.09
C5'	0.25	0.44	0.04	0.12	0.39	0.01	0.27	0.06	0.24	0.31	0.47	0.53	0.02	0.30	0.43	0.19	0.02	0.23	0.24	0.13
C6	0.19	0.30	0.03	0.10	0.18	0.01	0.11	0.04	0.11	0.20	0.26	0.43	0.03	0.23	0.18	0.14	0.02	0.14	0.22	0.10
C8	0.28	0.50	0.07	0.07	0.44	0.04	0.33	0.01	0.29	0.35	0.53	0.60	0.02	0.25	0.48	0.22	0.05	0.13	0.14	0.05
N1	0.18	0.27	0.04	0.24	0.12	0.08	0.05	0.14	0.05	0.16	0.22	0.41	0.04	0.43	0.12	0.11	0.13	0.28	0.34	0.22
N3	0.28	0.45	0.02	0.28	0.31	0.09	0.19	0.18	0.17	0.30	0.43	0.61	0.02	0.56	0.31	0.19	0.14	0.39	0.37	0.26
N6	0.11	0.15	0.07	0.04	0.08	0.08	0.05	0.06	0.06	0.11	0.12	0.21	0.04	0.02	0.07	0.10	0.06	0.01	0.12	0.01
N7	0.24	0.43	0.08	0.02	0.37	0.06	0.28	0.03	0.25	0.31	0.45	0.53	0.02	0.16	0.40	0.19	0.07	0.06	0.11	0.01
N9	0.31	0.53	0.05	0.15	0.44	0.01	0.32	0.07	0.28	0.37	0.55	0.66	0.02	0.38	0.47	0.23	0.01	0.24	0.23	0.13
O2'	0.41	0.79	0.03	0.24	0.81	0.06	0.62	0.13	0.51	0.58	0.89	0.88	0.08	0.61	0.90	0.30	0.01	0.32	0.14	0.10
O3'	0.35	0.76	0.04	0.15	0.88	0.04	0.69	0.07	0.54	0.56	0.91	0.80	0.13	0.45	1.00	0.26	0.08	0.18	0.00	0.01
O4'	0.31	0.49	0.07	0.15	0.38	0.01	0.26	0.07	0.24	0.34	0.49	0.62	0.08	0.37	0.39	0.24	0.04	0.29	0.31	0.18
O5'	0.31	0.45	0.15	0.02	0.39	0.12	0.30	0.07	0.28	0.35	0.46	0.53	0.13	0.13	0.41	0.27	0.09	0.08	0.14	0.01
OP1	1.35	1.33	1.23	1.13	1.20	1.25	1.20	1.20	1.24	1.31	1.27	1.40	1.26	1.03	1.16	1.35	1.18	1.05	0.91	1.08
OP2	0.24	0.18	0.18	0.13	0.06	0.23	0.06	0.19	0.12	0.18	0.11	0.25	0.24	0.11	0.03	0.26	0.14	0.07	0.15	0.04
P	0.73	0.74	0.62	0.53	0.63	0.63	0.60	0.58	0.63	0.70	0.70	0.82	0.65	0.44	0.60	0.72	0.56	0.44	0.29	0.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.03	0.10	0.05
C2	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.06	0.14	0.09
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.04
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.03	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.03
C4	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.18	0.13
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01
C5	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.09	0.13	0.19	0.15
C5'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00
C6	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.09	0.12	0.17	0.13
N1	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.14	0.09
N3	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.08	0.16	0.11
O2	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.01	0.03	0.03	0.13	0.07
O2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.01
O3'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.03	0.08	0.04	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.11	0.02
O4	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.12	0.18	0.14
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02
O5'	0.04	0.05	0.01	0.02	0.07	0.00	0.09	0.00	0.09	0.06	0.05	0.03	0.02	0.04	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.06	0.02	0.02	0.11	0.01	0.13	0.01	0.12	0.07	0.08	0.03	0.02	0.01	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.14	0.12	0.10	0.18	0.06	0.19	0.03	0.17	0.14	0.16	0.13	0.09	0.11	0.18	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.09	0.04	0.03	0.13	0.01	0.15	0.00	0.13	0.09	0.11	0.07	0.01	0.02	0.14	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00