Doublet Group distance statistics: 49382

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 3, 3, 9, 11, 3, 3, 1, 0, 4, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.012, 0.017, 0.023, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.018, 0.027, 0.036, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.018, 0.046, 0.075, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.046 std_dev=0.028
O4	A	0, 0.029, 0.079, 0.129, 0.263 max_d=0.263 avg_d=0.079 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.066, 0.280, 0.493, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.280 std_dev=0.213
C2'	A	0, 0.127, 0.354, 0.582, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.354 std_dev=0.227
N3	B	0, 0.364, 0.613, 0.862, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.613 std_dev=0.249
C4	B	0, 0.373, 0.635, 0.897, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.635 std_dev=0.262
O2'	A	0, 0.186, 0.457, 0.729, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.457 std_dev=0.271
C2	B	0, 0.392, 0.671, 0.950, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.671 std_dev=0.279
N9	B	0, 0.330, 0.618, 0.906, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.618 std_dev=0.288
C5	B	0, 0.421, 0.714, 1.007, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.714 std_dev=0.293
C8	B	0, 0.388, 0.699, 1.010, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.699 std_dev=0.311
N7	B	0, 0.435, 0.751, 1.066, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.751 std_dev=0.316
C1'	B	0, 0.228, 0.550, 0.872, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.550 std_dev=0.322
N1	B	0, 0.422, 0.747, 1.072, 1.773 max_d=1.773 avg_d=0.747 std_dev=0.325
C6	B	0, 0.442, 0.772, 1.101, 1.714 max_d=1.714 avg_d=0.772 std_dev=0.329
C4'	A	0, 0.043, 0.375, 0.707, 1.689 max_d=1.689 avg_d=0.375 std_dev=0.332
C3'	A	0, 0.140, 0.477, 0.815, 1.727 max_d=1.727 avg_d=0.477 std_dev=0.338
C2'	B	0, 0.177, 0.527, 0.878, 1.657 max_d=1.657 avg_d=0.527 std_dev=0.351
O2'	B	0, 0.118, 0.481, 0.845, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.481 std_dev=0.363
N6	B	0, 0.497, 0.894, 1.290, 2.271 max_d=2.271 avg_d=0.894 std_dev=0.396
O3'	A	0, 0.265, 0.671, 1.076, 2.057 max_d=2.057 avg_d=0.671 std_dev=0.405
O4'	B	0, 0.153, 0.582, 1.012, 2.082 max_d=2.082 avg_d=0.582 std_dev=0.430
C3'	B	0, 0.086, 0.583, 1.080, 2.342 max_d=2.342 avg_d=0.583 std_dev=0.497
C4'	B	0, 0.049, 0.603, 1.156, 2.559 max_d=2.559 avg_d=0.603 std_dev=0.553
O3'	B	0, 0.170, 0.725, 1.280, 2.737 max_d=2.737 avg_d=0.725 std_dev=0.555
O5'	B	0, 1.579, 2.162, 2.744, 4.111 max_d=4.111 avg_d=2.162 std_dev=0.582
C5'	A	0, 0.197, 0.795, 1.392, 3.121 max_d=3.121 avg_d=0.795 std_dev=0.597
C5'	B	0, 0.038, 0.693, 1.348, 2.913 max_d=2.913 avg_d=0.693 std_dev=0.655
O5'	A	0, -0.140, 0.832, 1.804, 5.105 max_d=5.105 avg_d=0.832 std_dev=0.972
OP2	B	0, 2.741, 3.837, 4.933, 7.422 max_d=7.422 avg_d=3.837 std_dev=1.096
P	B	0, 1.104, 2.260, 3.417, 6.041 max_d=6.041 avg_d=2.260 std_dev=1.156
OP1	B	0, 2.054, 3.268, 4.483, 6.683 max_d=6.683 avg_d=3.268 std_dev=1.214
P	A	0, -0.323, 1.007, 2.337, 6.951 max_d=6.951 avg_d=1.007 std_dev=1.330
OP2	A	0, -0.321, 1.073, 2.467, 7.354 max_d=7.354 avg_d=1.073 std_dev=1.394
OP1	A	0, -0.252, 1.464, 3.181, 7.979 max_d=7.979 avg_d=1.464 std_dev=1.717

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.22	0.28	0.12
C2	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.02	0.05	0.15	0.56	0.29	0.25
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.05	0.16	0.00	0.01	0.05	0.01	0.15	0.20	0.23	0.13
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.08	0.06	0.11	0.14	0.01	0.01	0.09	0.01	0.21	0.22	0.26	0.16
C4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.10	0.01	0.02	0.32	0.92	0.60	0.50
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.03	0.03	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.22	0.27	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.10	0.01	0.03	0.39	0.94	0.73	0.60
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.12	0.06	0.07	0.04	0.05	0.04	0.11	0.01	0.01	0.33	0.33	0.01
C6	0.01	0.02	0.10	0.08	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.09	0.01	0.04	0.36	0.72	0.62	0.50
N1	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.01	0.20	0.51	0.38	0.30
N3	0.02	0.00	0.05	0.11	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.11	0.01	0.04	0.22	0.75	0.41	0.36
O2	0.03	0.01	0.16	0.14	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.12	0.16	0.03	0.08	0.07	0.45	0.17	0.15
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.07	0.05	0.09	0.05	0.08	0.04	0.05	0.12	0.00	0.04	0.08	0.05	0.09	0.19	0.18	0.06
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.10	0.02	0.10	0.04	0.09	0.05	0.11	0.16	0.04	0.00	0.11	0.02	0.20	0.38	0.25	0.16
O4	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.03	0.08	0.11	0.00	0.03	0.33	1.01	0.66	0.55
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.08	0.05	0.02	0.03	0.00	0.08	0.11	0.39	0.10
O5'	0.07	0.15	0.15	0.21	0.32	0.01	0.39	0.01	0.36	0.20	0.22	0.07	0.09	0.20	0.33	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.22	0.56	0.20	0.22	0.92	0.22	0.94	0.33	0.72	0.51	0.75	0.45	0.19	0.38	1.01	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.29	0.23	0.26	0.60	0.27	0.73	0.33	0.62	0.38	0.41	0.17	0.18	0.25	0.66	0.39	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.25	0.13	0.16	0.50	0.03	0.60	0.01	0.50	0.30	0.36	0.15	0.06	0.16	0.55	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.24	0.16	0.18	0.18	0.15	0.20	0.16	0.23	0.16	0.25	0.19	0.25	0.18	0.15	0.15	0.20	0.14	0.23	0.34	0.44	0.30
C2	0.14	0.23	0.17	0.21	0.18	0.16	0.22	0.18	0.26	0.18	0.27	0.18	0.28	0.20	0.16	0.16	0.23	0.14	0.32	0.37	0.58	0.41
C2'	0.14	0.12	0.12	0.13	0.07	0.14	0.06	0.14	0.10	0.09	0.14	0.07	0.12	0.06	0.11	0.15	0.14	0.16	0.20	0.45	0.36	0.24
C3'	0.21	0.12	0.23	0.26	0.10	0.27	0.08	0.27	0.10	0.15	0.14	0.09	0.11	0.10	0.16	0.28	0.31	0.25	0.33	0.53	0.46	0.36
C4	0.14	0.23	0.18	0.21	0.19	0.16	0.23	0.18	0.28	0.18	0.28	0.18	0.32	0.22	0.16	0.16	0.25	0.13	0.30	0.38	0.55	0.40
C4'	0.16	0.14	0.23	0.29	0.11	0.24	0.12	0.25	0.14	0.14	0.16	0.10	0.16	0.13	0.14	0.24	0.35	0.19	0.23	0.40	0.32	0.24
C5	0.14	0.24	0.17	0.20	0.18	0.16	0.22	0.17	0.27	0.17	0.28	0.18	0.31	0.20	0.16	0.16	0.24	0.14	0.25	0.37	0.47	0.33
C5'	0.19	0.13	0.27	0.35	0.10	0.29	0.11	0.32	0.13	0.16	0.15	0.08	0.15	0.13	0.15	0.28	0.46	0.23	0.27	0.45	0.34	0.27
C6	0.14	0.24	0.17	0.20	0.18	0.16	0.21	0.17	0.26	0.17	0.28	0.19	0.29	0.19	0.16	0.17	0.23	0.14	0.23	0.36	0.44	0.30
N1	0.13	0.24	0.16	0.19	0.18	0.15	0.21	0.16	0.25	0.16	0.27	0.19	0.27	0.19	0.16	0.15	0.22	0.13	0.26	0.36	0.48	0.34
N3	0.13	0.22	0.18	0.22	0.19	0.17	0.23	0.19	0.27	0.18	0.28	0.18	0.31	0.22	0.16	0.16	0.25	0.14	0.33	0.39	0.60	0.44
O2	0.15	0.22	0.18	0.22	0.19	0.18	0.22	0.20	0.25	0.18	0.25	0.19	0.27	0.21	0.17	0.18	0.24	0.15	0.36	0.37	0.63	0.45
O2'	0.14	0.13	0.17	0.17	0.08	0.15	0.08	0.14	0.10	0.11	0.13	0.09	0.11	0.08	0.11	0.17	0.18	0.15	0.21	0.44	0.36	0.26
O3'	0.34	0.16	0.35	0.40	0.21	0.42	0.18	0.43	0.16	0.26	0.17	0.18	0.16	0.21	0.27	0.42	0.45	0.40	0.57	0.71	0.74	0.60
O4	0.14	0.23	0.18	0.22	0.20	0.17	0.24	0.19	0.29	0.20	0.29	0.19	0.34	0.24	0.17	0.16	0.26	0.14	0.32	0.40	0.59	0.43
O4'	0.14	0.24	0.20	0.24	0.19	0.18	0.21	0.20	0.25	0.17	0.26	0.20	0.26	0.19	0.16	0.18	0.28	0.15	0.22	0.32	0.42	0.27
O5'	0.23	0.11	0.37	0.51	0.12	0.41	0.12	0.46	0.12	0.21	0.14	0.06	0.15	0.17	0.19	0.37	0.67	0.29	0.38	0.58	0.39	0.39
OP1	0.30	0.26	0.50	0.70	0.13	0.63	0.14	0.71	0.21	0.22	0.28	0.14	0.24	0.17	0.20	0.56	0.93	0.39	0.52	0.78	0.52	0.58
OP2	0.39	0.19	0.55	0.74	0.23	0.67	0.25	0.76	0.25	0.37	0.25	0.14	0.30	0.33	0.33	0.52	0.92	0.48	0.68	0.90	0.64	0.69
P	0.32	0.12	0.50	0.68	0.18	0.59	0.19	0.67	0.16	0.31	0.15	0.10	0.19	0.26	0.27	0.48	0.88	0.40	0.55	0.80	0.52	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.19	0.43	0.39	0.26
C2	0.05	0.00	0.12	0.10	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.14	0.04	0.27	0.56	0.46	0.35
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.05	0.09	0.12	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.19	0.27	0.39	0.23
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.07	0.11	0.08	0.10	0.08	0.11	0.05	0.02	0.01	0.01	0.31	0.17	0.53	0.30
C4	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.08	0.06	0.02	0.28	0.59	0.46	0.36
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.10	0.05	0.07	0.06	0.09	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.17	0.25	0.07
C5	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.07	0.01	0.33	0.68	0.53	0.41
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.08	0.01	0.14	0.00	0.14	0.18	0.10	0.06	0.17	0.19	0.09	0.04	0.04	0.01	0.01	0.17	0.26	0.01
C6	0.03	0.01	0.07	0.07	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.02	0.33	0.69	0.54	0.42
C8	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.12	0.03	0.35	0.69	0.54	0.42
N1	0.04	0.00	0.09	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.11	0.02	0.30	0.63	0.50	0.39
N3	0.05	0.00	0.12	0.10	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.13	0.04	0.25	0.52	0.44	0.32
N6	0.03	0.01	0.06	0.08	0.02	0.06	0.02	0.17	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.10	0.03	0.36	0.74	0.59	0.46
N7	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.12	0.03	0.37	0.75	0.58	0.45
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.28	0.57	0.46	0.34
O2'	0.01	0.16	0.01	0.02	0.08	0.03	0.06	0.04	0.10	0.03	0.13	0.15	0.09	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.08	0.22	0.32	0.13
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.06	0.02	0.07	0.04	0.09	0.12	0.11	0.13	0.10	0.12	0.05	0.04	0.00	0.01	0.42	0.23	0.74	0.42
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.26	0.40	0.45	0.29
O5'	0.19	0.27	0.19	0.31	0.28	0.02	0.33	0.01	0.33	0.35	0.30	0.25	0.36	0.37	0.28	0.08	0.42	0.26	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.43	0.56	0.27	0.17	0.59	0.17	0.68	0.17	0.69	0.69	0.63	0.52	0.74	0.75	0.57	0.22	0.23	0.40	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.39	0.46	0.39	0.53	0.46	0.25	0.53	0.26	0.54	0.54	0.50	0.44	0.59	0.58	0.46	0.32	0.74	0.45	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.26	0.35	0.23	0.30	0.36	0.07	0.41	0.01	0.42	0.42	0.39	0.32	0.46	0.45	0.34	0.13	0.42	0.29	0.00	0.00	0.01	0.00