Doublet Group distance statistics: 49384

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 0, 5, 8, 6, 2, 1, 1, 1, 0, 3, 1, 3, 1, 0, 2, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.011, 0.016, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.007, 0.012, 0.018, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.010, 0.017, 0.024, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.009, 0.016, 0.024, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.016 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.015, 0.029, 0.043, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.029 std_dev=0.014
O4	A	0, 0.119, 0.172, 0.225, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.172 std_dev=0.053
O4'	A	0, 0.121, 0.197, 0.274, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.197 std_dev=0.076
C2'	A	0, 0.127, 0.209, 0.291, 0.406 max_d=0.406 avg_d=0.209 std_dev=0.082
O2'	A	0, 0.140, 0.239, 0.339, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.239 std_dev=0.100
C4'	A	0, 0.173, 0.294, 0.415, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.294 std_dev=0.121
C3'	A	0, 0.183, 0.324, 0.465, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.324 std_dev=0.141
C5'	A	0, 0.301, 0.508, 0.716, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.508 std_dev=0.208
O3'	A	0, 0.285, 0.500, 0.715, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.500 std_dev=0.215
O5'	A	0, 0.352, 0.576, 0.800, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.576 std_dev=0.224
N9	B	0, 0.214, 0.456, 0.698, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.456 std_dev=0.242
C1'	B	0, 0.164, 0.429, 0.694, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.429 std_dev=0.265
C4	B	0, 0.256, 0.559, 0.863, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.559 std_dev=0.303
C8	B	0, 0.258, 0.562, 0.867, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.562 std_dev=0.304
O4'	B	0, 0.196, 0.527, 0.859, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.527 std_dev=0.332
P	A	0, 0.388, 0.722, 1.056, 2.137 max_d=2.137 avg_d=0.722 std_dev=0.334
N3	B	0, 0.191, 0.549, 0.906, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.549 std_dev=0.357
OP2	A	0, 0.437, 0.795, 1.153, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.795 std_dev=0.358
C4'	B	0, 0.219, 0.585, 0.952, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.585 std_dev=0.366
N7	B	0, 0.328, 0.723, 1.118, 1.817 max_d=1.817 avg_d=0.723 std_dev=0.395
C3'	B	0, 0.098, 0.500, 0.902, 1.652 max_d=1.652 avg_d=0.500 std_dev=0.402
C5	B	0, 0.332, 0.744, 1.157, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.744 std_dev=0.412
C5'	B	0, 0.288, 0.710, 1.132, 1.800 max_d=1.800 avg_d=0.710 std_dev=0.422
C2'	B	0, 0.004, 0.441, 0.878, 1.832 max_d=1.832 avg_d=0.441 std_dev=0.437
O5'	B	0, 0.245, 0.687, 1.128, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.687 std_dev=0.441
C2	B	0, 0.222, 0.745, 1.269, 1.950 max_d=1.950 avg_d=0.745 std_dev=0.523
OP1	A	0, 0.515, 1.068, 1.621, 3.633 max_d=3.633 avg_d=1.068 std_dev=0.553
C6	B	0, 0.360, 0.940, 1.520, 2.355 max_d=2.355 avg_d=0.940 std_dev=0.580
P	B	0, 0.422, 1.034, 1.646, 2.465 max_d=2.465 avg_d=1.034 std_dev=0.612
N1	B	0, 0.302, 0.939, 1.575, 2.542 max_d=2.542 avg_d=0.939 std_dev=0.636
O3'	B	0, -0.101, 0.566, 1.234, 2.314 max_d=2.314 avg_d=0.566 std_dev=0.667
O2'	B	0, -0.165, 0.514, 1.192, 2.572 max_d=2.572 avg_d=0.514 std_dev=0.678
OP1	B	0, 0.454, 1.148, 1.842, 2.848 max_d=2.848 avg_d=1.148 std_dev=0.694
N6	B	0, 0.419, 1.141, 1.863, 2.945 max_d=2.945 avg_d=1.141 std_dev=0.722
OP2	B	0, 0.427, 1.294, 2.161, 3.914 max_d=3.914 avg_d=1.294 std_dev=0.867

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.13	0.13	0.15
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.01	0.08	0.13	0.17	0.18
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.06	0.09	0.08
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.09	0.03	0.04	0.09	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.10	0.09	0.06
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.15	0.19	0.22	0.21
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.05	0.00	0.01	0.07	0.06	0.06
C5	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.03	0.19	0.22	0.25	0.23
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.09	0.01	0.12	0.00	0.11	0.05	0.06	0.03	0.03	0.03	0.09	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.03	0.17	0.20	0.21	0.21
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.10	0.15	0.16	0.18
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.01	0.11	0.15	0.19	0.19
O2	0.02	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.11	0.02	0.02	0.07	0.12	0.16	0.17
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.05	0.09	0.00	0.04	0.04	0.02	0.04	0.07	0.09	0.08
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.02	0.10	0.03	0.10	0.03	0.05	0.11	0.04	0.00	0.07	0.02	0.10	0.20	0.13	0.09
O4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.00	0.02	0.15	0.20	0.24	0.22
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.06	0.19	0.14	0.17
O5'	0.06	0.08	0.02	0.05	0.15	0.01	0.19	0.01	0.17	0.10	0.11	0.07	0.04	0.10	0.15	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.13	0.13	0.06	0.10	0.19	0.07	0.22	0.06	0.20	0.15	0.15	0.12	0.07	0.20	0.20	0.19	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.17	0.09	0.09	0.22	0.06	0.25	0.02	0.21	0.16	0.19	0.16	0.09	0.13	0.24	0.14	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.18	0.08	0.06	0.21	0.06	0.23	0.01	0.21	0.18	0.19	0.17	0.08	0.09	0.22	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.32	0.11	0.12	0.19	0.12	0.23	0.10	0.29	0.14	0.33	0.23	0.31	0.19	0.12	0.09	0.19	0.16	0.15	0.19	0.26	0.10
C2	0.10	0.24	0.09	0.09	0.16	0.11	0.23	0.09	0.30	0.16	0.31	0.15	0.34	0.22	0.12	0.11	0.14	0.14	0.17	0.14	0.35	0.16
C2'	0.10	0.16	0.23	0.20	0.09	0.15	0.13	0.16	0.18	0.08	0.19	0.09	0.20	0.12	0.06	0.26	0.30	0.17	0.16	0.23	0.24	0.16
C3'	0.10	0.18	0.29	0.27	0.10	0.17	0.13	0.20	0.17	0.08	0.20	0.12	0.19	0.11	0.07	0.35	0.41	0.20	0.16	0.34	0.16	0.19
C4	0.10	0.28	0.07	0.08	0.19	0.11	0.26	0.09	0.34	0.17	0.36	0.18	0.40	0.24	0.14	0.09	0.14	0.14	0.16	0.16	0.33	0.14
C4'	0.11	0.31	0.22	0.22	0.18	0.16	0.20	0.18	0.26	0.10	0.31	0.24	0.27	0.15	0.10	0.18	0.35	0.22	0.12	0.33	0.15	0.13
C5	0.12	0.33	0.08	0.10	0.21	0.12	0.27	0.10	0.35	0.17	0.39	0.22	0.40	0.24	0.14	0.08	0.16	0.16	0.14	0.19	0.28	0.11
C5'	0.13	0.34	0.22	0.23	0.20	0.19	0.22	0.22	0.29	0.11	0.35	0.26	0.31	0.16	0.11	0.18	0.38	0.25	0.12	0.39	0.17	0.17
C6	0.12	0.35	0.08	0.10	0.21	0.12	0.26	0.11	0.34	0.16	0.39	0.24	0.38	0.22	0.14	0.08	0.17	0.17	0.14	0.20	0.26	0.10
N1	0.11	0.30	0.08	0.10	0.19	0.11	0.24	0.10	0.31	0.15	0.35	0.20	0.34	0.21	0.12	0.09	0.16	0.16	0.15	0.17	0.28	0.12
N3	0.10	0.24	0.08	0.09	0.17	0.11	0.25	0.09	0.32	0.17	0.32	0.16	0.37	0.23	0.13	0.10	0.13	0.14	0.18	0.14	0.36	0.17
O2	0.11	0.20	0.12	0.11	0.15	0.12	0.21	0.11	0.27	0.16	0.26	0.14	0.31	0.21	0.12	0.14	0.15	0.14	0.19	0.12	0.39	0.19
O2'	0.12	0.13	0.26	0.22	0.08	0.15	0.12	0.15	0.15	0.08	0.16	0.09	0.17	0.12	0.07	0.31	0.29	0.17	0.18	0.20	0.27	0.18
O3'	0.16	0.14	0.39	0.36	0.11	0.25	0.13	0.28	0.15	0.14	0.16	0.11	0.17	0.14	0.12	0.52	0.52	0.25	0.24	0.44	0.24	0.31
O4	0.10	0.27	0.07	0.08	0.19	0.10	0.27	0.08	0.35	0.18	0.36	0.18	0.42	0.25	0.14	0.09	0.13	0.13	0.17	0.16	0.34	0.15
O4'	0.13	0.41	0.14	0.16	0.25	0.15	0.28	0.13	0.36	0.16	0.42	0.31	0.38	0.23	0.16	0.10	0.24	0.19	0.14	0.26	0.25	0.11
O5'	0.12	0.29	0.21	0.23	0.16	0.19	0.19	0.22	0.26	0.10	0.31	0.21	0.28	0.14	0.10	0.18	0.37	0.24	0.13	0.37	0.15	0.17
OP1	0.15	0.26	0.17	0.22	0.14	0.23	0.15	0.26	0.22	0.10	0.27	0.19	0.23	0.11	0.11	0.17	0.36	0.25	0.20	0.55	0.27	0.30
OP2	0.14	0.26	0.16	0.19	0.15	0.19	0.18	0.22	0.25	0.10	0.29	0.18	0.28	0.14	0.10	0.13	0.33	0.25	0.12	0.39	0.13	0.16
P	0.16	0.25	0.14	0.18	0.14	0.20	0.16	0.22	0.22	0.09	0.27	0.18	0.24	0.12	0.10	0.12	0.32	0.26	0.12	0.42	0.16	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.16	0.10	0.24	0.12
C2	0.03	0.00	0.14	0.13	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.18	0.05	0.25	0.16	0.51	0.28
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.02	0.02	0.01	0.04	0.09	0.09	0.15	0.03	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.16	0.18	0.06
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.17	0.09	0.13	0.08	0.15	0.06	0.02	0.01	0.02	0.08	0.18	0.16	0.08
C4	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.07	0.02	0.28	0.15	0.51	0.30
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.08	0.04	0.05	0.06	0.08	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.17	0.03	0.07
C5	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.35	0.27	0.66	0.41
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.13	0.13	0.11	0.07	0.15	0.15	0.07	0.05	0.05	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.02	0.34	0.30	0.70	0.42
C8	0.01	0.01	0.09	0.17	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.19	0.04	0.38	0.26	0.62	0.40
N1	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.12	0.03	0.30	0.23	0.62	0.36
N3	0.03	0.00	0.15	0.13	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.17	0.05	0.22	0.12	0.43	0.23
N6	0.02	0.01	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.10	0.03	0.37	0.38	0.79	0.49
N7	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.18	0.04	0.40	0.35	0.74	0.48
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.27	0.12	0.45	0.27
O2'	0.01	0.16	0.01	0.02	0.08	0.05	0.05	0.05	0.08	0.06	0.13	0.16	0.07	0.05	0.02	0.00	0.05	0.05	0.05	0.26	0.10	0.06
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.07	0.01	0.08	0.05	0.08	0.19	0.12	0.17	0.10	0.18	0.06	0.05	0.00	0.01	0.11	0.29	0.20	0.17
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.14	0.13	0.19	0.13
O5'	0.16	0.25	0.10	0.08	0.28	0.01	0.35	0.01	0.34	0.38	0.30	0.22	0.37	0.40	0.27	0.05	0.11	0.14	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.10	0.16	0.16	0.18	0.15	0.17	0.27	0.07	0.30	0.26	0.23	0.12	0.38	0.35	0.12	0.26	0.29	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.24	0.51	0.18	0.16	0.51	0.03	0.66	0.02	0.70	0.62	0.62	0.43	0.79	0.74	0.45	0.10	0.20	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.28	0.06	0.08	0.30	0.07	0.41	0.01	0.42	0.40	0.36	0.23	0.49	0.48	0.27	0.06	0.17	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00