Doublet Group distance statistics: 49390

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.010, 0.032, 0.053, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.032 std_dev=0.021
O4	A	0, 0.039, 0.099, 0.159, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.099 std_dev=0.060
O2'	A	0, 0.077, 0.185, 0.293, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.185 std_dev=0.108
C2'	A	0, 0.053, 0.177, 0.300, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.177 std_dev=0.124
O4'	A	0, 0.002, 0.165, 0.328, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.165 std_dev=0.163
C3'	A	0, 0.049, 0.283, 0.517, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.283 std_dev=0.234
C4'	A	0, 0.012, 0.263, 0.515, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.263 std_dev=0.252
O3'	A	0, 0.092, 0.387, 0.682, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.387 std_dev=0.295
N3	B	0, 0.238, 0.659, 1.081, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.659 std_dev=0.422
C5'	A	0, 0.016, 0.464, 0.913, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.464 std_dev=0.448
C4	B	0, 0.241, 0.712, 1.184, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.712 std_dev=0.471
O5'	A	0, 0.004, 0.525, 1.046, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.525 std_dev=0.521
N1	B	0, 0.343, 0.943, 1.544, 1.606 max_d=1.606 avg_d=0.943 std_dev=0.601
C2	B	0, 0.437, 1.061, 1.685, 1.610 max_d=1.610 avg_d=1.061 std_dev=0.624
C1'	B	0, 0.314, 1.064, 1.815, 2.123 max_d=2.123 avg_d=1.064 std_dev=0.751
N9	B	0, 0.509, 1.314, 2.120, 2.189 max_d=2.189 avg_d=1.314 std_dev=0.805
O2'	B	0, 0.529, 1.382, 2.236, 2.260 max_d=2.260 avg_d=1.382 std_dev=0.853
C6	B	0, 0.407, 1.284, 2.161, 2.436 max_d=2.436 avg_d=1.284 std_dev=0.877
C5	B	0, 0.592, 1.497, 2.402, 2.386 max_d=2.386 avg_d=1.497 std_dev=0.905
C2'	B	0, 0.532, 1.438, 2.345, 2.495 max_d=2.495 avg_d=1.438 std_dev=0.906
P	A	0, -0.251, 0.852, 1.955, 2.723 max_d=2.723 avg_d=0.852 std_dev=1.103
OP2	A	0, -0.094, 1.027, 2.149, 2.893 max_d=2.893 avg_d=1.027 std_dev=1.121
O4'	B	0, 0.342, 1.513, 2.685, 3.290 max_d=3.290 avg_d=1.513 std_dev=1.172
N6	B	0, 0.698, 2.013, 3.329, 3.685 max_d=3.685 avg_d=2.013 std_dev=1.316
OP1	A	0, -0.215, 1.144, 2.503, 3.443 max_d=3.443 avg_d=1.144 std_dev=1.359
C3'	B	0, 0.739, 2.113, 3.487, 3.838 max_d=3.838 avg_d=2.113 std_dev=1.374
C8	B	0, 0.999, 2.383, 3.767, 3.411 max_d=3.411 avg_d=2.383 std_dev=1.384
C4'	B	0, 0.537, 1.972, 3.408, 4.053 max_d=4.053 avg_d=1.972 std_dev=1.436
N7	B	0, 1.057, 2.527, 3.998, 3.645 max_d=3.645 avg_d=2.527 std_dev=1.470
O3'	B	0, 0.915, 2.595, 4.274, 4.670 max_d=4.670 avg_d=2.595 std_dev=1.680
C5'	B	0, 0.719, 2.633, 4.548, 5.411 max_d=5.411 avg_d=2.633 std_dev=1.915
O5'	B	0, 0.961, 2.979, 4.996, 5.680 max_d=5.680 avg_d=2.979 std_dev=2.017
OP2	B	0, 1.160, 3.673, 6.186, 7.029 max_d=7.029 avg_d=3.673 std_dev=2.513
P	B	0, 1.293, 3.935, 6.577, 7.411 max_d=7.411 avg_d=3.935 std_dev=2.642
OP1	B	0, 1.756, 5.076, 8.396, 9.295 max_d=9.295 avg_d=5.076 std_dev=3.320

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.14	0.10	0.09
C2	0.01	0.00	0.09	0.12	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.13	0.01	0.02	0.19	0.31	0.30	0.24
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.06	0.01	0.06	0.15	0.00	0.01	0.03	0.01	0.06	0.25	0.11	0.12
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.04	0.02	0.05	0.04	0.11	0.17	0.03	0.00	0.09	0.01	0.05	0.28	0.10	0.14
C4	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.02	0.21	0.32	0.35	0.28
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.06	0.05	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.10	0.01	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.04	0.18	0.23	0.25	0.22
C5'	0.03	0.10	0.03	0.02	0.14	0.01	0.14	0.00	0.11	0.08	0.13	0.09	0.06	0.02	0.15	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.14	0.17	0.17	0.17
N1	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.14	0.21	0.20	0.17
N3	0.00	0.00	0.06	0.11	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.12	0.01	0.01	0.22	0.35	0.36	0.28
O2	0.01	0.00	0.15	0.17	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.19	0.02	0.04	0.18	0.34	0.32	0.24
O2'	0.01	0.03	0.00	0.03	0.03	0.05	0.05	0.06	0.04	0.02	0.03	0.06	0.00	0.05	0.03	0.04	0.08	0.26	0.12	0.13
O3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.06	0.04	0.12	0.19	0.05	0.00	0.10	0.01	0.03	0.33	0.12	0.16
O4	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.10	0.00	0.02	0.23	0.35	0.41	0.31
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.05	0.08	0.09
O5'	0.07	0.19	0.06	0.05	0.21	0.01	0.18	0.01	0.14	0.14	0.22	0.18	0.08	0.03	0.23	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.14	0.31	0.25	0.28	0.32	0.10	0.23	0.03	0.17	0.21	0.35	0.34	0.26	0.33	0.35	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.10	0.30	0.11	0.10	0.35	0.01	0.25	0.02	0.17	0.20	0.36	0.32	0.12	0.12	0.41	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.24	0.12	0.14	0.28	0.03	0.22	0.01	0.17	0.17	0.28	0.24	0.13	0.16	0.31	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.27	0.29	0.33	0.14	0.21	0.19	0.19	0.25	0.13	0.29	0.19	0.28	0.17	0.08	0.30	0.45	0.07	0.18	0.24	0.21	0.13
C2	0.09	0.28	0.18	0.21	0.21	0.05	0.34	0.03	0.43	0.24	0.42	0.14	0.51	0.33	0.15	0.20	0.35	0.16	0.03	0.14	0.13	0.14
C2'	0.12	0.40	0.18	0.18	0.27	0.13	0.32	0.11	0.38	0.24	0.41	0.31	0.40	0.29	0.19	0.24	0.26	0.13	0.11	0.05	0.22	0.11
C3'	0.21	0.46	0.24	0.25	0.32	0.19	0.34	0.18	0.39	0.27	0.44	0.40	0.39	0.30	0.26	0.31	0.33	0.20	0.19	0.11	0.27	0.18
C4	0.14	0.30	0.17	0.18	0.22	0.12	0.37	0.12	0.49	0.27	0.46	0.16	0.61	0.38	0.17	0.24	0.34	0.24	0.09	0.21	0.15	0.21
C4'	0.17	0.31	0.32	0.38	0.18	0.29	0.17	0.29	0.20	0.18	0.27	0.27	0.20	0.17	0.16	0.36	0.51	0.16	0.28	0.35	0.31	0.25
C5	0.12	0.31	0.22	0.24	0.19	0.14	0.32	0.12	0.43	0.21	0.43	0.16	0.52	0.31	0.13	0.28	0.39	0.20	0.06	0.17	0.09	0.11
C5'	0.19	0.36	0.33	0.41	0.22	0.31	0.19	0.32	0.23	0.19	0.31	0.32	0.22	0.18	0.18	0.37	0.56	0.18	0.30	0.39	0.33	0.28
C6	0.10	0.30	0.25	0.27	0.17	0.16	0.27	0.13	0.37	0.16	0.39	0.16	0.44	0.25	0.09	0.30	0.42	0.15	0.09	0.16	0.11	0.04
N1	0.07	0.29	0.23	0.26	0.17	0.13	0.27	0.10	0.36	0.17	0.37	0.16	0.42	0.25	0.10	0.26	0.40	0.11	0.07	0.14	0.12	0.03
N3	0.13	0.29	0.15	0.17	0.23	0.08	0.38	0.10	0.49	0.29	0.46	0.15	0.61	0.39	0.18	0.20	0.32	0.22	0.09	0.21	0.17	0.22
O2	0.08	0.26	0.17	0.21	0.22	0.02	0.35	0.03	0.44	0.26	0.41	0.12	0.51	0.35	0.17	0.16	0.34	0.14	0.08	0.16	0.17	0.17
O2'	0.12	0.22	0.21	0.21	0.13	0.17	0.17	0.16	0.17	0.19	0.18	0.20	0.20	0.21	0.13	0.21	0.24	0.12	0.16	0.15	0.23	0.12
O3'	0.33	0.49	0.34	0.37	0.39	0.31	0.38	0.30	0.41	0.35	0.46	0.47	0.40	0.36	0.35	0.39	0.42	0.31	0.33	0.25	0.40	0.33
O4	0.15	0.32	0.15	0.16	0.24	0.11	0.41	0.14	0.52	0.32	0.49	0.17	0.67	0.43	0.20	0.22	0.32	0.26	0.14	0.27	0.21	0.28
O4'	0.14	0.26	0.36	0.43	0.13	0.31	0.13	0.32	0.17	0.14	0.23	0.21	0.18	0.14	0.12	0.36	0.58	0.14	0.31	0.40	0.33	0.28
O5'	0.22	0.51	0.29	0.33	0.34	0.23	0.34	0.22	0.41	0.24	0.49	0.43	0.42	0.28	0.25	0.34	0.49	0.20	0.21	0.22	0.26	0.16
OP1	0.59	0.75	0.50	0.53	0.63	0.55	0.60	0.55	0.63	0.56	0.71	0.72	0.61	0.56	0.59	0.54	0.62	0.62	0.53	0.40	0.57	0.51
OP2	0.39	0.74	0.33	0.37	0.53	0.36	0.55	0.35	0.65	0.41	0.75	0.62	0.68	0.47	0.42	0.41	0.50	0.43	0.33	0.19	0.41	0.33
P	0.38	0.63	0.34	0.39	0.46	0.35	0.45	0.34	0.52	0.36	0.61	0.55	0.52	0.38	0.39	0.41	0.52	0.39	0.32	0.23	0.37	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.11	0.05
C2	0.00	0.00	0.20	0.18	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.25	0.10	0.09	0.11	0.25	0.17
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.15	0.14	0.20	0.06	0.11	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.07	0.04
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.10	0.00	0.09	0.01	0.11	0.17	0.15	0.18	0.11	0.15	0.06	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.10	0.08
C4	0.00	0.01	0.09	0.10	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.13	0.05	0.09	0.11	0.22	0.14
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.08	0.03	0.01	0.07	0.08	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.07	0.01	0.01
C5	0.00	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.03	0.14	0.18	0.29	0.18
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.12	0.12	0.10	0.05	0.13	0.14	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.15	0.05	0.14	0.20	0.32	0.21
C8	0.01	0.01	0.15	0.17	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.20	0.06	0.15	0.18	0.24	0.15
N1	0.01	0.00	0.14	0.15	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.20	0.08	0.12	0.16	0.29	0.19
N3	0.00	0.00	0.20	0.18	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.23	0.10	0.07	0.08	0.21	0.14
N6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.03	0.17	0.24	0.36	0.23
N7	0.01	0.01	0.11	0.15	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.19	0.03	0.17	0.23	0.32	0.20
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.08	0.10	0.18	0.10
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.07	0.05	0.01	0.05	0.04	0.11	0.11	0.18	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.03	0.05	0.13	0.06	0.05
O3'	0.01	0.25	0.01	0.01	0.13	0.02	0.12	0.03	0.15	0.20	0.20	0.23	0.16	0.19	0.06	0.02	0.00	0.02	0.10	0.25	0.20	0.16
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.08	0.10	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.12	0.12	0.08
O5'	0.02	0.09	0.04	0.07	0.09	0.01	0.14	0.01	0.14	0.15	0.12	0.07	0.17	0.17	0.08	0.05	0.10	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.06	0.11	0.09	0.14	0.11	0.07	0.18	0.07	0.20	0.18	0.16	0.08	0.24	0.23	0.10	0.13	0.25	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.25	0.07	0.10	0.22	0.01	0.29	0.01	0.32	0.24	0.29	0.21	0.36	0.32	0.18	0.06	0.20	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.17	0.04	0.08	0.14	0.01	0.18	0.01	0.21	0.15	0.19	0.14	0.23	0.20	0.10	0.05	0.16	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00