Doublet Group distance statistics: 49395

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 7, 19, 19, 15, 18, 12, 13, 15, 6, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.009, 0.019, 0.028, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.002, 0.013, 0.023, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.007, 0.020, 0.034, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.020 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.017, 0.047, 0.077, 0.207 max_d=0.207 avg_d=0.047 std_dev=0.030
O4	A	0, 0.026, 0.073, 0.121, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.073 std_dev=0.048
O4'	A	0, 0.068, 0.138, 0.209, 0.331 max_d=0.331 avg_d=0.138 std_dev=0.071
C2'	A	0, 0.089, 0.172, 0.254, 0.382 max_d=0.382 avg_d=0.172 std_dev=0.083
C4'	A	0, 0.095, 0.200, 0.304, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.200 std_dev=0.104
O2'	A	0, 0.165, 0.281, 0.397, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.281 std_dev=0.116
C3'	A	0, 0.148, 0.268, 0.387, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.268 std_dev=0.119
O3'	A	0, 0.227, 0.410, 0.592, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.410 std_dev=0.182
C5'	A	0, 0.204, 0.388, 0.571, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.388 std_dev=0.184
C2'	B	0, 0.180, 0.396, 0.612, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.396 std_dev=0.216
N9	B	0, 0.244, 0.461, 0.679, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.461 std_dev=0.218
C1'	B	0, 0.217, 0.440, 0.662, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.440 std_dev=0.222
O2'	B	0, 0.184, 0.410, 0.635, 1.727 max_d=1.727 avg_d=0.410 std_dev=0.225
C4	B	0, 0.242, 0.471, 0.701, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.471 std_dev=0.229
N3	B	0, 0.229, 0.460, 0.691, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.460 std_dev=0.231
O5'	A	0, 0.286, 0.520, 0.753, 1.818 max_d=1.818 avg_d=0.520 std_dev=0.233
C8	B	0, 0.280, 0.518, 0.757, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.518 std_dev=0.238
N7	B	0, 0.296, 0.554, 0.812, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.554 std_dev=0.258
C5	B	0, 0.277, 0.536, 0.795, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.536 std_dev=0.259
C2	B	0, 0.272, 0.535, 0.798, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.535 std_dev=0.263
C3'	B	0, 0.192, 0.457, 0.723, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.457 std_dev=0.266
N2	B	0, 0.294, 0.573, 0.851, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.573 std_dev=0.279
O4'	B	0, 0.255, 0.536, 0.816, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.536 std_dev=0.281
P	A	0, 0.326, 0.610, 0.895, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.610 std_dev=0.284
O3'	B	0, 0.182, 0.466, 0.751, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.466 std_dev=0.285
N1	B	0, 0.316, 0.610, 0.904, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.610 std_dev=0.294
C4'	B	0, 0.247, 0.542, 0.837, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.542 std_dev=0.295
C6	B	0, 0.313, 0.609, 0.904, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.609 std_dev=0.295
OP2	A	0, 0.308, 0.633, 0.959, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.633 std_dev=0.325
O6	B	0, 0.358, 0.689, 1.020, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.689 std_dev=0.331
C5'	B	0, 0.283, 0.633, 0.982, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.633 std_dev=0.350
O5'	B	0, 0.297, 0.653, 1.009, 1.924 max_d=1.924 avg_d=0.653 std_dev=0.356
OP1	A	0, 0.400, 0.771, 1.142, 1.848 max_d=1.848 avg_d=0.771 std_dev=0.371
P	B	0, 0.306, 0.722, 1.138, 2.195 max_d=2.195 avg_d=0.722 std_dev=0.416
OP2	B	0, 0.353, 0.772, 1.191, 2.127 max_d=2.127 avg_d=0.772 std_dev=0.419
OP1	B	0, 0.289, 0.738, 1.188, 2.703 max_d=2.703 avg_d=0.738 std_dev=0.450

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.11	0.11	0.16	0.10
C2	0.03	0.00	0.06	0.07	0.01	0.04	0.02	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.01	0.03	0.17	0.18	0.25	0.17
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.09	0.00	0.02	0.06	0.01	0.10	0.16	0.11	0.09
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.10	0.06	0.08	0.09	0.02	0.01	0.10	0.01	0.13	0.19	0.11	0.13
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.11	0.00	0.03	0.22	0.25	0.33	0.24
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.04	0.04	0.06	0.08	0.02	0.06	0.00	0.02	0.09	0.09	0.02
C5	0.02	0.02	0.05	0.10	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.12	0.01	0.04	0.23	0.26	0.33	0.25
C5'	0.04	0.09	0.03	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.13	0.09	0.11	0.08	0.07	0.05	0.14	0.02	0.01	0.10	0.12	0.02
C6	0.02	0.02	0.04	0.10	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.10	0.01	0.03	0.21	0.22	0.28	0.21
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.02	0.17	0.17	0.23	0.16
N3	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.01	0.03	0.20	0.22	0.29	0.21
O2	0.05	0.01	0.09	0.09	0.02	0.06	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.11	0.11	0.02	0.05	0.16	0.16	0.23	0.15
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.06	0.08	0.04	0.07	0.03	0.03	0.08	0.11	0.00	0.04	0.07	0.05	0.10	0.18	0.09	0.09
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.11	0.02	0.12	0.05	0.10	0.06	0.09	0.11	0.04	0.00	0.13	0.03	0.16	0.27	0.19	0.19
O4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.13	0.00	0.04	0.22	0.27	0.35	0.26
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.05	0.05	0.03	0.04	0.00	0.10	0.10	0.16	0.10
O5'	0.11	0.17	0.10	0.13	0.22	0.02	0.23	0.01	0.21	0.17	0.20	0.16	0.10	0.16	0.22	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.18	0.16	0.19	0.25	0.09	0.26	0.10	0.22	0.17	0.22	0.16	0.18	0.27	0.27	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.25	0.11	0.11	0.33	0.09	0.33	0.12	0.28	0.23	0.29	0.23	0.09	0.19	0.35	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.17	0.09	0.13	0.24	0.02	0.25	0.02	0.21	0.16	0.21	0.15	0.09	0.19	0.26	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.15	0.13	0.13	0.14	0.14	0.14	0.14	0.15	0.14	0.16	0.18	0.14	0.14	0.14	0.14	0.15	0.17	0.14	0.16	0.15	0.19	0.15
C2	0.15	0.17	0.14	0.13	0.16	0.14	0.17	0.15	0.18	0.16	0.19	0.19	0.16	0.16	0.16	0.13	0.14	0.17	0.15	0.19	0.16	0.22	0.16
C2'	0.13	0.14	0.12	0.11	0.13	0.12	0.13	0.13	0.13	0.13	0.14	0.16	0.13	0.13	0.13	0.12	0.11	0.16	0.12	0.14	0.14	0.17	0.13
C3'	0.17	0.14	0.13	0.12	0.14	0.17	0.14	0.17	0.14	0.16	0.14	0.16	0.14	0.15	0.15	0.12	0.12	0.21	0.16	0.14	0.17	0.19	0.17
C4	0.15	0.18	0.13	0.13	0.16	0.14	0.17	0.15	0.19	0.16	0.20	0.20	0.16	0.17	0.15	0.13	0.14	0.17	0.15	0.21	0.15	0.21	0.16
C4'	0.16	0.14	0.13	0.14	0.12	0.17	0.12	0.17	0.13	0.14	0.13	0.16	0.13	0.13	0.14	0.15	0.16	0.19	0.15	0.13	0.18	0.17	0.16
C5	0.15	0.17	0.13	0.13	0.15	0.14	0.16	0.15	0.18	0.15	0.19	0.19	0.15	0.16	0.15	0.13	0.15	0.17	0.14	0.20	0.15	0.20	0.15
C5'	0.18	0.14	0.16	0.19	0.13	0.21	0.13	0.22	0.13	0.16	0.13	0.16	0.13	0.14	0.15	0.18	0.22	0.21	0.19	0.13	0.24	0.19	0.20
C6	0.15	0.16	0.13	0.13	0.14	0.14	0.15	0.14	0.17	0.14	0.18	0.19	0.15	0.15	0.14	0.14	0.15	0.17	0.14	0.18	0.15	0.19	0.15
N1	0.15	0.16	0.13	0.13	0.14	0.14	0.15	0.14	0.16	0.15	0.17	0.19	0.15	0.15	0.14	0.13	0.14	0.16	0.14	0.17	0.15	0.20	0.15
N3	0.15	0.18	0.14	0.13	0.17	0.14	0.18	0.15	0.20	0.16	0.20	0.20	0.17	0.17	0.16	0.13	0.14	0.17	0.15	0.21	0.16	0.22	0.17
O2	0.16	0.18	0.15	0.15	0.17	0.15	0.18	0.17	0.18	0.17	0.19	0.19	0.17	0.18	0.17	0.14	0.15	0.18	0.17	0.19	0.18	0.23	0.18
O2'	0.13	0.15	0.15	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.14	0.13	0.14	0.16	0.14	0.13	0.13	0.18	0.15	0.15	0.13	0.14	0.14	0.17	0.13
O3'	0.22	0.16	0.19	0.18	0.19	0.21	0.19	0.22	0.18	0.22	0.16	0.16	0.17	0.21	0.21	0.19	0.17	0.26	0.21	0.18	0.23	0.24	0.22
O4	0.15	0.19	0.13	0.13	0.17	0.14	0.18	0.15	0.21	0.16	0.21	0.20	0.17	0.18	0.16	0.13	0.14	0.17	0.15	0.23	0.16	0.22	0.16
O4'	0.16	0.15	0.14	0.15	0.14	0.16	0.14	0.16	0.15	0.15	0.16	0.18	0.14	0.14	0.15	0.17	0.17	0.18	0.15	0.16	0.17	0.19	0.16
O5'	0.16	0.15	0.15	0.18	0.12	0.21	0.12	0.22	0.13	0.15	0.15	0.19	0.13	0.13	0.14	0.17	0.22	0.20	0.19	0.14	0.23	0.20	0.20
OP1	0.24	0.19	0.23	0.27	0.19	0.30	0.19	0.32	0.18	0.23	0.18	0.21	0.18	0.21	0.22	0.23	0.31	0.28	0.30	0.18	0.37	0.29	0.32
OP2	0.18	0.17	0.16	0.19	0.13	0.23	0.13	0.24	0.15	0.15	0.17	0.21	0.14	0.14	0.15	0.17	0.23	0.23	0.21	0.16	0.26	0.21	0.22
P	0.18	0.15	0.17	0.21	0.13	0.24	0.12	0.25	0.13	0.16	0.15	0.19	0.13	0.14	0.15	0.18	0.25	0.22	0.22	0.13	0.28	0.22	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.03	0.07	0.11	0.07
C2	0.04	0.00	0.08	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.08	0.06	0.09	0.02	0.10	0.18	0.11
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.04	0.07	0.10	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.05	0.08	0.09	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.05	0.08	0.06	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.06	0.11	0.08	0.06
C4	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.03	0.09	0.02	0.09	0.17	0.11
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.04	0.06	0.04	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.06	0.08	0.05	0.03
C5	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.11	0.02	0.13	0.20	0.13
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.09	0.09	0.08	0.07	0.06	0.10	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.11	0.09	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.06	0.04	0.12	0.01	0.14	0.21	0.15
C8	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.04	0.10	0.02	0.11	0.16	0.12
N1	0.03	0.01	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.07	0.05	0.10	0.01	0.12	0.20	0.13
N2	0.05	0.01	0.10	0.08	0.02	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.14	0.11	0.07	0.09	0.02	0.09	0.18	0.11
N3	0.04	0.01	0.08	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.07	0.06	0.08	0.02	0.08	0.16	0.10
N7	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.04	0.12	0.02	0.14	0.20	0.15
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.08	0.02	0.08	0.14	0.09
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.10	0.14	0.11	0.03	0.03	0.00	0.04	0.05	0.04	0.07	0.10	0.08	0.05
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.03	0.06	0.08	0.07	0.11	0.07	0.08	0.04	0.04	0.00	0.01	0.09	0.07	0.16	0.11	0.10
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.07	0.06	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.05	0.10	0.12	0.10
O5'	0.05	0.09	0.04	0.06	0.09	0.02	0.11	0.01	0.12	0.10	0.10	0.09	0.08	0.12	0.08	0.04	0.09	0.07	0.00	0.13	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.05	0.06	0.02	0.06	0.02	0.11	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.07	0.05	0.13	0.00	0.17	0.23	0.17
OP1	0.07	0.10	0.08	0.11	0.09	0.08	0.13	0.09	0.14	0.11	0.12	0.09	0.08	0.14	0.08	0.10	0.16	0.10	0.02	0.17	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.18	0.09	0.08	0.17	0.05	0.20	0.03	0.21	0.16	0.20	0.18	0.16	0.20	0.14	0.08	0.11	0.12	0.02	0.23	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.11	0.05	0.06	0.11	0.03	0.13	0.02	0.15	0.12	0.13	0.11	0.10	0.15	0.09	0.05	0.10	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00