Doublet Group distance statistics: 49398

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 3, 3, 1, 2, 6, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.007, 0.022, 0.036, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.009, 0.024, 0.038, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.024 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.026, 0.051, 0.076, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.051 std_dev=0.025
O4	A	0, 0.028, 0.062, 0.096, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.062 std_dev=0.034
C2'	A	0, 0.041, 0.152, 0.263, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.152 std_dev=0.111
O2'	A	0, 0.098, 0.210, 0.322, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.210 std_dev=0.112
O4'	A	0, 0.020, 0.134, 0.249, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.134 std_dev=0.114
C4'	A	0, 0.057, 0.228, 0.399, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.228 std_dev=0.171
C3'	A	0, 0.057, 0.230, 0.403, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.230 std_dev=0.173
C2'	B	0, 0.476, 0.672, 0.868, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.672 std_dev=0.196
O2'	B	0, 0.422, 0.650, 0.878, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.650 std_dev=0.228
O3'	A	0, 0.096, 0.343, 0.590, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.343 std_dev=0.247
C1'	B	0, 0.554, 0.805, 1.057, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.805 std_dev=0.251
C3'	B	0, 0.493, 0.755, 1.016, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.755 std_dev=0.261
C4	B	0, 0.458, 0.723, 0.988, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.723 std_dev=0.265
N9	B	0, 0.496, 0.764, 1.032, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.764 std_dev=0.268
O5'	A	0, 0.216, 0.487, 0.758, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.487 std_dev=0.271
C5'	A	0, 0.145, 0.427, 0.708, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.427 std_dev=0.281
N3	B	0, 0.562, 0.857, 1.151, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.857 std_dev=0.294
C2	B	0, 0.589, 0.889, 1.190, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.889 std_dev=0.301
N1	B	0, 0.485, 0.792, 1.099, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.792 std_dev=0.307
C4'	B	0, 0.552, 0.867, 1.182, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.867 std_dev=0.315
C5	B	0, 0.387, 0.703, 1.020, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.703 std_dev=0.316
O4'	B	0, 0.585, 0.913, 1.241, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.913 std_dev=0.328
O5'	B	0, 0.586, 0.921, 1.256, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.921 std_dev=0.335
P	B	0, 0.620, 0.965, 1.311, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.965 std_dev=0.345
C6	B	0, 0.390, 0.737, 1.085, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.737 std_dev=0.348
P	A	0, 0.430, 0.782, 1.134, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.782 std_dev=0.352
C8	B	0, 0.417, 0.779, 1.141, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.779 std_dev=0.362
N2	B	0, 0.768, 1.133, 1.498, 1.529 max_d=1.529 avg_d=1.133 std_dev=0.365
OP1	B	0, 0.669, 1.041, 1.412, 1.653 max_d=1.653 avg_d=1.041 std_dev=0.371
C5'	B	0, 0.598, 0.991, 1.385, 1.834 max_d=1.834 avg_d=0.991 std_dev=0.394
OP2	B	0, 0.603, 1.019, 1.435, 1.775 max_d=1.775 avg_d=1.019 std_dev=0.416
N7	B	0, 0.366, 0.783, 1.200, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.783 std_dev=0.417
O6	B	0, 0.410, 0.848, 1.285, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.848 std_dev=0.437
OP1	A	0, 0.541, 0.987, 1.432, 1.655 max_d=1.655 avg_d=0.987 std_dev=0.446
OP2	A	0, 0.509, 0.964, 1.418, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.964 std_dev=0.455
O3'	B	0, 0.331, 0.802, 1.273, 2.036 max_d=2.036 avg_d=0.802 std_dev=0.471

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.01	0.08	0.09	0.12	0.08
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.02	0.13	0.16	0.23	0.17
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.07	0.14	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.12	0.10	0.08
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.09	0.02	0.10	0.03	0.08	0.15	0.01	0.01	0.07	0.02	0.05	0.12	0.08	0.06
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.04	0.19	0.26	0.34	0.26
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.03	0.04	0.08	0.07	0.02	0.07	0.01	0.02	0.07	0.04	0.02
C5	0.03	0.02	0.05	0.09	0.01	0.10	0.00	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.10	0.02	0.06	0.22	0.27	0.33	0.28
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.15	0.01	0.19	0.00	0.17	0.08	0.10	0.07	0.07	0.05	0.17	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.03	0.01	0.07	0.10	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.10	0.02	0.05	0.20	0.21	0.25	0.22
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.13	0.14	0.19	0.15
N3	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.10	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.11	0.02	0.03	0.16	0.21	0.28	0.21
O2	0.05	0.01	0.14	0.15	0.02	0.08	0.02	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.13	0.18	0.03	0.04	0.12	0.16	0.21	0.15
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.04	0.07	0.04	0.07	0.05	0.02	0.07	0.13	0.00	0.04	0.05	0.04	0.03	0.11	0.07	0.05
O3'	0.02	0.11	0.01	0.01	0.09	0.02	0.10	0.05	0.10	0.04	0.11	0.18	0.04	0.00	0.10	0.02	0.09	0.16	0.15	0.12
O4	0.03	0.02	0.05	0.07	0.01	0.07	0.02	0.17	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.10	0.00	0.05	0.21	0.31	0.39	0.30
O4'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.05	0.00	0.09	0.09	0.12	0.09
O5'	0.08	0.13	0.06	0.05	0.19	0.02	0.22	0.01	0.20	0.13	0.16	0.12	0.03	0.09	0.21	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.16	0.12	0.12	0.26	0.07	0.27	0.07	0.21	0.14	0.21	0.16	0.11	0.16	0.31	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.23	0.10	0.08	0.34	0.04	0.33	0.02	0.25	0.19	0.28	0.21	0.07	0.15	0.39	0.12	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.17	0.08	0.06	0.26	0.02	0.28	0.01	0.22	0.15	0.21	0.15	0.05	0.12	0.30	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.19	0.23	0.24	0.13	0.20	0.14	0.19	0.16	0.18	0.19	0.28	0.13	0.17	0.16	0.25	0.36	0.17	0.21	0.17	0.20	0.22	0.20
C2	0.18	0.15	0.22	0.22	0.13	0.20	0.15	0.19	0.18	0.15	0.19	0.20	0.11	0.15	0.16	0.25	0.32	0.18	0.22	0.21	0.21	0.25	0.20
C2'	0.14	0.19	0.21	0.23	0.09	0.19	0.10	0.17	0.15	0.10	0.19	0.26	0.12	0.08	0.10	0.29	0.39	0.16	0.17	0.16	0.17	0.18	0.15
C3'	0.12	0.20	0.23	0.27	0.11	0.19	0.12	0.18	0.15	0.11	0.19	0.26	0.15	0.10	0.10	0.31	0.49	0.15	0.16	0.16	0.16	0.17	0.14
C4	0.17	0.14	0.22	0.23	0.13	0.19	0.16	0.19	0.18	0.17	0.19	0.17	0.11	0.17	0.16	0.24	0.35	0.18	0.21	0.21	0.21	0.25	0.21
C4'	0.11	0.22	0.21	0.27	0.11	0.17	0.12	0.17	0.15	0.14	0.19	0.30	0.17	0.13	0.11	0.24	0.47	0.14	0.17	0.15	0.17	0.19	0.17
C5	0.17	0.15	0.23	0.25	0.13	0.19	0.16	0.19	0.17	0.18	0.18	0.20	0.11	0.18	0.17	0.25	0.38	0.17	0.21	0.20	0.21	0.24	0.20
C5'	0.13	0.21	0.20	0.28	0.12	0.18	0.13	0.19	0.15	0.14	0.19	0.29	0.17	0.14	0.12	0.22	0.50	0.17	0.19	0.15	0.19	0.20	0.19
C6	0.17	0.17	0.23	0.25	0.13	0.19	0.15	0.19	0.17	0.18	0.19	0.24	0.11	0.18	0.17	0.25	0.39	0.17	0.21	0.19	0.21	0.23	0.20
N1	0.17	0.17	0.22	0.24	0.12	0.19	0.15	0.19	0.17	0.17	0.19	0.24	0.11	0.16	0.16	0.25	0.36	0.17	0.20	0.19	0.20	0.23	0.19
N3	0.18	0.15	0.22	0.22	0.14	0.20	0.16	0.19	0.19	0.16	0.19	0.17	0.12	0.16	0.16	0.25	0.32	0.19	0.22	0.22	0.22	0.26	0.21
O2	0.20	0.16	0.23	0.23	0.14	0.22	0.15	0.21	0.18	0.16	0.20	0.20	0.14	0.15	0.17	0.26	0.31	0.21	0.24	0.22	0.23	0.27	0.23
O2'	0.15	0.22	0.22	0.23	0.11	0.20	0.12	0.19	0.17	0.11	0.21	0.27	0.15	0.10	0.11	0.28	0.34	0.17	0.20	0.17	0.19	0.18	0.16
O3'	0.14	0.23	0.26	0.31	0.17	0.22	0.17	0.21	0.20	0.15	0.23	0.27	0.19	0.15	0.14	0.36	0.55	0.17	0.17	0.21	0.19	0.19	0.17
O4	0.18	0.14	0.22	0.23	0.14	0.20	0.16	0.19	0.19	0.16	0.19	0.16	0.12	0.17	0.16	0.25	0.34	0.19	0.22	0.22	0.21	0.26	0.21
O4'	0.17	0.22	0.24	0.28	0.16	0.20	0.18	0.20	0.19	0.22	0.21	0.30	0.16	0.22	0.19	0.24	0.41	0.17	0.22	0.20	0.22	0.23	0.22
O5'	0.12	0.19	0.21	0.28	0.12	0.18	0.13	0.18	0.15	0.14	0.18	0.26	0.15	0.14	0.12	0.23	0.50	0.16	0.17	0.16	0.17	0.19	0.17
OP1	0.21	0.26	0.27	0.35	0.21	0.30	0.21	0.32	0.22	0.20	0.25	0.31	0.24	0.20	0.20	0.28	0.59	0.26	0.29	0.22	0.30	0.28	0.30
OP2	0.14	0.21	0.22	0.29	0.15	0.22	0.16	0.22	0.18	0.15	0.21	0.26	0.17	0.15	0.14	0.25	0.53	0.19	0.19	0.19	0.21	0.20	0.20
P	0.14	0.20	0.22	0.30	0.13	0.21	0.14	0.23	0.16	0.15	0.19	0.26	0.16	0.14	0.13	0.24	0.54	0.18	0.20	0.16	0.21	0.21	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.06	0.04	0.03	0.01	0.02	0.05	0.01	0.09	0.03	0.11	0.10	0.07
C2	0.05	0.00	0.12	0.12	0.02	0.05	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.14	0.14	0.07	0.20	0.02	0.20	0.22	0.19
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.08	0.07	0.10	0.15	0.12	0.07	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.08	0.11	0.12	0.07
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.10	0.01	0.13	0.02	0.14	0.13	0.13	0.14	0.11	0.15	0.08	0.02	0.01	0.01	0.08	0.15	0.14	0.14	0.09
C4	0.02	0.02	0.07	0.10	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.05	0.20	0.02	0.19	0.20	0.18
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.05	0.06	0.05	0.08	0.04	0.05	0.04	0.01	0.02	0.05	0.11	0.05	0.02
C5	0.02	0.02	0.07	0.13	0.01	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.06	0.23	0.01	0.23	0.25	0.23
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.13	0.15	0.11	0.09	0.08	0.16	0.10	0.04	0.04	0.01	0.01	0.14	0.12	0.03	0.02
C6	0.03	0.02	0.08	0.14	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.08	0.18	0.07	0.23	0.01	0.24	0.27	0.24
C8	0.02	0.02	0.07	0.13	0.01	0.08	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.16	0.04	0.23	0.02	0.22	0.20	0.21
N1	0.04	0.01	0.10	0.13	0.02	0.05	0.02	0.11	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.11	0.16	0.08	0.22	0.02	0.22	0.25	0.22
N2	0.06	0.01	0.15	0.14	0.02	0.06	0.02	0.09	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.17	0.17	0.08	0.20	0.03	0.19	0.22	0.18
N3	0.04	0.01	0.12	0.11	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.13	0.12	0.07	0.18	0.02	0.18	0.19	0.16
N7	0.03	0.02	0.07	0.15	0.01	0.08	0.01	0.16	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.20	0.05	0.25	0.02	0.26	0.27	0.25
N9	0.01	0.03	0.03	0.08	0.01	0.04	0.01	0.10	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.07	0.02	0.18	0.02	0.18	0.16	0.15
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.07	0.05	0.05	0.04	0.08	0.05	0.11	0.17	0.13	0.05	0.02	0.00	0.12	0.06	0.05	0.07	0.11	0.10	0.05
O3'	0.05	0.14	0.05	0.01	0.10	0.04	0.16	0.04	0.18	0.16	0.16	0.17	0.12	0.20	0.07	0.12	0.00	0.04	0.14	0.21	0.23	0.28	0.18
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.07	0.04	0.08	0.08	0.07	0.05	0.02	0.06	0.04	0.00	0.08	0.07	0.11	0.14	0.10
O5'	0.09	0.20	0.07	0.08	0.20	0.02	0.23	0.01	0.23	0.23	0.22	0.20	0.18	0.25	0.18	0.05	0.14	0.08	0.00	0.23	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.08	0.15	0.02	0.05	0.01	0.14	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.07	0.21	0.07	0.23	0.00	0.26	0.29	0.25
OP1	0.11	0.20	0.11	0.14	0.19	0.11	0.23	0.12	0.24	0.22	0.22	0.19	0.18	0.26	0.18	0.11	0.23	0.11	0.02	0.26	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.22	0.12	0.14	0.20	0.05	0.25	0.03	0.27	0.20	0.25	0.22	0.19	0.27	0.16	0.10	0.28	0.14	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.19	0.07	0.09	0.18	0.02	0.23	0.02	0.24	0.21	0.22	0.18	0.16	0.25	0.15	0.05	0.18	0.10	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00