Doublet Group distance statistics: 49399

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 3, 0, 3, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.010, 0.021, 0.033, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.014, 0.027, 0.041, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.002, 0.016, 0.031, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.016 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.022 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.009, 0.029, 0.049, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.029 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.011, 0.033, 0.056, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.033 std_dev=0.022
O2	A	0, 0.020, 0.072, 0.124, 0.178 max_d=0.178 avg_d=0.072 std_dev=0.052
O4'	A	0, 0.061, 0.124, 0.187, 0.229 max_d=0.229 avg_d=0.124 std_dev=0.063
O4	A	0, 0.006, 0.070, 0.133, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.070 std_dev=0.063
C2'	A	0, 0.110, 0.212, 0.315, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.212 std_dev=0.102
C4'	A	0, 0.062, 0.164, 0.266, 0.395 max_d=0.395 avg_d=0.164 std_dev=0.102
O5'	A	0, 0.112, 0.230, 0.348, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.230 std_dev=0.118
C3'	A	0, 0.148, 0.267, 0.387, 0.476 max_d=0.476 avg_d=0.267 std_dev=0.119
P	A	0, 0.080, 0.219, 0.357, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.219 std_dev=0.139
O2'	A	0, 0.158, 0.319, 0.480, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.319 std_dev=0.161
OP2	A	0, 0.181, 0.343, 0.505, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.343 std_dev=0.162
O3'	A	0, 0.189, 0.366, 0.542, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.366 std_dev=0.176
C2'	B	0, 0.220, 0.405, 0.590, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.405 std_dev=0.185
OP1	A	0, 0.117, 0.307, 0.498, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.307 std_dev=0.190
C5'	A	0, 0.203, 0.397, 0.591, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.397 std_dev=0.194
C1'	B	0, 0.250, 0.463, 0.676, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.463 std_dev=0.213
N2	B	0, 0.169, 0.385, 0.601, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.385 std_dev=0.216
N3	B	0, 0.170, 0.389, 0.609, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.389 std_dev=0.220
C4'	B	0, 0.245, 0.466, 0.686, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.466 std_dev=0.220
C3'	B	0, 0.197, 0.419, 0.641, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.419 std_dev=0.222
N9	B	0, 0.257, 0.488, 0.718, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.488 std_dev=0.230
O2'	B	0, 0.166, 0.397, 0.627, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.397 std_dev=0.231
O3'	B	0, 0.200, 0.434, 0.667, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.434 std_dev=0.233
C4	B	0, 0.212, 0.448, 0.685, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.448 std_dev=0.237
C2	B	0, 0.156, 0.393, 0.630, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.393 std_dev=0.237
O4'	B	0, 0.268, 0.523, 0.778, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.523 std_dev=0.255
C8	B	0, 0.295, 0.553, 0.812, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.553 std_dev=0.259
C5	B	0, 0.234, 0.501, 0.768, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.501 std_dev=0.267
N1	B	0, 0.167, 0.449, 0.730, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.449 std_dev=0.281
N7	B	0, 0.290, 0.573, 0.857, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.573 std_dev=0.283
C6	B	0, 0.192, 0.481, 0.770, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.481 std_dev=0.289
C5'	B	0, 0.345, 0.636, 0.926, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.636 std_dev=0.291
O6	B	0, 0.196, 0.516, 0.835, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.516 std_dev=0.319
P	B	0, 0.398, 0.908, 1.419, 2.099 max_d=2.099 avg_d=0.908 std_dev=0.511
OP2	B	0, 0.374, 0.891, 1.408, 2.151 max_d=2.151 avg_d=0.891 std_dev=0.517
OP1	B	0, 0.476, 1.067, 1.658, 2.304 max_d=2.304 avg_d=1.067 std_dev=0.591
O5'	B	0, 0.344, 1.024, 1.704, 2.395 max_d=2.395 avg_d=1.024 std_dev=0.680

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.10	0.02	0.03	0.05	0.00	0.05	0.06	0.09	0.04
C2	0.05	0.00	0.10	0.07	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.01	0.12	0.10	0.02	0.03	0.08	0.08	0.11	0.06
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.11	0.02	0.09	0.02	0.07	0.06	0.11	0.13	0.00	0.04	0.13	0.02	0.04	0.07	0.10	0.05
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.08	0.01	0.06	0.02	0.05	0.04	0.08	0.11	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.10	0.12	0.09
C4	0.04	0.01	0.11	0.08	0.00	0.06	0.01	0.09	0.02	0.03	0.01	0.02	0.13	0.09	0.01	0.05	0.15	0.14	0.19	0.14
C4'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.05	0.04	0.05	0.11	0.09	0.02	0.07	0.00	0.02	0.08	0.05	0.01
C5	0.03	0.02	0.09	0.06	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.07	0.02	0.06	0.15	0.15	0.19	0.14
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.09	0.00	0.10	0.00	0.09	0.06	0.07	0.11	0.09	0.05	0.10	0.02	0.02	0.09	0.01	0.03
C6	0.03	0.02	0.07	0.05	0.02	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.06	0.03	0.06	0.12	0.10	0.13	0.09
N1	0.02	0.02	0.06	0.04	0.03	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.04	0.06	0.06	0.03	0.02	0.08	0.08	0.10	0.06
N3	0.04	0.01	0.11	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.02	0.14	0.11	0.02	0.03	0.11	0.10	0.16	0.10
O2	0.10	0.01	0.13	0.11	0.02	0.11	0.03	0.11	0.04	0.04	0.02	0.00	0.15	0.15	0.04	0.09	0.09	0.10	0.09	0.07
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.13	0.09	0.08	0.09	0.06	0.06	0.14	0.15	0.00	0.06	0.15	0.08	0.10	0.12	0.12	0.10
O3'	0.03	0.10	0.04	0.01	0.09	0.02	0.07	0.05	0.06	0.06	0.11	0.15	0.06	0.00	0.11	0.02	0.15	0.17	0.16	0.14
O4	0.05	0.02	0.13	0.09	0.01	0.07	0.02	0.10	0.03	0.03	0.02	0.04	0.15	0.11	0.00	0.06	0.17	0.17	0.22	0.17
O4'	0.00	0.03	0.02	0.02	0.05	0.00	0.06	0.02	0.06	0.02	0.03	0.09	0.08	0.02	0.06	0.00	0.09	0.08	0.12	0.08
O5'	0.05	0.08	0.04	0.09	0.15	0.02	0.15	0.02	0.12	0.08	0.11	0.09	0.10	0.15	0.17	0.09	0.00	0.05	0.02	0.01
OP1	0.06	0.08	0.07	0.10	0.14	0.08	0.15	0.09	0.10	0.08	0.10	0.10	0.12	0.17	0.17	0.08	0.05	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.11	0.10	0.12	0.19	0.05	0.19	0.01	0.13	0.10	0.16	0.09	0.12	0.16	0.22	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.06	0.05	0.09	0.14	0.01	0.14	0.03	0.09	0.06	0.10	0.07	0.10	0.14	0.17	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.10	0.11	0.15	0.09	0.13	0.09	0.14	0.08	0.10	0.09	0.13	0.09	0.09	0.10	0.15	0.15	0.11	0.31	0.08	0.32	0.31	0.22
C2	0.14	0.08	0.13	0.16	0.11	0.14	0.10	0.16	0.08	0.12	0.09	0.09	0.10	0.11	0.12	0.17	0.16	0.14	0.36	0.08	0.31	0.38	0.27
C2'	0.08	0.11	0.10	0.15	0.07	0.14	0.07	0.15	0.08	0.07	0.11	0.16	0.08	0.07	0.07	0.10	0.16	0.09	0.23	0.09	0.29	0.28	0.18
C3'	0.08	0.10	0.09	0.14	0.06	0.12	0.06	0.15	0.07	0.06	0.09	0.14	0.08	0.06	0.06	0.08	0.16	0.09	0.19	0.07	0.28	0.28	0.16
C4	0.14	0.12	0.13	0.16	0.12	0.14	0.12	0.16	0.12	0.13	0.12	0.12	0.12	0.13	0.13	0.16	0.16	0.15	0.37	0.12	0.31	0.40	0.28
C4'	0.11	0.11	0.11	0.16	0.10	0.13	0.10	0.16	0.09	0.11	0.10	0.14	0.10	0.10	0.11	0.10	0.17	0.11	0.26	0.09	0.33	0.30	0.21
C5	0.13	0.11	0.12	0.16	0.12	0.13	0.12	0.15	0.12	0.13	0.12	0.12	0.11	0.13	0.12	0.15	0.15	0.13	0.34	0.12	0.31	0.37	0.25
C5'	0.12	0.11	0.13	0.17	0.11	0.14	0.11	0.18	0.11	0.13	0.11	0.14	0.10	0.12	0.12	0.11	0.19	0.12	0.28	0.11	0.35	0.32	0.23
C6	0.12	0.09	0.11	0.15	0.10	0.13	0.11	0.14	0.10	0.12	0.10	0.10	0.10	0.11	0.11	0.15	0.15	0.12	0.33	0.10	0.31	0.34	0.24
N1	0.12	0.08	0.12	0.16	0.10	0.13	0.09	0.15	0.08	0.12	0.08	0.10	0.09	0.10	0.11	0.16	0.15	0.12	0.33	0.08	0.31	0.34	0.24
N3	0.15	0.11	0.14	0.17	0.12	0.14	0.12	0.17	0.11	0.13	0.11	0.11	0.12	0.12	0.13	0.17	0.16	0.16	0.37	0.11	0.31	0.41	0.29
O2	0.15	0.07	0.15	0.18	0.10	0.15	0.09	0.18	0.08	0.12	0.08	0.08	0.10	0.10	0.12	0.19	0.19	0.16	0.37	0.07	0.31	0.40	0.28
O2'	0.07	0.13	0.11	0.16	0.08	0.14	0.08	0.16	0.10	0.06	0.13	0.18	0.11	0.07	0.07	0.09	0.18	0.09	0.20	0.10	0.29	0.27	0.16
O3'	0.11	0.13	0.10	0.13	0.09	0.12	0.08	0.16	0.10	0.08	0.12	0.17	0.11	0.08	0.09	0.09	0.15	0.14	0.12	0.10	0.25	0.28	0.14
O4	0.15	0.12	0.14	0.17	0.13	0.14	0.13	0.17	0.13	0.14	0.13	0.12	0.13	0.14	0.14	0.17	0.16	0.17	0.38	0.12	0.31	0.42	0.29
O4'	0.14	0.13	0.13	0.18	0.13	0.15	0.14	0.18	0.13	0.15	0.13	0.15	0.13	0.14	0.14	0.17	0.18	0.12	0.33	0.12	0.35	0.32	0.24
O5'	0.11	0.09	0.11	0.17	0.08	0.13	0.09	0.18	0.08	0.11	0.09	0.12	0.07	0.10	0.10	0.11	0.18	0.11	0.28	0.08	0.34	0.32	0.22
OP1	0.11	0.11	0.14	0.22	0.10	0.15	0.11	0.22	0.10	0.12	0.10	0.13	0.10	0.12	0.11	0.14	0.23	0.12	0.25	0.10	0.32	0.35	0.22
OP2	0.14	0.11	0.13	0.16	0.12	0.15	0.12	0.18	0.12	0.14	0.12	0.13	0.11	0.13	0.13	0.13	0.17	0.14	0.31	0.12	0.35	0.32	0.24
P	0.10	0.08	0.11	0.17	0.08	0.13	0.08	0.18	0.08	0.10	0.08	0.11	0.08	0.09	0.10	0.11	0.18	0.10	0.28	0.08	0.33	0.33	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.19	0.03	0.18	0.27	0.13
C2	0.03	0.00	0.09	0.12	0.01	0.08	0.02	0.24	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.09	0.12	0.03	0.35	0.01	0.22	0.40	0.25
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.03	0.05	0.04	0.06	0.04	0.09	0.11	0.08	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.27	0.05	0.29	0.25	0.18
C3'	0.02	0.12	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.09	0.08	0.12	0.14	0.10	0.09	0.05	0.03	0.01	0.03	0.36	0.09	0.39	0.22	0.23
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.34	0.02	0.22	0.38	0.24
C4'	0.01	0.08	0.03	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.12	0.10	0.08	0.06	0.13	0.07	0.08	0.04	0.01	0.02	0.11	0.22	0.30	0.06
C5	0.02	0.02	0.05	0.08	0.00	0.11	0.00	0.31	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.03	0.39	0.02	0.26	0.42	0.29
C5'	0.07	0.24	0.04	0.04	0.24	0.01	0.31	0.00	0.32	0.30	0.29	0.22	0.20	0.34	0.21	0.07	0.08	0.03	0.02	0.35	0.36	0.43	0.05
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.11	0.01	0.32	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.09	0.02	0.41	0.01	0.26	0.45	0.30
C8	0.01	0.03	0.04	0.08	0.01	0.12	0.02	0.30	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.09	0.04	0.36	0.04	0.25	0.36	0.26
N1	0.03	0.00	0.09	0.12	0.01	0.10	0.01	0.29	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.12	0.02	0.38	0.01	0.25	0.44	0.29
N2	0.04	0.01	0.11	0.14	0.01	0.08	0.03	0.22	0.02	0.03	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.10	0.15	0.04	0.33	0.02	0.22	0.40	0.24
N3	0.03	0.01	0.08	0.10	0.00	0.06	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.32	0.02	0.22	0.38	0.23
N7	0.01	0.03	0.05	0.09	0.01	0.13	0.01	0.34	0.03	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.03	0.40	0.04	0.28	0.43	0.31
N9	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.07	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.31	0.02	0.21	0.33	0.21
O2'	0.05	0.09	0.01	0.03	0.05	0.08	0.05	0.07	0.06	0.04	0.08	0.10	0.07	0.04	0.04	0.00	0.06	0.08	0.13	0.06	0.24	0.22	0.10
O3'	0.03	0.12	0.03	0.01	0.07	0.04	0.08	0.08	0.09	0.09	0.12	0.15	0.10	0.10	0.06	0.06	0.00	0.03	0.30	0.09	0.39	0.19	0.20
O4'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.08	0.03	0.00	0.16	0.04	0.17	0.29	0.14
O5'	0.19	0.35	0.27	0.36	0.34	0.02	0.39	0.02	0.41	0.36	0.38	0.33	0.32	0.40	0.31	0.13	0.30	0.16	0.00	0.43	0.04	0.03	0.01
O6	0.03	0.01	0.05	0.09	0.02	0.11	0.02	0.35	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.06	0.09	0.04	0.43	0.00	0.28	0.47	0.32
OP1	0.18	0.22	0.29	0.39	0.22	0.22	0.26	0.36	0.26	0.25	0.25	0.22	0.22	0.28	0.21	0.24	0.39	0.17	0.04	0.28	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.40	0.25	0.22	0.38	0.30	0.42	0.43	0.45	0.36	0.44	0.40	0.38	0.43	0.33	0.22	0.19	0.29	0.03	0.47	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.25	0.18	0.23	0.24	0.06	0.29	0.05	0.30	0.26	0.29	0.24	0.23	0.31	0.21	0.10	0.20	0.14	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00