Doublet Group distance statistics: 49400

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.002, 0.014, 0.027, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.010, 0.028, 0.045, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.028 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.020, 0.061, 0.101, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.061 std_dev=0.040
O4	A	0, 0.014, 0.114, 0.213, 0.305 max_d=0.305 avg_d=0.114 std_dev=0.099
O4'	A	0, 0.003, 0.262, 0.521, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.262 std_dev=0.259
C4'	A	0, 0.131, 0.438, 0.745, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.438 std_dev=0.307
C2'	A	0, 0.031, 0.355, 0.678, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.355 std_dev=0.324
O3'	B	0, 0.298, 0.650, 1.001, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.650 std_dev=0.351
C3'	A	0, 0.219, 0.631, 1.043, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.631 std_dev=0.412
N2	B	0, 0.258, 0.671, 1.085, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.671 std_dev=0.413
C2'	B	0, 0.263, 0.691, 1.119, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.691 std_dev=0.428
C3'	B	0, 0.300, 0.739, 1.177, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.739 std_dev=0.438
O2'	B	0, 0.195, 0.654, 1.114, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.654 std_dev=0.460
O5'	A	0, 0.144, 0.608, 1.072, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.608 std_dev=0.464
N3	B	0, 0.267, 0.737, 1.208, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.737 std_dev=0.470
C1'	B	0, 0.297, 0.800, 1.303, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.800 std_dev=0.503
C2	B	0, 0.270, 0.774, 1.278, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.774 std_dev=0.504
C4'	B	0, 0.296, 0.842, 1.389, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.842 std_dev=0.547
OP2	A	0, 0.286, 0.852, 1.418, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.852 std_dev=0.566
C4	B	0, 0.302, 0.871, 1.439, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.871 std_dev=0.569
O4'	B	0, 0.308, 0.877, 1.446, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.877 std_dev=0.569
N9	B	0, 0.320, 0.895, 1.470, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.895 std_dev=0.575
O2'	A	0, 0.059, 0.639, 1.219, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.639 std_dev=0.580
P	A	0, 0.204, 0.790, 1.376, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.790 std_dev=0.586
O3'	A	0, 0.602, 1.218, 1.835, 1.878 max_d=1.878 avg_d=1.218 std_dev=0.616
N1	B	0, 0.287, 0.935, 1.582, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.935 std_dev=0.648
C5'	A	0, 0.131, 0.788, 1.445, 2.140 max_d=2.140 avg_d=0.788 std_dev=0.657
C5'	B	0, 0.290, 0.962, 1.635, 1.901 max_d=1.901 avg_d=0.962 std_dev=0.672
C8	B	0, 0.355, 1.057, 1.759, 2.109 max_d=2.109 avg_d=1.057 std_dev=0.702
C5	B	0, 0.323, 1.031, 1.739, 2.109 max_d=2.109 avg_d=1.031 std_dev=0.708
C6	B	0, 0.308, 1.074, 1.840, 2.268 max_d=2.268 avg_d=1.074 std_dev=0.766
N7	B	0, 0.354, 1.141, 1.929, 2.382 max_d=2.382 avg_d=1.141 std_dev=0.787
O6	B	0, 0.314, 1.230, 2.146, 2.728 max_d=2.728 avg_d=1.230 std_dev=0.916
OP1	A	0, -0.051, 1.178, 2.406, 3.693 max_d=3.693 avg_d=1.178 std_dev=1.229
O5'	B	0, 0.026, 1.512, 2.998, 4.381 max_d=4.381 avg_d=1.512 std_dev=1.486
OP1	B	0, -0.007, 1.628, 3.263, 5.088 max_d=5.088 avg_d=1.628 std_dev=1.635
P	B	0, 0.004, 1.686, 3.367, 5.157 max_d=5.157 avg_d=1.686 std_dev=1.681
OP2	B	0, 0.153, 1.933, 3.714, 5.565 max_d=5.565 avg_d=1.933 std_dev=1.781

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.23	0.02	0.00	0.19	0.48	0.18	0.10
C2	0.02	0.00	0.10	0.12	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.26	0.22	0.01	0.05	0.29	0.71	0.38	0.12
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.02	0.11	0.14	0.13	0.02	0.06	0.19	0.00	0.04	0.07	0.01	0.44	0.44	0.33	0.35
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.24	0.01	0.31	0.04	0.29	0.16	0.16	0.14	0.02	0.01	0.27	0.03	0.26	0.22	0.37	0.14
C4	0.02	0.01	0.06	0.24	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.02	0.00	0.00	0.28	0.09	0.01	0.03	0.39	0.94	0.58	0.21
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.05	0.05	0.04	0.28	0.03	0.08	0.01	0.04	0.32	0.23	0.07
C5	0.01	0.01	0.11	0.31	0.00	0.10	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.17	0.01	0.02	0.40	0.94	0.58	0.22
C5'	0.04	0.05	0.14	0.04	0.15	0.01	0.19	0.00	0.16	0.07	0.09	0.03	0.12	0.21	0.18	0.03	0.02	0.36	0.41	0.03
C6	0.01	0.01	0.13	0.29	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.16	0.01	0.02	0.37	0.79	0.45	0.17
N1	0.00	0.01	0.02	0.16	0.02	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.15	0.10	0.02	0.01	0.29	0.67	0.33	0.11
N3	0.01	0.00	0.06	0.16	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.29	0.14	0.01	0.05	0.34	0.84	0.49	0.16
O2	0.04	0.00	0.19	0.14	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.34	0.37	0.01	0.08	0.24	0.63	0.31	0.09
O2'	0.03	0.26	0.00	0.02	0.28	0.28	0.24	0.12	0.19	0.15	0.29	0.34	0.00	0.07	0.29	0.19	0.41	0.29	0.34	0.29
O3'	0.23	0.22	0.04	0.01	0.09	0.03	0.17	0.21	0.16	0.10	0.14	0.37	0.07	0.00	0.11	0.15	0.25	0.55	0.41	0.28
O4	0.02	0.01	0.07	0.27	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.01	0.29	0.11	0.00	0.04	0.41	1.01	0.63	0.24
O4'	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.05	0.08	0.19	0.15	0.04	0.00	0.11	0.44	0.08	0.18
O5'	0.19	0.29	0.44	0.26	0.39	0.04	0.40	0.02	0.37	0.29	0.34	0.24	0.41	0.25	0.41	0.11	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.48	0.71	0.44	0.22	0.94	0.32	0.94	0.36	0.79	0.67	0.84	0.63	0.29	0.55	1.01	0.44	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.38	0.33	0.37	0.58	0.23	0.58	0.41	0.45	0.33	0.49	0.31	0.34	0.41	0.63	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.12	0.35	0.14	0.21	0.07	0.22	0.03	0.17	0.11	0.16	0.09	0.29	0.28	0.24	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.18	0.07	0.08	0.12	0.12	0.16	0.10	0.21	0.10	0.22	0.20	0.12	0.14	0.08	0.27	0.12	0.13	0.19	0.23	0.23	0.34	0.20
C2	0.21	0.16	0.16	0.12	0.16	0.18	0.16	0.16	0.17	0.16	0.18	0.16	0.15	0.16	0.17	0.36	0.15	0.23	0.27	0.18	0.32	0.41	0.30
C2'	0.22	0.23	0.14	0.12	0.20	0.21	0.21	0.18	0.23	0.20	0.24	0.24	0.20	0.20	0.20	0.26	0.13	0.26	0.19	0.23	0.32	0.22	0.18
C3'	0.48	0.17	0.41	0.44	0.27	0.57	0.25	0.55	0.19	0.37	0.17	0.17	0.22	0.30	0.37	0.59	0.47	0.57	0.45	0.18	0.67	0.37	0.48
C4	0.24	0.25	0.18	0.13	0.23	0.19	0.25	0.17	0.28	0.23	0.28	0.26	0.23	0.25	0.23	0.36	0.14	0.25	0.30	0.29	0.34	0.49	0.34
C4'	0.17	0.19	0.14	0.13	0.15	0.18	0.18	0.15	0.22	0.15	0.22	0.19	0.15	0.18	0.14	0.26	0.15	0.20	0.11	0.25	0.30	0.22	0.12
C5	0.19	0.22	0.13	0.09	0.19	0.16	0.21	0.12	0.25	0.18	0.26	0.23	0.18	0.20	0.17	0.33	0.12	0.21	0.25	0.28	0.28	0.45	0.28
C5'	0.19	0.19	0.13	0.11	0.16	0.16	0.20	0.10	0.25	0.17	0.24	0.18	0.14	0.20	0.15	0.27	0.11	0.23	0.16	0.29	0.35	0.27	0.17
C6	0.16	0.18	0.10	0.08	0.14	0.14	0.17	0.11	0.21	0.12	0.22	0.20	0.14	0.15	0.12	0.31	0.11	0.18	0.21	0.24	0.25	0.41	0.24
N1	0.16	0.16	0.11	0.08	0.12	0.14	0.14	0.11	0.18	0.11	0.19	0.17	0.12	0.13	0.11	0.32	0.12	0.18	0.21	0.21	0.26	0.38	0.24
N3	0.25	0.22	0.19	0.15	0.22	0.21	0.23	0.19	0.23	0.23	0.24	0.22	0.22	0.23	0.23	0.37	0.15	0.26	0.32	0.24	0.36	0.48	0.36
O2	0.23	0.11	0.17	0.14	0.13	0.20	0.12	0.18	0.11	0.16	0.12	0.13	0.12	0.13	0.17	0.36	0.16	0.24	0.29	0.12	0.34	0.39	0.31
O2'	0.32	0.26	0.29	0.32	0.29	0.29	0.29	0.29	0.28	0.31	0.26	0.25	0.28	0.30	0.31	0.31	0.39	0.33	0.33	0.27	0.33	0.37	0.30
O3'	0.92	0.57	0.89	0.94	0.75	1.01	0.74	0.99	0.65	0.86	0.58	0.47	0.67	0.81	0.84	0.99	0.93	0.99	0.92	0.64	1.09	0.92	0.96
O4	0.27	0.31	0.21	0.17	0.29	0.22	0.31	0.21	0.33	0.29	0.33	0.31	0.28	0.31	0.28	0.36	0.16	0.28	0.34	0.35	0.38	0.51	0.38
O4'	0.10	0.22	0.14	0.18	0.19	0.13	0.24	0.16	0.28	0.18	0.27	0.21	0.17	0.23	0.14	0.23	0.19	0.11	0.31	0.32	0.30	0.46	0.31
O5'	0.19	0.28	0.16	0.14	0.20	0.21	0.25	0.18	0.32	0.17	0.33	0.29	0.21	0.22	0.16	0.34	0.12	0.24	0.21	0.37	0.22	0.36	0.17
OP1	0.42	0.45	0.28	0.23	0.39	0.27	0.37	0.23	0.37	0.35	0.41	0.51	0.44	0.34	0.38	0.43	0.25	0.40	0.35	0.35	0.42	0.44	0.34
OP2	0.21	0.41	0.26	0.31	0.27	0.36	0.35	0.37	0.47	0.23	0.50	0.46	0.28	0.31	0.19	0.39	0.38	0.30	0.30	0.55	0.42	0.43	0.30
P	0.19	0.15	0.10	0.08	0.08	0.17	0.16	0.10	0.24	0.08	0.23	0.15	0.06	0.14	0.06	0.34	0.08	0.24	0.16	0.30	0.29	0.36	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.15	0.02	0.25	0.19	0.15
C2	0.03	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.06	0.02	0.41	0.01	0.45	0.53	0.47
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.07	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.23	0.03	0.29	0.21	0.22
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.09	0.09	0.07	0.05	0.04	0.10	0.05	0.03	0.01	0.01	0.33	0.11	0.32	0.19	0.27
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02	0.40	0.01	0.43	0.44	0.43
C4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.08	0.09	0.05	0.02	0.02	0.10	0.05	0.08	0.04	0.00	0.01	0.10	0.23	0.19	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.09	0.03	0.51	0.02	0.54	0.57	0.56
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.13	0.14	0.09	0.04	0.04	0.15	0.07	0.09	0.06	0.02	0.01	0.16	0.21	0.30	0.03
C6	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.11	0.10	0.04	0.56	0.00	0.61	0.68	0.63
C8	0.02	0.01	0.03	0.09	0.00	0.09	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.04	0.45	0.03	0.46	0.37	0.45
N1	0.02	0.00	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.08	0.02	0.51	0.01	0.55	0.64	0.57
N2	0.04	0.00	0.07	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.08	0.04	0.38	0.01	0.41	0.52	0.43
N3	0.03	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.05	0.02	0.35	0.01	0.38	0.43	0.38
N7	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.10	0.00	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.04	0.53	0.03	0.56	0.54	0.58
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.02	0.34	0.02	0.37	0.31	0.34
O2'	0.02	0.18	0.00	0.03	0.10	0.08	0.09	0.09	0.11	0.02	0.15	0.21	0.16	0.04	0.04	0.00	0.06	0.06	0.12	0.10	0.31	0.14	0.14
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.06	0.04	0.09	0.06	0.10	0.10	0.08	0.08	0.05	0.11	0.05	0.06	0.00	0.03	0.32	0.12	0.29	0.15	0.23
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.06	0.03	0.00	0.16	0.05	0.22	0.23	0.04
O5'	0.15	0.41	0.23	0.33	0.40	0.01	0.51	0.01	0.56	0.45	0.51	0.38	0.35	0.53	0.34	0.12	0.32	0.16	0.00	0.62	0.04	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.03	0.11	0.01	0.10	0.02	0.16	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.10	0.12	0.05	0.62	0.00	0.69	0.77	0.71
OP1	0.25	0.45	0.29	0.32	0.43	0.23	0.54	0.21	0.61	0.46	0.55	0.41	0.38	0.56	0.37	0.31	0.29	0.22	0.04	0.69	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.53	0.21	0.19	0.44	0.19	0.57	0.30	0.68	0.37	0.64	0.52	0.43	0.54	0.31	0.14	0.15	0.23	0.01	0.77	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.47	0.22	0.27	0.43	0.04	0.56	0.03	0.63	0.45	0.57	0.43	0.38	0.58	0.34	0.14	0.23	0.04	0.01	0.71	0.00	0.01	0.00