Doublet Group distance statistics: 49408

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 4, 4, 1, 5, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.015, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.014, 0.020, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.020 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.007, 0.014, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.014, 0.021, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.021 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.014, 0.022, 0.031, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.022 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.018, 0.029, 0.040, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.029 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.025, 0.041, 0.058, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.041 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.019, 0.038, 0.057, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.038 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.030, 0.050, 0.070, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.050 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.034, 0.058, 0.083, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.058 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.073, 0.105, 0.136, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.105 std_dev=0.031
C2'	A	0, 0.147, 0.237, 0.327, 0.420 max_d=0.420 avg_d=0.237 std_dev=0.090
O4'	A	0, 0.119, 0.213, 0.308, 0.467 max_d=0.467 avg_d=0.213 std_dev=0.094
O2'	A	0, 0.281, 0.466, 0.651, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.466 std_dev=0.185
C3'	A	0, 0.065, 0.262, 0.460, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.262 std_dev=0.197
C4'	A	0, 0.044, 0.251, 0.458, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.251 std_dev=0.207
N3	B	0, 0.344, 0.553, 0.763, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.553 std_dev=0.209
C2	B	0, 0.344, 0.570, 0.796, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.570 std_dev=0.226
O2	B	0, 0.300, 0.530, 0.760, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.530 std_dev=0.230
C4	B	0, 0.385, 0.618, 0.851, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.618 std_dev=0.233
N4	B	0, 0.392, 0.632, 0.872, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.632 std_dev=0.240
O3'	A	0, 0.156, 0.405, 0.655, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.405 std_dev=0.250
N1	B	0, 0.419, 0.677, 0.934, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.677 std_dev=0.258
C5	B	0, 0.446, 0.720, 0.995, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.720 std_dev=0.275
C6	B	0, 0.464, 0.745, 1.027, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.745 std_dev=0.281
C1'	B	0, 0.431, 0.724, 1.016, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.724 std_dev=0.293
O4'	B	0, 0.407, 0.707, 1.007, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.707 std_dev=0.300
C2'	B	0, 0.469, 0.809, 1.150, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.809 std_dev=0.341
C4'	B	0, 0.528, 0.879, 1.230, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.879 std_dev=0.351
C5'	B	0, 0.506, 0.879, 1.253, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.879 std_dev=0.373
C3'	B	0, 0.582, 0.965, 1.348, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.965 std_dev=0.383
C5'	A	0, -0.057, 0.330, 0.717, 1.731 max_d=1.731 avg_d=0.330 std_dev=0.387
O3'	B	0, 0.762, 1.227, 1.693, 1.846 max_d=1.846 avg_d=1.227 std_dev=0.466
O2'	B	0, 0.515, 1.023, 1.531, 2.092 max_d=2.092 avg_d=1.023 std_dev=0.508
O5'	B	0, 0.293, 0.969, 1.645, 3.511 max_d=3.511 avg_d=0.969 std_dev=0.676
O5'	A	0, -0.389, 0.424, 1.237, 3.754 max_d=3.754 avg_d=0.424 std_dev=0.813
P	B	0, 0.085, 1.134, 2.183, 5.304 max_d=5.304 avg_d=1.134 std_dev=1.049
P	A	0, -0.591, 0.503, 1.596, 5.005 max_d=5.005 avg_d=0.503 std_dev=1.093
OP2	A	0, -0.575, 0.538, 1.650, 5.114 max_d=5.114 avg_d=0.538 std_dev=1.113
OP2	B	0, -0.031, 1.194, 2.419, 6.111 max_d=6.111 avg_d=1.194 std_dev=1.225
OP1	B	0, 0.073, 1.326, 2.578, 6.304 max_d=6.304 avg_d=1.326 std_dev=1.252
OP1	A	0, -0.715, 0.674, 2.062, 6.381 max_d=6.381 avg_d=0.674 std_dev=1.388

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.12	0.07
C2	0.01	0.00	0.11	0.17	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.17	0.05	0.14	0.01	0.15	0.36	0.19
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.03	0.08	0.04	0.10	0.12	0.10	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.07	0.13	0.14	0.13
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.13	0.01	0.15	0.02	0.17	0.09	0.18	0.17	0.14	0.12	0.09	0.02	0.01	0.01	0.19	0.18	0.18	0.12	0.17
C4	0.01	0.00	0.07	0.13	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.12	0.03	0.17	0.01	0.19	0.36	0.23
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.07	0.07	0.05	0.04	0.03	0.08	0.04	0.10	0.02	0.00	0.01	0.08	0.06	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.15	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.15	0.03	0.25	0.01	0.32	0.49	0.33
C5'	0.01	0.05	0.03	0.02	0.06	0.00	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.05	0.04	0.12	0.06	0.09	0.05	0.02	0.00	0.12	0.05	0.14	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.17	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.18	0.04	0.25	0.00	0.34	0.53	0.35
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.04	0.29	0.01	0.33	0.43	0.36
N1	0.01	0.00	0.10	0.18	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.19	0.04	0.20	0.01	0.25	0.46	0.27
N2	0.02	0.01	0.12	0.17	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.18	0.06	0.11	0.01	0.11	0.32	0.15
N3	0.01	0.00	0.10	0.14	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.14	0.04	0.11	0.01	0.10	0.29	0.15
N7	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.13	0.04	0.32	0.01	0.41	0.55	0.42
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.02	0.16	0.01	0.17	0.29	0.21
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.07	0.10	0.08	0.09	0.09	0.04	0.11	0.12	0.10	0.06	0.04	0.00	0.06	0.08	0.09	0.10	0.07	0.10	0.09
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.12	0.02	0.15	0.05	0.18	0.09	0.19	0.18	0.14	0.13	0.07	0.06	0.00	0.01	0.22	0.20	0.24	0.15	0.20
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.06	0.04	0.04	0.02	0.08	0.01	0.00	0.08	0.04	0.07	0.09	0.07
O5'	0.04	0.14	0.13	0.19	0.17	0.01	0.25	0.00	0.25	0.29	0.20	0.11	0.11	0.32	0.16	0.09	0.22	0.08	0.00	0.29	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.07	0.18	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.20	0.04	0.29	0.00	0.42	0.60	0.41
OP1	0.03	0.15	0.13	0.18	0.19	0.06	0.32	0.05	0.34	0.33	0.25	0.11	0.10	0.41	0.17	0.07	0.24	0.07	0.01	0.42	0.00	0.00	0.00
OP2	0.12	0.36	0.14	0.12	0.36	0.07	0.49	0.14	0.53	0.43	0.46	0.32	0.29	0.55	0.29	0.10	0.15	0.09	0.02	0.60	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.19	0.13	0.17	0.23	0.02	0.33	0.01	0.35	0.36	0.27	0.15	0.15	0.42	0.21	0.09	0.20	0.07	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.10	0.10	0.33	0.09	0.24	0.07	0.41	0.07	0.07	0.11	0.11	0.11	0.24	0.37	0.15	0.54	0.81	1.03	0.77
C2	0.07	0.11	0.15	0.31	0.13	0.29	0.10	0.49	0.08	0.08	0.13	0.17	0.11	0.31	0.40	0.19	0.66	0.99	1.13	0.92
C2'	0.11	0.14	0.15	0.35	0.14	0.25	0.11	0.41	0.11	0.12	0.15	0.15	0.15	0.31	0.40	0.15	0.57	0.86	1.07	0.80
C3'	0.18	0.19	0.16	0.19	0.17	0.10	0.17	0.29	0.17	0.18	0.18	0.16	0.20	0.41	0.21	0.14	0.41	0.68	0.95	0.65
C4	0.06	0.10	0.11	0.32	0.11	0.26	0.08	0.43	0.07	0.07	0.12	0.15	0.11	0.26	0.37	0.16	0.58	0.85	1.05	0.80
C4'	0.13	0.15	0.11	0.21	0.13	0.12	0.11	0.31	0.11	0.13	0.16	0.13	0.18	0.34	0.22	0.11	0.43	0.69	0.95	0.66
C5	0.06	0.10	0.10	0.31	0.11	0.24	0.07	0.41	0.06	0.07	0.12	0.15	0.11	0.24	0.35	0.16	0.55	0.78	1.01	0.76
C5'	0.20	0.22	0.18	0.15	0.18	0.08	0.15	0.26	0.16	0.19	0.21	0.17	0.25	0.41	0.13	0.15	0.32	0.54	0.85	0.53
C6	0.06	0.10	0.11	0.30	0.13	0.26	0.09	0.44	0.07	0.08	0.13	0.17	0.10	0.27	0.35	0.17	0.60	0.84	1.04	0.81
C8	0.07	0.10	0.10	0.31	0.09	0.21	0.07	0.36	0.07	0.07	0.11	0.11	0.11	0.21	0.33	0.13	0.47	0.68	0.94	0.66
N1	0.07	0.11	0.15	0.30	0.14	0.29	0.10	0.49	0.08	0.09	0.13	0.17	0.11	0.30	0.38	0.19	0.66	0.96	1.12	0.91
N2	0.08	0.11	0.17	0.31	0.14	0.31	0.11	0.52	0.09	0.09	0.14	0.17	0.11	0.33	0.42	0.19	0.70	1.08	1.15	0.98
N3	0.07	0.10	0.13	0.32	0.12	0.28	0.09	0.47	0.07	0.08	0.13	0.16	0.11	0.29	0.40	0.18	0.63	0.94	1.10	0.88
N7	0.07	0.10	0.09	0.30	0.10	0.21	0.07	0.36	0.07	0.07	0.12	0.13	0.11	0.21	0.31	0.14	0.47	0.67	0.92	0.65
N9	0.06	0.10	0.10	0.32	0.10	0.23	0.07	0.40	0.07	0.07	0.12	0.12	0.11	0.23	0.36	0.15	0.53	0.78	1.01	0.75
O2'	0.15	0.16	0.22	0.46	0.16	0.36	0.15	0.52	0.15	0.15	0.17	0.17	0.17	0.30	0.53	0.23	0.70	1.03	1.20	0.95
O3'	0.24	0.24	0.21	0.19	0.21	0.09	0.21	0.26	0.22	0.23	0.23	0.19	0.26	0.47	0.21	0.17	0.41	0.72	0.99	0.68
O4'	0.08	0.10	0.08	0.29	0.09	0.20	0.08	0.37	0.08	0.08	0.11	0.10	0.12	0.24	0.31	0.13	0.49	0.73	0.98	0.70
O5'	0.46	0.49	0.47	0.24	0.44	0.31	0.39	0.33	0.41	0.45	0.48	0.42	0.52	0.72	0.27	0.39	0.14	0.31	0.65	0.31
O6	0.06	0.10	0.12	0.28	0.13	0.26	0.09	0.43	0.07	0.08	0.13	0.17	0.10	0.26	0.32	0.18	0.58	0.78	0.99	0.78
OP1	0.77	0.80	0.77	0.55	0.68	0.60	0.61	0.52	0.65	0.74	0.78	0.65	0.87	1.06	0.63	0.67	0.27	0.15	0.54	0.18
OP2	0.84	0.85	0.82	0.64	0.79	0.73	0.74	0.68	0.77	0.82	0.85	0.76	0.88	1.07	0.71	0.79	0.46	0.32	0.42	0.28
P	0.66	0.69	0.66	0.45	0.62	0.52	0.55	0.47	0.58	0.64	0.69	0.60	0.74	0.92	0.51	0.58	0.23	0.16	0.51	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.16	0.01	0.06	0.35	0.14	0.10
C2	0.01	0.00	0.10	0.11	0.01	0.03	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.12	0.08	0.12	0.29	0.33	0.14
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.08	0.03	0.10	0.17	0.10	0.05	0.09	0.09	0.14	0.01	0.05	0.01	0.12	0.37	0.12	0.17
C3'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.21	0.00	0.23	0.04	0.20	0.12	0.16	0.23	0.07	0.02	0.01	0.02	0.19	0.37	0.15	0.19
C4	0.01	0.01	0.08	0.21	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.18	0.02	0.26	0.37	0.59	0.36
C4'	0.02	0.03	0.03	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.16	0.05	0.03	0.10	0.10	0.16	0.03	0.01	0.02	0.39	0.10	0.18
C5	0.01	0.01	0.10	0.23	0.00	0.15	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.22	0.09	0.36	0.45	0.65	0.46
C5'	0.10	0.14	0.17	0.04	0.22	0.01	0.28	0.00	0.26	0.16	0.16	0.24	0.13	0.09	0.12	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.20	0.01	0.16	0.00	0.26	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.19	0.12	0.32	0.40	0.50	0.38
N1	0.00	0.01	0.05	0.12	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.02	0.15	0.31	0.33	0.19
N3	0.01	0.00	0.09	0.16	0.00	0.03	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.13	0.06	0.17	0.29	0.46	0.22
N4	0.01	0.01	0.09	0.23	0.00	0.10	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.20	0.02	0.29	0.40	0.67	0.41
O2	0.02	0.00	0.14	0.07	0.01	0.10	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.18	0.15	0.13	0.33	0.23	0.08
O2'	0.03	0.10	0.01	0.02	0.16	0.16	0.19	0.09	0.18	0.10	0.13	0.18	0.15	0.00	0.10	0.09	0.15	0.33	0.12	0.15
O3'	0.16	0.12	0.05	0.01	0.18	0.03	0.22	0.12	0.19	0.13	0.13	0.20	0.18	0.10	0.00	0.13	0.23	0.44	0.23	0.26
O4'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.02	0.12	0.02	0.06	0.02	0.15	0.09	0.13	0.00	0.07	0.35	0.13	0.12
O5'	0.06	0.12	0.12	0.19	0.26	0.02	0.36	0.01	0.32	0.15	0.17	0.29	0.13	0.15	0.23	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.35	0.29	0.37	0.37	0.37	0.39	0.45	0.06	0.40	0.31	0.29	0.40	0.33	0.33	0.44	0.35	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.14	0.33	0.12	0.15	0.59	0.10	0.65	0.12	0.50	0.33	0.46	0.67	0.23	0.12	0.23	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.14	0.17	0.19	0.36	0.18	0.46	0.01	0.38	0.19	0.22	0.41	0.08	0.15	0.26	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00