Doublet Group distance statistics: 49412

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 14, 30, 25, 25, 22, 12, 6, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.014, 0.021, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.014 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.009, 0.021, 0.032, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.010, 0.023, 0.035, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.009, 0.022, 0.034, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.026 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.024, 0.054, 0.084, 0.197 max_d=0.197 avg_d=0.054 std_dev=0.030
O4	A	0, 0.010, 0.064, 0.117, 0.340 max_d=0.340 avg_d=0.064 std_dev=0.053
C2'	A	0, 0.135, 0.249, 0.364, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.249 std_dev=0.114
O4'	A	0, 0.051, 0.183, 0.315, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.183 std_dev=0.132
C4	B	0, 0.222, 0.396, 0.569, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.396 std_dev=0.173
N3	B	0, 0.293, 0.476, 0.658, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.476 std_dev=0.182
N9	B	0, 0.234, 0.417, 0.600, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.417 std_dev=0.183
O2'	A	0, 0.149, 0.341, 0.532, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.341 std_dev=0.191
C8	B	0, 0.265, 0.468, 0.672, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.468 std_dev=0.203
C5	B	0, 0.214, 0.424, 0.634, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.424 std_dev=0.210
C2	B	0, 0.348, 0.565, 0.783, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.565 std_dev=0.218
C4'	A	0, 0.167, 0.395, 0.623, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.395 std_dev=0.228
N7	B	0, 0.238, 0.469, 0.701, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.469 std_dev=0.232
C3'	B	0, 0.248, 0.484, 0.720, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.484 std_dev=0.236
O3'	B	0, 0.263, 0.505, 0.747, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.505 std_dev=0.242
C1'	B	0, 0.239, 0.485, 0.731, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.485 std_dev=0.246
N1	B	0, 0.330, 0.581, 0.832, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.581 std_dev=0.251
C6	B	0, 0.261, 0.521, 0.781, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.521 std_dev=0.260
C3'	A	0, 0.204, 0.466, 0.728, 1.840 max_d=1.840 avg_d=0.466 std_dev=0.262
P	A	0, 0.252, 0.514, 0.776, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.514 std_dev=0.262
O5'	A	0, 0.183, 0.452, 0.722, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.452 std_dev=0.269
N2	B	0, 0.438, 0.717, 0.996, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.717 std_dev=0.279
C2'	B	0, 0.169, 0.455, 0.741, 2.133 max_d=2.133 avg_d=0.455 std_dev=0.286
C5'	A	0, 0.199, 0.494, 0.789, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.494 std_dev=0.295
O4'	B	0, 0.275, 0.579, 0.883, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.579 std_dev=0.304
C4'	B	0, 0.297, 0.603, 0.909, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.603 std_dev=0.306
OP2	A	0, 0.323, 0.637, 0.951, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.637 std_dev=0.314
O6	B	0, 0.299, 0.628, 0.956, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.628 std_dev=0.329
OP1	A	0, 0.348, 0.686, 1.025, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.686 std_dev=0.339
C5'	B	0, 0.343, 0.757, 1.171, 2.105 max_d=2.105 avg_d=0.757 std_dev=0.414
O3'	A	0, 0.299, 0.756, 1.214, 3.202 max_d=3.202 avg_d=0.756 std_dev=0.458
O2'	B	0, 0.097, 0.570, 1.043, 3.893 max_d=3.893 avg_d=0.570 std_dev=0.473
O5'	B	0, 1.574, 2.294, 3.014, 4.380 max_d=4.380 avg_d=2.294 std_dev=0.720
P	B	0, 1.821, 2.741, 3.661, 5.583 max_d=5.583 avg_d=2.741 std_dev=0.920
OP2	B	0, 1.894, 2.825, 3.756, 5.775 max_d=5.775 avg_d=2.825 std_dev=0.931
OP1	B	0, 2.146, 3.279, 4.412, 6.476 max_d=6.476 avg_d=3.279 std_dev=1.133

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.10	0.02	0.00	0.09	0.08	0.17	0.11
C2	0.02	0.00	0.07	0.11	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.11	0.01	0.03	0.12	0.12	0.22	0.14
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.02	0.06	0.07	0.07	0.03	0.07	0.12	0.00	0.02	0.07	0.01	0.16	0.17	0.22	0.16
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.16	0.00	0.17	0.02	0.15	0.09	0.13	0.10	0.02	0.01	0.17	0.02	0.09	0.13	0.11	0.09
C4	0.02	0.01	0.06	0.16	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.15	0.01	0.03	0.18	0.21	0.28	0.21
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.09	0.04	0.05	0.05	0.11	0.02	0.08	0.00	0.02	0.08	0.08	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.17	0.01	0.09	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.16	0.01	0.04	0.19	0.21	0.27	0.21
C5'	0.03	0.06	0.07	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.06	0.09	0.05	0.07	0.08	0.13	0.02	0.01	0.08	0.07	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.13	0.01	0.04	0.16	0.15	0.22	0.17
N1	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.02	0.12	0.11	0.20	0.13
N3	0.02	0.00	0.07	0.13	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.12	0.01	0.03	0.15	0.16	0.25	0.18
O2	0.04	0.01	0.12	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.16	0.02	0.06	0.11	0.10	0.21	0.13
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.13	0.11	0.12	0.07	0.10	0.07	0.12	0.13	0.00	0.05	0.15	0.08	0.11	0.14	0.22	0.13
O3'	0.10	0.11	0.02	0.01	0.15	0.02	0.16	0.08	0.13	0.07	0.12	0.16	0.05	0.00	0.17	0.08	0.14	0.25	0.19	0.17
O4	0.02	0.01	0.07	0.17	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.17	0.00	0.04	0.19	0.24	0.31	0.23
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.06	0.08	0.08	0.04	0.00	0.08	0.09	0.16	0.11
O5'	0.09	0.12	0.16	0.09	0.18	0.02	0.19	0.01	0.16	0.12	0.15	0.11	0.11	0.14	0.19	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.12	0.17	0.13	0.21	0.08	0.21	0.08	0.15	0.11	0.16	0.10	0.14	0.25	0.24	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.22	0.22	0.11	0.28	0.08	0.27	0.07	0.22	0.20	0.25	0.21	0.22	0.19	0.31	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.14	0.16	0.09	0.21	0.03	0.21	0.02	0.17	0.13	0.18	0.13	0.13	0.17	0.23	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.20	0.19	0.18	0.16	0.15	0.20	0.20	0.22	0.19	0.21	0.25	0.18	0.21	0.17	0.27	0.17	0.17	0.43	0.25	0.59	0.46	0.45
C2	0.17	0.15	0.16	0.20	0.15	0.18	0.21	0.30	0.21	0.22	0.15	0.24	0.15	0.26	0.17	0.28	0.17	0.17	0.55	0.27	0.72	0.63	0.59
C2'	0.16	0.21	0.17	0.17	0.15	0.13	0.18	0.20	0.21	0.18	0.21	0.27	0.18	0.20	0.15	0.27	0.16	0.15	0.45	0.25	0.66	0.50	0.49
C3'	0.15	0.20	0.16	0.13	0.13	0.10	0.16	0.17	0.19	0.17	0.19	0.27	0.17	0.19	0.13	0.26	0.11	0.11	0.43	0.22	0.67	0.48	0.48
C4	0.20	0.22	0.20	0.23	0.14	0.27	0.12	0.42	0.12	0.23	0.19	0.27	0.19	0.22	0.18	0.37	0.21	0.23	0.66	0.17	0.84	0.76	0.72
C4'	0.15	0.24	0.19	0.13	0.16	0.10	0.17	0.12	0.20	0.16	0.23	0.30	0.21	0.18	0.14	0.26	0.12	0.13	0.35	0.22	0.55	0.36	0.37
C5	0.22	0.22	0.22	0.24	0.17	0.27	0.14	0.40	0.16	0.20	0.19	0.26	0.21	0.19	0.19	0.41	0.21	0.24	0.63	0.19	0.81	0.66	0.67
C5'	0.18	0.25	0.21	0.13	0.18	0.12	0.18	0.13	0.20	0.17	0.22	0.31	0.23	0.18	0.16	0.28	0.11	0.14	0.31	0.20	0.53	0.31	0.35
C6	0.20	0.21	0.19	0.21	0.15	0.20	0.15	0.31	0.16	0.18	0.17	0.25	0.20	0.19	0.16	0.35	0.18	0.19	0.53	0.18	0.71	0.55	0.56
N1	0.17	0.17	0.16	0.19	0.13	0.17	0.17	0.26	0.19	0.19	0.16	0.23	0.15	0.21	0.15	0.29	0.16	0.16	0.51	0.22	0.67	0.55	0.53
N3	0.17	0.18	0.16	0.21	0.13	0.22	0.18	0.37	0.15	0.23	0.13	0.27	0.16	0.26	0.17	0.31	0.18	0.19	0.62	0.22	0.79	0.72	0.67
O2	0.19	0.18	0.18	0.20	0.19	0.18	0.25	0.28	0.28	0.24	0.22	0.25	0.18	0.28	0.20	0.27	0.17	0.18	0.53	0.34	0.69	0.63	0.57
O2'	0.20	0.26	0.21	0.16	0.20	0.14	0.22	0.17	0.26	0.20	0.27	0.33	0.23	0.23	0.18	0.30	0.15	0.18	0.41	0.30	0.61	0.48	0.45
O3'	0.15	0.29	0.16	0.14	0.16	0.11	0.18	0.18	0.23	0.16	0.27	0.39	0.23	0.18	0.13	0.26	0.14	0.12	0.43	0.25	0.69	0.49	0.49
O4	0.23	0.25	0.23	0.25	0.18	0.31	0.16	0.47	0.17	0.26	0.24	0.30	0.21	0.24	0.21	0.40	0.23	0.28	0.71	0.20	0.90	0.85	0.80
O4'	0.17	0.24	0.20	0.17	0.16	0.15	0.18	0.17	0.21	0.18	0.23	0.29	0.20	0.19	0.15	0.27	0.18	0.16	0.37	0.23	0.52	0.37	0.37
O5'	0.16	0.21	0.18	0.09	0.15	0.06	0.17	0.13	0.19	0.19	0.20	0.26	0.19	0.20	0.15	0.26	0.02	0.09	0.40	0.21	0.63	0.36	0.43
OP1	0.09	0.17	0.09	0.03	0.09	0.07	0.12	0.19	0.14	0.16	0.15	0.24	0.15	0.18	0.07	0.17	0.02	0.06	0.26	0.17	0.56	0.33	0.35
OP2	0.13	0.20	0.16	0.06	0.17	0.13	0.22	0.26	0.24	0.24	0.21	0.22	0.17	0.27	0.15	0.32	0.02	0.12	0.45	0.27	0.75	0.43	0.53
P	0.09	0.16	0.09	0.01	0.09	0.06	0.13	0.16	0.15	0.16	0.15	0.20	0.14	0.18	0.08	0.20	0.01	0.04	0.33	0.18	0.60	0.31	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.16	0.02	0.19	0.26	0.15
C2	0.03	0.00	0.13	0.14	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.15	0.06	0.34	0.01	0.38	0.40	0.31
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.05	0.06	0.08	0.10	0.16	0.13	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.24	0.06	0.31	0.24	0.21
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.13	0.13	0.14	0.16	0.13	0.13	0.08	0.02	0.01	0.02	0.28	0.14	0.38	0.15	0.23
C4	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.08	0.03	0.35	0.01	0.36	0.37	0.30
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.12	0.07	0.07	0.05	0.12	0.06	0.09	0.02	0.00	0.02	0.10	0.13	0.24	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.09	0.02	0.44	0.01	0.44	0.46	0.40
C5'	0.05	0.15	0.05	0.02	0.16	0.01	0.22	0.00	0.23	0.24	0.19	0.13	0.13	0.26	0.15	0.05	0.08	0.02	0.01	0.25	0.19	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.09	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.10	0.03	0.46	0.01	0.49	0.51	0.44
C8	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.12	0.01	0.24	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.13	0.12	0.05	0.43	0.02	0.39	0.37	0.36
N1	0.03	0.01	0.10	0.14	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.04	0.41	0.01	0.44	0.47	0.39
N2	0.04	0.01	0.16	0.16	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.19	0.07	0.31	0.02	0.36	0.39	0.29
N3	0.03	0.01	0.13	0.13	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.14	0.06	0.30	0.01	0.33	0.35	0.26
N7	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.12	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.12	0.04	0.48	0.03	0.47	0.48	0.44
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.01	0.32	0.02	0.30	0.31	0.26
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.09	0.09	0.12	0.05	0.13	0.13	0.12	0.17	0.12	0.15	0.07	0.00	0.05	0.08	0.10	0.14	0.20	0.27	0.13
O3'	0.08	0.15	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.08	0.10	0.12	0.12	0.19	0.14	0.12	0.05	0.05	0.00	0.04	0.23	0.12	0.44	0.18	0.25
O4'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.07	0.06	0.04	0.01	0.08	0.04	0.00	0.12	0.03	0.15	0.33	0.18
O5'	0.16	0.34	0.24	0.28	0.35	0.02	0.44	0.01	0.46	0.43	0.41	0.31	0.30	0.48	0.32	0.10	0.23	0.12	0.00	0.50	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.14	0.01	0.10	0.01	0.25	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.14	0.12	0.03	0.50	0.00	0.54	0.57	0.50
OP1	0.19	0.38	0.31	0.38	0.36	0.13	0.44	0.19	0.49	0.39	0.44	0.36	0.33	0.47	0.30	0.20	0.44	0.15	0.02	0.54	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.40	0.24	0.15	0.37	0.24	0.46	0.30	0.51	0.37	0.47	0.39	0.35	0.48	0.31	0.27	0.18	0.33	0.02	0.57	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.31	0.21	0.23	0.30	0.06	0.40	0.02	0.44	0.36	0.39	0.29	0.26	0.44	0.26	0.13	0.25	0.18	0.01	0.50	0.01	0.01	0.00