Doublet Group distance statistics: 49413

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 2, 7, 7, 14, 16, 6, 5, 5, 5, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.024 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.009, 0.024, 0.040, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.024 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.033, 0.061, 0.088, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.061 std_dev=0.028
O4	A	0, 0.005, 0.073, 0.140, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.073 std_dev=0.068
O4'	A	0, -0.012, 0.144, 0.300, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.144 std_dev=0.156
C2'	A	0, -0.016, 0.158, 0.331, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.158 std_dev=0.174
C2'	B	0, 0.236, 0.461, 0.687, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.461 std_dev=0.225
C4	B	0, 0.364, 0.603, 0.843, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.603 std_dev=0.240
N3	B	0, 0.528, 0.768, 1.007, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.768 std_dev=0.240
N9	B	0, 0.290, 0.537, 0.784, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.537 std_dev=0.247
C1'	B	0, 0.253, 0.502, 0.751, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.502 std_dev=0.249
C3'	B	0, 0.201, 0.453, 0.706, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.453 std_dev=0.253
C4'	A	0, -0.004, 0.253, 0.510, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.253 std_dev=0.257
C3'	A	0, 0.013, 0.282, 0.551, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.282 std_dev=0.269
O4'	B	0, 0.260, 0.554, 0.847, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.554 std_dev=0.293
O2'	B	0, 0.276, 0.570, 0.865, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.570 std_dev=0.295
C2	B	0, 0.606, 0.904, 1.203, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.904 std_dev=0.299
C8	B	0, 0.406, 0.709, 1.011, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.709 std_dev=0.302
O2'	A	0, -0.059, 0.249, 0.556, 2.174 max_d=2.174 avg_d=0.249 std_dev=0.308
C5	B	0, 0.358, 0.666, 0.974, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.666 std_dev=0.308
O5'	A	0, 0.075, 0.385, 0.696, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.385 std_dev=0.310
O3'	B	0, 0.150, 0.475, 0.800, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.475 std_dev=0.325
N7	B	0, 0.448, 0.785, 1.121, 1.863 max_d=1.863 avg_d=0.785 std_dev=0.336
N1	B	0, 0.523, 0.862, 1.201, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.862 std_dev=0.339
C4'	B	0, 0.203, 0.546, 0.889, 1.794 max_d=1.794 avg_d=0.546 std_dev=0.343
P	A	0, 0.097, 0.445, 0.793, 1.921 max_d=1.921 avg_d=0.445 std_dev=0.348
C5'	A	0, 0.034, 0.388, 0.742, 2.057 max_d=2.057 avg_d=0.388 std_dev=0.354
C6	B	0, 0.415, 0.770, 1.126, 1.672 max_d=1.672 avg_d=0.770 std_dev=0.356
N2	B	0, 0.776, 1.164, 1.552, 2.243 max_d=2.243 avg_d=1.164 std_dev=0.388
O3'	A	0, 0.016, 0.448, 0.879, 2.716 max_d=2.716 avg_d=0.448 std_dev=0.432
O6	B	0, 0.438, 0.876, 1.313, 2.047 max_d=2.047 avg_d=0.876 std_dev=0.437
OP2	A	0, 0.067, 0.508, 0.950, 2.719 max_d=2.719 avg_d=0.508 std_dev=0.442
C5'	B	0, 0.319, 0.780, 1.240, 2.348 max_d=2.348 avg_d=0.780 std_dev=0.460
OP1	A	0, 0.131, 0.592, 1.052, 2.479 max_d=2.479 avg_d=0.592 std_dev=0.461
O5'	B	0, 0.454, 1.058, 1.663, 3.158 max_d=3.158 avg_d=1.058 std_dev=0.605
P	B	0, 0.875, 1.561, 2.246, 4.023 max_d=4.023 avg_d=1.561 std_dev=0.685
OP2	B	0, 1.205, 1.928, 2.652, 4.676 max_d=4.676 avg_d=1.928 std_dev=0.724
OP1	B	0, 1.037, 1.968, 2.899, 5.909 max_d=5.909 avg_d=1.968 std_dev=0.931

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.12	0.03	0.01	0.09	0.11	0.15	0.09
C2	0.03	0.00	0.09	0.13	0.01	0.05	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.02	0.05	0.16	0.21	0.25	0.16
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.06	0.01	0.08	0.07	0.08	0.03	0.08	0.16	0.00	0.02	0.07	0.01	0.19	0.23	0.23	0.19
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.18	0.01	0.17	0.02	0.15	0.11	0.16	0.14	0.02	0.01	0.20	0.02	0.12	0.20	0.12	0.11
C4	0.03	0.01	0.06	0.18	0.00	0.09	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.16	0.15	0.01	0.04	0.23	0.33	0.38	0.25
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.06	0.06	0.13	0.02	0.10	0.01	0.02	0.11	0.10	0.02
C5	0.02	0.02	0.08	0.17	0.01	0.11	0.00	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.18	0.16	0.01	0.05	0.24	0.33	0.37	0.26
C5'	0.03	0.08	0.07	0.02	0.15	0.01	0.16	0.00	0.14	0.08	0.11	0.08	0.07	0.09	0.16	0.02	0.01	0.13	0.14	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.10	0.01	0.14	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.12	0.01	0.06	0.20	0.25	0.27	0.20
N1	0.01	0.01	0.03	0.11	0.02	0.05	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.07	0.02	0.02	0.15	0.18	0.21	0.14
N3	0.03	0.01	0.08	0.16	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.14	0.01	0.04	0.20	0.27	0.32	0.21
O2	0.05	0.01	0.16	0.14	0.02	0.06	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.11	0.18	0.03	0.08	0.15	0.18	0.22	0.15
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.16	0.13	0.18	0.07	0.16	0.09	0.13	0.11	0.00	0.05	0.18	0.09	0.13	0.19	0.25	0.15
O3'	0.12	0.13	0.02	0.01	0.15	0.02	0.16	0.09	0.12	0.07	0.14	0.18	0.05	0.00	0.18	0.08	0.15	0.30	0.23	0.19
O4	0.03	0.02	0.07	0.20	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.03	0.18	0.18	0.00	0.04	0.25	0.37	0.42	0.28
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.04	0.08	0.09	0.08	0.04	0.00	0.07	0.08	0.14	0.10
O5'	0.09	0.16	0.19	0.12	0.23	0.02	0.24	0.01	0.20	0.15	0.20	0.15	0.13	0.15	0.25	0.07	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.11	0.21	0.23	0.20	0.33	0.11	0.33	0.13	0.25	0.18	0.27	0.18	0.19	0.30	0.37	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.25	0.23	0.12	0.38	0.10	0.37	0.14	0.27	0.21	0.32	0.22	0.25	0.23	0.42	0.14	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.16	0.19	0.11	0.25	0.02	0.26	0.02	0.20	0.14	0.21	0.15	0.15	0.19	0.28	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.32	0.19	0.19	0.25	0.18	0.31	0.21	0.34	0.30	0.34	0.40	0.26	0.33	0.25	0.28	0.19	0.20	0.42	0.37	0.57	0.49	0.44
C2	0.20	0.22	0.20	0.20	0.19	0.20	0.28	0.25	0.31	0.30	0.25	0.36	0.17	0.35	0.22	0.27	0.21	0.20	0.49	0.38	0.62	0.59	0.50
C2'	0.18	0.32	0.15	0.19	0.23	0.17	0.30	0.24	0.33	0.30	0.34	0.42	0.25	0.33	0.22	0.23	0.19	0.17	0.48	0.37	0.70	0.57	0.55
C3'	0.15	0.30	0.13	0.12	0.20	0.10	0.25	0.15	0.29	0.26	0.30	0.39	0.24	0.29	0.19	0.22	0.13	0.11	0.42	0.32	0.67	0.54	0.49
C4	0.25	0.27	0.25	0.26	0.19	0.28	0.22	0.36	0.16	0.34	0.20	0.38	0.23	0.36	0.25	0.27	0.26	0.27	0.57	0.24	0.71	0.70	0.60
C4'	0.18	0.33	0.15	0.12	0.24	0.11	0.27	0.12	0.29	0.26	0.32	0.40	0.28	0.28	0.21	0.22	0.13	0.14	0.35	0.31	0.55	0.42	0.39
C5	0.24	0.25	0.25	0.28	0.16	0.29	0.20	0.36	0.17	0.34	0.20	0.34	0.21	0.34	0.24	0.27	0.27	0.27	0.57	0.24	0.71	0.67	0.60
C5'	0.21	0.33	0.20	0.13	0.24	0.13	0.25	0.12	0.27	0.24	0.30	0.39	0.30	0.25	0.22	0.26	0.13	0.16	0.33	0.27	0.57	0.39	0.38
C6	0.22	0.25	0.23	0.24	0.18	0.24	0.25	0.29	0.25	0.32	0.23	0.34	0.20	0.34	0.23	0.27	0.24	0.23	0.51	0.29	0.65	0.58	0.53
N1	0.20	0.26	0.20	0.20	0.20	0.19	0.29	0.24	0.30	0.31	0.27	0.36	0.20	0.34	0.23	0.27	0.20	0.20	0.47	0.35	0.61	0.55	0.49
N3	0.22	0.23	0.22	0.23	0.18	0.23	0.26	0.30	0.24	0.32	0.17	0.38	0.20	0.35	0.23	0.27	0.23	0.23	0.53	0.34	0.66	0.65	0.55
O2	0.21	0.23	0.19	0.19	0.21	0.19	0.30	0.23	0.34	0.30	0.29	0.35	0.19	0.34	0.23	0.28	0.20	0.20	0.47	0.42	0.59	0.57	0.48
O2'	0.22	0.38	0.18	0.17	0.27	0.16	0.33	0.21	0.38	0.31	0.38	0.48	0.31	0.35	0.25	0.29	0.16	0.19	0.44	0.42	0.68	0.54	0.52
O3'	0.15	0.33	0.14	0.13	0.21	0.11	0.26	0.16	0.30	0.25	0.33	0.43	0.26	0.28	0.18	0.22	0.15	0.11	0.42	0.34	0.70	0.56	0.50
O4	0.28	0.32	0.26	0.28	0.24	0.31	0.25	0.40	0.19	0.36	0.27	0.40	0.27	0.38	0.28	0.28	0.27	0.31	0.59	0.21	0.74	0.76	0.64
O4'	0.20	0.32	0.18	0.19	0.25	0.17	0.30	0.19	0.32	0.29	0.33	0.39	0.27	0.31	0.24	0.26	0.21	0.18	0.38	0.34	0.51	0.43	0.38
O5'	0.19	0.33	0.20	0.08	0.24	0.07	0.24	0.09	0.27	0.23	0.31	0.39	0.30	0.25	0.20	0.27	0.02	0.12	0.37	0.28	0.63	0.44	0.44
OP1	0.12	0.29	0.11	0.10	0.21	0.12	0.25	0.22	0.28	0.27	0.29	0.34	0.25	0.29	0.18	0.14	0.02	0.12	0.38	0.31	0.72	0.51	0.50
OP2	0.15	0.33	0.14	0.12	0.26	0.17	0.31	0.29	0.34	0.30	0.34	0.36	0.29	0.34	0.23	0.12	0.02	0.17	0.52	0.37	0.81	0.57	0.61
P	0.05	0.25	0.09	0.02	0.15	0.06	0.16	0.15	0.20	0.17	0.23	0.31	0.22	0.18	0.09	0.13	0.01	0.03	0.35	0.22	0.65	0.40	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.14	0.02	0.15	0.25	0.14
C2	0.04	0.00	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.19	0.05	0.29	0.02	0.35	0.38	0.26
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.15	0.12	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.17	0.06	0.24	0.21	0.13
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.11	0.11	0.13	0.17	0.13	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.23	0.12	0.34	0.20	0.20
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.31	0.01	0.33	0.36	0.26
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.06	0.08	0.06	0.09	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.09	0.13	0.23	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.39	0.02	0.42	0.44	0.34
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.11	0.01	0.15	0.00	0.16	0.17	0.13	0.10	0.08	0.19	0.10	0.06	0.04	0.02	0.01	0.19	0.20	0.26	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.14	0.02	0.40	0.01	0.46	0.49	0.37
C8	0.01	0.02	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.17	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.12	0.04	0.39	0.03	0.36	0.37	0.30
N1	0.03	0.01	0.10	0.13	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.17	0.03	0.35	0.01	0.42	0.45	0.32
N2	0.05	0.01	0.15	0.17	0.01	0.08	0.02	0.10	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.23	0.07	0.27	0.03	0.34	0.36	0.25
N3	0.04	0.01	0.12	0.13	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.17	0.05	0.26	0.02	0.30	0.33	0.22
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.09	0.00	0.19	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.04	0.44	0.03	0.45	0.47	0.38
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.28	0.02	0.27	0.31	0.22
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.07	0.05	0.06	0.06	0.08	0.04	0.11	0.17	0.13	0.04	0.03	0.00	0.05	0.04	0.06	0.08	0.17	0.20	0.09
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.10	0.02	0.11	0.04	0.14	0.12	0.17	0.23	0.17	0.13	0.06	0.05	0.00	0.02	0.22	0.15	0.45	0.25	0.25
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.07	0.05	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.11	0.04	0.13	0.31	0.20
O5'	0.14	0.29	0.17	0.23	0.31	0.02	0.39	0.01	0.40	0.39	0.35	0.27	0.26	0.44	0.28	0.06	0.22	0.11	0.00	0.44	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.12	0.01	0.09	0.02	0.19	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.08	0.15	0.04	0.44	0.00	0.52	0.56	0.42
OP1	0.15	0.35	0.24	0.34	0.33	0.13	0.42	0.20	0.46	0.36	0.42	0.34	0.30	0.45	0.27	0.17	0.45	0.13	0.02	0.52	0.00	0.02	0.01
OP2	0.25	0.38	0.21	0.20	0.36	0.23	0.44	0.26	0.49	0.37	0.45	0.36	0.33	0.47	0.31	0.20	0.25	0.31	0.02	0.56	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.26	0.13	0.20	0.26	0.07	0.34	0.02	0.37	0.30	0.32	0.25	0.22	0.38	0.22	0.09	0.25	0.20	0.01	0.42	0.01	0.01	0.00