Doublet Group distance statistics: 49415

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 9, 4, 14, 8, 5, 2, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.016, 0.025, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.001, 0.016, 0.030, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.020 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.004, 0.047, 0.089, 0.281 max_d=0.281 avg_d=0.047 std_dev=0.042
O4	A	0, 0.015, 0.060, 0.105, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.060 std_dev=0.045
O4'	A	0, 0.032, 0.099, 0.165, 0.333 max_d=0.333 avg_d=0.099 std_dev=0.067
C2'	A	0, 0.034, 0.121, 0.209, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.121 std_dev=0.088
O2'	A	0, 0.058, 0.181, 0.305, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.181 std_dev=0.124
C4'	A	0, 0.049, 0.180, 0.310, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.180 std_dev=0.130
C3'	A	0, 0.080, 0.212, 0.343, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.212 std_dev=0.131
C4	B	0, 0.217, 0.387, 0.556, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.387 std_dev=0.170
N9	B	0, 0.208, 0.389, 0.571, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.389 std_dev=0.181
C5	B	0, 0.241, 0.429, 0.616, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.429 std_dev=0.188
C8	B	0, 0.248, 0.442, 0.637, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.442 std_dev=0.194
N7	B	0, 0.265, 0.473, 0.682, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.473 std_dev=0.208
N3	B	0, 0.202, 0.422, 0.643, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.422 std_dev=0.220
O3'	A	0, 0.124, 0.347, 0.569, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.347 std_dev=0.222
C2'	B	0, 0.142, 0.370, 0.598, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.370 std_dev=0.228
O5'	A	0, 0.069, 0.298, 0.528, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.298 std_dev=0.229
C6	B	0, 0.248, 0.489, 0.731, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.489 std_dev=0.242
C5'	A	0, 0.040, 0.282, 0.523, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.282 std_dev=0.242
C1'	B	0, 0.180, 0.431, 0.682, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.431 std_dev=0.251
C3'	B	0, 0.171, 0.423, 0.674, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.423 std_dev=0.251
C2	B	0, 0.209, 0.472, 0.736, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.472 std_dev=0.263
P	A	0, 0.132, 0.399, 0.667, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.399 std_dev=0.267
O3'	B	0, 0.180, 0.450, 0.720, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.450 std_dev=0.270
N1	B	0, 0.225, 0.497, 0.768, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.497 std_dev=0.271
OP2	A	0, 0.177, 0.462, 0.748, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.462 std_dev=0.285
O6	B	0, 0.269, 0.573, 0.877, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.573 std_dev=0.304
O2'	B	0, 0.163, 0.473, 0.783, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.473 std_dev=0.310
OP1	A	0, 0.173, 0.503, 0.833, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.503 std_dev=0.330
O4'	B	0, 0.201, 0.539, 0.876, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.539 std_dev=0.337
N2	B	0, 0.196, 0.553, 0.910, 1.891 max_d=1.891 avg_d=0.553 std_dev=0.357
C4'	B	0, 0.174, 0.551, 0.928, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.551 std_dev=0.377
C5'	B	0, 0.227, 0.744, 1.260, 2.304 max_d=2.304 avg_d=0.744 std_dev=0.516
O5'	B	0, 0.287, 0.820, 1.352, 2.279 max_d=2.279 avg_d=0.820 std_dev=0.532
P	B	0, 0.343, 1.034, 1.724, 3.296 max_d=3.296 avg_d=1.034 std_dev=0.690
OP2	B	0, 0.320, 1.010, 1.701, 3.282 max_d=3.282 avg_d=1.010 std_dev=0.690
OP1	B	0, 0.365, 1.247, 2.128, 4.291 max_d=4.291 avg_d=1.247 std_dev=0.882

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.04	0.00	0.13	0.14	0.15	0.11
C2	0.03	0.00	0.07	0.09	0.02	0.05	0.02	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.10	0.03	0.03	0.19	0.20	0.23	0.18
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.07	0.11	0.01	0.02	0.08	0.01	0.09	0.14	0.13	0.09
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.13	0.00	0.13	0.02	0.12	0.07	0.11	0.11	0.02	0.01	0.14	0.01	0.08	0.15	0.11	0.08
C4	0.03	0.02	0.07	0.13	0.00	0.10	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.17	0.01	0.04	0.22	0.25	0.29	0.24
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.07	0.06	0.05	0.03	0.10	0.00	0.02	0.10	0.07	0.03
C5	0.03	0.02	0.07	0.13	0.01	0.11	0.00	0.21	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.17	0.01	0.04	0.23	0.25	0.28	0.24
C5'	0.04	0.11	0.02	0.02	0.19	0.01	0.21	0.00	0.18	0.11	0.15	0.10	0.05	0.04	0.20	0.02	0.01	0.14	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.13	0.02	0.04	0.21	0.21	0.23	0.20
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.05	0.02	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.07	0.03	0.02	0.18	0.18	0.20	0.17
N3	0.03	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.01	0.15	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.14	0.02	0.03	0.21	0.23	0.27	0.21
O2	0.05	0.00	0.11	0.11	0.03	0.06	0.02	0.10	0.01	0.02	0.02	0.00	0.13	0.13	0.05	0.05	0.18	0.19	0.22	0.17
O2'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.04	0.03	0.07	0.13	0.00	0.06	0.07	0.05	0.05	0.12	0.10	0.06
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.17	0.03	0.17	0.04	0.13	0.07	0.14	0.13	0.06	0.00	0.19	0.02	0.12	0.17	0.16	0.12
O4	0.04	0.03	0.08	0.14	0.01	0.10	0.01	0.20	0.02	0.03	0.02	0.05	0.07	0.19	0.00	0.04	0.23	0.27	0.31	0.26
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.05	0.05	0.02	0.04	0.00	0.13	0.13	0.13	0.10
O5'	0.13	0.19	0.09	0.08	0.22	0.02	0.23	0.01	0.21	0.18	0.21	0.18	0.05	0.12	0.23	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.20	0.14	0.15	0.25	0.10	0.25	0.14	0.21	0.18	0.23	0.19	0.12	0.17	0.27	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.23	0.13	0.11	0.29	0.07	0.28	0.12	0.23	0.20	0.27	0.22	0.10	0.16	0.31	0.13	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.18	0.09	0.08	0.24	0.03	0.24	0.02	0.20	0.17	0.21	0.17	0.06	0.12	0.26	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.20	0.17	0.15	0.13	0.13	0.19	0.22	0.23	0.17	0.20	0.27	0.18	0.22	0.13	0.31	0.14	0.12	0.43	0.28	0.52	0.49	0.46
C2	0.15	0.25	0.18	0.17	0.13	0.18	0.17	0.32	0.15	0.21	0.17	0.36	0.21	0.25	0.15	0.28	0.15	0.15	0.56	0.23	0.71	0.69	0.64
C2'	0.13	0.21	0.14	0.12	0.12	0.11	0.18	0.22	0.22	0.17	0.21	0.30	0.18	0.21	0.11	0.30	0.11	0.10	0.45	0.28	0.58	0.52	0.50
C3'	0.11	0.19	0.12	0.12	0.10	0.10	0.15	0.22	0.19	0.16	0.19	0.28	0.16	0.19	0.09	0.28	0.10	0.08	0.43	0.23	0.54	0.45	0.46
C4	0.19	0.28	0.21	0.23	0.17	0.28	0.15	0.45	0.19	0.24	0.28	0.34	0.22	0.24	0.18	0.25	0.21	0.24	0.68	0.20	0.86	0.81	0.78
C4'	0.13	0.24	0.12	0.14	0.14	0.12	0.18	0.19	0.22	0.16	0.24	0.29	0.19	0.19	0.12	0.29	0.13	0.11	0.33	0.25	0.40	0.34	0.34
C5	0.19	0.23	0.23	0.23	0.16	0.28	0.15	0.42	0.17	0.23	0.22	0.27	0.20	0.22	0.18	0.26	0.22	0.24	0.65	0.19	0.78	0.69	0.71
C5'	0.15	0.24	0.14	0.15	0.19	0.14	0.22	0.21	0.24	0.23	0.24	0.29	0.22	0.24	0.18	0.27	0.11	0.14	0.31	0.26	0.35	0.30	0.30
C6	0.18	0.20	0.21	0.19	0.14	0.21	0.15	0.33	0.14	0.21	0.16	0.25	0.19	0.21	0.16	0.28	0.18	0.18	0.56	0.17	0.65	0.57	0.58
N1	0.16	0.20	0.19	0.16	0.12	0.16	0.16	0.29	0.16	0.19	0.14	0.28	0.19	0.23	0.14	0.29	0.15	0.14	0.52	0.21	0.63	0.58	0.56
N3	0.17	0.29	0.19	0.19	0.16	0.23	0.16	0.39	0.14	0.24	0.25	0.38	0.23	0.26	0.17	0.26	0.18	0.20	0.63	0.16	0.81	0.78	0.73
O2	0.16	0.25	0.18	0.16	0.14	0.16	0.19	0.30	0.21	0.21	0.16	0.38	0.21	0.26	0.15	0.30	0.15	0.14	0.54	0.31	0.69	0.69	0.62
O2'	0.16	0.26	0.15	0.14	0.16	0.12	0.22	0.20	0.29	0.17	0.29	0.35	0.21	0.23	0.13	0.31	0.14	0.12	0.40	0.35	0.52	0.49	0.44
O3'	0.11	0.23	0.12	0.14	0.11	0.12	0.16	0.22	0.20	0.16	0.22	0.33	0.19	0.19	0.10	0.27	0.13	0.09	0.42	0.25	0.54	0.45	0.45
O4	0.21	0.30	0.23	0.25	0.19	0.32	0.19	0.50	0.26	0.26	0.33	0.35	0.23	0.24	0.20	0.25	0.24	0.29	0.72	0.30	0.94	0.91	0.86
O4'	0.14	0.22	0.15	0.15	0.14	0.13	0.19	0.18	0.23	0.15	0.23	0.25	0.17	0.19	0.11	0.31	0.16	0.12	0.35	0.26	0.41	0.37	0.36
O5'	0.18	0.27	0.20	0.07	0.20	0.07	0.20	0.13	0.22	0.18	0.25	0.31	0.25	0.18	0.17	0.27	0.02	0.11	0.39	0.22	0.46	0.29	0.37
OP1	0.06	0.22	0.10	0.03	0.12	0.09	0.13	0.17	0.16	0.13	0.20	0.29	0.19	0.14	0.07	0.15	0.03	0.05	0.24	0.18	0.33	0.24	0.24
OP2	0.09	0.21	0.11	0.07	0.17	0.16	0.21	0.29	0.24	0.21	0.23	0.23	0.18	0.24	0.14	0.10	0.02	0.12	0.42	0.27	0.53	0.28	0.39
P	0.06	0.18	0.11	0.02	0.11	0.07	0.13	0.15	0.15	0.14	0.17	0.23	0.16	0.15	0.08	0.14	0.01	0.03	0.31	0.17	0.38	0.19	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.15	0.02	0.15	0.15	0.13
C2	0.04	0.00	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.14	0.04	0.34	0.02	0.37	0.41	0.36
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.06	0.06	0.11	0.09	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.20	0.05	0.23	0.12	0.17
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.09	0.09	0.10	0.14	0.11	0.08	0.04	0.02	0.01	0.02	0.26	0.09	0.30	0.10	0.22
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.34	0.01	0.34	0.36	0.34
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.09	0.07	0.07	0.05	0.09	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.10	0.11	0.19	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.03	0.41	0.02	0.44	0.47	0.43
C5'	0.04	0.14	0.02	0.02	0.14	0.01	0.19	0.00	0.21	0.19	0.18	0.13	0.12	0.22	0.12	0.07	0.04	0.02	0.01	0.23	0.15	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.10	0.03	0.43	0.01	0.48	0.53	0.47
C8	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.09	0.01	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.05	0.39	0.03	0.38	0.36	0.38
N1	0.03	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.12	0.04	0.40	0.02	0.44	0.49	0.43
N2	0.05	0.01	0.11	0.14	0.01	0.07	0.01	0.13	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.18	0.05	0.32	0.03	0.35	0.39	0.33
N3	0.04	0.01	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.04	0.30	0.02	0.31	0.33	0.30
N7	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.09	0.00	0.22	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.05	0.44	0.03	0.47	0.49	0.47
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.30	0.02	0.29	0.27	0.28
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.07	0.06	0.06	0.07	0.08	0.03	0.11	0.15	0.11	0.04	0.03	0.00	0.05	0.06	0.07	0.08	0.15	0.09	0.07
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.04	0.10	0.10	0.12	0.18	0.12	0.10	0.04	0.05	0.00	0.02	0.21	0.10	0.30	0.13	0.19
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.02	0.06	0.02	0.00	0.10	0.05	0.10	0.18	0.09
O5'	0.15	0.34	0.20	0.26	0.34	0.02	0.41	0.01	0.43	0.39	0.40	0.32	0.30	0.44	0.30	0.07	0.21	0.10	0.00	0.47	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.10	0.02	0.23	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.08	0.10	0.05	0.47	0.00	0.54	0.60	0.53
OP1	0.15	0.37	0.23	0.30	0.34	0.11	0.44	0.15	0.48	0.38	0.44	0.35	0.31	0.47	0.29	0.15	0.30	0.10	0.02	0.54	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.41	0.12	0.10	0.36	0.19	0.47	0.30	0.53	0.36	0.49	0.39	0.33	0.49	0.27	0.09	0.13	0.18	0.02	0.60	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.36	0.17	0.22	0.34	0.04	0.43	0.02	0.47	0.38	0.43	0.33	0.30	0.47	0.28	0.07	0.19	0.09	0.01	0.53	0.01	0.01	0.00