Doublet Group distance statistics: 49416

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 5, 4, 5, 3, 4, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.008, 0.011, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.015, 0.028, 0.041, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.012, 0.027, 0.041, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.011, 0.026, 0.040, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.026 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.035, 0.063, 0.092, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.063 std_dev=0.029
O4	A	0, 0.024, 0.084, 0.145, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.084 std_dev=0.060
C2'	A	0, 0.090, 0.184, 0.279, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.184 std_dev=0.094
O4'	A	0, 0.038, 0.155, 0.272, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.155 std_dev=0.117
O2'	A	0, 0.166, 0.291, 0.416, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.291 std_dev=0.125
C3'	A	0, 0.111, 0.284, 0.457, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.284 std_dev=0.173
C4'	A	0, 0.059, 0.259, 0.460, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.259 std_dev=0.201
O3'	A	0, 0.240, 0.472, 0.704, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.472 std_dev=0.232
C4	B	0, 0.252, 0.490, 0.727, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.490 std_dev=0.238
N9	B	0, 0.283, 0.524, 0.765, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.524 std_dev=0.241
N7	B	0, 0.423, 0.665, 0.907, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.665 std_dev=0.242
C5	B	0, 0.322, 0.565, 0.808, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.565 std_dev=0.243
N3	B	0, 0.240, 0.489, 0.737, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.489 std_dev=0.249
C3'	B	0, 0.190, 0.444, 0.697, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.444 std_dev=0.254
C8	B	0, 0.374, 0.638, 0.902, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.638 std_dev=0.264
O4'	B	0, 0.323, 0.588, 0.854, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.588 std_dev=0.266
C2'	B	0, 0.182, 0.449, 0.716, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.449 std_dev=0.267
C1'	B	0, 0.252, 0.522, 0.792, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.522 std_dev=0.270
O5'	A	0, 0.119, 0.392, 0.664, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.392 std_dev=0.273
C4'	B	0, 0.334, 0.611, 0.888, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.611 std_dev=0.277
C2	B	0, 0.284, 0.562, 0.840, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.562 std_dev=0.278
O3'	B	0, 0.165, 0.449, 0.734, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.449 std_dev=0.284
P	A	0, 0.156, 0.441, 0.726, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.441 std_dev=0.285
N2	B	0, 0.371, 0.670, 0.968, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.670 std_dev=0.299
C6	B	0, 0.294, 0.598, 0.903, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.598 std_dev=0.305
N1	B	0, 0.284, 0.596, 0.908, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.596 std_dev=0.312
OP2	A	0, 0.210, 0.523, 0.837, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.523 std_dev=0.314
C5'	B	0, 0.478, 0.814, 1.149, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.814 std_dev=0.336
O2'	B	0, 0.234, 0.572, 0.911, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.572 std_dev=0.339
O6	B	0, 0.354, 0.694, 1.033, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.694 std_dev=0.339
OP1	A	0, 0.164, 0.513, 0.861, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.513 std_dev=0.349
C5'	A	0, 0.026, 0.400, 0.773, 1.724 max_d=1.724 avg_d=0.400 std_dev=0.374
O5'	B	0, 0.873, 1.485, 2.097, 2.858 max_d=2.858 avg_d=1.485 std_dev=0.612
OP2	B	0, 0.964, 1.619, 2.275, 3.351 max_d=3.351 avg_d=1.619 std_dev=0.655
P	B	0, 0.869, 1.590, 2.310, 4.044 max_d=4.044 avg_d=1.590 std_dev=0.720
OP1	B	0, 0.778, 1.686, 2.594, 5.329 max_d=5.329 avg_d=1.686 std_dev=0.908

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.11	0.11	0.20	0.11
C2	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.02	0.21	0.20	0.29	0.20
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.06	0.02	0.06	0.03	0.06	0.02	0.05	0.09	0.00	0.02	0.08	0.01	0.16	0.18	0.13	0.12
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.00	0.11	0.03	0.09	0.06	0.11	0.12	0.02	0.01	0.13	0.01	0.21	0.22	0.11	0.16
C4	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.03	0.28	0.31	0.38	0.29
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.07	0.05	0.05	0.03	0.09	0.00	0.02	0.08	0.18	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.09	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.01	0.03	0.28	0.31	0.37	0.29
C5'	0.04	0.13	0.03	0.03	0.20	0.01	0.20	0.00	0.16	0.12	0.17	0.11	0.06	0.05	0.21	0.02	0.01	0.09	0.23	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.02	0.03	0.25	0.24	0.30	0.23
N1	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.20	0.18	0.26	0.18
N3	0.01	0.00	0.05	0.11	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.01	0.02	0.25	0.26	0.34	0.25
O2	0.03	0.01	0.09	0.12	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.12	0.01	0.03	0.18	0.17	0.27	0.17
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.05	0.05	0.05	0.06	0.04	0.02	0.05	0.08	0.00	0.05	0.07	0.04	0.08	0.14	0.14	0.08
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.13	0.03	0.13	0.05	0.11	0.06	0.12	0.12	0.05	0.00	0.16	0.02	0.18	0.25	0.14	0.16
O4	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.09	0.01	0.21	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.16	0.00	0.03	0.30	0.35	0.40	0.31
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.00	0.07	0.06	0.22	0.10
O5'	0.11	0.21	0.16	0.21	0.28	0.02	0.28	0.01	0.25	0.20	0.25	0.18	0.08	0.18	0.30	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.20	0.18	0.22	0.31	0.08	0.31	0.09	0.24	0.18	0.26	0.17	0.14	0.25	0.35	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.29	0.13	0.11	0.38	0.18	0.37	0.23	0.30	0.26	0.34	0.27	0.14	0.14	0.40	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.20	0.12	0.16	0.29	0.03	0.29	0.02	0.23	0.18	0.25	0.17	0.08	0.16	0.31	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.20	0.17	0.16	0.19	0.15	0.25	0.20	0.28	0.26	0.26	0.25	0.15	0.28	0.21	0.27	0.15	0.17	0.51	0.32	0.69	0.39	0.48
C2	0.15	0.14	0.15	0.16	0.13	0.15	0.22	0.26	0.25	0.23	0.18	0.25	0.12	0.27	0.16	0.24	0.17	0.14	0.57	0.34	0.69	0.45	0.52
C2'	0.18	0.21	0.16	0.16	0.18	0.14	0.24	0.20	0.27	0.25	0.26	0.28	0.15	0.27	0.19	0.27	0.16	0.15	0.52	0.32	0.76	0.42	0.52
C3'	0.17	0.19	0.18	0.19	0.15	0.18	0.21	0.23	0.24	0.26	0.22	0.26	0.12	0.27	0.19	0.26	0.21	0.16	0.51	0.29	0.79	0.42	0.53
C4	0.15	0.21	0.17	0.20	0.12	0.22	0.15	0.36	0.15	0.23	0.17	0.29	0.18	0.26	0.16	0.21	0.22	0.19	0.62	0.25	0.68	0.52	0.56
C4'	0.17	0.22	0.16	0.14	0.16	0.15	0.21	0.15	0.24	0.23	0.24	0.29	0.16	0.24	0.18	0.26	0.13	0.16	0.43	0.27	0.71	0.34	0.45
C5	0.17	0.18	0.18	0.20	0.13	0.23	0.18	0.35	0.17	0.26	0.15	0.25	0.17	0.29	0.18	0.21	0.22	0.20	0.62	0.24	0.70	0.50	0.57
C5'	0.20	0.22	0.21	0.18	0.15	0.21	0.19	0.19	0.21	0.22	0.22	0.28	0.18	0.22	0.17	0.31	0.20	0.20	0.39	0.24	0.70	0.30	0.43
C6	0.17	0.14	0.17	0.18	0.15	0.19	0.22	0.29	0.21	0.28	0.15	0.21	0.13	0.30	0.20	0.23	0.19	0.18	0.59	0.26	0.70	0.45	0.54
N1	0.17	0.13	0.16	0.16	0.15	0.16	0.23	0.25	0.25	0.25	0.19	0.22	0.11	0.28	0.19	0.25	0.16	0.15	0.56	0.31	0.70	0.43	0.51
N3	0.14	0.18	0.15	0.18	0.11	0.18	0.18	0.31	0.20	0.22	0.15	0.29	0.15	0.26	0.15	0.22	0.20	0.16	0.60	0.31	0.68	0.49	0.54
O2	0.16	0.15	0.16	0.15	0.15	0.14	0.23	0.24	0.28	0.22	0.22	0.25	0.13	0.27	0.17	0.26	0.16	0.14	0.56	0.37	0.69	0.44	0.50
O2'	0.20	0.27	0.17	0.14	0.21	0.15	0.26	0.17	0.31	0.25	0.31	0.33	0.21	0.27	0.21	0.30	0.14	0.18	0.48	0.35	0.73	0.39	0.48
O3'	0.17	0.20	0.17	0.18	0.15	0.18	0.22	0.21	0.25	0.26	0.24	0.28	0.14	0.27	0.18	0.25	0.21	0.16	0.49	0.30	0.81	0.43	0.54
O4	0.17	0.25	0.18	0.22	0.16	0.26	0.16	0.41	0.16	0.24	0.23	0.32	0.21	0.25	0.17	0.20	0.24	0.23	0.62	0.22	0.66	0.55	0.58
O4'	0.18	0.22	0.17	0.16	0.18	0.15	0.23	0.18	0.25	0.24	0.25	0.28	0.15	0.25	0.20	0.27	0.14	0.17	0.46	0.27	0.67	0.35	0.44
O5'	0.14	0.23	0.16	0.06	0.17	0.05	0.22	0.11	0.25	0.24	0.25	0.28	0.19	0.26	0.17	0.24	0.02	0.09	0.49	0.29	0.77	0.36	0.51
OP1	0.05	0.20	0.08	0.02	0.11	0.05	0.17	0.11	0.20	0.20	0.20	0.27	0.16	0.22	0.09	0.13	0.02	0.02	0.36	0.25	0.77	0.38	0.49
OP2	0.10	0.28	0.14	0.05	0.21	0.14	0.27	0.29	0.31	0.25	0.30	0.32	0.25	0.30	0.16	0.14	0.03	0.08	0.54	0.35	0.87	0.46	0.60
P	0.06	0.20	0.09	0.01	0.12	0.05	0.18	0.13	0.21	0.21	0.20	0.25	0.16	0.23	0.11	0.12	0.01	0.02	0.44	0.25	0.77	0.35	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.14	0.01	0.21	0.28	0.12
C2	0.02	0.00	0.11	0.15	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.18	0.02	0.36	0.01	0.36	0.31	0.29
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.07	0.08	0.09	0.14	0.11	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.25	0.08	0.40	0.16	0.20
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.11	0.13	0.13	0.18	0.13	0.12	0.05	0.03	0.00	0.01	0.36	0.12	0.50	0.13	0.30
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.36	0.01	0.35	0.29	0.28
C4'	0.00	0.07	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.08	0.06	0.08	0.06	0.08	0.04	0.07	0.02	0.00	0.02	0.08	0.18	0.29	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.11	0.02	0.46	0.01	0.41	0.34	0.36
C5'	0.03	0.12	0.02	0.02	0.11	0.01	0.14	0.00	0.16	0.14	0.14	0.12	0.10	0.16	0.09	0.07	0.03	0.01	0.01	0.18	0.17	0.35	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.02	0.48	0.00	0.44	0.38	0.39
C8	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.15	0.03	0.44	0.02	0.36	0.29	0.31
N1	0.02	0.00	0.09	0.13	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.16	0.02	0.43	0.01	0.41	0.36	0.35
N2	0.03	0.00	0.14	0.18	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.23	0.03	0.33	0.01	0.35	0.31	0.27
N3	0.02	0.00	0.11	0.13	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.15	0.02	0.31	0.01	0.32	0.29	0.24
N7	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.15	0.03	0.50	0.02	0.42	0.35	0.39
N9	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.32	0.01	0.31	0.27	0.23
O2'	0.02	0.11	0.00	0.03	0.05	0.07	0.05	0.07	0.07	0.05	0.09	0.13	0.09	0.05	0.02	0.00	0.05	0.05	0.09	0.07	0.33	0.18	0.11
O3'	0.01	0.18	0.02	0.00	0.09	0.02	0.11	0.03	0.14	0.15	0.16	0.23	0.15	0.15	0.05	0.05	0.00	0.01	0.31	0.16	0.62	0.20	0.37
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.03	0.11	0.39	0.17
O5'	0.14	0.36	0.25	0.36	0.36	0.02	0.46	0.01	0.48	0.44	0.43	0.33	0.31	0.50	0.32	0.09	0.31	0.07	0.00	0.52	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.16	0.03	0.52	0.00	0.47	0.43	0.44
OP1	0.21	0.36	0.40	0.50	0.35	0.18	0.41	0.17	0.44	0.36	0.41	0.35	0.32	0.42	0.31	0.33	0.62	0.11	0.02	0.47	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.31	0.16	0.13	0.29	0.29	0.34	0.35	0.38	0.29	0.36	0.31	0.29	0.35	0.27	0.18	0.20	0.39	0.02	0.43	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.29	0.20	0.30	0.28	0.05	0.36	0.02	0.39	0.31	0.35	0.27	0.24	0.39	0.23	0.11	0.37	0.17	0.01	0.44	0.01	0.01	0.00