Doublet Group distance statistics: 49417

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 4, 1, 0, 3, 3, 6, 2, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.013, 0.024, 0.034, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.007, 0.020, 0.034, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.011, 0.027, 0.044, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.027 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.011, 0.029, 0.046, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.029 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.020, 0.063, 0.106, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.063 std_dev=0.043
O4	A	0, 0.026, 0.086, 0.145, 0.294 max_d=0.294 avg_d=0.086 std_dev=0.059
C2'	A	0, 0.025, 0.207, 0.389, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.207 std_dev=0.182
O4'	A	0, -0.008, 0.181, 0.369, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.181 std_dev=0.189
C4	B	0, 0.206, 0.426, 0.646, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.426 std_dev=0.220
N9	B	0, 0.158, 0.427, 0.697, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.427 std_dev=0.270
C5	B	0, 0.266, 0.536, 0.806, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.536 std_dev=0.270
N3	B	0, 0.264, 0.534, 0.805, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.534 std_dev=0.271
C4'	A	0, -0.023, 0.277, 0.578, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.277 std_dev=0.301
C2'	B	0, 0.195, 0.504, 0.814, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.504 std_dev=0.310
C1'	B	0, 0.203, 0.525, 0.847, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.525 std_dev=0.322
N7	B	0, 0.325, 0.647, 0.970, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.647 std_dev=0.323
C3'	A	0, -0.007, 0.316, 0.640, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.316 std_dev=0.323
C8	B	0, 0.249, 0.581, 0.913, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.581 std_dev=0.332
O2'	A	0, -0.026, 0.323, 0.672, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.323 std_dev=0.349
O2'	B	0, 0.359, 0.733, 1.107, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.733 std_dev=0.374
C3'	B	0, 0.188, 0.563, 0.938, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.563 std_dev=0.375
C2	B	0, 0.279, 0.664, 1.050, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.664 std_dev=0.386
C6	B	0, 0.287, 0.675, 1.062, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.675 std_dev=0.388
C5'	A	0, 0.049, 0.450, 0.851, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.450 std_dev=0.401
O5'	A	0, 0.099, 0.516, 0.932, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.516 std_dev=0.417
O3'	B	0, 0.212, 0.629, 1.047, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.629 std_dev=0.417
N1	B	0, 0.285, 0.713, 1.141, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.713 std_dev=0.428
O4'	B	0, 0.226, 0.662, 1.098, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.662 std_dev=0.436
P	A	0, 0.161, 0.622, 1.084, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.622 std_dev=0.461
OP2	A	0, 0.275, 0.760, 1.246, 1.765 max_d=1.765 avg_d=0.760 std_dev=0.486
C4'	B	0, 0.281, 0.770, 1.260, 1.732 max_d=1.732 avg_d=0.770 std_dev=0.489
O6	B	0, 0.344, 0.860, 1.375, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.860 std_dev=0.515
O3'	A	0, -0.001, 0.515, 1.031, 2.689 max_d=2.689 avg_d=0.515 std_dev=0.516
N2	B	0, 0.351, 0.869, 1.387, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.869 std_dev=0.518
OP1	A	0, 0.243, 0.801, 1.360, 2.443 max_d=2.443 avg_d=0.801 std_dev=0.559
C5'	B	0, 0.381, 1.023, 1.666, 2.275 max_d=2.275 avg_d=1.023 std_dev=0.643
O5'	B	0, 0.463, 1.270, 2.078, 3.972 max_d=3.972 avg_d=1.270 std_dev=0.807
P	B	0, 0.453, 1.706, 2.958, 5.966 max_d=5.966 avg_d=1.706 std_dev=1.253
OP1	B	0, 0.598, 2.148, 3.698, 7.301 max_d=7.301 avg_d=2.148 std_dev=1.550
OP2	B	0, 0.410, 2.025, 3.639, 8.146 max_d=8.146 avg_d=2.025 std_dev=1.614

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.07	0.02	0.15	0.04	0.01	0.12	0.17	0.16	0.12
C2	0.04	0.00	0.11	0.13	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.02	0.05	0.18	0.19	0.21	0.18
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.10	0.09	0.03	0.08	0.19	0.00	0.02	0.07	0.01	0.24	0.35	0.30	0.28
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.18	0.00	0.20	0.02	0.18	0.11	0.16	0.14	0.02	0.01	0.20	0.01	0.19	0.26	0.15	0.17
C4	0.03	0.01	0.06	0.18	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.02	0.01	0.02	0.17	0.12	0.01	0.04	0.27	0.27	0.32	0.27
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.11	0.05	0.06	0.08	0.14	0.01	0.09	0.01	0.02	0.13	0.12	0.02
C5	0.02	0.02	0.08	0.20	0.00	0.11	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.03	0.17	0.17	0.01	0.05	0.28	0.27	0.30	0.27
C5'	0.04	0.07	0.10	0.02	0.12	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.09	0.09	0.06	0.10	0.13	0.02	0.01	0.13	0.17	0.02
C6	0.02	0.02	0.09	0.18	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.15	0.01	0.06	0.25	0.21	0.22	0.20
N1	0.01	0.01	0.03	0.11	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.07	0.02	0.02	0.18	0.17	0.18	0.16
N3	0.03	0.01	0.08	0.16	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.15	0.08	0.02	0.04	0.23	0.23	0.27	0.23
O2	0.07	0.01	0.19	0.14	0.02	0.08	0.03	0.09	0.02	0.02	0.02	0.00	0.15	0.19	0.02	0.09	0.16	0.18	0.20	0.17
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.17	0.14	0.17	0.06	0.15	0.09	0.15	0.15	0.00	0.04	0.19	0.10	0.17	0.32	0.34	0.24
O3'	0.15	0.10	0.02	0.01	0.12	0.01	0.17	0.10	0.15	0.07	0.08	0.19	0.04	0.00	0.14	0.10	0.25	0.32	0.25	0.24
O4	0.04	0.02	0.07	0.20	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.02	0.02	0.02	0.19	0.14	0.00	0.04	0.29	0.31	0.36	0.31
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.04	0.09	0.10	0.10	0.04	0.00	0.12	0.13	0.17	0.11
O5'	0.12	0.18	0.24	0.19	0.27	0.02	0.28	0.01	0.25	0.18	0.23	0.16	0.17	0.25	0.29	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.17	0.19	0.35	0.26	0.27	0.13	0.27	0.13	0.21	0.17	0.23	0.18	0.32	0.32	0.31	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.21	0.30	0.15	0.32	0.12	0.30	0.17	0.22	0.18	0.27	0.20	0.34	0.25	0.36	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.18	0.28	0.17	0.27	0.02	0.27	0.02	0.20	0.16	0.23	0.17	0.24	0.24	0.31	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.28	0.26	0.22	0.22	0.21	0.23	0.26	0.27	0.21	0.29	0.34	0.25	0.23	0.21	0.39	0.22	0.23	0.52	0.30	0.76	0.71	0.61
C2	0.23	0.22	0.25	0.25	0.20	0.24	0.23	0.37	0.25	0.24	0.18	0.35	0.23	0.27	0.21	0.35	0.24	0.22	0.67	0.32	0.98	0.99	0.83
C2'	0.20	0.27	0.20	0.23	0.18	0.21	0.21	0.30	0.24	0.20	0.26	0.36	0.22	0.22	0.18	0.32	0.26	0.19	0.57	0.28	0.91	0.79	0.70
C3'	0.17	0.22	0.18	0.18	0.14	0.17	0.17	0.22	0.20	0.18	0.22	0.31	0.18	0.19	0.14	0.30	0.22	0.15	0.48	0.23	0.70	0.56	0.51
C4	0.25	0.26	0.25	0.30	0.20	0.34	0.23	0.50	0.15	0.32	0.18	0.38	0.23	0.33	0.25	0.29	0.29	0.29	0.80	0.21	1.18	1.23	1.02
C4'	0.16	0.30	0.16	0.15	0.18	0.14	0.19	0.16	0.24	0.15	0.29	0.37	0.24	0.17	0.14	0.30	0.18	0.15	0.38	0.26	0.55	0.48	0.40
C5	0.28	0.21	0.28	0.31	0.23	0.34	0.23	0.48	0.16	0.32	0.15	0.28	0.22	0.31	0.28	0.30	0.28	0.31	0.76	0.20	1.09	1.10	0.94
C5'	0.24	0.34	0.23	0.18	0.26	0.19	0.25	0.17	0.28	0.23	0.32	0.40	0.31	0.24	0.23	0.34	0.21	0.21	0.35	0.28	0.49	0.42	0.34
C6	0.27	0.18	0.28	0.27	0.22	0.28	0.22	0.38	0.19	0.27	0.14	0.23	0.23	0.26	0.26	0.33	0.25	0.27	0.66	0.21	0.93	0.90	0.78
N1	0.25	0.21	0.26	0.24	0.21	0.24	0.22	0.33	0.23	0.23	0.20	0.29	0.23	0.25	0.22	0.35	0.23	0.23	0.62	0.27	0.89	0.87	0.74
N3	0.22	0.24	0.24	0.28	0.19	0.29	0.23	0.44	0.19	0.28	0.13	0.39	0.22	0.30	0.22	0.31	0.26	0.24	0.74	0.28	1.11	1.15	0.95
O2	0.23	0.22	0.25	0.24	0.20	0.22	0.24	0.34	0.28	0.23	0.23	0.35	0.23	0.27	0.20	0.37	0.23	0.22	0.64	0.37	0.95	0.96	0.80
O2'	0.22	0.35	0.20	0.19	0.23	0.17	0.25	0.25	0.31	0.21	0.34	0.47	0.30	0.25	0.20	0.37	0.21	0.19	0.52	0.35	0.88	0.80	0.68
O3'	0.17	0.28	0.18	0.20	0.16	0.20	0.18	0.25	0.22	0.19	0.27	0.40	0.22	0.19	0.15	0.30	0.26	0.17	0.45	0.25	0.62	0.52	0.44
O4	0.26	0.29	0.25	0.32	0.20	0.38	0.23	0.57	0.17	0.36	0.26	0.41	0.22	0.37	0.27	0.27	0.31	0.33	0.86	0.23	1.30	1.38	1.13
O4'	0.22	0.29	0.23	0.22	0.18	0.21	0.21	0.23	0.26	0.17	0.30	0.35	0.22	0.19	0.17	0.38	0.24	0.21	0.43	0.28	0.58	0.55	0.47
O5'	0.24	0.31	0.27	0.10	0.26	0.09	0.27	0.10	0.29	0.27	0.30	0.34	0.28	0.27	0.25	0.35	0.02	0.16	0.49	0.29	0.65	0.42	0.45
OP1	0.06	0.24	0.12	0.02	0.13	0.09	0.15	0.21	0.19	0.16	0.22	0.31	0.20	0.18	0.09	0.19	0.01	0.05	0.34	0.20	0.56	0.49	0.35
OP2	0.12	0.25	0.14	0.09	0.20	0.17	0.23	0.31	0.26	0.23	0.26	0.28	0.22	0.25	0.17	0.14	0.02	0.14	0.57	0.28	0.85	0.54	0.59
P	0.07	0.21	0.12	0.01	0.13	0.06	0.16	0.16	0.18	0.17	0.20	0.27	0.18	0.18	0.10	0.17	0.01	0.02	0.42	0.20	0.61	0.37	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.16	0.03	0.26	0.34	0.20
C2	0.03	0.00	0.10	0.17	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.20	0.02	0.49	0.02	0.67	0.71	0.58
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.04	0.07	0.07	0.12	0.10	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.24	0.04	0.30	0.27	0.21
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.10	0.00	0.09	0.02	0.11	0.12	0.14	0.20	0.16	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.33	0.11	0.37	0.21	0.25
C4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.10	0.02	0.45	0.01	0.60	0.63	0.53
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.10	0.10	0.09	0.09	0.07	0.10	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.12	0.16	0.35	0.07
C5	0.02	0.01	0.03	0.09	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.09	0.04	0.54	0.02	0.76	0.84	0.68
C5'	0.04	0.18	0.02	0.02	0.16	0.01	0.21	0.00	0.23	0.18	0.21	0.18	0.15	0.22	0.13	0.04	0.02	0.02	0.01	0.26	0.25	0.35	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.11	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.11	0.04	0.59	0.01	0.85	0.95	0.76
C8	0.03	0.01	0.07	0.12	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.05	0.45	0.03	0.60	0.70	0.56
N1	0.03	0.01	0.07	0.14	0.01	0.09	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.16	0.03	0.56	0.02	0.79	0.86	0.70
N2	0.04	0.01	0.12	0.20	0.01	0.09	0.01	0.18	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.25	0.03	0.47	0.03	0.65	0.68	0.56
N3	0.03	0.01	0.10	0.16	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.18	0.02	0.42	0.01	0.56	0.58	0.48
N7	0.03	0.01	0.05	0.11	0.00	0.10	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.12	0.05	0.54	0.03	0.78	0.89	0.71
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.06	0.02	0.13	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.05	0.02	0.36	0.03	0.47	0.51	0.42
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.06	0.04	0.06	0.04	0.07	0.04	0.10	0.14	0.10	0.05	0.03	0.00	0.05	0.04	0.09	0.07	0.24	0.36	0.11
O3'	0.02	0.20	0.02	0.01	0.10	0.02	0.09	0.02	0.11	0.13	0.16	0.25	0.18	0.12	0.05	0.05	0.00	0.02	0.29	0.12	0.41	0.29	0.23
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.03	0.03	0.02	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.11	0.06	0.20	0.39	0.14
O5'	0.16	0.49	0.24	0.33	0.45	0.02	0.54	0.01	0.59	0.45	0.56	0.47	0.42	0.54	0.36	0.09	0.29	0.11	0.00	0.64	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.04	0.11	0.01	0.12	0.02	0.26	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.07	0.12	0.06	0.64	0.00	0.95	1.08	0.85
OP1	0.26	0.67	0.30	0.37	0.60	0.16	0.76	0.25	0.85	0.60	0.79	0.65	0.56	0.78	0.47	0.24	0.41	0.20	0.02	0.95	0.00	0.02	0.01
OP2	0.34	0.71	0.27	0.21	0.63	0.35	0.84	0.35	0.95	0.70	0.86	0.68	0.58	0.89	0.51	0.36	0.29	0.39	0.02	1.08	0.02	0.00	0.01
P	0.20	0.58	0.21	0.25	0.53	0.07	0.68	0.02	0.76	0.56	0.70	0.56	0.48	0.71	0.42	0.11	0.23	0.14	0.01	0.85	0.01	0.01	0.00