Doublet Group distance statistics: 49419

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 2, 2, 3, 5, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.013, 0.024, 0.035, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.015, 0.026, 0.037, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.016, 0.027, 0.038, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.027 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.014, 0.025, 0.037, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.009, 0.020, 0.032, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.037, 0.064, 0.091, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.064 std_dev=0.027
O4	A	0, 0.034, 0.077, 0.120, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.077 std_dev=0.043
C2'	A	0, 0.123, 0.280, 0.437, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.280 std_dev=0.157
O4'	A	0, 0.034, 0.211, 0.387, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.211 std_dev=0.176
C4	B	0, 0.251, 0.438, 0.625, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.438 std_dev=0.187
N3	B	0, 0.233, 0.438, 0.642, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.438 std_dev=0.205
C5	B	0, 0.260, 0.491, 0.722, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.491 std_dev=0.231
C2'	B	0, 0.322, 0.572, 0.822, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.572 std_dev=0.250
N9	B	0, 0.285, 0.539, 0.793, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.539 std_dev=0.254
C6	B	0, 0.254, 0.514, 0.775, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.514 std_dev=0.260
C3'	B	0, 0.385, 0.649, 0.912, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.649 std_dev=0.263
C1'	B	0, 0.324, 0.599, 0.873, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.599 std_dev=0.275
O2'	B	0, 0.348, 0.644, 0.940, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.644 std_dev=0.296
C2	B	0, 0.199, 0.499, 0.799, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.499 std_dev=0.300
N1	B	0, 0.226, 0.526, 0.826, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.526 std_dev=0.300
O3'	B	0, 0.421, 0.724, 1.026, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.724 std_dev=0.303
N7	B	0, 0.311, 0.633, 0.955, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.633 std_dev=0.322
C8	B	0, 0.341, 0.672, 1.004, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.672 std_dev=0.332
C4'	B	0, 0.436, 0.770, 1.105, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.770 std_dev=0.334
O4'	B	0, 0.364, 0.714, 1.065, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.714 std_dev=0.350
O6	B	0, 0.254, 0.605, 0.956, 1.371 max_d=1.371 avg_d=0.605 std_dev=0.351
C5'	A	0, 0.236, 0.593, 0.949, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.593 std_dev=0.356
C4'	A	0, 0.069, 0.428, 0.787, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.428 std_dev=0.359
P	A	0, 0.378, 0.764, 1.150, 1.681 max_d=1.681 avg_d=0.764 std_dev=0.386
O2'	A	0, 0.194, 0.593, 0.993, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.593 std_dev=0.399
O5'	A	0, 0.301, 0.717, 1.133, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.717 std_dev=0.416
C5'	B	0, 0.556, 0.972, 1.388, 2.017 max_d=2.017 avg_d=0.972 std_dev=0.416
N2	B	0, 0.215, 0.653, 1.092, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.653 std_dev=0.439
OP1	A	0, 0.401, 0.897, 1.393, 2.056 max_d=2.056 avg_d=0.897 std_dev=0.496
OP2	A	0, 0.339, 0.865, 1.391, 2.157 max_d=2.157 avg_d=0.865 std_dev=0.526
C3'	A	0, 0.090, 0.647, 1.204, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.647 std_dev=0.557
O5'	B	0, 0.313, 1.373, 2.432, 4.184 max_d=4.184 avg_d=1.373 std_dev=1.060
O3'	A	0, 0.028, 1.162, 2.296, 3.130 max_d=3.130 avg_d=1.162 std_dev=1.134
P	B	0, 0.363, 1.744, 3.124, 5.550 max_d=5.550 avg_d=1.744 std_dev=1.381
OP1	B	0, 0.530, 2.089, 3.647, 6.397 max_d=6.397 avg_d=2.089 std_dev=1.558
OP2	B	0, 0.105, 1.952, 3.799, 7.032 max_d=7.032 avg_d=1.952 std_dev=1.847

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.31	0.03	0.01	0.17	0.18	0.38	0.19
C2	0.02	0.00	0.10	0.18	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.20	0.02	0.08	0.23	0.20	0.45	0.25
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.02	0.09	0.20	0.11	0.02	0.08	0.18	0.00	0.03	0.07	0.02	0.33	0.42	0.55	0.39
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.34	0.00	0.37	0.03	0.33	0.20	0.26	0.09	0.02	0.01	0.37	0.02	0.25	0.26	0.13	0.20
C4	0.02	0.01	0.06	0.34	0.00	0.11	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.36	0.15	0.01	0.04	0.33	0.36	0.58	0.38
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.11	0.00	0.16	0.01	0.15	0.07	0.06	0.07	0.30	0.03	0.12	0.00	0.02	0.11	0.19	0.04
C5	0.02	0.01	0.09	0.37	0.01	0.16	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.35	0.25	0.01	0.06	0.36	0.38	0.57	0.39
C5'	0.08	0.10	0.20	0.03	0.16	0.01	0.19	0.00	0.17	0.10	0.12	0.11	0.11	0.19	0.18	0.01	0.01	0.09	0.22	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.33	0.01	0.15	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.18	0.02	0.08	0.31	0.28	0.47	0.30
N1	0.01	0.01	0.02	0.20	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.10	0.02	0.02	0.22	0.19	0.43	0.23
N3	0.02	0.00	0.08	0.26	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.11	0.02	0.06	0.28	0.27	0.52	0.31
O2	0.04	0.00	0.18	0.09	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.39	0.02	0.13	0.20	0.18	0.43	0.22
O2'	0.02	0.23	0.00	0.02	0.36	0.30	0.35	0.11	0.28	0.20	0.30	0.17	0.00	0.05	0.39	0.20	0.28	0.35	0.56	0.32
O3'	0.31	0.20	0.03	0.01	0.15	0.03	0.25	0.19	0.18	0.10	0.11	0.39	0.05	0.00	0.20	0.21	0.35	0.49	0.33	0.38
O4	0.03	0.02	0.07	0.37	0.01	0.12	0.01	0.18	0.02	0.02	0.02	0.02	0.39	0.20	0.00	0.04	0.36	0.42	0.62	0.42
O4'	0.01	0.08	0.02	0.02	0.04	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.06	0.13	0.20	0.21	0.04	0.00	0.08	0.10	0.31	0.14
O5'	0.17	0.23	0.33	0.25	0.33	0.02	0.36	0.01	0.31	0.22	0.28	0.20	0.28	0.35	0.36	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.18	0.20	0.42	0.26	0.36	0.11	0.38	0.09	0.28	0.19	0.27	0.18	0.35	0.49	0.42	0.10	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.38	0.45	0.55	0.13	0.58	0.19	0.57	0.22	0.47	0.43	0.52	0.43	0.56	0.33	0.62	0.31	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.25	0.39	0.20	0.38	0.04	0.39	0.02	0.30	0.23	0.31	0.22	0.32	0.38	0.42	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.33	0.23	0.21	0.20	0.23	0.20	0.23	0.26	0.19	0.32	0.42	0.26	0.18	0.19	0.40	0.26	0.23	0.39	0.27	0.63	0.50	0.44
C2	0.23	0.29	0.25	0.23	0.17	0.21	0.19	0.24	0.25	0.18	0.30	0.38	0.23	0.19	0.18	0.39	0.27	0.21	0.57	0.29	0.80	0.87	0.67
C2'	0.18	0.33	0.17	0.26	0.23	0.23	0.25	0.33	0.29	0.23	0.32	0.41	0.27	0.25	0.20	0.27	0.29	0.19	0.36	0.30	0.64	0.52	0.44
C3'	0.29	0.34	0.28	0.30	0.30	0.27	0.32	0.31	0.31	0.40	0.32	0.44	0.30	0.39	0.32	0.25	0.29	0.28	0.52	0.31	0.81	0.61	0.60
C4	0.20	0.23	0.23	0.25	0.17	0.21	0.18	0.30	0.21	0.22	0.24	0.29	0.20	0.22	0.19	0.32	0.31	0.19	0.78	0.25	1.05	1.21	0.94
C4'	0.17	0.41	0.16	0.18	0.24	0.18	0.22	0.19	0.27	0.21	0.36	0.52	0.34	0.20	0.19	0.17	0.22	0.16	0.34	0.26	0.60	0.36	0.38
C5	0.22	0.26	0.23	0.24	0.22	0.21	0.24	0.31	0.25	0.26	0.27	0.29	0.23	0.26	0.23	0.30	0.31	0.20	0.73	0.26	1.02	1.06	0.87
C5'	0.27	0.43	0.27	0.24	0.31	0.25	0.27	0.25	0.30	0.25	0.38	0.53	0.40	0.24	0.27	0.27	0.25	0.26	0.35	0.27	0.60	0.35	0.39
C6	0.24	0.31	0.24	0.23	0.24	0.21	0.24	0.27	0.26	0.25	0.30	0.35	0.27	0.24	0.24	0.35	0.29	0.21	0.58	0.26	0.86	0.80	0.67
N1	0.23	0.32	0.24	0.22	0.20	0.21	0.20	0.24	0.26	0.20	0.31	0.39	0.26	0.19	0.19	0.39	0.27	0.21	0.51	0.27	0.76	0.72	0.59
N3	0.22	0.26	0.25	0.25	0.17	0.21	0.18	0.27	0.23	0.20	0.26	0.34	0.22	0.20	0.18	0.36	0.29	0.20	0.69	0.28	0.93	1.08	0.82
O2	0.24	0.30	0.25	0.23	0.18	0.23	0.19	0.23	0.27	0.17	0.32	0.41	0.23	0.18	0.18	0.40	0.26	0.23	0.52	0.31	0.74	0.82	0.61
O2'	0.25	0.33	0.25	0.26	0.19	0.28	0.26	0.33	0.36	0.20	0.38	0.42	0.25	0.26	0.16	0.48	0.31	0.25	0.42	0.44	0.68	0.54	0.48
O3'	0.17	0.55	0.18	0.29	0.26	0.24	0.25	0.33	0.32	0.29	0.47	0.76	0.43	0.27	0.20	0.15	0.37	0.18	0.58	0.30	0.95	0.71	0.70
O4	0.20	0.23	0.24	0.27	0.16	0.22	0.16	0.33	0.16	0.22	0.22	0.29	0.20	0.23	0.18	0.30	0.33	0.19	0.88	0.21	1.18	1.40	1.08
O4'	0.20	0.40	0.21	0.23	0.21	0.25	0.21	0.24	0.28	0.18	0.37	0.51	0.31	0.17	0.17	0.35	0.29	0.22	0.34	0.28	0.57	0.34	0.36
O5'	0.21	0.39	0.22	0.11	0.27	0.09	0.26	0.08	0.30	0.23	0.34	0.47	0.36	0.26	0.21	0.32	0.01	0.15	0.38	0.30	0.65	0.39	0.43
OP1	0.07	0.27	0.12	0.02	0.16	0.08	0.23	0.18	0.26	0.27	0.25	0.36	0.24	0.31	0.12	0.22	0.01	0.04	0.44	0.31	0.64	0.54	0.50
OP2	0.15	0.44	0.20	0.06	0.36	0.12	0.45	0.28	0.50	0.39	0.48	0.47	0.37	0.47	0.28	0.23	0.02	0.10	0.49	0.55	0.88	0.51	0.59
P	0.07	0.27	0.12	0.01	0.19	0.04	0.25	0.13	0.28	0.25	0.27	0.33	0.24	0.30	0.14	0.19	0.01	0.02	0.39	0.33	0.65	0.39	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.28	0.01	0.27	0.41	0.26
C2	0.04	0.00	0.10	0.13	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.14	0.06	0.54	0.01	0.56	0.90	0.59
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.07	0.08	0.13	0.10	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.22	0.05	0.37	0.23	0.21
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.12	0.00	0.16	0.02	0.17	0.18	0.14	0.14	0.11	0.20	0.11	0.01	0.00	0.02	0.26	0.19	0.44	0.12	0.25
C4	0.02	0.01	0.05	0.12	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.03	0.61	0.01	0.61	0.92	0.65
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.09	0.16	0.05	0.07	0.04	0.16	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.13	0.15	0.20	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.16	0.00	0.10	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.17	0.03	0.80	0.01	0.84	1.22	0.89
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.15	0.01	0.23	0.00	0.24	0.28	0.17	0.08	0.08	0.30	0.15	0.05	0.03	0.02	0.01	0.29	0.21	0.29	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.17	0.01	0.09	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.17	0.03	0.82	0.00	0.88	1.31	0.94
C8	0.01	0.01	0.07	0.18	0.01	0.16	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.20	0.05	0.85	0.02	0.84	1.11	0.89
N1	0.03	0.00	0.08	0.14	0.01	0.05	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.15	0.05	0.69	0.01	0.73	1.14	0.78
N2	0.05	0.01	0.13	0.14	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.24	0.18	0.08	0.44	0.01	0.49	0.79	0.49
N3	0.04	0.01	0.10	0.11	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.12	0.06	0.46	0.01	0.47	0.75	0.49
N7	0.01	0.01	0.06	0.20	0.01	0.16	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.22	0.04	0.93	0.02	0.99	1.36	1.05
N9	0.00	0.01	0.02	0.11	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.59	0.01	0.56	0.80	0.59
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.11	0.06	0.08	0.05	0.12	0.04	0.17	0.24	0.18	0.04	0.04	0.00	0.04	0.08	0.09	0.11	0.31	0.13	0.11
O3'	0.02	0.14	0.02	0.00	0.11	0.02	0.17	0.03	0.17	0.20	0.15	0.18	0.12	0.22	0.10	0.04	0.00	0.02	0.33	0.21	0.48	0.28	0.32
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.05	0.08	0.06	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.23	0.03	0.14	0.36	0.20
O5'	0.28	0.54	0.22	0.26	0.61	0.02	0.80	0.01	0.82	0.85	0.69	0.44	0.46	0.93	0.59	0.09	0.33	0.23	0.00	0.91	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.05	0.19	0.01	0.13	0.01	0.29	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.21	0.03	0.91	0.00	1.03	1.49	1.08
OP1	0.27	0.56	0.37	0.44	0.61	0.15	0.84	0.21	0.88	0.84	0.73	0.49	0.47	0.99	0.56	0.31	0.48	0.14	0.02	1.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.41	0.90	0.23	0.12	0.92	0.20	1.22	0.29	1.31	1.11	1.14	0.79	0.75	1.36	0.80	0.13	0.28	0.36	0.02	1.49	0.01	0.00	0.00
P	0.26	0.59	0.21	0.25	0.65	0.04	0.89	0.01	0.94	0.89	0.78	0.49	0.49	1.05	0.59	0.11	0.32	0.20	0.01	1.08	0.00	0.00	0.00