Doublet Group distance statistics: 49420

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 5, 1, 1, 2, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.008, 0.016, 0.025, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.009, 0.022, 0.036, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.011, 0.027, 0.043, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.027 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.010, 0.034, 0.059, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.034 std_dev=0.025
O4	A	0, 0.085, 0.138, 0.190, 0.241 max_d=0.241 avg_d=0.138 std_dev=0.053
C5	B	0, 0.219, 0.415, 0.611, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.415 std_dev=0.196
O4'	A	0, 0.029, 0.259, 0.488, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.259 std_dev=0.229
C2'	A	0, 0.013, 0.244, 0.475, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.244 std_dev=0.231
N7	B	0, 0.331, 0.566, 0.802, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.566 std_dev=0.235
C4	B	0, 0.268, 0.543, 0.817, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.543 std_dev=0.275
C8	B	0, 0.414, 0.697, 0.980, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.697 std_dev=0.283
N1	B	0, 0.321, 0.618, 0.914, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.618 std_dev=0.297
C6	B	0, 0.141, 0.448, 0.755, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.448 std_dev=0.307
C2	B	0, 0.410, 0.734, 1.058, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.734 std_dev=0.324
N9	B	0, 0.347, 0.694, 1.040, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.694 std_dev=0.347
N3	B	0, 0.359, 0.720, 1.080, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.720 std_dev=0.360
O2'	A	0, -0.005, 0.388, 0.780, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.388 std_dev=0.392
C4'	A	0, 0.130, 0.528, 0.925, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.528 std_dev=0.398
O6	B	0, 0.185, 0.614, 1.042, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.614 std_dev=0.429
N2	B	0, 0.572, 1.007, 1.443, 1.590 max_d=1.590 avg_d=1.007 std_dev=0.435
C3'	A	0, 0.049, 0.499, 0.950, 1.717 max_d=1.717 avg_d=0.499 std_dev=0.450
C1'	B	0, 0.541, 1.011, 1.482, 1.838 max_d=1.838 avg_d=1.011 std_dev=0.471
C2'	B	0, 0.395, 0.868, 1.340, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.868 std_dev=0.472
C5'	A	0, 0.348, 0.840, 1.332, 1.792 max_d=1.792 avg_d=0.840 std_dev=0.492
C3'	B	0, 0.640, 1.175, 1.711, 2.122 max_d=2.122 avg_d=1.175 std_dev=0.536
O2'	B	0, 0.646, 1.186, 1.726, 1.945 max_d=1.945 avg_d=1.186 std_dev=0.540
O5'	A	0, 0.399, 0.967, 1.535, 2.072 max_d=2.072 avg_d=0.967 std_dev=0.568
O4'	B	0, 0.847, 1.418, 1.989, 2.569 max_d=2.569 avg_d=1.418 std_dev=0.571
C4'	B	0, 0.869, 1.487, 2.104, 2.672 max_d=2.672 avg_d=1.487 std_dev=0.618
O3'	B	0, 0.647, 1.265, 1.883, 2.274 max_d=2.274 avg_d=1.265 std_dev=0.618
OP2	B	0, 1.040, 1.668, 2.296, 2.862 max_d=2.862 avg_d=1.668 std_dev=0.628
P	A	0, 0.611, 1.268, 1.926, 2.249 max_d=2.249 avg_d=1.268 std_dev=0.658
O5'	B	0, 1.043, 1.703, 2.363, 2.829 max_d=2.829 avg_d=1.703 std_dev=0.660
O3'	A	0, 0.043, 0.707, 1.371, 2.725 max_d=2.725 avg_d=0.707 std_dev=0.664
OP2	A	0, 0.676, 1.347, 2.018, 2.432 max_d=2.432 avg_d=1.347 std_dev=0.671
C5'	B	0, 1.095, 1.798, 2.500, 3.177 max_d=3.177 avg_d=1.798 std_dev=0.702
P	B	0, 1.060, 1.763, 2.467, 2.971 max_d=2.971 avg_d=1.763 std_dev=0.703
OP1	A	0, 0.722, 1.511, 2.301, 2.608 max_d=2.608 avg_d=1.511 std_dev=0.789
OP1	B	0, 1.459, 2.306, 3.153, 3.703 max_d=3.703 avg_d=2.306 std_dev=0.847

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.18	0.02	0.00	0.12	0.14	0.17	0.11
C2	0.02	0.00	0.11	0.16	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.17	0.01	0.07	0.16	0.16	0.18	0.13
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.02	0.09	0.12	0.11	0.02	0.09	0.19	0.00	0.02	0.06	0.01	0.26	0.34	0.36	0.29
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.24	0.00	0.23	0.01	0.20	0.14	0.21	0.14	0.02	0.01	0.25	0.01	0.07	0.19	0.11	0.10
C4	0.02	0.01	0.05	0.24	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.19	0.01	0.03	0.23	0.24	0.26	0.22
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.12	0.05	0.05	0.05	0.19	0.02	0.10	0.00	0.01	0.08	0.02	0.02
C5	0.02	0.01	0.09	0.23	0.00	0.13	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.24	0.20	0.01	0.06	0.24	0.24	0.25	0.23
C5'	0.05	0.09	0.12	0.01	0.14	0.01	0.16	0.00	0.14	0.08	0.11	0.09	0.09	0.12	0.16	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.20	0.01	0.12	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.15	0.01	0.08	0.20	0.19	0.19	0.16
N1	0.01	0.01	0.02	0.14	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.10	0.02	0.01	0.15	0.15	0.17	0.12
N3	0.02	0.00	0.09	0.21	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.17	0.01	0.05	0.19	0.20	0.22	0.17
O2	0.03	0.00	0.19	0.14	0.01	0.05	0.02	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.25	0.02	0.12	0.14	0.15	0.17	0.11
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.21	0.19	0.24	0.09	0.21	0.12	0.15	0.13	0.00	0.04	0.23	0.13	0.19	0.26	0.38	0.23
O3'	0.18	0.17	0.02	0.01	0.19	0.02	0.20	0.12	0.15	0.10	0.17	0.25	0.04	0.00	0.22	0.13	0.19	0.28	0.23	0.21
O4	0.02	0.01	0.06	0.25	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.23	0.22	0.00	0.03	0.25	0.27	0.30	0.25
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.05	0.12	0.13	0.13	0.03	0.00	0.08	0.09	0.11	0.11
O5'	0.12	0.16	0.26	0.07	0.23	0.01	0.24	0.01	0.20	0.15	0.19	0.14	0.19	0.19	0.25	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.14	0.16	0.34	0.19	0.24	0.08	0.24	0.07	0.19	0.15	0.20	0.15	0.26	0.28	0.27	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.18	0.36	0.11	0.26	0.02	0.25	0.01	0.19	0.17	0.22	0.17	0.38	0.23	0.30	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.13	0.29	0.10	0.22	0.02	0.23	0.01	0.16	0.12	0.17	0.11	0.23	0.21	0.25	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.28	0.32	0.24	0.26	0.27	0.24	0.26	0.23	0.31	0.25	0.36	0.28	0.27	0.30	0.42	0.19	0.32	0.33	0.24	0.41	0.46	0.38
C2	0.28	0.22	0.24	0.17	0.25	0.22	0.28	0.24	0.27	0.32	0.23	0.28	0.22	0.32	0.29	0.31	0.12	0.27	0.31	0.30	0.38	0.45	0.37
C2'	0.27	0.29	0.25	0.24	0.21	0.23	0.22	0.27	0.22	0.28	0.26	0.39	0.25	0.26	0.25	0.34	0.23	0.24	0.34	0.25	0.47	0.50	0.42
C3'	0.22	0.25	0.21	0.15	0.19	0.15	0.20	0.16	0.22	0.22	0.24	0.32	0.22	0.21	0.20	0.28	0.11	0.18	0.22	0.23	0.36	0.45	0.32
C4	0.22	0.20	0.20	0.16	0.16	0.19	0.16	0.22	0.10	0.28	0.15	0.27	0.19	0.28	0.21	0.24	0.15	0.22	0.30	0.16	0.36	0.46	0.38
C4'	0.19	0.25	0.19	0.16	0.15	0.16	0.16	0.16	0.20	0.19	0.24	0.33	0.20	0.18	0.16	0.28	0.14	0.18	0.23	0.21	0.37	0.41	0.31
C5	0.28	0.24	0.27	0.21	0.20	0.23	0.14	0.25	0.10	0.29	0.18	0.29	0.24	0.24	0.25	0.30	0.18	0.26	0.32	0.12	0.39	0.49	0.40
C5'	0.16	0.33	0.15	0.12	0.22	0.11	0.22	0.11	0.26	0.17	0.31	0.40	0.29	0.19	0.16	0.21	0.11	0.14	0.15	0.26	0.34	0.35	0.25
C6	0.32	0.24	0.32	0.23	0.21	0.26	0.16	0.26	0.13	0.30	0.18	0.31	0.25	0.24	0.28	0.36	0.17	0.29	0.33	0.15	0.41	0.49	0.40
N1	0.32	0.24	0.29	0.21	0.24	0.24	0.23	0.25	0.20	0.31	0.21	0.32	0.25	0.28	0.29	0.36	0.15	0.29	0.32	0.23	0.40	0.47	0.39
N3	0.24	0.17	0.20	0.15	0.20	0.19	0.25	0.23	0.22	0.30	0.16	0.24	0.17	0.32	0.25	0.26	0.11	0.23	0.30	0.28	0.36	0.45	0.37
O2	0.29	0.26	0.24	0.18	0.29	0.23	0.32	0.25	0.33	0.33	0.31	0.29	0.25	0.34	0.30	0.32	0.14	0.28	0.31	0.36	0.37	0.44	0.37
O2'	0.34	0.35	0.31	0.23	0.28	0.24	0.27	0.26	0.27	0.32	0.29	0.48	0.35	0.32	0.30	0.48	0.18	0.30	0.36	0.31	0.52	0.57	0.46
O3'	0.19	0.26	0.19	0.17	0.17	0.16	0.18	0.19	0.22	0.20	0.25	0.34	0.21	0.20	0.18	0.26	0.17	0.17	0.25	0.24	0.42	0.51	0.37
O4	0.18	0.22	0.18	0.16	0.15	0.17	0.12	0.21	0.11	0.23	0.20	0.28	0.19	0.24	0.18	0.21	0.17	0.19	0.28	0.14	0.35	0.44	0.37
O4'	0.30	0.26	0.31	0.27	0.18	0.28	0.19	0.28	0.21	0.26	0.25	0.35	0.20	0.23	0.24	0.40	0.24	0.30	0.33	0.23	0.43	0.46	0.39
O5'	0.15	0.31	0.16	0.06	0.23	0.06	0.25	0.05	0.28	0.23	0.31	0.35	0.26	0.25	0.19	0.21	0.02	0.10	0.16	0.30	0.37	0.41	0.30
OP1	0.05	0.24	0.08	0.02	0.16	0.05	0.20	0.12	0.23	0.18	0.25	0.30	0.20	0.21	0.11	0.12	0.02	0.03	0.18	0.26	0.42	0.41	0.31
OP2	0.04	0.26	0.05	0.04	0.19	0.11	0.25	0.19	0.29	0.21	0.29	0.29	0.21	0.26	0.13	0.08	0.02	0.08	0.22	0.33	0.44	0.49	0.38
P	0.05	0.24	0.08	0.01	0.17	0.03	0.21	0.09	0.24	0.19	0.25	0.28	0.20	0.22	0.12	0.11	0.00	0.01	0.16	0.26	0.39	0.40	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.08	0.11	0.06
C2	0.04	0.00	0.14	0.14	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.18	0.04	0.10	0.02	0.13	0.18	0.12
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.02	0.04	0.02	0.07	0.06	0.11	0.18	0.14	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.18	0.15	0.10
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.11	0.13	0.12	0.17	0.12	0.13	0.07	0.02	0.01	0.01	0.10	0.13	0.22	0.19	0.15
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.02	0.11	0.01	0.13	0.17	0.12
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.10	0.04	0.09	0.06	0.09	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.08	0.11	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.02	0.17	0.01	0.19	0.23	0.18
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.12	0.15	0.08	0.07	0.05	0.16	0.08	0.05	0.04	0.01	0.01	0.15	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.14	0.02	0.18	0.00	0.21	0.26	0.20
C8	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.10	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.15	0.03	0.19	0.03	0.19	0.21	0.17
N1	0.03	0.00	0.11	0.12	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.16	0.03	0.14	0.02	0.17	0.23	0.16
N2	0.05	0.00	0.18	0.17	0.01	0.09	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.23	0.23	0.06	0.09	0.03	0.12	0.17	0.10
N3	0.04	0.01	0.14	0.12	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.16	0.04	0.09	0.02	0.11	0.15	0.09
N7	0.01	0.01	0.04	0.13	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.15	0.02	0.21	0.03	0.23	0.26	0.22
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.11	0.02	0.12	0.15	0.10
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.09	0.05	0.07	0.05	0.10	0.03	0.15	0.23	0.17	0.03	0.03	0.00	0.04	0.05	0.05	0.09	0.19	0.13	0.08
O3'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.10	0.01	0.12	0.04	0.14	0.15	0.16	0.23	0.16	0.15	0.06	0.04	0.00	0.01	0.13	0.15	0.32	0.28	0.22
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.06	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.04	0.05	0.16	0.12
O5'	0.05	0.10	0.07	0.10	0.11	0.01	0.17	0.01	0.18	0.19	0.14	0.09	0.09	0.21	0.11	0.05	0.13	0.06	0.00	0.22	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.13	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.09	0.15	0.04	0.22	0.00	0.26	0.31	0.25
OP1	0.08	0.13	0.18	0.22	0.13	0.11	0.19	0.06	0.21	0.19	0.17	0.12	0.11	0.23	0.12	0.19	0.32	0.05	0.02	0.26	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.18	0.15	0.19	0.17	0.05	0.23	0.02	0.26	0.21	0.23	0.17	0.15	0.26	0.15	0.13	0.28	0.16	0.02	0.31	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.12	0.10	0.15	0.12	0.02	0.18	0.01	0.20	0.17	0.16	0.10	0.09	0.22	0.10	0.08	0.22	0.12	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00