Doublet Group distance statistics: 49421

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 6, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.015, 0.043, 0.072, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.043 std_dev=0.028
O4	A	0, -0.001, 0.057, 0.115, 0.185 max_d=0.185 avg_d=0.057 std_dev=0.058
C5	B	0, 0.262, 0.443, 0.624, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.443 std_dev=0.181
N7	B	0, 0.280, 0.464, 0.648, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.464 std_dev=0.184
C8	B	0, 0.323, 0.515, 0.706, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.515 std_dev=0.191
N9	B	0, 0.290, 0.492, 0.693, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.492 std_dev=0.201
C4	B	0, 0.189, 0.398, 0.606, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.398 std_dev=0.208
C6	B	0, 0.413, 0.643, 0.872, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.643 std_dev=0.229
N3	B	0, 0.254, 0.488, 0.722, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.488 std_dev=0.234
N1	B	0, 0.476, 0.729, 0.982, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.729 std_dev=0.253
C2	B	0, 0.364, 0.634, 0.904, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.634 std_dev=0.270
C1'	B	0, 0.487, 0.760, 1.033, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.760 std_dev=0.273
C4'	B	0, 0.478, 0.759, 1.040, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.759 std_dev=0.281
O4'	A	0, 0.616, 0.908, 1.200, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.908 std_dev=0.292
C5'	B	0, 0.539, 0.847, 1.156, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.847 std_dev=0.309
O4'	B	0, 0.408, 0.726, 1.044, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.726 std_dev=0.318
O6	B	0, 0.482, 0.800, 1.118, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.800 std_dev=0.318
C2'	A	0, 0.706, 1.035, 1.364, 1.355 max_d=1.355 avg_d=1.035 std_dev=0.329
C2'	B	0, 0.632, 0.990, 1.348, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.990 std_dev=0.358
N2	B	0, 0.428, 0.801, 1.175, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.801 std_dev=0.373
O5'	B	0, 0.719, 1.118, 1.517, 1.680 max_d=1.680 avg_d=1.118 std_dev=0.399
C3'	B	0, 0.430, 0.869, 1.308, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.869 std_dev=0.439
C4'	A	0, 0.992, 1.449, 1.906, 1.954 max_d=1.954 avg_d=1.449 std_dev=0.457
C3'	A	0, 1.046, 1.518, 1.990, 1.952 max_d=1.952 avg_d=1.518 std_dev=0.472
O5'	A	0, 0.988, 1.490, 1.993, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.490 std_dev=0.502
O2'	B	0, 0.899, 1.402, 1.905, 2.033 max_d=2.033 avg_d=1.402 std_dev=0.503
O3'	B	0, 0.735, 1.265, 1.796, 2.103 max_d=2.103 avg_d=1.265 std_dev=0.531
O2'	A	0, 1.235, 1.790, 2.346, 2.148 max_d=2.148 avg_d=1.790 std_dev=0.555
C5'	A	0, 1.241, 1.844, 2.447, 2.651 max_d=2.651 avg_d=1.844 std_dev=0.603
P	A	0, 1.152, 1.761, 2.370, 2.593 max_d=2.593 avg_d=1.761 std_dev=0.609
P	B	0, 0.665, 1.295, 1.925, 2.325 max_d=2.325 avg_d=1.295 std_dev=0.630
OP2	A	0, 1.299, 1.947, 2.595, 2.683 max_d=2.683 avg_d=1.947 std_dev=0.648
O3'	A	0, 1.572, 2.269, 2.965, 2.701 max_d=2.701 avg_d=2.269 std_dev=0.697
OP2	B	0, 0.878, 1.616, 2.353, 2.568 max_d=2.568 avg_d=1.616 std_dev=0.737
OP1	B	0, 0.521, 1.351, 2.180, 2.788 max_d=2.788 avg_d=1.351 std_dev=0.829
OP1	A	0, 1.731, 2.572, 3.414, 3.619 max_d=3.619 avg_d=2.572 std_dev=0.841

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.01	0.06	0.09	0.07	0.05
C2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.01	0.03	0.10	0.11	0.15	0.11
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.02	0.06	0.11	0.00	0.02	0.06	0.00	0.09	0.17	0.14	0.12
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.08	0.05	0.08	0.09	0.01	0.01	0.10	0.01	0.04	0.16	0.08	0.08
C4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.00	0.03	0.14	0.16	0.21	0.17
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.06	0.01	0.04	0.00	0.01	0.09	0.02	0.02
C5	0.00	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.00	0.03	0.15	0.16	0.20	0.18
C5'	0.03	0.05	0.04	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.09	0.06	0.07	0.05	0.04	0.04	0.10	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.03	0.13	0.13	0.15	0.14
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02	0.01	0.10	0.10	0.12	0.10
N3	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.01	0.03	0.12	0.14	0.19	0.14
O2	0.03	0.00	0.11	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.12	0.01	0.05	0.09	0.10	0.13	0.09
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.07	0.06	0.09	0.04	0.08	0.04	0.06	0.10	0.00	0.05	0.08	0.04	0.06	0.15	0.15	0.10
O3'	0.05	0.08	0.02	0.01	0.09	0.01	0.09	0.04	0.07	0.04	0.09	0.12	0.05	0.00	0.11	0.04	0.05	0.19	0.11	0.11
O4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.11	0.00	0.03	0.15	0.18	0.24	0.19
O4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.04	0.03	0.00	0.04	0.04	0.09	0.05
O5'	0.06	0.10	0.09	0.04	0.14	0.01	0.15	0.01	0.13	0.10	0.12	0.09	0.06	0.05	0.15	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.09	0.11	0.17	0.16	0.16	0.09	0.16	0.06	0.13	0.10	0.14	0.10	0.15	0.19	0.18	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.15	0.14	0.08	0.21	0.02	0.20	0.02	0.15	0.12	0.19	0.13	0.15	0.11	0.24	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.11	0.12	0.08	0.17	0.02	0.18	0.02	0.14	0.10	0.14	0.09	0.10	0.11	0.19	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.27	0.15	0.10	0.14	0.13	0.15	0.11	0.17	0.17	0.21	0.39	0.23	0.17	0.15	0.29	0.09	0.17	0.20	0.19	0.40	0.51	0.33
C2	0.15	0.24	0.12	0.11	0.16	0.10	0.20	0.16	0.23	0.19	0.23	0.37	0.19	0.22	0.15	0.24	0.09	0.13	0.29	0.27	0.44	0.60	0.42
C2'	0.17	0.26	0.15	0.09	0.14	0.11	0.15	0.11	0.18	0.18	0.20	0.39	0.23	0.20	0.14	0.29	0.08	0.14	0.23	0.22	0.48	0.62	0.40
C3'	0.16	0.25	0.15	0.06	0.10	0.09	0.11	0.06	0.12	0.17	0.16	0.38	0.23	0.19	0.11	0.29	0.05	0.12	0.18	0.17	0.50	0.61	0.39
C4	0.15	0.22	0.14	0.20	0.18	0.20	0.22	0.31	0.21	0.24	0.17	0.31	0.19	0.27	0.18	0.19	0.17	0.18	0.43	0.25	0.56	0.71	0.57
C4'	0.18	0.27	0.16	0.08	0.13	0.13	0.11	0.09	0.12	0.16	0.19	0.39	0.25	0.16	0.13	0.30	0.07	0.17	0.13	0.14	0.41	0.47	0.28
C5	0.16	0.20	0.16	0.21	0.15	0.21	0.17	0.31	0.13	0.22	0.12	0.29	0.20	0.24	0.17	0.20	0.19	0.19	0.42	0.19	0.56	0.70	0.55
C5'	0.18	0.29	0.17	0.09	0.17	0.13	0.12	0.08	0.13	0.16	0.21	0.39	0.28	0.15	0.14	0.28	0.06	0.16	0.11	0.13	0.41	0.43	0.26
C6	0.14	0.22	0.15	0.16	0.13	0.15	0.15	0.22	0.13	0.19	0.14	0.31	0.21	0.21	0.15	0.22	0.14	0.14	0.33	0.18	0.49	0.62	0.46
N1	0.15	0.24	0.13	0.11	0.14	0.10	0.16	0.15	0.18	0.18	0.19	0.36	0.21	0.20	0.14	0.25	0.10	0.13	0.27	0.21	0.44	0.58	0.40
N3	0.13	0.23	0.12	0.14	0.17	0.13	0.22	0.23	0.24	0.21	0.22	0.34	0.18	0.25	0.16	0.20	0.13	0.13	0.36	0.29	0.50	0.66	0.49
O2	0.18	0.24	0.13	0.10	0.16	0.12	0.21	0.14	0.25	0.19	0.26	0.35	0.18	0.22	0.16	0.26	0.08	0.16	0.26	0.30	0.40	0.57	0.38
O2'	0.20	0.28	0.16	0.10	0.15	0.15	0.16	0.12	0.20	0.18	0.24	0.42	0.24	0.19	0.15	0.32	0.09	0.19	0.20	0.23	0.45	0.58	0.36
O3'	0.17	0.26	0.17	0.08	0.11	0.12	0.11	0.07	0.13	0.17	0.17	0.39	0.24	0.19	0.11	0.30	0.08	0.14	0.15	0.19	0.53	0.63	0.39
O4	0.18	0.23	0.16	0.23	0.21	0.25	0.26	0.37	0.23	0.28	0.20	0.31	0.21	0.32	0.22	0.18	0.20	0.23	0.49	0.28	0.62	0.77	0.63
O4'	0.20	0.27	0.17	0.12	0.13	0.16	0.12	0.13	0.14	0.17	0.20	0.38	0.24	0.16	0.15	0.30	0.13	0.19	0.16	0.15	0.37	0.43	0.27
O5'	0.13	0.28	0.15	0.06	0.14	0.06	0.10	0.08	0.11	0.15	0.19	0.37	0.27	0.15	0.10	0.23	0.02	0.09	0.17	0.11	0.49	0.54	0.37
OP1	0.03	0.22	0.07	0.01	0.08	0.05	0.06	0.12	0.07	0.17	0.14	0.32	0.21	0.17	0.03	0.12	0.01	0.02	0.16	0.11	0.63	0.56	0.44
OP2	0.08	0.21	0.11	0.04	0.12	0.10	0.15	0.22	0.15	0.24	0.16	0.28	0.19	0.24	0.11	0.12	0.02	0.08	0.27	0.18	0.65	0.68	0.55
P	0.04	0.20	0.08	0.01	0.07	0.03	0.07	0.11	0.07	0.17	0.12	0.28	0.19	0.17	0.05	0.12	0.00	0.01	0.16	0.10	0.55	0.53	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.08	0.13	0.12
C2	0.03	0.00	0.10	0.11	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.13	0.04	0.14	0.01	0.17	0.29	0.22
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.09	0.06	0.13	0.11	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.17	0.15	0.08
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.02	0.04	0.11	0.07	0.14	0.11	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.22	0.18	0.11
C4	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.02	0.14	0.01	0.16	0.26	0.21
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.06	0.02	0.04	0.03	0.06	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.05	0.03
C5	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.17	0.01	0.21	0.31	0.26
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.07	0.00	0.11	0.00	0.11	0.11	0.09	0.05	0.05	0.13	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.13	0.07	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.18	0.01	0.24	0.34	0.29
C8	0.01	0.00	0.09	0.11	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.13	0.04	0.15	0.01	0.19	0.26	0.23
N1	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.02	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.03	0.17	0.01	0.21	0.33	0.26
N2	0.04	0.00	0.13	0.14	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.19	0.06	0.14	0.02	0.17	0.29	0.21
N3	0.03	0.00	0.11	0.11	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.13	0.05	0.12	0.01	0.14	0.25	0.19
N7	0.00	0.00	0.08	0.09	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.12	0.03	0.17	0.02	0.24	0.32	0.28
N9	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.11	0.01	0.13	0.21	0.18
O2'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.06	0.08	0.15	0.12	0.06	0.02	0.00	0.03	0.04	0.04	0.06	0.19	0.13	0.07
O3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.13	0.08	0.19	0.13	0.12	0.03	0.03	0.00	0.01	0.05	0.07	0.35	0.29	0.20
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.06	0.05	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.14	0.13
O5'	0.05	0.14	0.05	0.04	0.14	0.01	0.17	0.01	0.18	0.15	0.17	0.14	0.12	0.17	0.11	0.04	0.05	0.03	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.07	0.02	0.19	0.00	0.27	0.37	0.31
OP1	0.08	0.17	0.17	0.22	0.16	0.11	0.21	0.07	0.24	0.19	0.21	0.17	0.14	0.24	0.13	0.19	0.35	0.06	0.01	0.27	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.29	0.15	0.18	0.26	0.05	0.31	0.02	0.34	0.26	0.33	0.29	0.25	0.32	0.21	0.13	0.29	0.14	0.01	0.37	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.22	0.08	0.11	0.21	0.03	0.26	0.01	0.29	0.23	0.26	0.21	0.19	0.28	0.18	0.07	0.20	0.13	0.01	0.31	0.01	0.00	0.00