Doublet Group distance statistics: 49424

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.008, 0.015, 0.023, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.021 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.021, 0.039, 0.057, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.039 std_dev=0.018
O4	A	0, 0.040, 0.074, 0.108, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.074 std_dev=0.034
O2'	A	0, 0.153, 0.318, 0.483, 0.505 max_d=0.505 avg_d=0.318 std_dev=0.165
C3'	B	0, 0.206, 0.390, 0.573, 0.558 max_d=0.558 avg_d=0.390 std_dev=0.183
C2'	A	0, 0.063, 0.252, 0.441, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.252 std_dev=0.189
O4'	A	0, 0.013, 0.210, 0.408, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.210 std_dev=0.197
C4'	B	0, 0.234, 0.435, 0.637, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.435 std_dev=0.201
C2'	B	0, 0.254, 0.466, 0.677, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.466 std_dev=0.211
O5'	A	0, 0.176, 0.394, 0.613, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.394 std_dev=0.218
N9	B	0, 0.253, 0.475, 0.697, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.475 std_dev=0.222
N7	B	0, 0.253, 0.476, 0.698, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.476 std_dev=0.223
C8	B	0, 0.264, 0.493, 0.723, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.493 std_dev=0.229
C1'	B	0, 0.278, 0.512, 0.747, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.512 std_dev=0.234
O4'	B	0, 0.285, 0.520, 0.755, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.520 std_dev=0.235
C5	B	0, 0.207, 0.446, 0.685, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.446 std_dev=0.239
C4	B	0, 0.202, 0.442, 0.682, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.442 std_dev=0.240
P	A	0, 0.254, 0.495, 0.735, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.495 std_dev=0.241
C6	B	0, 0.191, 0.461, 0.731, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.461 std_dev=0.270
N3	B	0, 0.171, 0.443, 0.715, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.443 std_dev=0.272
O6	B	0, 0.212, 0.488, 0.764, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.488 std_dev=0.276
N1	B	0, 0.220, 0.500, 0.781, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.500 std_dev=0.281
C2	B	0, 0.196, 0.482, 0.769, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.482 std_dev=0.286
O3'	B	0, 0.275, 0.564, 0.852, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.564 std_dev=0.288
N2	B	0, 0.241, 0.541, 0.842, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.541 std_dev=0.300
O2'	B	0, 0.347, 0.652, 0.957, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.652 std_dev=0.305
C5'	B	0, 0.203, 0.512, 0.820, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.512 std_dev=0.309
C3'	A	0, 0.080, 0.399, 0.718, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.399 std_dev=0.319
C4'	A	0, 0.033, 0.362, 0.690, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.362 std_dev=0.328
O3'	A	0, 0.154, 0.547, 0.940, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.547 std_dev=0.393
OP1	A	0, 0.395, 0.798, 1.202, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.798 std_dev=0.404
OP2	A	0, 0.256, 0.788, 1.320, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.788 std_dev=0.532
O5'	B	0, 0.618, 1.212, 1.805, 1.726 max_d=1.726 avg_d=1.212 std_dev=0.594
P	B	0, 0.550, 1.162, 1.774, 1.930 max_d=1.930 avg_d=1.162 std_dev=0.612
C5'	A	0, 0.070, 0.708, 1.347, 1.771 max_d=1.771 avg_d=0.708 std_dev=0.638
OP2	B	0, 0.486, 1.176, 1.867, 2.190 max_d=2.190 avg_d=1.176 std_dev=0.691
OP1	B	0, 0.748, 1.615, 2.483, 2.944 max_d=2.944 avg_d=1.615 std_dev=0.868

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.05	0.38	0.10
C2	0.01	0.00	0.07	0.16	0.01	0.08	0.01	0.21	0.02	0.00	0.00	0.00	0.06	0.15	0.01	0.01	0.14	0.09	0.44	0.14
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.03	0.04	0.02	0.05	0.01	0.05	0.13	0.01	0.02	0.02	0.01	0.19	0.21	0.27	0.09
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.13	0.00	0.08	0.02	0.05	0.08	0.16	0.19	0.01	0.00	0.13	0.02	0.31	0.32	0.19	0.18
C4	0.02	0.01	0.02	0.13	0.00	0.12	0.01	0.30	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.05	0.21	0.14	0.42	0.14
C4'	0.02	0.08	0.03	0.00	0.12	0.00	0.11	0.01	0.08	0.07	0.11	0.07	0.05	0.02	0.12	0.00	0.03	0.10	0.34	0.04
C5	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.11	0.00	0.28	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.09	0.00	0.07	0.22	0.14	0.41	0.13
C5'	0.05	0.21	0.02	0.02	0.30	0.01	0.28	0.00	0.23	0.18	0.27	0.18	0.06	0.04	0.32	0.01	0.00	0.14	0.38	0.01
C6	0.02	0.02	0.05	0.05	0.00	0.08	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.00	0.06	0.19	0.10	0.43	0.13
N1	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.02	0.14	0.08	0.43	0.13
N3	0.01	0.00	0.05	0.16	0.01	0.11	0.02	0.27	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.17	0.01	0.02	0.18	0.12	0.44	0.15
O2	0.03	0.00	0.13	0.19	0.01	0.07	0.02	0.18	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.19	0.02	0.02	0.12	0.08	0.44	0.14
O2'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.06	0.05	0.05	0.06	0.04	0.03	0.06	0.08	0.00	0.06	0.07	0.05	0.03	0.15	0.29	0.02
O3'	0.01	0.15	0.02	0.00	0.14	0.02	0.09	0.04	0.05	0.07	0.17	0.19	0.06	0.00	0.16	0.01	0.28	0.39	0.13	0.22
O4	0.02	0.01	0.02	0.13	0.00	0.12	0.00	0.32	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.16	0.00	0.05	0.23	0.16	0.39	0.14
O4'	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.05	0.00	0.09	0.03	0.38	0.13
O5'	0.08	0.14	0.19	0.31	0.21	0.03	0.22	0.00	0.19	0.14	0.18	0.12	0.03	0.28	0.23	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.05	0.09	0.21	0.32	0.14	0.10	0.14	0.14	0.10	0.08	0.12	0.08	0.15	0.39	0.16	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.38	0.44	0.27	0.19	0.42	0.34	0.41	0.38	0.43	0.43	0.44	0.44	0.29	0.13	0.39	0.38	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.14	0.09	0.18	0.14	0.04	0.13	0.01	0.13	0.13	0.15	0.14	0.02	0.22	0.14	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.22	0.10	0.08	0.17	0.08	0.21	0.09	0.26	0.19	0.26	0.25	0.15	0.21	0.16	0.13	0.08	0.15	0.17	0.29	0.37	0.36	0.24
C2	0.18	0.17	0.13	0.09	0.17	0.12	0.22	0.16	0.27	0.20	0.25	0.20	0.15	0.22	0.18	0.15	0.05	0.17	0.24	0.32	0.41	0.42	0.30
C2'	0.11	0.22	0.03	0.11	0.15	0.05	0.20	0.09	0.26	0.15	0.26	0.25	0.16	0.19	0.12	0.08	0.19	0.07	0.13	0.29	0.32	0.32	0.21
C3'	0.05	0.18	0.11	0.22	0.11	0.20	0.17	0.24	0.21	0.13	0.21	0.21	0.12	0.18	0.07	0.13	0.32	0.10	0.18	0.25	0.30	0.30	0.20
C4	0.16	0.15	0.15	0.12	0.12	0.14	0.12	0.19	0.13	0.16	0.09	0.22	0.16	0.18	0.15	0.17	0.09	0.14	0.27	0.23	0.45	0.46	0.35
C4'	0.09	0.24	0.12	0.17	0.15	0.17	0.17	0.19	0.21	0.13	0.23	0.30	0.20	0.17	0.10	0.15	0.22	0.11	0.15	0.23	0.34	0.32	0.21
C5	0.16	0.14	0.16	0.11	0.08	0.12	0.08	0.17	0.11	0.14	0.11	0.20	0.14	0.16	0.13	0.18	0.09	0.12	0.24	0.18	0.45	0.45	0.34
C5'	0.22	0.21	0.24	0.28	0.13	0.33	0.13	0.32	0.16	0.11	0.17	0.27	0.21	0.14	0.12	0.36	0.37	0.27	0.18	0.19	0.33	0.35	0.22
C6	0.16	0.12	0.15	0.09	0.07	0.10	0.14	0.14	0.17	0.16	0.15	0.18	0.09	0.18	0.13	0.18	0.06	0.13	0.21	0.22	0.43	0.42	0.31
N1	0.17	0.16	0.12	0.09	0.14	0.11	0.20	0.13	0.24	0.19	0.23	0.20	0.11	0.21	0.16	0.16	0.05	0.15	0.21	0.28	0.41	0.40	0.29
N3	0.18	0.13	0.14	0.11	0.15	0.14	0.19	0.19	0.23	0.19	0.17	0.19	0.15	0.22	0.17	0.16	0.07	0.16	0.27	0.30	0.43	0.45	0.33
O2	0.19	0.22	0.11	0.09	0.19	0.12	0.24	0.15	0.29	0.20	0.29	0.23	0.18	0.23	0.19	0.13	0.05	0.18	0.23	0.34	0.39	0.40	0.28
O2'	0.18	0.28	0.10	0.08	0.19	0.09	0.22	0.09	0.28	0.17	0.31	0.32	0.20	0.20	0.16	0.14	0.14	0.16	0.13	0.32	0.34	0.32	0.21
O3'	0.08	0.19	0.14	0.26	0.11	0.25	0.17	0.30	0.21	0.14	0.21	0.24	0.13	0.18	0.09	0.15	0.37	0.14	0.21	0.25	0.31	0.29	0.21
O4	0.16	0.19	0.15	0.12	0.13	0.14	0.09	0.21	0.06	0.15	0.11	0.25	0.19	0.15	0.14	0.17	0.11	0.13	0.28	0.18	0.45	0.47	0.36
O4'	0.04	0.27	0.04	0.09	0.16	0.06	0.20	0.09	0.25	0.15	0.27	0.32	0.21	0.19	0.10	0.09	0.11	0.04	0.13	0.26	0.34	0.31	0.21
O5'	0.14	0.23	0.16	0.06	0.15	0.08	0.19	0.07	0.24	0.14	0.25	0.27	0.18	0.18	0.11	0.35	0.02	0.12	0.10	0.26	0.35	0.22	0.18
OP1	0.04	0.13	0.07	0.02	0.04	0.06	0.09	0.17	0.09	0.16	0.11	0.19	0.10	0.16	0.07	0.12	0.02	0.04	0.26	0.12	0.61	0.51	0.45
OP2	0.11	0.22	0.20	0.04	0.17	0.11	0.19	0.27	0.20	0.18	0.22	0.24	0.19	0.19	0.15	0.24	0.01	0.08	0.23	0.21	0.25	0.26	0.20
P	0.06	0.11	0.11	0.02	0.04	0.05	0.07	0.15	0.08	0.13	0.10	0.16	0.08	0.12	0.06	0.18	0.01	0.03	0.17	0.10	0.41	0.34	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.11	0.01	0.10	0.10	0.09
C2	0.01	0.00	0.11	0.10	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.14	0.02	0.17	0.02	0.12	0.17	0.11
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.01	0.06	0.05	0.09	0.13	0.11	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.05	0.20	0.16	0.07
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.05	0.10	0.07	0.12	0.09	0.08	0.04	0.01	0.00	0.01	0.08	0.06	0.26	0.22	0.15
C4	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.16	0.02	0.11	0.14	0.10
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.09	0.03	0.04	0.03	0.08	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.11	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.02	0.20	0.02	0.15	0.18	0.14
C5'	0.03	0.08	0.01	0.02	0.09	0.00	0.14	0.00	0.15	0.16	0.12	0.07	0.06	0.18	0.09	0.03	0.05	0.01	0.01	0.18	0.13	0.11	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02	0.20	0.01	0.17	0.21	0.16
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.09	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.12	0.01	0.20	0.03	0.13	0.13	0.12
N1	0.01	0.00	0.09	0.07	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.11	0.03	0.19	0.01	0.15	0.19	0.14
N2	0.02	0.00	0.13	0.12	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.18	0.19	0.03	0.16	0.01	0.12	0.17	0.10
N3	0.02	0.01	0.11	0.09	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.14	0.13	0.02	0.15	0.02	0.10	0.14	0.09
N7	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.21	0.03	0.16	0.18	0.16
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.15	0.02	0.10	0.12	0.09
O2'	0.02	0.15	0.00	0.01	0.07	0.03	0.05	0.03	0.08	0.03	0.12	0.18	0.14	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.07	0.20	0.16	0.07
O3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.06	0.01	0.05	0.05	0.07	0.12	0.11	0.19	0.13	0.10	0.04	0.02	0.00	0.01	0.16	0.07	0.42	0.34	0.29
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.13	0.03	0.17	0.16	0.18
O5'	0.11	0.17	0.07	0.08	0.16	0.01	0.20	0.01	0.20	0.20	0.19	0.16	0.15	0.21	0.15	0.04	0.16	0.13	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.02	0.05	0.06	0.02	0.06	0.02	0.18	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.07	0.07	0.03	0.23	0.00	0.20	0.24	0.20
OP1	0.10	0.12	0.20	0.26	0.11	0.12	0.15	0.13	0.17	0.13	0.15	0.12	0.10	0.16	0.10	0.20	0.42	0.17	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.17	0.16	0.22	0.14	0.11	0.18	0.11	0.21	0.13	0.19	0.17	0.14	0.18	0.12	0.16	0.34	0.16	0.01	0.24	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.11	0.07	0.15	0.10	0.01	0.14	0.01	0.16	0.12	0.14	0.10	0.09	0.16	0.09	0.07	0.29	0.18	0.01	0.20	0.00	0.00	0.00