Doublet Group distance statistics: 49426

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.002, 0.016, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.008, 0.022, 0.037, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.013, 0.031, 0.050, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.031 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.006, 0.035, 0.064, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.035 std_dev=0.029
C2'	A	0, 0.042, 0.103, 0.163, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.103 std_dev=0.060
O4'	A	0, 0.041, 0.118, 0.195, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.118 std_dev=0.077
O2'	A	0, 0.046, 0.165, 0.284, 0.319 max_d=0.319 avg_d=0.165 std_dev=0.119
C3'	A	0, 0.110, 0.270, 0.430, 0.420 max_d=0.420 avg_d=0.270 std_dev=0.160
C4'	A	0, 0.118, 0.294, 0.470, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.294 std_dev=0.176
C6	B	0, 0.121, 0.342, 0.563, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.342 std_dev=0.221
N1	B	0, 0.077, 0.302, 0.526, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.302 std_dev=0.225
O6	B	0, 0.161, 0.390, 0.618, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.390 std_dev=0.228
O3'	A	0, 0.165, 0.397, 0.628, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.397 std_dev=0.232
C2	B	0, 0.168, 0.407, 0.645, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.407 std_dev=0.239
C5	B	0, 0.184, 0.447, 0.709, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.447 std_dev=0.262
C5'	A	0, 0.185, 0.472, 0.758, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.472 std_dev=0.287
N3	B	0, 0.207, 0.498, 0.788, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.498 std_dev=0.291
C4	B	0, 0.197, 0.490, 0.784, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.490 std_dev=0.293
O5'	A	0, 0.215, 0.511, 0.806, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.511 std_dev=0.295
N2	B	0, 0.200, 0.497, 0.793, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.497 std_dev=0.296
C2'	B	0, 0.207, 0.556, 0.905, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.556 std_dev=0.349
N7	B	0, 0.219, 0.570, 0.922, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.570 std_dev=0.351
P	A	0, 0.221, 0.582, 0.944, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.582 std_dev=0.361
N9	B	0, 0.201, 0.597, 0.993, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.597 std_dev=0.396
C3'	B	0, 0.280, 0.687, 1.093, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.687 std_dev=0.407
OP2	A	0, 0.202, 0.612, 1.022, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.612 std_dev=0.410
OP1	A	0, 0.212, 0.622, 1.032, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.622 std_dev=0.410
O3'	B	0, 0.295, 0.708, 1.121, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.708 std_dev=0.413
C8	B	0, 0.206, 0.627, 1.049, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.627 std_dev=0.422
O2'	B	0, 0.220, 0.702, 1.183, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.702 std_dev=0.482
C1'	B	0, 0.188, 0.707, 1.225, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.707 std_dev=0.518
P	B	0, 0.375, 0.997, 1.619, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.997 std_dev=0.622
O5'	B	0, 0.420, 1.056, 1.692, 1.686 max_d=1.686 avg_d=1.056 std_dev=0.636
C4'	B	0, 0.275, 0.952, 1.629, 1.907 max_d=1.907 avg_d=0.952 std_dev=0.677
OP2	B	0, 0.486, 1.177, 1.869, 1.779 max_d=1.779 avg_d=1.177 std_dev=0.692
O4'	B	0, 0.179, 0.897, 1.614, 1.999 max_d=1.999 avg_d=0.897 std_dev=0.718
OP1	B	0, 0.160, 0.942, 1.725, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.942 std_dev=0.782
C5'	B	0, 0.322, 1.246, 2.170, 2.608 max_d=2.608 avg_d=1.246 std_dev=0.924

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.09	0.04	0.02
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.07	0.03	0.01	0.13	0.10	0.09	0.07
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.09	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.09	0.09	0.10
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.04	0.06	0.08	0.01	0.00	0.06	0.01	0.21	0.13	0.10	0.16
C4	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.03	0.19	0.18	0.20	0.16
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.03	0.03	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.09	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.19	0.18	0.18	0.16
C5'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.12	0.00	0.13	0.00	0.10	0.05	0.08	0.01	0.04	0.02	0.13	0.00	0.00	0.12	0.08	0.00
C6	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.03	0.15	0.12	0.10	0.10
N1	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.12	0.09	0.07	0.05
N3	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.07	0.02	0.02	0.17	0.14	0.15	0.12
O2	0.03	0.00	0.09	0.08	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.08	0.10	0.04	0.02	0.11	0.08	0.07	0.04
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.00	0.04	0.08	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.07	0.06	0.05
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.05	0.04	0.07	0.10	0.02	0.00	0.07	0.01	0.29	0.18	0.12	0.21
O4	0.02	0.03	0.02	0.06	0.01	0.07	0.01	0.13	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.07	0.00	0.03	0.21	0.22	0.24	0.19
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.16	0.15	0.06	0.07
O5'	0.08	0.13	0.10	0.21	0.19	0.01	0.19	0.00	0.15	0.12	0.17	0.11	0.05	0.29	0.21	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.10	0.09	0.13	0.18	0.09	0.18	0.12	0.12	0.09	0.14	0.08	0.07	0.18	0.22	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.09	0.09	0.10	0.20	0.04	0.18	0.08	0.10	0.07	0.15	0.07	0.06	0.12	0.24	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.07	0.10	0.16	0.16	0.02	0.16	0.00	0.10	0.05	0.12	0.04	0.05	0.21	0.19	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.17	0.09	0.15	0.12	0.11	0.15	0.23	0.13	0.23	0.15	0.27	0.10	0.21	0.18	0.18	0.21	0.12	0.24	0.14	0.16	0.75	0.34
C2	0.13	0.04	0.04	0.15	0.10	0.15	0.14	0.26	0.11	0.16	0.06	0.11	0.02	0.18	0.13	0.09	0.16	0.12	0.25	0.14	0.31	0.90	0.46
C2'	0.18	0.15	0.10	0.17	0.11	0.12	0.15	0.29	0.14	0.21	0.15	0.24	0.09	0.20	0.16	0.24	0.25	0.07	0.19	0.17	0.15	0.70	0.31
C3'	0.14	0.18	0.13	0.22	0.07	0.19	0.11	0.36	0.10	0.20	0.13	0.29	0.13	0.20	0.12	0.28	0.31	0.08	0.18	0.13	0.15	0.60	0.25
C4	0.13	0.05	0.10	0.18	0.08	0.27	0.10	0.39	0.10	0.14	0.03	0.08	0.08	0.16	0.12	0.09	0.15	0.27	0.17	0.17	0.43	0.94	0.48
C4'	0.21	0.23	0.18	0.15	0.10	0.11	0.11	0.21	0.08	0.25	0.15	0.36	0.18	0.22	0.17	0.32	0.25	0.11	0.25	0.09	0.08	0.60	0.26
C5	0.14	0.11	0.10	0.22	0.09	0.33	0.09	0.48	0.07	0.14	0.03	0.16	0.14	0.18	0.12	0.09	0.17	0.32	0.11	0.15	0.35	0.83	0.40
C5'	0.23	0.25	0.24	0.20	0.14	0.20	0.14	0.25	0.09	0.30	0.15	0.38	0.24	0.27	0.20	0.35	0.29	0.19	0.29	0.10	0.11	0.52	0.24
C6	0.07	0.15	0.05	0.22	0.07	0.28	0.11	0.42	0.08	0.18	0.07	0.21	0.14	0.20	0.09	0.08	0.19	0.23	0.12	0.13	0.24	0.76	0.35
N1	0.11	0.13	0.04	0.18	0.08	0.18	0.13	0.30	0.10	0.19	0.10	0.20	0.09	0.20	0.13	0.10	0.19	0.12	0.20	0.13	0.23	0.81	0.38
N3	0.09	0.03	0.06	0.15	0.08	0.19	0.12	0.30	0.11	0.13	0.03	0.08	0.03	0.16	0.10	0.07	0.14	0.16	0.23	0.15	0.39	0.96	0.50
O2	0.19	0.05	0.05	0.13	0.13	0.11	0.14	0.20	0.13	0.17	0.09	0.09	0.09	0.17	0.16	0.10	0.16	0.14	0.30	0.15	0.30	0.92	0.47
O2'	0.25	0.17	0.14	0.14	0.15	0.08	0.17	0.22	0.17	0.24	0.19	0.25	0.11	0.22	0.21	0.27	0.23	0.15	0.23	0.19	0.12	0.70	0.31
O3'	0.16	0.17	0.16	0.23	0.08	0.21	0.11	0.39	0.11	0.20	0.14	0.28	0.13	0.19	0.12	0.33	0.34	0.10	0.19	0.15	0.18	0.53	0.22
O4	0.16	0.05	0.12	0.18	0.10	0.30	0.11	0.41	0.12	0.17	0.09	0.07	0.08	0.16	0.15	0.11	0.16	0.32	0.18	0.22	0.51	0.98	0.52
O4'	0.21	0.23	0.12	0.14	0.10	0.07	0.12	0.17	0.09	0.25	0.16	0.35	0.17	0.21	0.18	0.22	0.21	0.11	0.26	0.09	0.11	0.67	0.30
O5'	0.38	0.06	0.42	0.13	0.28	0.11	0.36	0.15	0.28	0.53	0.14	0.08	0.11	0.49	0.40	0.46	0.01	0.21	0.36	0.31	0.23	0.65	0.39
OP1	0.13	0.08	0.21	0.02	0.09	0.13	0.19	0.31	0.15	0.34	0.03	0.19	0.06	0.33	0.18	0.30	0.01	0.07	0.18	0.21	0.17	0.18	0.13
OP2	0.10	0.20	0.08	0.13	0.12	0.34	0.17	0.55	0.16	0.25	0.15	0.27	0.20	0.28	0.10	0.08	0.00	0.29	0.27	0.22	0.30	0.42	0.29
P	0.10	0.11	0.19	0.00	0.08	0.12	0.19	0.28	0.14	0.36	0.05	0.22	0.09	0.34	0.17	0.22	0.00	0.05	0.23	0.20	0.15	0.41	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.01	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.05	0.26	0.24	0.09
C2	0.04	0.00	0.20	0.19	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.21	0.27	0.10	0.29	0.02	0.16	0.79	0.36
C2'	0.00	0.20	0.00	0.01	0.09	0.02	0.00	0.03	0.04	0.14	0.13	0.25	0.21	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.01	0.13	0.41	0.13
C3'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.04	0.27	0.11	0.26	0.18	0.22	0.08	0.01	0.00	0.00	0.31	0.08	0.13	0.47	0.26
C4	0.03	0.01	0.09	0.04	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.06	0.31	0.03	0.21	0.75	0.37
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.15	0.04	0.08	0.05	0.13	0.06	0.05	0.02	0.00	0.03	0.09	0.31	0.05	0.13
C5	0.03	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.05	0.41	0.02	0.42	0.99	0.57
C5'	0.03	0.08	0.03	0.02	0.09	0.01	0.14	0.00	0.13	0.21	0.10	0.09	0.07	0.20	0.10	0.06	0.03	0.01	0.01	0.16	0.12	0.07	0.02
C6	0.05	0.01	0.04	0.04	0.02	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.07	0.03	0.07	0.42	0.01	0.47	1.08	0.63
C8	0.01	0.01	0.14	0.27	0.01	0.15	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.30	0.02	0.43	0.02	0.43	0.85	0.53
N1	0.04	0.00	0.13	0.11	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.16	0.09	0.36	0.01	0.32	0.97	0.51
N2	0.05	0.00	0.25	0.26	0.01	0.08	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.27	0.39	0.11	0.26	0.02	0.13	0.73	0.30
N3	0.04	0.00	0.21	0.18	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.25	0.09	0.25	0.02	0.13	0.66	0.27
N7	0.02	0.01	0.10	0.22	0.01	0.13	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.26	0.02	0.47	0.02	0.57	1.08	0.68
N9	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.10	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.02	0.28	0.04	0.17	0.61	0.29
O2'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.10	0.05	0.03	0.06	0.07	0.09	0.15	0.27	0.21	0.06	0.01	0.00	0.02	0.06	0.13	0.04	0.36	0.20	0.12
O3'	0.01	0.27	0.01	0.00	0.06	0.02	0.07	0.03	0.03	0.30	0.16	0.39	0.25	0.26	0.08	0.02	0.00	0.01	0.32	0.08	0.16	0.46	0.28
O4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.09	0.11	0.09	0.02	0.02	0.06	0.01	0.00	0.12	0.07	0.40	0.06	0.24
O5'	0.10	0.29	0.22	0.31	0.31	0.03	0.41	0.01	0.42	0.43	0.36	0.26	0.25	0.47	0.28	0.13	0.32	0.12	0.00	0.47	0.02	0.01	0.01
O6	0.05	0.02	0.01	0.08	0.03	0.09	0.02	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.08	0.07	0.47	0.00	0.61	1.22	0.74
OP1	0.26	0.16	0.13	0.13	0.21	0.31	0.42	0.12	0.47	0.43	0.32	0.13	0.13	0.57	0.17	0.36	0.16	0.40	0.02	0.61	0.00	0.00	0.00
OP2	0.24	0.79	0.41	0.47	0.75	0.05	0.99	0.07	1.08	0.85	0.97	0.73	0.66	1.08	0.61	0.20	0.46	0.06	0.01	1.22	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.36	0.13	0.26	0.37	0.13	0.57	0.02	0.63	0.53	0.51	0.30	0.27	0.68	0.29	0.12	0.28	0.24	0.01	0.74	0.00	0.00	0.00