Doublet Group distance statistics: 49428

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.003, 0.020, 0.037, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.020 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.009, 0.034, 0.060, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.034 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.006, 0.033, 0.060, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.033 std_dev=0.027
O4	A	0, 0.002, 0.031, 0.061, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.031 std_dev=0.029
N3	B	0, 0.101, 0.396, 0.692, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.396 std_dev=0.295
C2'	B	0, 0.131, 0.449, 0.766, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.449 std_dev=0.317
O4'	A	0, 0.132, 0.450, 0.768, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.450 std_dev=0.318
C1'	B	0, 0.137, 0.469, 0.802, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.469 std_dev=0.332
C2'	A	0, 0.138, 0.470, 0.803, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.470 std_dev=0.333
C4	B	0, 0.146, 0.506, 0.866, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.506 std_dev=0.360
N9	B	0, 0.161, 0.551, 0.941, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.551 std_dev=0.390
C2	B	0, 0.167, 0.572, 0.977, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.572 std_dev=0.405
O2'	B	0, 0.117, 0.560, 1.002, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.560 std_dev=0.442
N2	B	0, 0.195, 0.669, 1.143, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.669 std_dev=0.474
O4'	B	0, 0.182, 0.680, 1.177, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.680 std_dev=0.498
N1	B	0, 0.214, 0.732, 1.250, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.732 std_dev=0.518
C5	B	0, 0.211, 0.732, 1.254, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.732 std_dev=0.521
C3'	B	0, 0.166, 0.729, 1.291, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.729 std_dev=0.562
C8	B	0, 0.220, 0.800, 1.381, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.800 std_dev=0.580
C6	B	0, 0.238, 0.826, 1.415, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.826 std_dev=0.589
O5'	A	0, 0.189, 0.796, 1.404, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.796 std_dev=0.607
C4'	A	0, 0.246, 0.866, 1.486, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.866 std_dev=0.620
N7	B	0, 0.243, 0.895, 1.546, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.895 std_dev=0.651
O3'	B	0, 0.145, 0.800, 1.454, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.800 std_dev=0.655
C5'	A	0, 0.248, 0.922, 1.596, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.922 std_dev=0.674
C3'	A	0, 0.298, 1.027, 1.757, 1.620 max_d=1.620 avg_d=1.027 std_dev=0.729
O6	B	0, 0.287, 1.021, 1.756, 1.693 max_d=1.693 avg_d=1.021 std_dev=0.734
C4'	B	0, 0.155, 0.892, 1.629, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.892 std_dev=0.737
P	A	0, 0.192, 0.967, 1.741, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.967 std_dev=0.774
O2'	A	0, 0.328, 1.121, 1.913, 1.710 max_d=1.710 avg_d=1.121 std_dev=0.793
OP2	A	0, 0.249, 1.102, 1.955, 2.078 max_d=2.078 avg_d=1.102 std_dev=0.853
OP1	A	0, 0.287, 1.307, 2.327, 2.489 max_d=2.489 avg_d=1.307 std_dev=1.020
C5'	B	0, 0.142, 1.234, 2.325, 2.653 max_d=2.653 avg_d=1.234 std_dev=1.091
O3'	A	0, 0.528, 1.820, 3.112, 2.871 max_d=2.871 avg_d=1.820 std_dev=1.292
O5'	B	0, 0.661, 2.636, 4.610, 4.751 max_d=4.751 avg_d=2.636 std_dev=1.974
OP2	B	0, 0.898, 3.153, 5.409, 5.144 max_d=5.144 avg_d=3.153 std_dev=2.255
P	B	0, 0.768, 3.179, 5.590, 5.836 max_d=5.836 avg_d=3.179 std_dev=2.411
OP1	B	0, 0.904, 4.488, 8.071, 8.771 max_d=8.771 avg_d=4.488 std_dev=3.584

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.18	0.03	0.00	0.09	0.11	0.08	0.07
C2	0.03	0.00	0.06	0.12	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.09	0.02	0.05	0.15	0.15	0.20	0.16
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.02	0.07	0.12	0.08	0.02	0.05	0.11	0.00	0.05	0.05	0.01	0.24	0.32	0.32	0.28
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.21	0.00	0.21	0.01	0.17	0.12	0.17	0.07	0.01	0.01	0.23	0.01	0.03	0.11	0.03	0.02
C4	0.03	0.01	0.04	0.21	0.00	0.11	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.08	0.00	0.03	0.25	0.30	0.36	0.30
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.11	0.00	0.13	0.00	0.11	0.06	0.07	0.02	0.19	0.03	0.12	0.00	0.02	0.04	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.21	0.01	0.13	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.11	0.01	0.03	0.24	0.28	0.31	0.29
C5'	0.04	0.11	0.12	0.01	0.19	0.00	0.20	0.00	0.17	0.11	0.14	0.08	0.06	0.12	0.21	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.08	0.17	0.01	0.11	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.07	0.01	0.04	0.17	0.17	0.16	0.18
N1	0.02	0.00	0.02	0.12	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.05	0.02	0.02	0.12	0.11	0.12	0.11
N3	0.03	0.00	0.05	0.17	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.03	0.02	0.04	0.20	0.23	0.30	0.24
O2	0.03	0.00	0.11	0.07	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.20	0.02	0.07	0.12	0.13	0.17	0.12
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.26	0.19	0.24	0.06	0.19	0.14	0.23	0.12	0.00	0.07	0.28	0.13	0.17	0.27	0.38	0.25
O3'	0.18	0.09	0.05	0.01	0.08	0.03	0.11	0.12	0.07	0.05	0.03	0.20	0.07	0.00	0.10	0.12	0.17	0.15	0.19	0.17
O4	0.03	0.02	0.05	0.23	0.00	0.12	0.01	0.21	0.01	0.02	0.02	0.02	0.28	0.10	0.00	0.03	0.27	0.36	0.43	0.36
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.07	0.13	0.12	0.03	0.00	0.05	0.07	0.08	0.08
O5'	0.09	0.15	0.24	0.03	0.25	0.02	0.24	0.01	0.17	0.12	0.20	0.12	0.17	0.17	0.27	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.11	0.15	0.32	0.11	0.30	0.04	0.28	0.04	0.17	0.11	0.23	0.13	0.27	0.15	0.36	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.20	0.32	0.03	0.36	0.03	0.31	0.02	0.16	0.12	0.30	0.17	0.38	0.19	0.43	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.16	0.28	0.02	0.30	0.02	0.29	0.02	0.18	0.11	0.24	0.12	0.25	0.17	0.36	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.36	0.11	0.03	0.11	0.05	0.07	0.06	0.15	0.09	0.29	0.53	0.26	0.05	0.03	0.31	0.08	0.07	0.48	0.12	0.89	0.46	0.49
C2	0.08	0.32	0.11	0.14	0.08	0.13	0.06	0.28	0.13	0.11	0.27	0.47	0.20	0.09	0.05	0.29	0.14	0.06	0.75	0.11	1.46	0.64	0.83
C2'	0.21	0.37	0.22	0.17	0.16	0.18	0.12	0.16	0.16	0.19	0.30	0.54	0.28	0.15	0.17	0.34	0.17	0.20	0.32	0.13	0.74	0.42	0.33
C3'	0.08	0.36	0.09	0.03	0.12	0.02	0.08	0.08	0.15	0.12	0.29	0.52	0.28	0.10	0.01	0.24	0.04	0.05	0.48	0.14	0.77	0.56	0.51
C4	0.10	0.24	0.12	0.26	0.03	0.28	0.03	0.48	0.09	0.16	0.23	0.32	0.14	0.14	0.08	0.21	0.28	0.14	0.97	0.07	1.82	0.81	1.07
C4'	0.14	0.38	0.12	0.01	0.19	0.06	0.13	0.02	0.18	0.08	0.30	0.51	0.33	0.06	0.12	0.25	0.06	0.10	0.33	0.15	0.54	0.39	0.34
C5	0.08	0.29	0.11	0.25	0.07	0.25	0.07	0.41	0.15	0.14	0.26	0.35	0.20	0.13	0.05	0.18	0.28	0.11	0.88	0.15	1.52	0.71	0.91
C5'	0.21	0.42	0.20	0.09	0.27	0.09	0.22	0.03	0.27	0.13	0.36	0.50	0.38	0.13	0.20	0.27	0.00	0.15	0.24	0.24	0.40	0.30	0.24
C6	0.06	0.33	0.09	0.16	0.10	0.14	0.07	0.25	0.14	0.12	0.26	0.43	0.26	0.10	0.03	0.21	0.19	0.05	0.69	0.11	1.18	0.57	0.69
N1	0.07	0.35	0.10	0.11	0.09	0.08	0.05	0.20	0.13	0.09	0.28	0.50	0.25	0.07	0.02	0.28	0.12	0.04	0.64	0.09	1.18	0.55	0.67
N3	0.09	0.26	0.12	0.21	0.06	0.21	0.06	0.40	0.10	0.14	0.23	0.37	0.15	0.13	0.08	0.26	0.22	0.11	0.89	0.07	1.73	0.76	1.00
O2	0.08	0.30	0.11	0.11	0.08	0.09	0.09	0.25	0.15	0.11	0.27	0.47	0.19	0.10	0.05	0.33	0.10	0.05	0.72	0.15	1.44	0.62	0.81
O2'	0.13	0.36	0.13	0.11	0.17	0.12	0.18	0.12	0.22	0.21	0.31	0.55	0.27	0.22	0.15	0.26	0.10	0.13	0.31	0.22	0.69	0.39	0.30
O3'	0.11	0.40	0.09	0.09	0.16	0.06	0.08	0.17	0.15	0.11	0.31	0.57	0.32	0.08	0.07	0.23	0.15	0.04	0.54	0.11	0.83	0.62	0.59
O4	0.12	0.19	0.13	0.30	0.03	0.34	0.07	0.57	0.09	0.19	0.21	0.26	0.09	0.18	0.11	0.19	0.32	0.18	1.08	0.11	2.10	0.94	1.23
O4'	0.10	0.36	0.11	0.08	0.14	0.10	0.10	0.08	0.16	0.10	0.28	0.51	0.29	0.07	0.07	0.29	0.17	0.09	0.40	0.13	0.66	0.43	0.40
O5'	0.16	0.40	0.17	0.06	0.24	0.05	0.19	0.03	0.25	0.10	0.36	0.49	0.35	0.09	0.15	0.22	0.01	0.10	0.39	0.23	0.58	0.40	0.37
OP1	0.02	0.29	0.06	0.02	0.14	0.07	0.13	0.15	0.20	0.03	0.27	0.35	0.23	0.04	0.04	0.09	0.01	0.05	0.38	0.20	0.71	0.37	0.38
OP2	0.09	0.30	0.11	0.08	0.12	0.11	0.12	0.17	0.21	0.12	0.30	0.36	0.21	0.05	0.04	0.09	0.01	0.13	0.65	0.22	0.85	0.56	0.61
P	0.05	0.29	0.08	0.03	0.15	0.05	0.13	0.10	0.20	0.04	0.28	0.35	0.23	0.03	0.04	0.09	0.01	0.05	0.43	0.20	0.61	0.38	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.07	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.01	0.32	0.21	0.15
C2	0.05	0.00	0.04	0.20	0.01	0.09	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.19	0.03	0.53	0.01	1.25	0.46	0.61
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.02	0.05	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.21	0.01	0.31	0.16	0.19
C3'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.14	0.01	0.13	0.01	0.16	0.02	0.20	0.20	0.17	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.26	0.17	0.31	0.13	0.20
C4	0.03	0.01	0.02	0.14	0.00	0.10	0.00	0.22	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.12	0.00	0.48	0.01	1.07	0.44	0.53
C4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.10	0.00	0.15	0.00	0.16	0.13	0.13	0.06	0.06	0.16	0.08	0.03	0.02	0.00	0.02	0.19	0.16	0.20	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.13	0.00	0.15	0.00	0.30	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.12	0.04	0.60	0.00	1.38	0.56	0.69
C5'	0.03	0.23	0.00	0.01	0.22	0.00	0.30	0.00	0.34	0.23	0.31	0.20	0.18	0.31	0.16	0.03	0.04	0.01	0.00	0.39	0.31	0.34	0.01
C6	0.02	0.01	0.01	0.16	0.01	0.16	0.00	0.34	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.16	0.03	0.66	0.00	1.60	0.61	0.80
C8	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.13	0.01	0.23	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.44	0.02	0.94	0.47	0.49
N1	0.04	0.00	0.02	0.20	0.00	0.13	0.01	0.31	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.19	0.00	0.63	0.01	1.50	0.55	0.74
N2	0.07	0.01	0.05	0.20	0.01	0.06	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.21	0.20	0.06	0.49	0.01	1.20	0.42	0.58
N3	0.06	0.01	0.05	0.17	0.01	0.06	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.16	0.16	0.04	0.44	0.01	1.01	0.39	0.49
N7	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.16	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.06	0.06	0.58	0.02	1.35	0.59	0.69
N9	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.05	0.02	0.36	0.01	0.76	0.36	0.38
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.11	0.03	0.11	0.03	0.14	0.03	0.17	0.21	0.16	0.07	0.04	0.00	0.01	0.07	0.07	0.14	0.10	0.07	0.07
O3'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.12	0.02	0.12	0.04	0.16	0.01	0.19	0.20	0.16	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.20	0.16	0.33	0.17	0.15
O4'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.07	0.00	0.06	0.04	0.06	0.02	0.07	0.01	0.00	0.05	0.05	0.06	0.23	0.04
O5'	0.14	0.53	0.21	0.26	0.48	0.02	0.60	0.00	0.66	0.44	0.63	0.49	0.44	0.58	0.36	0.07	0.20	0.05	0.00	0.72	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.01	0.17	0.01	0.19	0.00	0.39	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.14	0.16	0.05	0.72	0.00	1.79	0.67	0.89
OP1	0.32	1.25	0.31	0.31	1.07	0.16	1.38	0.31	1.60	0.94	1.50	1.20	1.01	1.35	0.76	0.10	0.33	0.06	0.02	1.79	0.00	0.00	0.00
OP2	0.21	0.46	0.16	0.13	0.44	0.20	0.56	0.34	0.61	0.47	0.55	0.42	0.39	0.59	0.36	0.07	0.17	0.23	0.02	0.67	0.00	0.00	0.01
P	0.15	0.61	0.19	0.20	0.53	0.01	0.69	0.01	0.80	0.49	0.74	0.58	0.49	0.69	0.38	0.07	0.15	0.04	0.00	0.89	0.00	0.01	0.00