Doublet Group distance statistics: 49429

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.003, 0.017, 0.030, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.002, 0.017, 0.033, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.004, 0.022, 0.039, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.017
C4	A	0, -0.001, 0.016, 0.034, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.004, 0.050, 0.097, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.050 std_dev=0.047
O4'	A	0, 0.020, 0.085, 0.151, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.085 std_dev=0.066
O4	A	0, -0.017, 0.052, 0.121, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.052 std_dev=0.069
C2'	A	0, 0.042, 0.142, 0.243, 0.217 max_d=0.217 avg_d=0.142 std_dev=0.100
C4'	A	0, 0.070, 0.252, 0.434, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.252 std_dev=0.182
O2'	A	0, 0.081, 0.279, 0.477, 0.433 max_d=0.433 avg_d=0.279 std_dev=0.198
C3'	A	0, 0.088, 0.320, 0.552, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.320 std_dev=0.232
C5'	A	0, 0.111, 0.380, 0.649, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.380 std_dev=0.269
C3'	B	0, 0.118, 0.418, 0.718, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.418 std_dev=0.300
O3'	B	0, 0.103, 0.405, 0.708, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.405 std_dev=0.303
C2'	B	0, 0.049, 0.375, 0.702, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.375 std_dev=0.327
C4'	B	0, 0.129, 0.470, 0.812, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.470 std_dev=0.342
O2'	B	0, 0.049, 0.428, 0.808, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.428 std_dev=0.380
O5'	A	0, 0.165, 0.563, 0.961, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.563 std_dev=0.398
O3'	A	0, 0.150, 0.549, 0.947, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.549 std_dev=0.398
N9	B	0, 0.140, 0.539, 0.939, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.539 std_dev=0.399
C4	B	0, 0.160, 0.567, 0.973, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.567 std_dev=0.406
C1'	B	0, 0.097, 0.508, 0.920, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.508 std_dev=0.412
C8	B	0, 0.161, 0.579, 0.998, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.579 std_dev=0.419
N3	B	0, 0.175, 0.600, 1.024, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.600 std_dev=0.425
P	A	0, 0.138, 0.569, 1.000, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.569 std_dev=0.431
C5	B	0, 0.185, 0.635, 1.084, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.635 std_dev=0.450
N7	B	0, 0.189, 0.649, 1.109, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.649 std_dev=0.460
C2	B	0, 0.200, 0.687, 1.174, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.687 std_dev=0.487
O4'	B	0, 0.131, 0.619, 1.107, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.619 std_dev=0.488
C5'	B	0, 0.199, 0.687, 1.176, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.687 std_dev=0.489
C6	B	0, 0.212, 0.727, 1.241, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.727 std_dev=0.514
N1	B	0, 0.214, 0.736, 1.258, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.736 std_dev=0.522
N2	B	0, 0.219, 0.770, 1.321, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.770 std_dev=0.551
O6	B	0, 0.238, 0.826, 1.414, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.826 std_dev=0.588
OP1	A	0, 0.129, 0.725, 1.321, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.725 std_dev=0.596
OP1	B	0, 0.225, 0.824, 1.423, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.824 std_dev=0.599
OP2	A	0, 0.117, 0.757, 1.398, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.757 std_dev=0.640
P	B	0, 0.295, 1.008, 1.721, 1.544 max_d=1.544 avg_d=1.008 std_dev=0.713
OP2	B	0, 0.282, 1.069, 1.855, 1.872 max_d=1.872 avg_d=1.069 std_dev=0.787
O5'	B	0, 0.347, 1.197, 2.046, 1.889 max_d=1.889 avg_d=1.197 std_dev=0.850

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.10	0.07
C2	0.03	0.00	0.08	0.11	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.13	0.02	0.03	0.10	0.14	0.16	0.14
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.11	0.00	0.03	0.05	0.01	0.03	0.12	0.05	0.02
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.11	0.00	0.08	0.01	0.07	0.06	0.12	0.12	0.03	0.01	0.11	0.00	0.05	0.17	0.10	0.07
C4	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.14	0.02	0.02	0.16	0.24	0.28	0.20
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.07	0.09	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.09	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.02	0.03	0.17	0.23	0.30	0.20
C5'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.08	0.05	0.09	0.08	0.05	0.03	0.09	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.02	0.02	0.15	0.17	0.24	0.16
N1	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02	0.00	0.09	0.12	0.17	0.13
N3	0.02	0.00	0.08	0.12	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.16	0.02	0.02	0.14	0.20	0.22	0.18
O2	0.05	0.00	0.11	0.12	0.00	0.09	0.01	0.08	0.02	0.02	0.00	0.00	0.08	0.15	0.01	0.05	0.08	0.10	0.11	0.11
O2'	0.01	0.05	0.00	0.03	0.03	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.02	0.05	0.01	0.12	0.03	0.01
O3'	0.02	0.13	0.03	0.01	0.14	0.01	0.11	0.03	0.08	0.07	0.16	0.15	0.05	0.00	0.16	0.01	0.09	0.27	0.19	0.15
O4	0.02	0.02	0.05	0.11	0.02	0.05	0.02	0.09	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.16	0.00	0.04	0.17	0.28	0.31	0.22
O4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.05	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.14	0.10
O5'	0.03	0.10	0.03	0.05	0.16	0.01	0.17	0.01	0.15	0.09	0.14	0.08	0.01	0.09	0.17	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.14	0.12	0.17	0.24	0.09	0.23	0.06	0.17	0.12	0.20	0.10	0.12	0.27	0.28	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.16	0.05	0.10	0.28	0.03	0.30	0.02	0.24	0.17	0.22	0.11	0.03	0.19	0.31	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.14	0.02	0.07	0.20	0.02	0.20	0.01	0.16	0.13	0.18	0.11	0.01	0.15	0.22	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.09	0.08	0.18	0.13	0.14	0.15	0.20	0.14	0.18	0.13	0.09	0.09	0.18	0.15	0.26	0.19	0.11	0.32	0.15	0.29	0.42	0.35
C2	0.10	0.14	0.10	0.16	0.16	0.15	0.17	0.25	0.14	0.18	0.13	0.13	0.17	0.18	0.16	0.28	0.18	0.13	0.37	0.14	0.34	0.50	0.42
C2'	0.04	0.09	0.05	0.11	0.13	0.09	0.16	0.15	0.16	0.17	0.14	0.08	0.08	0.19	0.12	0.29	0.12	0.06	0.29	0.17	0.23	0.41	0.30
C3'	0.05	0.10	0.09	0.05	0.09	0.05	0.15	0.09	0.17	0.14	0.14	0.12	0.06	0.18	0.07	0.33	0.06	0.04	0.23	0.19	0.18	0.36	0.24
C4	0.14	0.21	0.18	0.10	0.16	0.13	0.16	0.23	0.16	0.13	0.19	0.22	0.20	0.15	0.14	0.34	0.12	0.14	0.36	0.13	0.36	0.51	0.44
C4'	0.05	0.16	0.04	0.08	0.09	0.03	0.13	0.09	0.14	0.13	0.16	0.21	0.11	0.15	0.07	0.30	0.12	0.01	0.22	0.16	0.22	0.32	0.22
C5	0.14	0.16	0.18	0.10	0.16	0.13	0.17	0.23	0.14	0.16	0.13	0.17	0.18	0.18	0.15	0.34	0.11	0.14	0.36	0.13	0.35	0.48	0.42
C5'	0.14	0.21	0.14	0.01	0.14	0.04	0.16	0.03	0.18	0.14	0.19	0.26	0.19	0.17	0.10	0.34	0.07	0.09	0.15	0.18	0.21	0.26	0.16
C6	0.10	0.06	0.13	0.14	0.14	0.14	0.16	0.23	0.12	0.18	0.06	0.08	0.11	0.19	0.14	0.33	0.15	0.12	0.35	0.12	0.33	0.45	0.39
N1	0.09	0.07	0.09	0.16	0.15	0.15	0.16	0.23	0.14	0.18	0.10	0.03	0.12	0.19	0.16	0.29	0.18	0.12	0.36	0.14	0.33	0.47	0.39
N3	0.11	0.18	0.13	0.13	0.16	0.14	0.15	0.25	0.14	0.15	0.15	0.20	0.18	0.16	0.14	0.31	0.15	0.13	0.37	0.11	0.35	0.52	0.44
O2	0.12	0.16	0.09	0.18	0.18	0.16	0.18	0.25	0.16	0.19	0.15	0.15	0.18	0.19	0.18	0.25	0.20	0.13	0.37	0.16	0.33	0.50	0.42
O2'	0.09	0.11	0.07	0.15	0.15	0.11	0.17	0.16	0.15	0.19	0.13	0.09	0.12	0.19	0.16	0.18	0.16	0.10	0.29	0.15	0.26	0.41	0.31
O3'	0.08	0.10	0.11	0.05	0.09	0.08	0.15	0.06	0.17	0.13	0.15	0.11	0.07	0.18	0.06	0.34	0.05	0.08	0.18	0.20	0.14	0.33	0.17
O4	0.18	0.25	0.22	0.07	0.19	0.12	0.17	0.22	0.20	0.13	0.25	0.26	0.23	0.14	0.16	0.37	0.09	0.17	0.34	0.17	0.37	0.52	0.45
O4'	0.04	0.15	0.06	0.18	0.08	0.12	0.11	0.18	0.13	0.14	0.15	0.22	0.08	0.14	0.10	0.28	0.21	0.07	0.29	0.14	0.27	0.36	0.30
O5'	0.15	0.21	0.19	0.05	0.20	0.04	0.24	0.05	0.25	0.22	0.23	0.23	0.20	0.26	0.16	0.34	0.01	0.09	0.17	0.26	0.22	0.32	0.21
OP1	0.01	0.14	0.06	0.04	0.17	0.11	0.27	0.19	0.27	0.31	0.20	0.17	0.11	0.36	0.17	0.14	0.01	0.07	0.30	0.31	0.36	0.45	0.32
OP2	0.17	0.26	0.04	0.11	0.36	0.20	0.46	0.29	0.44	0.49	0.35	0.18	0.24	0.54	0.35	0.04	0.05	0.19	0.40	0.48	0.35	0.55	0.43
P	0.03	0.15	0.06	0.02	0.20	0.07	0.28	0.14	0.27	0.30	0.21	0.12	0.12	0.34	0.19	0.14	0.01	0.04	0.24	0.30	0.25	0.36	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.06	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.02	0.08	0.09	0.04
C2	0.05	0.00	0.09	0.07	0.00	0.02	0.02	0.12	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.32	0.07	0.03	0.24	0.01	0.25	0.28	0.28
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.09	0.09	0.08	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.07	0.09	0.06	0.02
C3'	0.03	0.07	0.01	0.00	0.12	0.00	0.14	0.00	0.12	0.17	0.09	0.05	0.06	0.17	0.12	0.04	0.01	0.00	0.05	0.13	0.12	0.01	0.00
C4	0.03	0.00	0.04	0.12	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.18	0.12	0.01	0.25	0.01	0.25	0.19	0.25
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.09	0.14	0.05	0.04	0.03	0.15	0.07	0.11	0.03	0.00	0.01	0.11	0.09	0.08	0.03
C5	0.01	0.02	0.04	0.14	0.00	0.10	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.16	0.17	0.02	0.34	0.01	0.35	0.30	0.37
C5'	0.03	0.12	0.01	0.00	0.16	0.00	0.24	0.00	0.24	0.26	0.18	0.08	0.08	0.29	0.15	0.10	0.04	0.00	0.00	0.28	0.10	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.09	0.00	0.24	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.22	0.16	0.02	0.36	0.00	0.39	0.39	0.42
C8	0.02	0.02	0.02	0.17	0.01	0.14	0.01	0.26	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.19	0.05	0.33	0.03	0.31	0.12	0.29
N1	0.04	0.00	0.09	0.09	0.00	0.05	0.01	0.18	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.29	0.12	0.01	0.30	0.00	0.33	0.36	0.36
N2	0.06	0.00	0.09	0.05	0.01	0.04	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.36	0.04	0.04	0.21	0.01	0.22	0.28	0.25
N3	0.06	0.00	0.08	0.06	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.29	0.06	0.04	0.19	0.01	0.20	0.18	0.20
N7	0.01	0.02	0.02	0.17	0.01	0.15	0.01	0.29	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.07	0.21	0.05	0.39	0.03	0.40	0.29	0.41
N9	0.01	0.01	0.01	0.12	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.12	0.00	0.22	0.01	0.20	0.07	0.17
O2'	0.00	0.32	0.00	0.04	0.18	0.11	0.16	0.10	0.22	0.02	0.29	0.36	0.29	0.07	0.07	0.00	0.02	0.11	0.07	0.21	0.18	0.01	0.06
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.12	0.03	0.17	0.04	0.16	0.19	0.12	0.04	0.06	0.21	0.12	0.02	0.00	0.02	0.06	0.18	0.18	0.10	0.04
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.04	0.05	0.00	0.11	0.02	0.00	0.06	0.04	0.03	0.20	0.08
O5'	0.06	0.24	0.03	0.05	0.25	0.01	0.34	0.00	0.36	0.33	0.30	0.21	0.19	0.39	0.22	0.07	0.06	0.06	0.00	0.40	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.11	0.01	0.28	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.21	0.18	0.04	0.40	0.00	0.45	0.46	0.49
OP1	0.08	0.25	0.09	0.12	0.25	0.09	0.35	0.10	0.39	0.31	0.33	0.22	0.20	0.40	0.20	0.18	0.18	0.03	0.01	0.45	0.00	0.00	0.00
OP2	0.09	0.28	0.06	0.01	0.19	0.08	0.30	0.03	0.39	0.12	0.36	0.28	0.18	0.29	0.07	0.01	0.10	0.20	0.01	0.46	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.28	0.02	0.00	0.25	0.03	0.37	0.01	0.42	0.29	0.36	0.25	0.20	0.41	0.17	0.06	0.04	0.08	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00