Doublet Group distance statistics: 49430

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N3	A	0, -0.001, 0.019, 0.039, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.008, 0.040, 0.073, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.040 std_dev=0.033
O4	A	0, -0.004, 0.056, 0.116, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.056 std_dev=0.060
O4'	A	0, 0.083, 0.310, 0.538, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.310 std_dev=0.227
P	A	0, 0.092, 0.323, 0.554, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.323 std_dev=0.231
C4	B	0, 0.107, 0.372, 0.636, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.372 std_dev=0.264
C2'	A	0, 0.090, 0.370, 0.649, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.370 std_dev=0.280
C5	B	0, 0.118, 0.404, 0.690, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.404 std_dev=0.286
O5'	A	0, 0.089, 0.395, 0.702, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.395 std_dev=0.307
C5'	A	0, 0.121, 0.445, 0.770, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.445 std_dev=0.325
C4'	A	0, 0.152, 0.521, 0.889, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.521 std_dev=0.369
N9	B	0, 0.054, 0.430, 0.806, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.430 std_dev=0.376
OP2	A	0, 0.121, 0.574, 1.026, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.574 std_dev=0.452
OP1	A	0, 0.107, 0.585, 1.062, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.585 std_dev=0.477
C6	B	0, 0.205, 0.699, 1.194, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.699 std_dev=0.495
N7	B	0, 0.027, 0.526, 1.025, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.526 std_dev=0.499
N3	B	0, 0.200, 0.712, 1.223, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.712 std_dev=0.512
C8	B	0, -0.086, 0.454, 0.995, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.454 std_dev=0.541
O3'	B	0, 0.022, 0.569, 1.117, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.569 std_dev=0.548
C3'	B	0, 0.031, 0.590, 1.149, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.590 std_dev=0.559
C2'	B	0, 0.049, 0.610, 1.171, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.610 std_dev=0.561
C3'	A	0, 0.218, 0.784, 1.349, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.784 std_dev=0.565
N1	B	0, 0.249, 0.849, 1.449, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.849 std_dev=0.600
C2	B	0, 0.252, 0.879, 1.506, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.879 std_dev=0.627
O2'	A	0, 0.253, 0.885, 1.517, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.885 std_dev=0.632
C1'	B	0, 0.110, 0.755, 1.401, 1.577 max_d=1.577 avg_d=0.755 std_dev=0.645
O6	B	0, 0.272, 0.969, 1.666, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.969 std_dev=0.697
O2'	B	0, 0.097, 0.890, 1.684, 1.927 max_d=1.927 avg_d=0.890 std_dev=0.793
O4'	B	0, 0.124, 1.020, 1.915, 2.180 max_d=2.180 avg_d=1.020 std_dev=0.895
C4'	B	0, 0.084, 1.001, 1.918, 2.215 max_d=2.215 avg_d=1.001 std_dev=0.917
N2	B	0, 0.339, 1.268, 2.196, 2.198 max_d=2.198 avg_d=1.268 std_dev=0.929
O3'	A	0, 0.402, 1.394, 2.387, 2.232 max_d=2.232 avg_d=1.394 std_dev=0.992
C5'	B	0, 0.143, 1.257, 2.370, 2.707 max_d=2.707 avg_d=1.257 std_dev=1.114
O5'	B	0, 0.095, 1.213, 2.330, 2.696 max_d=2.696 avg_d=1.213 std_dev=1.117
P	B	0, 0.355, 1.915, 3.475, 3.822 max_d=3.822 avg_d=1.915 std_dev=1.560
OP1	B	0, 0.519, 2.137, 3.755, 3.914 max_d=3.914 avg_d=2.137 std_dev=1.618
OP2	B	0, 0.330, 2.013, 3.697, 4.120 max_d=4.120 avg_d=2.013 std_dev=1.683

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.17	0.01	0.00	0.15	0.05	0.39	0.18
C2	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.17	0.01	0.04	0.22	0.05	0.41	0.15
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.02	0.07	0.12	0.08	0.04	0.05	0.10	0.01	0.05	0.04	0.02	0.25	0.30	0.26	0.18
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.17	0.00	0.21	0.02	0.20	0.09	0.10	0.02	0.05	0.01	0.17	0.02	0.10	0.25	0.18	0.07
C4	0.01	0.01	0.05	0.17	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.09	0.01	0.00	0.28	0.09	0.32	0.08
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.09	0.04	0.04	0.04	0.18	0.03	0.08	0.01	0.04	0.17	0.23	0.10
C5	0.01	0.01	0.07	0.21	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.02	0.00	0.02	0.21	0.14	0.01	0.04	0.27	0.08	0.31	0.07
C5'	0.05	0.10	0.12	0.02	0.15	0.00	0.15	0.00	0.13	0.10	0.13	0.08	0.09	0.13	0.17	0.03	0.01	0.24	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.20	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.14	0.01	0.05	0.25	0.05	0.37	0.11
N1	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.04	0.02	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.11	0.00	0.00	0.21	0.03	0.41	0.15
N3	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.13	0.01	0.03	0.26	0.06	0.37	0.11
O2	0.01	0.01	0.10	0.02	0.01	0.04	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.27	0.01	0.06	0.19	0.05	0.44	0.19
O2'	0.03	0.07	0.01	0.05	0.18	0.18	0.21	0.09	0.19	0.10	0.12	0.10	0.00	0.12	0.20	0.12	0.20	0.32	0.27	0.13
O3'	0.17	0.17	0.05	0.01	0.09	0.03	0.14	0.13	0.14	0.11	0.13	0.27	0.12	0.00	0.09	0.11	0.17	0.35	0.22	0.18
O4	0.01	0.01	0.04	0.17	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.09	0.00	0.01	0.29	0.10	0.27	0.05
O4'	0.00	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.03	0.05	0.00	0.03	0.06	0.12	0.11	0.01	0.00	0.06	0.06	0.46	0.26
O5'	0.15	0.22	0.25	0.10	0.28	0.04	0.27	0.01	0.25	0.21	0.26	0.19	0.20	0.17	0.29	0.06	0.00	0.04	0.03	0.01
OP1	0.05	0.05	0.30	0.25	0.09	0.17	0.08	0.24	0.05	0.03	0.06	0.05	0.32	0.35	0.10	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01
OP2	0.39	0.41	0.26	0.18	0.32	0.23	0.31	0.04	0.37	0.41	0.37	0.44	0.27	0.22	0.27	0.46	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.15	0.18	0.07	0.08	0.10	0.07	0.02	0.11	0.15	0.11	0.19	0.13	0.18	0.05	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.26	0.28	0.26	0.12	0.28	0.15	0.26	0.23	0.06	0.25	0.34	0.24	0.14	0.06	0.38	0.38	0.22	0.15	0.28	0.35	0.23	0.14
C2	0.19	0.30	0.26	0.20	0.10	0.18	0.15	0.13	0.24	0.12	0.23	0.44	0.30	0.22	0.05	0.33	0.29	0.15	0.08	0.32	0.20	0.34	0.12
C2'	0.08	0.27	0.14	0.12	0.12	0.15	0.17	0.16	0.20	0.19	0.22	0.40	0.24	0.24	0.05	0.26	0.26	0.09	0.18	0.25	0.42	0.47	0.29
C3'	0.08	0.28	0.10	0.12	0.08	0.17	0.12	0.17	0.18	0.21	0.24	0.41	0.22	0.21	0.07	0.18	0.24	0.11	0.09	0.20	0.21	0.32	0.05
C4	0.09	0.28	0.09	0.05	0.01	0.10	0.17	0.16	0.10	0.33	0.18	0.41	0.20	0.38	0.13	0.13	0.09	0.14	0.26	0.18	0.31	0.62	0.41
C4'	0.06	0.35	0.10	0.18	0.19	0.24	0.19	0.28	0.27	0.09	0.34	0.44	0.29	0.14	0.06	0.18	0.34	0.15	0.12	0.28	0.39	0.13	0.14
C5	0.09	0.23	0.06	0.06	0.04	0.12	0.14	0.18	0.11	0.32	0.17	0.34	0.17	0.34	0.14	0.09	0.07	0.16	0.29	0.15	0.34	0.62	0.42
C5'	0.14	0.36	0.15	0.03	0.25	0.08	0.26	0.16	0.30	0.21	0.35	0.42	0.32	0.23	0.19	0.09	0.17	0.03	0.01	0.30	0.38	0.18	0.12
C6	0.04	0.23	0.09	0.05	0.08	0.01	0.14	0.06	0.16	0.22	0.19	0.32	0.19	0.24	0.07	0.14	0.16	0.04	0.17	0.20	0.29	0.46	0.27
N1	0.14	0.26	0.22	0.18	0.10	0.16	0.15	0.14	0.22	0.13	0.22	0.35	0.24	0.20	0.02	0.28	0.29	0.11	0.09	0.27	0.26	0.33	0.15
N3	0.12	0.31	0.18	0.11	0.04	0.07	0.16	0.02	0.19	0.23	0.17	0.46	0.26	0.31	0.08	0.23	0.19	0.08	0.12	0.30	0.19	0.48	0.26
O2	0.29	0.33	0.35	0.28	0.16	0.30	0.15	0.25	0.27	0.04	0.27	0.49	0.36	0.16	0.13	0.44	0.37	0.26	0.17	0.37	0.24	0.23	0.07
O2'	0.21	0.33	0.25	0.17	0.15	0.23	0.21	0.20	0.29	0.15	0.28	0.48	0.32	0.26	0.06	0.44	0.28	0.20	0.20	0.38	0.49	0.53	0.34
O3'	0.02	0.50	0.06	0.13	0.26	0.19	0.29	0.21	0.41	0.20	0.50	0.63	0.38	0.27	0.12	0.17	0.28	0.09	0.09	0.44	0.23	0.31	0.03
O4	0.16	0.27	0.10	0.12	0.11	0.21	0.23	0.28	0.07	0.41	0.19	0.41	0.18	0.47	0.21	0.11	0.06	0.25	0.36	0.14	0.43	0.74	0.55
O4'	0.15	0.33	0.23	0.31	0.18	0.33	0.19	0.35	0.29	0.02	0.33	0.38	0.26	0.11	0.06	0.29	0.46	0.23	0.24	0.30	0.44	0.05	0.22
O5'	0.28	0.34	0.29	0.18	0.32	0.09	0.33	0.01	0.34	0.36	0.35	0.36	0.32	0.36	0.32	0.21	0.03	0.19	0.16	0.33	0.31	0.33	0.14
OP1	0.08	0.23	0.05	0.11	0.19	0.22	0.23	0.43	0.25	0.25	0.23	0.27	0.20	0.26	0.16	0.17	0.01	0.19	0.38	0.29	0.83	0.41	0.57
OP2	0.17	0.48	0.15	0.06	0.36	0.01	0.35	0.07	0.41	0.18	0.47	0.54	0.44	0.23	0.24	0.11	0.01	0.08	0.14	0.42	0.30	0.25	0.20
P	0.02	0.24	0.03	0.02	0.15	0.05	0.13	0.12	0.18	0.08	0.22	0.30	0.22	0.08	0.06	0.06	0.01	0.04	0.04	0.19	0.38	0.07	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.03	0.14	0.09	0.06
C2	0.02	0.00	0.16	0.15	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.21	0.05	0.12	0.02	0.05	0.20	0.11
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.10	0.01	0.07	0.03	0.10	0.05	0.13	0.21	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.10	0.18	0.13	0.02
C3'	0.03	0.15	0.01	0.00	0.09	0.01	0.06	0.03	0.08	0.09	0.11	0.19	0.14	0.07	0.04	0.05	0.00	0.01	0.00	0.08	0.19	0.13	0.03
C4	0.02	0.00	0.10	0.09	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.11	0.05	0.12	0.02	0.06	0.19	0.10
C4'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.07	0.02	0.07	0.04	0.06	0.03	0.07	0.04	0.01	0.03	0.02	0.16	0.08	0.04
C5	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.09	0.05	0.10	0.01	0.09	0.24	0.16
C5'	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.00	0.04	0.05	0.03	0.05	0.04	0.07	0.03	0.09	0.04	0.04	0.01	0.04	0.14	0.03	0.06
C6	0.02	0.02	0.10	0.08	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.12	0.06	0.09	0.01	0.11	0.27	0.18
C8	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.07	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.11	0.02	0.09	0.19	0.12
N1	0.01	0.01	0.13	0.11	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.12	0.17	0.07	0.10	0.01	0.07	0.25	0.16
N2	0.04	0.01	0.21	0.19	0.01	0.07	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.27	0.03	0.14	0.02	0.07	0.18	0.09
N3	0.02	0.00	0.16	0.14	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.19	0.04	0.13	0.02	0.07	0.17	0.08
N7	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.04	0.09	0.02	0.14	0.26	0.18
N9	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.04	0.13	0.03	0.08	0.15	0.08
O2'	0.01	0.15	0.01	0.05	0.08	0.07	0.06	0.09	0.09	0.03	0.12	0.20	0.14	0.00	0.01	0.00	0.05	0.05	0.09	0.09	0.24	0.07	0.09
O3'	0.02	0.21	0.02	0.00	0.11	0.04	0.09	0.04	0.12	0.09	0.17	0.27	0.19	0.07	0.04	0.05	0.00	0.02	0.08	0.13	0.22	0.14	0.04
O4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.06	0.03	0.07	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.02	0.00	0.13	0.04	0.12	0.08	0.07
O5'	0.13	0.12	0.05	0.00	0.12	0.03	0.10	0.01	0.09	0.11	0.10	0.14	0.13	0.09	0.13	0.09	0.08	0.13	0.00	0.08	0.02	0.05	0.01
O6	0.03	0.02	0.10	0.08	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.09	0.13	0.04	0.08	0.00	0.14	0.27	0.19
OP1	0.14	0.05	0.18	0.19	0.06	0.16	0.09	0.14	0.11	0.09	0.07	0.07	0.07	0.14	0.08	0.24	0.22	0.12	0.02	0.14	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.20	0.13	0.13	0.19	0.08	0.24	0.03	0.27	0.19	0.25	0.18	0.17	0.26	0.15	0.07	0.14	0.08	0.05	0.27	0.01	0.00	0.02
P	0.06	0.11	0.02	0.03	0.10	0.04	0.16	0.06	0.18	0.12	0.16	0.09	0.08	0.18	0.08	0.09	0.04	0.07	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00