Doublet Group distance statistics: 49437

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 8, 24, 21, 16, 13, 12, 6, 16, 4, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.009, 0.021, 0.032, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.021 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.019, 0.046, 0.074, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.046 std_dev=0.027
O4	A	0, 0.020, 0.080, 0.141, 0.367 max_d=0.367 avg_d=0.080 std_dev=0.060
C2'	A	0, 0.052, 0.140, 0.227, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.140 std_dev=0.087
O4'	A	0, 0.029, 0.117, 0.204, 0.447 max_d=0.447 avg_d=0.117 std_dev=0.088
O2'	A	0, 0.085, 0.196, 0.308, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.196 std_dev=0.112
C4'	A	0, 0.072, 0.214, 0.355, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.214 std_dev=0.141
C3'	A	0, 0.088, 0.237, 0.387, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.237 std_dev=0.150
C5'	A	0, 0.126, 0.354, 0.583, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.354 std_dev=0.228
O3'	A	0, 0.148, 0.384, 0.620, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.384 std_dev=0.236
C3'	B	0, 0.273, 0.534, 0.794, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.534 std_dev=0.261
C2'	B	0, 0.289, 0.558, 0.827, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.558 std_dev=0.269
C4	B	0, 0.327, 0.599, 0.872, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.599 std_dev=0.272
C5	B	0, 0.394, 0.671, 0.947, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.671 std_dev=0.276
N1	B	0, 0.281, 0.563, 0.845, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.563 std_dev=0.282
N4	B	0, 0.409, 0.691, 0.973, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.691 std_dev=0.282
C6	B	0, 0.344, 0.627, 0.909, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.627 std_dev=0.283
N3	B	0, 0.255, 0.552, 0.848, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.552 std_dev=0.296
O5'	A	0, 0.074, 0.371, 0.668, 3.049 max_d=3.049 avg_d=0.371 std_dev=0.297
C1'	B	0, 0.311, 0.609, 0.907, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.609 std_dev=0.298
C2	B	0, 0.263, 0.563, 0.864, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.563 std_dev=0.300
O3'	B	0, 0.218, 0.529, 0.840, 2.677 max_d=2.677 avg_d=0.529 std_dev=0.311
C4'	B	0, 0.305, 0.641, 0.976, 1.982 max_d=1.982 avg_d=0.641 std_dev=0.335
O2'	B	0, 0.309, 0.648, 0.988, 2.670 max_d=2.670 avg_d=0.648 std_dev=0.340
O2	B	0, 0.340, 0.680, 1.020, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.680 std_dev=0.340
P	A	0, 0.088, 0.428, 0.768, 3.446 max_d=3.446 avg_d=0.428 std_dev=0.340
O4'	B	0, 0.337, 0.680, 1.023, 1.633 max_d=1.633 avg_d=0.680 std_dev=0.343
OP2	A	0, 0.142, 0.501, 0.860, 3.464 max_d=3.464 avg_d=0.501 std_dev=0.359
C5'	B	0, 0.301, 0.692, 1.082, 2.603 max_d=2.603 avg_d=0.692 std_dev=0.390
O5'	B	0, 0.266, 0.745, 1.223, 4.063 max_d=4.063 avg_d=0.745 std_dev=0.479
OP1	A	0, 0.009, 0.498, 0.986, 4.967 max_d=4.967 avg_d=0.498 std_dev=0.488
P	B	0, 0.205, 0.860, 1.516, 6.522 max_d=6.522 avg_d=0.860 std_dev=0.656
OP2	B	0, 0.298, 1.023, 1.747, 7.679 max_d=7.679 avg_d=1.023 std_dev=0.724
OP1	B	0, 0.143, 0.960, 1.777, 8.378 max_d=8.378 avg_d=0.960 std_dev=0.817

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.08	0.09	0.15	0.08
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02	0.03	0.15	0.14	0.21	0.14
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.06	0.10	0.01	0.02	0.07	0.01	0.10	0.14	0.13	0.08
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.02	0.12	0.07	0.11	0.11	0.02	0.01	0.14	0.02	0.15	0.20	0.13	0.13
C4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01	0.03	0.25	0.24	0.31	0.24
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.05	0.06	0.02	0.08	0.01	0.02	0.09	0.11	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.09	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.16	0.01	0.04	0.26	0.25	0.30	0.24
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.10	0.06	0.06	0.05	0.14	0.02	0.01	0.10	0.13	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.01	0.04	0.22	0.19	0.22	0.18
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.07	0.02	0.02	0.15	0.13	0.19	0.13
N3	0.02	0.00	0.06	0.11	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.13	0.01	0.03	0.20	0.19	0.26	0.19
O2	0.04	0.01	0.10	0.11	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.11	0.12	0.02	0.05	0.12	0.11	0.19	0.12
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.05	0.06	0.05	0.06	0.04	0.03	0.07	0.11	0.00	0.06	0.07	0.05	0.07	0.14	0.11	0.06
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.15	0.02	0.16	0.05	0.13	0.07	0.13	0.12	0.06	0.00	0.18	0.02	0.17	0.28	0.19	0.19
O4	0.02	0.02	0.07	0.14	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.18	0.00	0.03	0.27	0.28	0.35	0.27
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.05	0.05	0.02	0.03	0.00	0.09	0.11	0.18	0.12
O5'	0.08	0.15	0.10	0.15	0.25	0.02	0.26	0.01	0.22	0.15	0.20	0.12	0.07	0.17	0.27	0.09	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.09	0.14	0.14	0.20	0.24	0.09	0.25	0.10	0.19	0.13	0.19	0.11	0.14	0.28	0.28	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.21	0.13	0.13	0.31	0.11	0.30	0.13	0.22	0.19	0.26	0.19	0.11	0.19	0.35	0.18	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.08	0.13	0.24	0.03	0.24	0.02	0.18	0.13	0.19	0.12	0.06	0.19	0.27	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.23	0.18	0.16	0.27	0.16	0.24	0.17	0.20	0.18	0.28	0.32	0.29	0.27	0.17	0.17	0.28	0.35	0.31	0.28
C2	0.18	0.18	0.18	0.15	0.26	0.15	0.26	0.18	0.20	0.17	0.22	0.33	0.26	0.28	0.15	0.17	0.34	0.38	0.42	0.35
C2'	0.16	0.22	0.14	0.12	0.25	0.12	0.22	0.14	0.18	0.16	0.26	0.30	0.29	0.25	0.12	0.13	0.29	0.37	0.36	0.30
C3'	0.15	0.21	0.15	0.13	0.22	0.12	0.21	0.16	0.18	0.15	0.24	0.26	0.28	0.23	0.12	0.12	0.32	0.38	0.38	0.33
C4	0.20	0.20	0.21	0.20	0.17	0.19	0.24	0.24	0.21	0.19	0.17	0.21	0.28	0.30	0.19	0.19	0.43	0.44	0.56	0.46
C4'	0.16	0.25	0.16	0.12	0.24	0.12	0.20	0.13	0.17	0.17	0.27	0.27	0.32	0.21	0.11	0.14	0.24	0.32	0.26	0.23
C5	0.20	0.18	0.22	0.21	0.15	0.20	0.20	0.24	0.20	0.17	0.15	0.19	0.25	0.31	0.20	0.19	0.43	0.43	0.52	0.44
C5'	0.21	0.26	0.22	0.15	0.23	0.16	0.20	0.15	0.19	0.21	0.26	0.24	0.33	0.27	0.13	0.18	0.25	0.31	0.25	0.23
C6	0.18	0.17	0.19	0.18	0.19	0.17	0.21	0.20	0.18	0.15	0.18	0.23	0.25	0.30	0.16	0.16	0.36	0.38	0.43	0.36
N1	0.17	0.19	0.17	0.15	0.25	0.15	0.23	0.17	0.19	0.16	0.23	0.30	0.26	0.28	0.15	0.16	0.32	0.36	0.38	0.32
N3	0.19	0.19	0.19	0.17	0.23	0.16	0.25	0.20	0.21	0.17	0.17	0.30	0.27	0.29	0.16	0.17	0.38	0.41	0.50	0.40
O2	0.19	0.20	0.18	0.15	0.30	0.15	0.27	0.17	0.21	0.18	0.25	0.38	0.26	0.28	0.16	0.18	0.32	0.38	0.39	0.33
O2'	0.20	0.26	0.19	0.15	0.28	0.16	0.24	0.15	0.19	0.19	0.30	0.34	0.33	0.27	0.14	0.18	0.27	0.35	0.31	0.26
O3'	0.15	0.21	0.16	0.15	0.22	0.15	0.21	0.19	0.19	0.16	0.24	0.26	0.29	0.22	0.15	0.14	0.34	0.42	0.42	0.36
O4	0.23	0.25	0.23	0.22	0.20	0.23	0.25	0.28	0.24	0.22	0.24	0.21	0.30	0.30	0.21	0.22	0.47	0.49	0.65	0.52
O4'	0.17	0.25	0.17	0.16	0.27	0.16	0.23	0.17	0.19	0.19	0.29	0.30	0.31	0.24	0.19	0.16	0.26	0.34	0.27	0.25
O5'	0.13	0.21	0.16	0.08	0.23	0.07	0.23	0.11	0.20	0.16	0.23	0.26	0.26	0.20	0.02	0.09	0.31	0.37	0.30	0.30
OP1	0.07	0.13	0.07	0.04	0.16	0.08	0.18	0.13	0.15	0.08	0.15	0.19	0.20	0.12	0.03	0.07	0.22	0.39	0.29	0.27
OP2	0.09	0.19	0.10	0.06	0.26	0.12	0.27	0.21	0.23	0.15	0.23	0.29	0.20	0.18	0.03	0.10	0.40	0.51	0.42	0.43
P	0.06	0.14	0.07	0.02	0.17	0.05	0.19	0.12	0.16	0.09	0.16	0.20	0.19	0.12	0.01	0.04	0.28	0.38	0.28	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.06	0.01	0.10	0.19	0.12	0.10
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.04	0.21	0.26	0.24	0.20
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.06	0.02	0.07	0.05	0.13	0.00	0.02	0.01	0.13	0.19	0.10	0.12
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.11	0.01	0.12	0.03	0.12	0.07	0.10	0.12	0.12	0.02	0.01	0.01	0.19	0.22	0.10	0.15
C4	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.04	0.31	0.31	0.43	0.33
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.04	0.07	0.06	0.08	0.02	0.01	0.02	0.15	0.14	0.06
C5	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.09	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.12	0.05	0.34	0.32	0.46	0.36
C5'	0.02	0.06	0.03	0.03	0.11	0.01	0.13	0.00	0.11	0.06	0.08	0.12	0.06	0.06	0.06	0.02	0.01	0.10	0.18	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.11	0.05	0.30	0.25	0.34	0.29
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.05	0.02	0.21	0.21	0.22	0.19
N3	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.04	0.26	0.28	0.33	0.27
N4	0.03	0.01	0.05	0.12	0.01	0.07	0.02	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.09	0.11	0.05	0.34	0.35	0.49	0.38
O2	0.04	0.01	0.13	0.12	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.12	0.16	0.06	0.16	0.29	0.19	0.18
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.08	0.08	0.09	0.06	0.08	0.05	0.08	0.09	0.12	0.00	0.05	0.06	0.08	0.16	0.09	0.06
O3'	0.06	0.10	0.02	0.01	0.09	0.02	0.12	0.06	0.11	0.05	0.09	0.11	0.16	0.05	0.00	0.04	0.19	0.27	0.16	0.17
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.05	0.06	0.06	0.04	0.00	0.09	0.20	0.17	0.12
O5'	0.10	0.21	0.13	0.19	0.31	0.02	0.34	0.01	0.30	0.21	0.26	0.34	0.16	0.08	0.19	0.09	0.00	0.02	0.04	0.01
OP1	0.19	0.26	0.19	0.22	0.31	0.15	0.32	0.10	0.25	0.21	0.28	0.35	0.29	0.16	0.27	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.24	0.10	0.10	0.43	0.14	0.46	0.18	0.34	0.22	0.33	0.49	0.19	0.09	0.16	0.17	0.04	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.20	0.12	0.15	0.33	0.06	0.36	0.02	0.29	0.19	0.27	0.38	0.18	0.06	0.17	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00