Doublet Group distance statistics: 49438

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 5, 12, 19, 18, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.011, 0.021, 0.032, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.028 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.022, 0.044, 0.067, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.044 std_dev=0.022
O4	A	0, 0.001, 0.056, 0.111, 0.311 max_d=0.311 avg_d=0.056 std_dev=0.055
O4'	A	0, 0.073, 0.160, 0.247, 0.446 max_d=0.446 avg_d=0.160 std_dev=0.087
C2'	A	0, 0.108, 0.202, 0.297, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.202 std_dev=0.095
N1	B	0, 0.261, 0.391, 0.520, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.391 std_dev=0.129
C4'	A	0, 0.156, 0.292, 0.427, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.292 std_dev=0.135
C3'	A	0, 0.321, 0.462, 0.604, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.462 std_dev=0.141
C2	B	0, 0.258, 0.409, 0.560, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.409 std_dev=0.151
O2'	A	0, 0.465, 0.618, 0.772, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.618 std_dev=0.154
C2'	B	0, 0.245, 0.399, 0.553, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.399 std_dev=0.154
C1'	B	0, 0.276, 0.433, 0.590, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.433 std_dev=0.157
C6	B	0, 0.280, 0.443, 0.605, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.443 std_dev=0.163
N3	B	0, 0.277, 0.443, 0.609, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.443 std_dev=0.166
C4	B	0, 0.293, 0.467, 0.641, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.467 std_dev=0.174
C5	B	0, 0.299, 0.480, 0.662, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.480 std_dev=0.181
C3'	B	0, 0.347, 0.532, 0.717, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.532 std_dev=0.185
O2'	B	0, 0.295, 0.495, 0.695, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.495 std_dev=0.200
O2	B	0, 0.267, 0.471, 0.676, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.471 std_dev=0.204
P	A	0, 0.402, 0.626, 0.850, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.626 std_dev=0.224
C5'	A	0, 0.282, 0.508, 0.734, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.508 std_dev=0.226
O5'	A	0, 0.381, 0.608, 0.836, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.608 std_dev=0.228
OP1	A	0, 0.493, 0.720, 0.948, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.720 std_dev=0.228
O3'	B	0, 0.405, 0.633, 0.861, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.633 std_dev=0.228
N4	B	0, 0.324, 0.553, 0.783, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.553 std_dev=0.229
O3'	A	0, 0.762, 0.992, 1.221, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.992 std_dev=0.229
OP2	A	0, 0.441, 0.674, 0.907, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.674 std_dev=0.233
O4'	B	0, 0.371, 0.611, 0.851, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.611 std_dev=0.240
C4'	B	0, 0.404, 0.663, 0.921, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.663 std_dev=0.259
O5'	B	0, 0.443, 0.784, 1.126, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.784 std_dev=0.341
C5'	B	0, 0.484, 0.843, 1.202, 2.036 max_d=2.036 avg_d=0.843 std_dev=0.359
P	B	0, 0.521, 0.953, 1.386, 2.343 max_d=2.343 avg_d=0.953 std_dev=0.432
OP2	B	0, 0.391, 0.925, 1.460, 2.737 max_d=2.737 avg_d=0.925 std_dev=0.535
OP1	B	0, 0.708, 1.336, 1.964, 3.562 max_d=3.562 avg_d=1.336 std_dev=0.628

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.08	0.09	0.20	0.12
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02	0.03	0.15	0.16	0.27	0.18
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.05	0.03	0.06	0.11	0.01	0.02	0.06	0.01	0.10	0.13	0.15	0.10
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.02	0.10	0.06	0.09	0.11	0.02	0.01	0.11	0.01	0.13	0.18	0.12	0.12
C4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.03	0.21	0.23	0.31	0.23
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.05	0.06	0.06	0.02	0.08	0.00	0.02	0.10	0.11	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.01	0.04	0.22	0.22	0.29	0.22
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.10	0.07	0.06	0.03	0.14	0.02	0.01	0.11	0.10	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.02	0.04	0.19	0.17	0.25	0.18
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.02	0.14	0.14	0.24	0.16
N3	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.01	0.03	0.18	0.20	0.30	0.21
O2	0.04	0.01	0.11	0.11	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.14	0.02	0.04	0.14	0.15	0.26	0.17
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.05	0.06	0.04	0.06	0.04	0.03	0.07	0.12	0.00	0.05	0.06	0.05	0.07	0.14	0.14	0.08
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.12	0.02	0.13	0.03	0.11	0.06	0.11	0.14	0.05	0.00	0.14	0.02	0.16	0.25	0.16	0.16
O4	0.02	0.02	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.14	0.00	0.04	0.22	0.25	0.32	0.25
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.02	0.04	0.00	0.08	0.09	0.21	0.13
O5'	0.08	0.15	0.10	0.13	0.21	0.02	0.22	0.01	0.19	0.14	0.18	0.14	0.07	0.16	0.22	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.16	0.13	0.18	0.23	0.10	0.22	0.11	0.17	0.14	0.20	0.15	0.14	0.25	0.25	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.27	0.15	0.12	0.31	0.11	0.29	0.10	0.25	0.24	0.30	0.26	0.14	0.16	0.32	0.21	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.18	0.10	0.12	0.23	0.04	0.22	0.01	0.18	0.16	0.21	0.17	0.08	0.16	0.25	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.24	0.17	0.20	0.25	0.18	0.22	0.20	0.18	0.18	0.27	0.29	0.31	0.23	0.22	0.17	0.24	0.33	0.32	0.26
C2	0.15	0.21	0.15	0.19	0.27	0.17	0.26	0.22	0.20	0.16	0.25	0.32	0.27	0.20	0.21	0.16	0.28	0.37	0.42	0.32
C2'	0.15	0.23	0.14	0.16	0.24	0.14	0.20	0.17	0.16	0.15	0.26	0.28	0.30	0.22	0.18	0.14	0.23	0.37	0.33	0.27
C3'	0.14	0.20	0.14	0.14	0.20	0.13	0.18	0.16	0.15	0.14	0.22	0.23	0.28	0.21	0.17	0.12	0.22	0.40	0.35	0.28
C4	0.16	0.18	0.17	0.20	0.17	0.21	0.23	0.28	0.20	0.16	0.18	0.21	0.25	0.19	0.21	0.19	0.35	0.43	0.51	0.39
C4'	0.16	0.23	0.15	0.13	0.20	0.13	0.17	0.14	0.15	0.16	0.23	0.22	0.30	0.23	0.17	0.14	0.19	0.34	0.28	0.22
C5	0.17	0.17	0.18	0.21	0.14	0.22	0.19	0.28	0.18	0.15	0.15	0.17	0.23	0.20	0.22	0.19	0.33	0.40	0.45	0.36
C5'	0.21	0.23	0.21	0.14	0.19	0.15	0.18	0.14	0.18	0.19	0.22	0.20	0.30	0.27	0.15	0.17	0.17	0.36	0.29	0.21
C6	0.15	0.17	0.17	0.20	0.18	0.19	0.19	0.24	0.17	0.14	0.17	0.20	0.23	0.20	0.21	0.17	0.29	0.36	0.37	0.31
N1	0.15	0.21	0.16	0.19	0.24	0.17	0.22	0.21	0.18	0.16	0.24	0.27	0.27	0.20	0.21	0.16	0.27	0.35	0.37	0.29
N3	0.15	0.18	0.15	0.19	0.24	0.18	0.26	0.25	0.21	0.16	0.21	0.30	0.25	0.19	0.21	0.16	0.32	0.40	0.48	0.36
O2	0.17	0.23	0.15	0.19	0.30	0.17	0.28	0.21	0.21	0.18	0.28	0.37	0.28	0.21	0.21	0.16	0.27	0.36	0.42	0.31
O2'	0.19	0.26	0.17	0.17	0.27	0.17	0.22	0.17	0.17	0.18	0.29	0.31	0.34	0.25	0.19	0.18	0.21	0.34	0.31	0.24
O3'	0.15	0.21	0.15	0.15	0.19	0.14	0.19	0.17	0.16	0.14	0.22	0.23	0.29	0.23	0.17	0.13	0.23	0.44	0.39	0.31
O4	0.18	0.21	0.18	0.22	0.19	0.24	0.24	0.32	0.22	0.18	0.22	0.21	0.27	0.20	0.22	0.22	0.39	0.48	0.58	0.44
O4'	0.16	0.24	0.16	0.20	0.23	0.18	0.20	0.20	0.17	0.17	0.26	0.25	0.31	0.22	0.24	0.16	0.23	0.32	0.28	0.24
O5'	0.19	0.21	0.21	0.09	0.20	0.07	0.21	0.06	0.21	0.19	0.20	0.21	0.25	0.26	0.01	0.13	0.14	0.36	0.30	0.21
OP1	0.05	0.10	0.08	0.04	0.14	0.11	0.18	0.22	0.15	0.07	0.12	0.17	0.16	0.14	0.02	0.08	0.30	0.53	0.46	0.35
OP2	0.10	0.19	0.11	0.07	0.23	0.12	0.24	0.20	0.21	0.15	0.22	0.25	0.21	0.11	0.02	0.11	0.24	0.45	0.39	0.30
P	0.05	0.10	0.09	0.02	0.13	0.05	0.16	0.13	0.14	0.07	0.12	0.16	0.16	0.13	0.01	0.03	0.20	0.41	0.36	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.00	0.07	0.10	0.13	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.09	0.03	0.13	0.16	0.26	0.13
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.06	0.03	0.07	0.06	0.12	0.01	0.02	0.01	0.05	0.15	0.12	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.09	0.04	0.08	0.09	0.11	0.02	0.01	0.01	0.08	0.21	0.18	0.10
C4	0.03	0.01	0.06	0.08	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.05	0.17	0.26	0.39	0.19
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.05	0.08	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.12	0.12	0.03
C5	0.03	0.01	0.06	0.09	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.11	0.06	0.18	0.26	0.38	0.19
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.11	0.06	0.08	0.12	0.05	0.05	0.02	0.02	0.01	0.12	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.06	0.15	0.20	0.28	0.15
N1	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.12	0.14	0.22	0.12
N3	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.04	0.15	0.21	0.33	0.16
N4	0.03	0.02	0.06	0.09	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.11	0.05	0.19	0.30	0.44	0.21
O2	0.04	0.01	0.12	0.11	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.12	0.14	0.04	0.11	0.15	0.22	0.11
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.07	0.06	0.12	0.00	0.05	0.05	0.05	0.17	0.14	0.05
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.09	0.02	0.11	0.02	0.11	0.05	0.10	0.11	0.14	0.05	0.00	0.02	0.13	0.32	0.31	0.18
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.02	0.06	0.03	0.04	0.05	0.04	0.05	0.02	0.00	0.10	0.13	0.13	0.13
O5'	0.07	0.13	0.05	0.08	0.17	0.01	0.18	0.01	0.15	0.12	0.15	0.19	0.11	0.05	0.13	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.16	0.15	0.21	0.26	0.12	0.26	0.12	0.20	0.14	0.21	0.30	0.15	0.17	0.32	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.26	0.12	0.18	0.39	0.12	0.38	0.15	0.28	0.22	0.33	0.44	0.22	0.14	0.31	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.13	0.06	0.10	0.19	0.03	0.19	0.02	0.15	0.12	0.16	0.21	0.11	0.05	0.18	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00