Doublet Group distance statistics: 49444

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 2, 1, 5, 0, 1, 0, 0, 0, 5, 6, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.010, 0.014, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.014 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.012, 0.018, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.013, 0.023, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.025, 0.039, 0.052, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.039 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.014, 0.028, 0.041, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.016, 0.030, 0.044, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.030 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.018, 0.032, 0.046, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.032 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.050, 0.078, 0.107, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.078 std_dev=0.029
O4	A	0, 0.038, 0.105, 0.172, 0.271 max_d=0.271 avg_d=0.105 std_dev=0.067
O4'	A	0, 0.081, 0.166, 0.251, 0.292 max_d=0.292 avg_d=0.166 std_dev=0.085
C4'	A	0, 0.212, 0.301, 0.391, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.301 std_dev=0.090
C2'	A	0, 0.111, 0.242, 0.373, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.242 std_dev=0.131
C3'	A	0, 0.281, 0.426, 0.571, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.426 std_dev=0.145
C5'	A	0, 0.384, 0.559, 0.734, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.559 std_dev=0.175
O2'	A	0, 0.250, 0.446, 0.642, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.446 std_dev=0.196
C6	B	0, 0.288, 0.487, 0.686, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.487 std_dev=0.199
N1	B	0, 0.328, 0.557, 0.786, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.557 std_dev=0.229
O3'	A	0, 0.372, 0.605, 0.837, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.605 std_dev=0.232
O5'	A	0, 0.399, 0.652, 0.904, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.652 std_dev=0.252
C2'	B	0, 0.380, 0.670, 0.960, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.670 std_dev=0.290
P	A	0, 0.516, 0.890, 1.263, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.890 std_dev=0.373
O3'	B	0, 0.458, 0.863, 1.268, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.863 std_dev=0.405
C5	B	0, 0.437, 0.853, 1.269, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.853 std_dev=0.416
C1'	B	0, 0.469, 0.886, 1.303, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.886 std_dev=0.417
OP1	A	0, 0.583, 1.006, 1.428, 1.851 max_d=1.851 avg_d=1.006 std_dev=0.423
C3'	B	0, 0.382, 0.809, 1.236, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.809 std_dev=0.427
OP2	A	0, 0.548, 1.003, 1.457, 1.761 max_d=1.761 avg_d=1.003 std_dev=0.454
O2'	B	0, 0.479, 0.935, 1.391, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.935 std_dev=0.456
C2	B	0, 0.509, 1.015, 1.522, 1.627 max_d=1.627 avg_d=1.015 std_dev=0.506
C4	B	0, 0.508, 1.122, 1.736, 1.987 max_d=1.987 avg_d=1.122 std_dev=0.614
N3	B	0, 0.519, 1.199, 1.879, 2.065 max_d=2.065 avg_d=1.199 std_dev=0.680
O4'	B	0, 0.511, 1.192, 1.873, 2.195 max_d=2.195 avg_d=1.192 std_dev=0.681
O2	B	0, 0.672, 1.463, 2.253, 2.417 max_d=2.417 avg_d=1.463 std_dev=0.790
C4'	B	0, 0.458, 1.263, 2.068, 2.400 max_d=2.400 avg_d=1.263 std_dev=0.805
N4	B	0, 0.653, 1.606, 2.559, 2.878 max_d=2.878 avg_d=1.606 std_dev=0.953
O5'	B	0, 0.630, 1.745, 2.861, 3.197 max_d=3.197 avg_d=1.745 std_dev=1.116
C5'	B	0, 0.580, 1.768, 2.956, 3.286 max_d=3.286 avg_d=1.768 std_dev=1.188
P	B	0, 1.211, 2.620, 4.029, 4.240 max_d=4.240 avg_d=2.620 std_dev=1.409
OP2	B	0, 1.215, 2.662, 4.108, 4.181 max_d=4.181 avg_d=2.662 std_dev=1.447
OP1	B	0, 1.702, 3.379, 5.057, 5.303 max_d=5.303 avg_d=3.379 std_dev=1.677

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.08	0.14	0.11
C2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.01	0.02	0.15	0.17	0.26	0.20
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.08	0.02	0.04	0.12	0.00	0.02	0.07	0.01	0.05	0.07	0.09	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.02	0.08	0.03	0.05	0.11	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.10	0.09	0.07
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.06	0.00	0.02	0.20	0.27	0.36	0.29
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.00	0.04	0.19	0.27	0.34	0.30
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.12	0.00	0.13	0.00	0.11	0.07	0.09	0.05	0.05	0.03	0.12	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.17	0.21	0.26	0.24
N1	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.14	0.15	0.22	0.18
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.01	0.01	0.18	0.23	0.32	0.25
O2	0.02	0.00	0.12	0.11	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.13	0.01	0.05	0.14	0.14	0.24	0.17
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.07	0.05	0.07	0.05	0.06	0.03	0.07	0.11	0.00	0.04	0.09	0.04	0.06	0.08	0.08	0.06
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.06	0.01	0.10	0.03	0.10	0.03	0.05	0.13	0.04	0.00	0.07	0.01	0.11	0.19	0.15	0.14
O4	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.00	0.03	0.20	0.30	0.38	0.32
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.03	0.00	0.07	0.09	0.11	0.10
O5'	0.08	0.15	0.05	0.07	0.20	0.01	0.19	0.01	0.17	0.14	0.18	0.14	0.06	0.11	0.20	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.08	0.17	0.07	0.10	0.27	0.04	0.27	0.05	0.21	0.15	0.23	0.14	0.08	0.19	0.30	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.26	0.09	0.09	0.36	0.03	0.34	0.01	0.26	0.22	0.32	0.24	0.08	0.15	0.38	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.20	0.06	0.07	0.29	0.01	0.30	0.01	0.24	0.18	0.25	0.17	0.06	0.14	0.32	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.19	0.19	0.19	0.30	0.18	0.38	0.29	0.30	0.14	0.21	0.36	0.38	0.37	0.15	0.18	0.40	0.43	0.56	0.46
C2	0.16	0.32	0.18	0.24	0.20	0.27	0.43	0.46	0.35	0.12	0.32	0.29	0.57	0.32	0.21	0.23	0.60	0.71	0.87	0.74
C2'	0.15	0.18	0.17	0.13	0.27	0.12	0.35	0.25	0.26	0.11	0.20	0.35	0.36	0.37	0.08	0.13	0.37	0.39	0.55	0.43
C3'	0.13	0.20	0.16	0.10	0.23	0.08	0.28	0.19	0.21	0.11	0.22	0.29	0.34	0.35	0.06	0.09	0.30	0.29	0.42	0.32
C4	0.20	0.34	0.17	0.38	0.36	0.51	0.31	0.75	0.36	0.13	0.51	0.57	0.46	0.17	0.34	0.47	0.86	1.01	1.12	1.02
C4'	0.15	0.22	0.16	0.08	0.24	0.08	0.24	0.10	0.18	0.12	0.24	0.29	0.32	0.37	0.06	0.11	0.20	0.22	0.29	0.21
C5	0.25	0.27	0.21	0.43	0.36	0.56	0.27	0.76	0.32	0.15	0.43	0.51	0.36	0.18	0.37	0.51	0.84	0.89	0.93	0.91
C5'	0.18	0.24	0.19	0.10	0.23	0.10	0.23	0.08	0.20	0.18	0.25	0.25	0.32	0.32	0.06	0.13	0.16	0.20	0.19	0.13
C6	0.21	0.24	0.19	0.36	0.24	0.42	0.28	0.58	0.31	0.15	0.31	0.32	0.35	0.19	0.31	0.39	0.65	0.66	0.71	0.68
N1	0.16	0.24	0.18	0.26	0.21	0.28	0.36	0.43	0.32	0.13	0.25	0.27	0.44	0.28	0.21	0.25	0.55	0.60	0.71	0.62
N3	0.16	0.37	0.16	0.30	0.23	0.38	0.40	0.60	0.37	0.13	0.47	0.36	0.57	0.24	0.26	0.33	0.74	0.89	1.04	0.91
O2	0.21	0.32	0.22	0.19	0.26	0.20	0.47	0.37	0.34	0.13	0.25	0.39	0.63	0.40	0.16	0.17	0.53	0.66	0.85	0.69
O2'	0.18	0.21	0.18	0.14	0.39	0.14	0.42	0.21	0.31	0.17	0.29	0.49	0.34	0.40	0.10	0.16	0.34	0.35	0.53	0.40
O3'	0.15	0.20	0.17	0.11	0.24	0.10	0.28	0.17	0.22	0.12	0.22	0.30	0.33	0.36	0.11	0.11	0.28	0.25	0.39	0.29
O4	0.25	0.33	0.20	0.42	0.42	0.60	0.28	0.86	0.37	0.15	0.55	0.71	0.44	0.18	0.37	0.55	0.97	1.19	1.31	1.19
O4'	0.15	0.21	0.18	0.14	0.25	0.13	0.27	0.19	0.20	0.11	0.24	0.30	0.33	0.37	0.14	0.13	0.27	0.30	0.37	0.29
O5'	0.11	0.20	0.15	0.04	0.23	0.04	0.25	0.13	0.21	0.14	0.22	0.26	0.26	0.24	0.01	0.06	0.17	0.21	0.20	0.15
OP1	0.04	0.11	0.06	0.02	0.23	0.05	0.29	0.08	0.24	0.10	0.16	0.27	0.19	0.09	0.02	0.04	0.12	0.34	0.24	0.21
OP2	0.10	0.26	0.12	0.05	0.44	0.12	0.46	0.23	0.37	0.24	0.36	0.50	0.21	0.10	0.02	0.08	0.18	0.23	0.21	0.17
P	0.05	0.15	0.08	0.02	0.26	0.05	0.31	0.11	0.26	0.14	0.20	0.30	0.16	0.10	0.01	0.03	0.13	0.25	0.18	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.05	0.07	0.09	0.06
C2	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.06	0.02	0.11	0.13	0.15	0.11
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.09	0.03	0.05	0.06	0.12	0.00	0.02	0.01	0.04	0.14	0.08	0.06
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.13	0.00	0.18	0.01	0.17	0.07	0.08	0.14	0.09	0.01	0.01	0.02	0.06	0.17	0.09	0.09
C4	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.16	0.02	0.22	0.24	0.27	0.22
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.12	0.05	0.05	0.10	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.08	0.18	0.00	0.12	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.21	0.02	0.26	0.27	0.29	0.25
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.16	0.01	0.19	0.00	0.17	0.08	0.10	0.18	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.17	0.00	0.12	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.19	0.02	0.22	0.21	0.20	0.18
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.12	0.13	0.13	0.10
N3	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.02	0.16	0.18	0.21	0.16
N4	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.10	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.18	0.03	0.24	0.29	0.32	0.27
O2	0.02	0.00	0.12	0.09	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.12	0.03	0.06	0.10	0.12	0.07
O2'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.08	0.05	0.16	0.00	0.04	0.03	0.04	0.14	0.07	0.05
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.16	0.02	0.21	0.04	0.19	0.08	0.09	0.18	0.12	0.04	0.00	0.02	0.10	0.26	0.16	0.15
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.07	0.07	0.13	0.11
O5'	0.05	0.11	0.04	0.06	0.22	0.02	0.26	0.01	0.22	0.12	0.16	0.24	0.06	0.04	0.10	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.07	0.13	0.14	0.17	0.24	0.07	0.27	0.05	0.21	0.13	0.18	0.29	0.10	0.14	0.26	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.15	0.08	0.09	0.27	0.03	0.29	0.01	0.20	0.13	0.21	0.32	0.12	0.07	0.16	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.11	0.06	0.09	0.22	0.02	0.25	0.01	0.18	0.10	0.16	0.27	0.07	0.05	0.15	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00