Doublet Group distance statistics: 49446

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 3, 2, 4, 2, 2, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.021 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.015, 0.045, 0.076, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.045 std_dev=0.031
O4	A	0, 0.002, 0.078, 0.154, 0.295 max_d=0.295 avg_d=0.078 std_dev=0.076
O4'	A	0, 0.009, 0.089, 0.169, 0.302 max_d=0.302 avg_d=0.089 std_dev=0.080
C2'	A	0, 0.043, 0.132, 0.220, 0.303 max_d=0.303 avg_d=0.132 std_dev=0.089
C4'	A	0, 0.077, 0.193, 0.309, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.193 std_dev=0.116
O2'	A	0, 0.101, 0.228, 0.355, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.228 std_dev=0.127
C3'	A	0, 0.103, 0.242, 0.381, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.242 std_dev=0.139
C2	B	0, 0.187, 0.331, 0.475, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.331 std_dev=0.144
O5'	A	0, 0.158, 0.327, 0.495, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.327 std_dev=0.169
C2'	B	0, 0.267, 0.441, 0.614, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.441 std_dev=0.173
C5'	A	0, 0.132, 0.316, 0.501, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.316 std_dev=0.184
N1	B	0, 0.175, 0.363, 0.551, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.363 std_dev=0.188
N3	B	0, 0.265, 0.466, 0.667, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.466 std_dev=0.201
O2	B	0, 0.245, 0.452, 0.659, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.452 std_dev=0.207
C1'	B	0, 0.296, 0.534, 0.773, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.534 std_dev=0.238
P	A	0, 0.188, 0.428, 0.667, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.428 std_dev=0.240
O3'	A	0, 0.202, 0.442, 0.682, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.442 std_dev=0.240
C3'	B	0, 0.232, 0.480, 0.727, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.480 std_dev=0.248
O3'	B	0, 0.259, 0.516, 0.773, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.516 std_dev=0.257
OP1	A	0, 0.232, 0.513, 0.794, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.513 std_dev=0.281
OP2	A	0, 0.187, 0.476, 0.766, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.476 std_dev=0.290
O2'	B	0, 0.422, 0.728, 1.033, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.728 std_dev=0.306
C6	B	0, 0.202, 0.515, 0.827, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.515 std_dev=0.312
C4	B	0, 0.251, 0.568, 0.885, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.568 std_dev=0.317
C5	B	0, 0.232, 0.602, 0.972, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.602 std_dev=0.370
O4'	B	0, 0.415, 0.795, 1.175, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.795 std_dev=0.380
C4'	B	0, 0.421, 0.830, 1.240, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.830 std_dev=0.409
N4	B	0, 0.389, 0.805, 1.222, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.805 std_dev=0.417
O5'	B	0, 0.749, 1.214, 1.678, 2.164 max_d=2.164 avg_d=1.214 std_dev=0.464
OP2	B	0, 0.340, 0.866, 1.391, 2.601 max_d=2.601 avg_d=0.866 std_dev=0.525
P	B	0, 0.629, 1.174, 1.719, 2.552 max_d=2.552 avg_d=1.174 std_dev=0.545
C5'	B	0, 0.593, 1.166, 1.740, 2.229 max_d=2.229 avg_d=1.166 std_dev=0.573
OP1	B	0, 0.485, 1.406, 2.327, 4.851 max_d=4.851 avg_d=1.406 std_dev=0.921

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.07	0.11	0.07
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.01	0.02	0.11	0.13	0.18	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.10	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.10	0.10	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.10	0.07	0.10	0.10	0.01	0.01	0.12	0.01	0.06	0.11	0.11	0.07
C4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.15	0.00	0.03	0.16	0.20	0.26	0.21
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.07	0.01	0.02	0.07	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.15	0.01	0.03	0.17	0.20	0.24	0.21
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.10	0.06	0.08	0.05	0.05	0.02	0.12	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.03	0.14	0.15	0.18	0.15
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.01	0.10	0.11	0.15	0.11
N3	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.13	0.01	0.02	0.14	0.17	0.22	0.17
O2	0.03	0.01	0.10	0.10	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.13	0.02	0.03	0.10	0.12	0.17	0.12
O2'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.06	0.05	0.04	0.05	0.03	0.03	0.07	0.11	0.00	0.06	0.08	0.04	0.03	0.08	0.08	0.04
O3'	0.02	0.10	0.03	0.01	0.15	0.02	0.15	0.02	0.12	0.07	0.13	0.13	0.06	0.00	0.17	0.02	0.09	0.17	0.18	0.12
O4	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.17	0.00	0.03	0.17	0.23	0.28	0.23
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.00	0.07	0.07	0.11	0.08
O5'	0.06	0.11	0.05	0.06	0.16	0.02	0.17	0.01	0.14	0.10	0.14	0.10	0.03	0.09	0.17	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.13	0.10	0.11	0.20	0.07	0.20	0.06	0.15	0.11	0.17	0.12	0.08	0.17	0.23	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.18	0.10	0.11	0.26	0.04	0.24	0.02	0.18	0.15	0.22	0.17	0.08	0.18	0.28	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.13	0.06	0.07	0.21	0.02	0.21	0.01	0.15	0.11	0.17	0.12	0.04	0.12	0.23	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.16	0.13	0.12	0.13	0.11	0.16	0.16	0.15	0.11	0.13	0.17	0.29	0.21	0.13	0.12	0.46	0.62	0.38	0.45
C2	0.16	0.19	0.14	0.15	0.22	0.17	0.27	0.26	0.24	0.18	0.18	0.25	0.28	0.18	0.14	0.17	0.57	0.85	0.51	0.59
C2'	0.12	0.15	0.11	0.09	0.13	0.09	0.18	0.16	0.17	0.11	0.14	0.17	0.28	0.21	0.09	0.10	0.49	0.64	0.41	0.48
C3'	0.12	0.12	0.11	0.08	0.12	0.08	0.20	0.15	0.19	0.10	0.10	0.15	0.26	0.20	0.08	0.09	0.48	0.57	0.38	0.46
C4	0.18	0.18	0.15	0.22	0.16	0.27	0.28	0.39	0.27	0.18	0.18	0.15	0.24	0.14	0.21	0.24	0.68	1.01	0.61	0.71
C4'	0.13	0.13	0.11	0.07	0.12	0.08	0.16	0.10	0.16	0.10	0.12	0.14	0.25	0.21	0.10	0.10	0.39	0.45	0.29	0.36
C5	0.16	0.19	0.15	0.21	0.11	0.25	0.19	0.36	0.21	0.15	0.18	0.14	0.26	0.15	0.20	0.21	0.65	0.89	0.54	0.65
C5'	0.15	0.15	0.15	0.07	0.13	0.09	0.18	0.09	0.18	0.14	0.13	0.15	0.24	0.22	0.09	0.12	0.36	0.38	0.23	0.32
C6	0.14	0.19	0.13	0.16	0.10	0.17	0.17	0.26	0.17	0.13	0.16	0.13	0.29	0.15	0.16	0.15	0.57	0.74	0.45	0.55
N1	0.14	0.18	0.13	0.14	0.14	0.14	0.20	0.22	0.19	0.14	0.15	0.16	0.30	0.18	0.14	0.13	0.54	0.74	0.45	0.53
N3	0.17	0.19	0.14	0.19	0.23	0.22	0.31	0.34	0.28	0.19	0.19	0.24	0.26	0.15	0.17	0.21	0.64	0.97	0.58	0.67
O2	0.18	0.20	0.15	0.15	0.26	0.16	0.29	0.24	0.25	0.19	0.21	0.31	0.29	0.20	0.14	0.17	0.55	0.84	0.51	0.57
O2'	0.14	0.15	0.13	0.10	0.14	0.11	0.16	0.14	0.14	0.11	0.15	0.19	0.28	0.24	0.12	0.12	0.44	0.58	0.37	0.43
O3'	0.12	0.13	0.12	0.09	0.12	0.09	0.20	0.15	0.19	0.10	0.11	0.16	0.26	0.22	0.09	0.10	0.46	0.55	0.37	0.45
O4	0.22	0.19	0.18	0.26	0.19	0.33	0.32	0.47	0.32	0.22	0.19	0.17	0.23	0.16	0.24	0.30	0.72	1.13	0.68	0.79
O4'	0.13	0.13	0.13	0.12	0.12	0.11	0.14	0.13	0.14	0.10	0.12	0.15	0.25	0.21	0.15	0.11	0.40	0.49	0.31	0.37
O5'	0.13	0.15	0.15	0.07	0.14	0.06	0.19	0.11	0.19	0.12	0.14	0.16	0.24	0.18	0.02	0.09	0.45	0.47	0.28	0.40
OP1	0.06	0.10	0.09	0.02	0.12	0.07	0.17	0.15	0.15	0.05	0.11	0.16	0.20	0.16	0.02	0.04	0.26	0.45	0.21	0.26
OP2	0.10	0.20	0.08	0.07	0.26	0.12	0.28	0.22	0.24	0.16	0.23	0.29	0.23	0.07	0.02	0.12	0.48	0.60	0.36	0.45
P	0.04	0.11	0.07	0.02	0.14	0.05	0.18	0.13	0.16	0.07	0.12	0.17	0.19	0.11	0.01	0.03	0.36	0.45	0.22	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.16	0.24	0.09	0.15
C2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.09	0.03	0.37	0.53	0.29	0.36
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.05	0.05	0.14	0.00	0.02	0.01	0.24	0.26	0.10	0.20
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.11	0.02	0.11	0.04	0.08	0.09	0.14	0.02	0.01	0.01	0.32	0.31	0.09	0.25
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.53	0.78	0.52	0.54
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.05	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.11	0.24	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.03	0.56	0.79	0.51	0.56
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.09	0.06	0.08	0.11	0.06	0.06	0.04	0.01	0.01	0.21	0.38	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.04	0.49	0.62	0.33	0.45
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.36	0.47	0.22	0.33
N3	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.02	0.46	0.67	0.42	0.46
N4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.57	0.87	0.61	0.60
O2	0.03	0.00	0.14	0.14	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.16	0.04	0.29	0.44	0.23	0.29
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.05	0.06	0.06	0.06	0.06	0.03	0.05	0.06	0.11	0.00	0.04	0.04	0.07	0.12	0.10	0.07
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.09	0.02	0.13	0.04	0.12	0.04	0.09	0.11	0.16	0.04	0.00	0.02	0.24	0.31	0.11	0.21
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.02	0.00	0.07	0.12	0.20	0.09
O5'	0.16	0.37	0.24	0.32	0.53	0.02	0.56	0.01	0.49	0.36	0.46	0.57	0.29	0.07	0.24	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.24	0.53	0.26	0.31	0.78	0.11	0.79	0.21	0.62	0.47	0.67	0.87	0.44	0.12	0.31	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.29	0.10	0.09	0.52	0.24	0.51	0.38	0.33	0.22	0.42	0.61	0.23	0.10	0.11	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.36	0.20	0.25	0.54	0.02	0.56	0.02	0.45	0.33	0.46	0.60	0.29	0.07	0.21	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00