Doublet Group distance statistics: 49447

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 4, 4, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.010, 0.020, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.002, 0.014, 0.025, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.014, 0.027, 0.041, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.014, 0.028, 0.043, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.008, 0.025, 0.041, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.025 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.016, 0.049, 0.081, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.049 std_dev=0.033
O4	A	0, 0.021, 0.089, 0.157, 0.227 max_d=0.227 avg_d=0.089 std_dev=0.068
N1	B	0, 0.297, 0.461, 0.624, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.461 std_dev=0.163
C2	B	0, 0.314, 0.481, 0.647, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.481 std_dev=0.167
O4'	A	0, 0.049, 0.237, 0.426, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.237 std_dev=0.188
C6	B	0, 0.231, 0.425, 0.620, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.425 std_dev=0.195
N3	B	0, 0.247, 0.448, 0.649, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.448 std_dev=0.201
C2'	A	0, 0.052, 0.271, 0.489, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.271 std_dev=0.219
C5	B	0, 0.142, 0.377, 0.612, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.377 std_dev=0.235
C4	B	0, 0.120, 0.370, 0.620, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.370 std_dev=0.250
O2'	A	0, 0.025, 0.287, 0.549, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.287 std_dev=0.262
O2	B	0, 0.383, 0.672, 0.961, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.672 std_dev=0.289
C3'	A	0, 0.235, 0.533, 0.830, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.533 std_dev=0.298
C4'	A	0, 0.114, 0.419, 0.723, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.419 std_dev=0.304
C1'	B	0, 0.364, 0.682, 0.999, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.682 std_dev=0.318
C2'	B	0, 0.332, 0.683, 1.033, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.683 std_dev=0.350
N4	B	0, 0.139, 0.523, 0.907, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.523 std_dev=0.384
O3'	A	0, 0.579, 0.964, 1.349, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.964 std_dev=0.385
O4'	B	0, 0.344, 0.789, 1.234, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.789 std_dev=0.445
OP1	A	0, 0.174, 0.625, 1.075, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.625 std_dev=0.451
P	A	0, 0.093, 0.547, 1.000, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.547 std_dev=0.454
C5'	A	0, 0.100, 0.588, 1.076, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.588 std_dev=0.488
C3'	B	0, 0.185, 0.673, 1.162, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.673 std_dev=0.489
OP2	A	0, 0.192, 0.682, 1.173, 1.831 max_d=1.831 avg_d=0.682 std_dev=0.491
O2'	B	0, 0.449, 0.953, 1.456, 2.209 max_d=2.209 avg_d=0.953 std_dev=0.503
O5'	A	0, -0.015, 0.489, 0.994, 2.068 max_d=2.068 avg_d=0.489 std_dev=0.505
O5'	B	0, 0.495, 1.057, 1.619, 2.512 max_d=2.512 avg_d=1.057 std_dev=0.562
C4'	B	0, 0.335, 0.904, 1.473, 2.256 max_d=2.256 avg_d=0.904 std_dev=0.569
O3'	B	0, 0.168, 0.757, 1.346, 2.252 max_d=2.252 avg_d=0.757 std_dev=0.589
C5'	B	0, 0.426, 1.075, 1.724, 2.681 max_d=2.681 avg_d=1.075 std_dev=0.649
P	B	0, 0.600, 1.350, 2.100, 3.438 max_d=3.438 avg_d=1.350 std_dev=0.750
OP2	B	0, 0.606, 1.408, 2.211, 3.612 max_d=3.612 avg_d=1.408 std_dev=0.803
OP1	B	0, 0.739, 1.672, 2.605, 4.349 max_d=4.349 avg_d=1.672 std_dev=0.933

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.13	0.08	0.37	0.15
C2	0.03	0.00	0.08	0.11	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.13	0.01	0.02	0.32	0.20	0.28	0.17
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.09	0.03	0.07	0.16	0.00	0.02	0.08	0.01	0.18	0.21	0.22	0.05
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.13	0.00	0.16	0.01	0.16	0.07	0.11	0.18	0.02	0.01	0.15	0.01	0.25	0.34	0.16	0.16
C4	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.16	0.00	0.03	0.47	0.27	0.26	0.26
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.06	0.09	0.05	0.02	0.09	0.00	0.01	0.11	0.32	0.09
C5	0.01	0.01	0.09	0.16	0.01	0.10	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.19	0.01	0.04	0.48	0.23	0.21	0.24
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.12	0.01	0.14	0.00	0.12	0.06	0.10	0.10	0.05	0.03	0.14	0.01	0.01	0.16	0.27	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.16	0.01	0.09	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.17	0.01	0.04	0.41	0.16	0.23	0.15
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.07	0.02	0.02	0.30	0.15	0.29	0.13
N3	0.03	0.01	0.07	0.11	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.13	0.01	0.02	0.40	0.25	0.27	0.22
O2	0.05	0.00	0.16	0.18	0.01	0.09	0.02	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00	0.12	0.21	0.01	0.04	0.26	0.19	0.31	0.17
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.04	0.02	0.07	0.12	0.00	0.04	0.07	0.05	0.05	0.16	0.27	0.07
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.16	0.02	0.19	0.03	0.17	0.07	0.13	0.21	0.04	0.00	0.19	0.02	0.22	0.46	0.19	0.24
O4	0.02	0.01	0.08	0.15	0.00	0.09	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.19	0.00	0.03	0.50	0.31	0.30	0.31
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.03	0.00	0.10	0.13	0.48	0.26
O5'	0.13	0.32	0.18	0.25	0.47	0.01	0.48	0.01	0.41	0.30	0.40	0.26	0.05	0.22	0.50	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.20	0.21	0.34	0.27	0.11	0.23	0.16	0.16	0.15	0.25	0.19	0.16	0.46	0.31	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.37	0.28	0.22	0.16	0.26	0.32	0.21	0.27	0.23	0.29	0.27	0.31	0.27	0.19	0.30	0.48	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.17	0.05	0.16	0.26	0.09	0.24	0.02	0.15	0.13	0.22	0.17	0.07	0.24	0.31	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.13	0.19	0.21	0.16	0.20	0.13	0.22	0.12	0.12	0.16	0.20	0.15	0.24	0.25	0.17	0.26	0.37	0.39	0.33
C2	0.13	0.10	0.15	0.13	0.16	0.12	0.13	0.14	0.08	0.08	0.13	0.23	0.15	0.22	0.16	0.11	0.22	0.28	0.39	0.29
C2'	0.11	0.12	0.11	0.10	0.15	0.09	0.12	0.12	0.09	0.10	0.15	0.19	0.15	0.19	0.11	0.10	0.20	0.30	0.35	0.26
C3'	0.18	0.19	0.16	0.13	0.17	0.13	0.17	0.13	0.17	0.18	0.19	0.18	0.22	0.18	0.10	0.16	0.20	0.27	0.31	0.23
C4	0.14	0.11	0.16	0.16	0.14	0.14	0.17	0.17	0.15	0.13	0.10	0.19	0.16	0.19	0.18	0.13	0.24	0.31	0.44	0.33
C4'	0.15	0.22	0.12	0.06	0.16	0.05	0.12	0.08	0.10	0.15	0.21	0.18	0.29	0.18	0.10	0.10	0.17	0.35	0.33	0.26
C5	0.17	0.13	0.19	0.17	0.14	0.15	0.13	0.16	0.14	0.14	0.12	0.18	0.14	0.21	0.19	0.15	0.22	0.28	0.39	0.29
C5'	0.35	0.33	0.36	0.21	0.20	0.24	0.16	0.15	0.19	0.29	0.27	0.17	0.42	0.47	0.16	0.30	0.16	0.30	0.28	0.20
C6	0.14	0.12	0.16	0.11	0.15	0.11	0.12	0.13	0.09	0.11	0.14	0.19	0.14	0.20	0.13	0.11	0.21	0.27	0.37	0.28
N1	0.13	0.11	0.15	0.14	0.15	0.13	0.12	0.15	0.08	0.09	0.14	0.20	0.13	0.21	0.16	0.12	0.22	0.30	0.38	0.29
N3	0.12	0.10	0.14	0.12	0.16	0.10	0.16	0.14	0.11	0.09	0.10	0.23	0.16	0.20	0.15	0.10	0.22	0.29	0.42	0.31
O2	0.15	0.11	0.17	0.16	0.17	0.15	0.13	0.17	0.08	0.09	0.15	0.25	0.17	0.25	0.20	0.13	0.23	0.30	0.39	0.30
O2'	0.21	0.16	0.21	0.20	0.17	0.22	0.13	0.21	0.13	0.15	0.17	0.21	0.19	0.31	0.23	0.21	0.24	0.36	0.36	0.30
O3'	0.18	0.18	0.17	0.17	0.18	0.16	0.19	0.17	0.19	0.18	0.18	0.18	0.20	0.18	0.15	0.17	0.23	0.29	0.31	0.25
O4	0.17	0.17	0.18	0.19	0.17	0.18	0.23	0.22	0.21	0.17	0.16	0.21	0.22	0.20	0.22	0.16	0.29	0.38	0.50	0.39
O4'	0.09	0.18	0.10	0.21	0.17	0.17	0.13	0.22	0.11	0.10	0.20	0.19	0.26	0.14	0.29	0.10	0.28	0.44	0.42	0.36
O5'	0.26	0.36	0.27	0.14	0.34	0.10	0.30	0.08	0.28	0.31	0.37	0.34	0.39	0.23	0.02	0.18	0.17	0.30	0.20	0.18
OP1	0.04	0.07	0.08	0.06	0.16	0.12	0.20	0.24	0.17	0.08	0.11	0.19	0.11	0.16	0.02	0.10	0.32	0.61	0.49	0.49
OP2	0.09	0.16	0.11	0.05	0.22	0.09	0.20	0.19	0.16	0.13	0.20	0.25	0.15	0.11	0.02	0.08	0.25	0.26	0.23	0.24
P	0.05	0.09	0.08	0.01	0.13	0.03	0.13	0.11	0.11	0.07	0.11	0.15	0.11	0.10	0.00	0.02	0.18	0.33	0.25	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.11	0.10	0.17	0.13
C2	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.04	0.03	0.11	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.05	0.03	0.23	0.24	0.38	0.29
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.04	0.05	0.05	0.00	0.02	0.01	0.06	0.12	0.11	0.07
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.08	0.01	0.10	0.03	0.09	0.05	0.07	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.14	0.08	0.06
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.08	0.00	0.19	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.10	0.03	0.31	0.39	0.52	0.42
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.10	0.05	0.06	0.09	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.09	0.03	0.02
C5	0.02	0.03	0.05	0.10	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.11	0.04	0.32	0.40	0.51	0.43
C5'	0.03	0.11	0.02	0.03	0.19	0.01	0.21	0.00	0.19	0.11	0.15	0.21	0.07	0.05	0.03	0.02	0.01	0.08	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.02	0.10	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.10	0.04	0.28	0.31	0.38	0.34
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.21	0.21	0.31	0.26
N3	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.07	0.03	0.27	0.31	0.46	0.36
N4	0.02	0.02	0.05	0.09	0.00	0.09	0.01	0.21	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.11	0.04	0.32	0.44	0.58	0.47
O2	0.03	0.01	0.05	0.05	0.03	0.03	0.04	0.07	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.09	0.05	0.04	0.19	0.18	0.33	0.24
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.07	0.06	0.09	0.00	0.04	0.06	0.06	0.12	0.09	0.06
O3'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.10	0.02	0.11	0.03	0.10	0.05	0.07	0.11	0.05	0.04	0.00	0.01	0.10	0.22	0.12	0.12
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.06	0.01	0.00	0.09	0.10	0.13	0.12
O5'	0.11	0.23	0.06	0.05	0.31	0.01	0.32	0.01	0.28	0.21	0.27	0.32	0.19	0.06	0.10	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.10	0.24	0.12	0.14	0.39	0.09	0.40	0.08	0.31	0.21	0.31	0.44	0.18	0.12	0.22	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.38	0.11	0.08	0.52	0.03	0.51	0.02	0.38	0.31	0.46	0.58	0.33	0.09	0.12	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.29	0.07	0.06	0.42	0.02	0.43	0.01	0.34	0.26	0.36	0.47	0.24	0.06	0.12	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00