Doublet Group distance statistics: 49449

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.010 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.022 std_dev=0.018
O4	A	0, 0.008, 0.044, 0.080, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.044 std_dev=0.036
O4'	A	0, -0.024, 0.156, 0.335, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.156 std_dev=0.179
C2'	A	0, 0.005, 0.208, 0.411, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.208 std_dev=0.203
O2'	A	0, 0.028, 0.285, 0.543, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.285 std_dev=0.258
C4'	A	0, -0.023, 0.238, 0.499, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.238 std_dev=0.261
C3'	A	0, -0.016, 0.300, 0.616, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.300 std_dev=0.316
C6	B	0, 0.044, 0.398, 0.753, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.398 std_dev=0.355
N1	B	0, 0.042, 0.416, 0.790, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.416 std_dev=0.374
N3	B	0, 0.049, 0.429, 0.809, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.429 std_dev=0.380
C5	B	0, -0.016, 0.378, 0.772, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.378 std_dev=0.394
C4	B	0, -0.010, 0.384, 0.779, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.384 std_dev=0.394
C2	B	0, 0.045, 0.445, 0.845, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.445 std_dev=0.400
C2'	B	0, 0.019, 0.438, 0.856, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.438 std_dev=0.418
C1'	B	0, 0.064, 0.485, 0.906, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.485 std_dev=0.421
N4	B	0, 0.009, 0.447, 0.884, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.447 std_dev=0.438
O5'	A	0, -0.047, 0.395, 0.836, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.395 std_dev=0.441
C3'	B	0, 0.020, 0.467, 0.914, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.467 std_dev=0.447
O3'	A	0, -0.010, 0.446, 0.903, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.446 std_dev=0.457
C5'	A	0, -0.047, 0.413, 0.872, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.413 std_dev=0.459
OP2	A	0, 0.051, 0.512, 0.973, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.512 std_dev=0.461
O2'	B	0, 0.095, 0.563, 1.030, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.563 std_dev=0.468
O2	B	0, 0.078, 0.551, 1.024, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.551 std_dev=0.473
O4'	B	0, 0.093, 0.593, 1.093, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.593 std_dev=0.500
P	A	0, -0.005, 0.499, 1.003, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.499 std_dev=0.504
C4'	B	0, 0.079, 0.604, 1.130, 1.726 max_d=1.726 avg_d=0.604 std_dev=0.525
O3'	B	0, -0.014, 0.517, 1.047, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.517 std_dev=0.530
C5'	B	0, 0.128, 0.682, 1.237, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.682 std_dev=0.555
OP1	A	0, 0.014, 0.595, 1.176, 1.890 max_d=1.890 avg_d=0.595 std_dev=0.581
O5'	B	0, 0.080, 0.707, 1.333, 2.005 max_d=2.005 avg_d=0.707 std_dev=0.626
P	B	0, 0.076, 0.776, 1.475, 2.311 max_d=2.311 avg_d=0.776 std_dev=0.699
OP1	B	0, 0.048, 0.856, 1.665, 2.785 max_d=2.785 avg_d=0.856 std_dev=0.808
OP2	B	0, -0.325, 0.954, 2.233, 4.355 max_d=4.355 avg_d=0.954 std_dev=1.279

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.04	0.09	0.07
C2	0.02	0.00	0.10	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.08	0.01	0.04	0.06	0.06	0.11	0.07
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.10	0.03	0.08	0.17	0.00	0.02	0.07	0.00	0.02	0.08	0.04	0.03
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.12	0.02	0.13	0.04	0.05	0.12	0.01	0.01	0.08	0.01	0.06	0.13	0.09	0.08
C4	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.00	0.01	0.06	0.09	0.13	0.10
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.09	0.12	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.03	0.07	0.10	0.14	0.12
C5'	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.13	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.16	0.01	0.05	0.07	0.08	0.13	0.12
N1	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.00	0.06	0.06	0.11	0.09
N3	0.01	0.00	0.08	0.05	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.01	0.03	0.06	0.07	0.12	0.08
O2	0.03	0.00	0.17	0.12	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.16	0.02	0.06	0.06	0.06	0.10	0.07
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.03	0.06	0.03	0.07	0.02	0.08	0.18	0.00	0.02	0.06	0.03	0.03	0.10	0.03	0.03
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.10	0.01	0.16	0.03	0.16	0.05	0.08	0.16	0.02	0.00	0.11	0.01	0.11	0.22	0.17	0.15
O4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.11	0.00	0.02	0.06	0.10	0.13	0.10
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.03	0.06	0.03	0.01	0.02	0.00	0.06	0.05	0.10	0.09
O5'	0.05	0.06	0.02	0.06	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.06	0.06	0.06	0.03	0.11	0.06	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.04	0.06	0.08	0.13	0.09	0.04	0.10	0.03	0.08	0.06	0.07	0.06	0.10	0.22	0.10	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.11	0.04	0.09	0.13	0.02	0.14	0.01	0.13	0.11	0.12	0.10	0.03	0.17	0.13	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.07	0.03	0.08	0.10	0.02	0.12	0.01	0.12	0.09	0.08	0.07	0.03	0.15	0.10	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.28	0.17	0.16	0.12	0.17	0.06	0.18	0.09	0.18	0.25	0.09	0.38	0.19	0.14	0.17	0.51	0.63	0.67	0.50
C2	0.08	0.18	0.08	0.11	0.11	0.15	0.10	0.21	0.11	0.08	0.22	0.15	0.24	0.09	0.09	0.14	0.65	0.75	1.00	0.68
C2'	0.15	0.29	0.13	0.11	0.15	0.12	0.07	0.16	0.07	0.15	0.28	0.14	0.40	0.19	0.08	0.13	0.51	0.72	0.65	0.52
C3'	0.08	0.18	0.08	0.07	0.07	0.07	0.07	0.14	0.09	0.07	0.18	0.08	0.29	0.16	0.05	0.04	0.49	0.77	0.53	0.50
C4	0.13	0.23	0.10	0.13	0.27	0.22	0.14	0.29	0.10	0.14	0.29	0.36	0.25	0.09	0.11	0.21	0.69	0.87	1.13	0.77
C4'	0.11	0.13	0.11	0.07	0.04	0.06	0.10	0.08	0.11	0.08	0.11	0.05	0.23	0.18	0.08	0.07	0.40	0.63	0.39	0.39
C5	0.21	0.30	0.16	0.19	0.30	0.26	0.21	0.32	0.17	0.23	0.33	0.34	0.32	0.14	0.15	0.27	0.62	0.83	0.90	0.66
C5'	0.13	0.07	0.13	0.05	0.10	0.05	0.17	0.05	0.18	0.12	0.07	0.11	0.12	0.19	0.03	0.08	0.34	0.62	0.21	0.32
C6	0.23	0.33	0.20	0.21	0.26	0.25	0.16	0.29	0.16	0.25	0.33	0.26	0.36	0.17	0.18	0.26	0.56	0.74	0.74	0.57
N1	0.16	0.27	0.14	0.15	0.17	0.18	0.06	0.22	0.09	0.17	0.28	0.16	0.33	0.14	0.13	0.18	0.57	0.71	0.81	0.58
N3	0.08	0.17	0.07	0.11	0.18	0.18	0.08	0.25	0.10	0.07	0.24	0.27	0.21	0.07	0.09	0.17	0.70	0.82	1.14	0.76
O2	0.08	0.13	0.07	0.10	0.08	0.13	0.19	0.18	0.17	0.08	0.15	0.09	0.21	0.09	0.08	0.12	0.65	0.73	1.03	0.69
O2'	0.24	0.34	0.20	0.13	0.18	0.15	0.09	0.14	0.11	0.22	0.32	0.17	0.48	0.27	0.10	0.19	0.49	0.65	0.63	0.49
O3'	0.10	0.19	0.10	0.06	0.07	0.06	0.08	0.13	0.10	0.07	0.19	0.09	0.30	0.20	0.07	0.04	0.47	0.80	0.50	0.50
O4	0.13	0.21	0.09	0.13	0.29	0.23	0.15	0.31	0.11	0.13	0.29	0.40	0.22	0.09	0.11	0.23	0.70	0.91	1.25	0.82
O4'	0.14	0.17	0.15	0.15	0.04	0.14	0.08	0.14	0.08	0.11	0.12	0.06	0.26	0.18	0.16	0.13	0.44	0.57	0.50	0.42
O5'	0.09	0.13	0.11	0.04	0.16	0.04	0.19	0.09	0.18	0.12	0.15	0.17	0.17	0.13	0.01	0.05	0.38	0.71	0.24	0.36
OP1	0.05	0.09	0.07	0.02	0.14	0.03	0.18	0.08	0.16	0.08	0.11	0.17	0.15	0.11	0.03	0.02	0.14	0.60	0.30	0.13
OP2	0.04	0.17	0.03	0.04	0.23	0.13	0.23	0.20	0.17	0.11	0.20	0.27	0.20	0.06	0.03	0.10	0.35	0.84	0.16	0.35
P	0.04	0.12	0.06	0.01	0.16	0.04	0.18	0.09	0.16	0.09	0.14	0.19	0.17	0.08	0.00	0.02	0.26	0.67	0.12	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.16	0.09	0.25	0.14
C2	0.03	0.00	0.08	0.08	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.09	0.03	0.34	0.24	0.62	0.35
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.07	0.01	0.06	0.02	0.17	0.00	0.02	0.01	0.18	0.25	0.15	0.16
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.04	0.07	0.08	0.15	0.03	0.00	0.01	0.25	0.40	0.08	0.19
C4	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.58	0.49	1.05	0.63
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.05	0.10	0.06	0.01	0.00	0.02	0.13	0.14	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.12	0.02	0.64	0.54	1.09	0.67
C5'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.05	0.05	0.09	0.09	0.06	0.01	0.01	0.01	0.25	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.12	0.02	0.55	0.41	0.83	0.52
N1	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.36	0.25	0.57	0.34
N3	0.02	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.09	0.02	0.47	0.36	0.85	0.50
N4	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.02	0.64	0.57	1.20	0.71
O2	0.07	0.00	0.17	0.15	0.01	0.10	0.01	0.09	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.17	0.18	0.06	0.20	0.10	0.42	0.21
O2'	0.01	0.09	0.00	0.03	0.04	0.06	0.04	0.06	0.05	0.02	0.08	0.04	0.17	0.00	0.06	0.04	0.06	0.09	0.13	0.07
O3'	0.02	0.09	0.02	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.12	0.04	0.09	0.10	0.18	0.06	0.00	0.01	0.14	0.46	0.15	0.11
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.04	0.01	0.00	0.07	0.04	0.12	0.06
O5'	0.16	0.34	0.18	0.25	0.58	0.02	0.64	0.01	0.55	0.36	0.47	0.64	0.20	0.06	0.14	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.09	0.24	0.25	0.40	0.49	0.13	0.54	0.25	0.41	0.25	0.36	0.57	0.10	0.09	0.46	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.62	0.15	0.08	1.05	0.14	1.09	0.23	0.83	0.57	0.85	1.20	0.42	0.13	0.15	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.35	0.16	0.19	0.63	0.02	0.67	0.02	0.52	0.34	0.50	0.71	0.21	0.07	0.11	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00