Doublet Group distance statistics: 49451

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.008, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.018, 0.042, 0.065, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.042 std_dev=0.024
O4	A	0, -0.008, 0.044, 0.096, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.044 std_dev=0.052
O4'	A	0, 0.141, 0.275, 0.408, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.275 std_dev=0.134
C2'	A	0, 0.161, 0.335, 0.508, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.335 std_dev=0.174
N1	B	0, 0.274, 0.528, 0.782, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.528 std_dev=0.254
C4'	A	0, 0.301, 0.580, 0.859, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.580 std_dev=0.279
C6	B	0, 0.325, 0.620, 0.915, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.620 std_dev=0.295
C5	B	0, 0.369, 0.676, 0.984, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.676 std_dev=0.308
C2	B	0, 0.253, 0.568, 0.883, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.568 std_dev=0.315
C4	B	0, 0.334, 0.668, 1.002, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.668 std_dev=0.334
C1'	B	0, 0.361, 0.730, 1.099, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.730 std_dev=0.369
N3	B	0, 0.252, 0.636, 1.020, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.636 std_dev=0.384
O2'	A	0, 0.255, 0.654, 1.052, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.654 std_dev=0.398
C2'	B	0, 0.367, 0.769, 1.171, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.769 std_dev=0.402
O2	B	0, 0.353, 0.771, 1.190, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.771 std_dev=0.419
C3'	A	0, 0.264, 0.689, 1.114, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.689 std_dev=0.425
C5'	A	0, 0.513, 0.945, 1.376, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.945 std_dev=0.432
O2'	B	0, 0.548, 1.008, 1.467, 1.425 max_d=1.425 avg_d=1.008 std_dev=0.459
O5'	A	0, 0.421, 0.884, 1.347, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.884 std_dev=0.463
N4	B	0, 0.439, 0.907, 1.375, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.907 std_dev=0.468
O4'	B	0, 0.472, 0.973, 1.473, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.973 std_dev=0.500
C3'	B	0, 0.447, 0.971, 1.494, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.971 std_dev=0.523
C4'	B	0, 0.546, 1.153, 1.760, 2.021 max_d=2.021 avg_d=1.153 std_dev=0.607
O5'	B	0, 0.689, 1.305, 1.922, 2.216 max_d=2.216 avg_d=1.305 std_dev=0.616
O3'	B	0, 0.505, 1.129, 1.754, 1.885 max_d=1.885 avg_d=1.129 std_dev=0.625
P	A	0, 0.510, 1.149, 1.788, 1.942 max_d=1.942 avg_d=1.149 std_dev=0.639
OP2	B	0, 0.829, 1.512, 2.194, 2.340 max_d=2.340 avg_d=1.512 std_dev=0.682
OP2	A	0, 0.626, 1.331, 2.035, 2.175 max_d=2.175 avg_d=1.331 std_dev=0.704
P	B	0, 0.805, 1.510, 2.215, 2.526 max_d=2.526 avg_d=1.510 std_dev=0.705
C5'	B	0, 0.744, 1.467, 2.190, 2.579 max_d=2.579 avg_d=1.467 std_dev=0.723
OP1	A	0, 0.550, 1.334, 2.119, 2.392 max_d=2.392 avg_d=1.334 std_dev=0.784
O3'	A	0, 0.330, 1.154, 1.977, 2.902 max_d=2.902 avg_d=1.154 std_dev=0.824
OP1	B	0, 0.801, 1.855, 2.909, 3.737 max_d=3.737 avg_d=1.855 std_dev=1.054

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.22	0.02	0.01	0.16	0.14	0.26	0.18
C2	0.02	0.00	0.09	0.13	0.01	0.02	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.18	0.01	0.05	0.25	0.27	0.43	0.31
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.02	0.08	0.14	0.10	0.02	0.07	0.16	0.00	0.04	0.05	0.02	0.29	0.27	0.38	0.31
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.27	0.00	0.31	0.01	0.29	0.17	0.19	0.05	0.02	0.01	0.28	0.03	0.06	0.12	0.13	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.27	0.00	0.13	0.00	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.17	0.00	0.04	0.43	0.54	0.70	0.56
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.13	0.00	0.19	0.00	0.19	0.08	0.06	0.06	0.22	0.02	0.14	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01
C5	0.02	0.01	0.08	0.31	0.00	0.19	0.00	0.35	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.25	0.00	0.08	0.47	0.59	0.72	0.61
C5'	0.05	0.12	0.14	0.01	0.29	0.00	0.35	0.00	0.30	0.16	0.19	0.06	0.10	0.15	0.31	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.29	0.00	0.19	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.25	0.21	0.01	0.09	0.41	0.46	0.55	0.48
N1	0.01	0.00	0.02	0.17	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.11	0.01	0.02	0.26	0.28	0.40	0.31
N3	0.02	0.00	0.07	0.19	0.00	0.06	0.01	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.13	0.01	0.03	0.34	0.40	0.57	0.43
O2	0.03	0.00	0.16	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.31	0.01	0.09	0.18	0.17	0.35	0.22
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.24	0.22	0.28	0.10	0.25	0.14	0.17	0.16	0.00	0.04	0.26	0.13	0.19	0.18	0.37	0.22
O3'	0.22	0.18	0.04	0.01	0.17	0.02	0.25	0.15	0.21	0.11	0.13	0.31	0.04	0.00	0.19	0.14	0.20	0.40	0.32	0.28
O4	0.02	0.01	0.05	0.28	0.00	0.14	0.00	0.31	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.19	0.00	0.05	0.46	0.61	0.77	0.62
O4'	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.00	0.08	0.02	0.09	0.02	0.03	0.09	0.13	0.14	0.05	0.00	0.05	0.04	0.13	0.09
O5'	0.16	0.25	0.29	0.06	0.43	0.01	0.47	0.01	0.41	0.26	0.34	0.18	0.19	0.20	0.46	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.14	0.27	0.27	0.12	0.54	0.06	0.59	0.05	0.46	0.28	0.40	0.17	0.18	0.40	0.61	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.43	0.38	0.13	0.70	0.02	0.72	0.00	0.55	0.40	0.57	0.35	0.37	0.32	0.77	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.31	0.31	0.08	0.56	0.01	0.61	0.01	0.48	0.31	0.43	0.22	0.22	0.28	0.62	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.28	0.13	0.15	0.25	0.13	0.20	0.17	0.15	0.17	0.29	0.28	0.37	0.16	0.19	0.10	0.17	0.28	0.17	0.18
C2	0.13	0.32	0.17	0.25	0.13	0.23	0.16	0.32	0.13	0.12	0.35	0.17	0.47	0.19	0.27	0.15	0.36	0.54	0.43	0.40
C2'	0.11	0.25	0.13	0.23	0.24	0.21	0.16	0.29	0.10	0.13	0.29	0.29	0.34	0.16	0.29	0.12	0.27	0.42	0.31	0.31
C3'	0.13	0.22	0.09	0.04	0.29	0.05	0.31	0.05	0.27	0.20	0.25	0.31	0.23	0.11	0.04	0.09	0.12	0.14	0.24	0.14
C4	0.28	0.29	0.33	0.52	0.34	0.55	0.16	0.67	0.28	0.20	0.44	0.52	0.35	0.30	0.54	0.43	0.71	0.92	0.73	0.75
C4'	0.10	0.14	0.09	0.09	0.18	0.09	0.20	0.10	0.17	0.13	0.16	0.20	0.18	0.14	0.12	0.08	0.12	0.10	0.15	0.10
C5	0.30	0.26	0.38	0.57	0.38	0.58	0.16	0.66	0.19	0.18	0.41	0.53	0.28	0.38	0.60	0.44	0.64	0.82	0.53	0.63
C5'	0.11	0.15	0.10	0.05	0.20	0.06	0.22	0.07	0.20	0.15	0.18	0.22	0.14	0.11	0.09	0.07	0.11	0.14	0.17	0.12
C6	0.21	0.27	0.29	0.42	0.33	0.40	0.19	0.45	0.14	0.16	0.37	0.39	0.30	0.29	0.46	0.29	0.40	0.56	0.31	0.39
N1	0.10	0.29	0.14	0.25	0.23	0.23	0.15	0.29	0.10	0.12	0.33	0.25	0.37	0.14	0.28	0.14	0.29	0.45	0.29	0.31
N3	0.18	0.33	0.23	0.38	0.21	0.38	0.21	0.49	0.24	0.16	0.43	0.28	0.44	0.20	0.39	0.28	0.55	0.75	0.63	0.60
O2	0.21	0.35	0.22	0.19	0.08	0.17	0.20	0.22	0.11	0.16	0.28	0.21	0.57	0.30	0.21	0.14	0.28	0.46	0.40	0.33
O2'	0.19	0.35	0.16	0.12	0.24	0.12	0.14	0.23	0.10	0.20	0.35	0.28	0.49	0.25	0.15	0.10	0.28	0.48	0.44	0.38
O3'	0.08	0.16	0.07	0.07	0.07	0.07	0.14	0.10	0.14	0.09	0.13	0.06	0.26	0.13	0.12	0.06	0.16	0.22	0.29	0.20
O4	0.36	0.30	0.40	0.60	0.38	0.66	0.27	0.81	0.38	0.27	0.46	0.63	0.35	0.36	0.62	0.53	0.87	1.13	0.96	0.95
O4'	0.13	0.18	0.13	0.15	0.19	0.14	0.19	0.15	0.17	0.15	0.19	0.20	0.22	0.15	0.17	0.12	0.17	0.13	0.15	0.15
O5'	0.13	0.16	0.12	0.05	0.22	0.04	0.25	0.04	0.24	0.18	0.19	0.23	0.13	0.11	0.01	0.09	0.10	0.13	0.21	0.12
OP1	0.06	0.09	0.09	0.02	0.14	0.06	0.16	0.13	0.14	0.09	0.11	0.16	0.07	0.13	0.02	0.03	0.16	0.22	0.23	0.18
OP2	0.07	0.15	0.05	0.07	0.19	0.11	0.19	0.16	0.16	0.13	0.18	0.21	0.15	0.06	0.02	0.10	0.21	0.18	0.26	0.19
P	0.03	0.09	0.06	0.00	0.14	0.04	0.16	0.09	0.15	0.09	0.12	0.16	0.08	0.08	0.00	0.01	0.14	0.16	0.21	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.05
C2	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.02	0.05	0.08	0.20	0.12
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.07	0.00	0.02	0.00	0.03	0.08	0.04	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.05	0.06	0.08	0.06	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.06	0.05
C4	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.08	0.02	0.09	0.18	0.26	0.18
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.04	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.09	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.10	0.02	0.09	0.19	0.26	0.18
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.06	0.08	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.02	0.07	0.12	0.21	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.06	0.17	0.11
N3	0.02	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.07	0.02	0.07	0.14	0.24	0.16
N4	0.02	0.00	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.10	0.23	0.28	0.20
O2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.07	0.03	0.04	0.05	0.18	0.10
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.00	0.05	0.02	0.03	0.12	0.03	0.03
O3'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.08	0.01	0.10	0.02	0.10	0.04	0.07	0.09	0.07	0.05	0.00	0.01	0.08	0.16	0.13	0.10
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.13	0.05
O5'	0.01	0.05	0.03	0.04	0.09	0.00	0.09	0.01	0.07	0.04	0.07	0.10	0.04	0.03	0.08	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.08	0.08	0.11	0.18	0.09	0.19	0.09	0.12	0.06	0.14	0.23	0.05	0.12	0.16	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.20	0.04	0.06	0.26	0.04	0.26	0.02	0.21	0.17	0.24	0.28	0.18	0.03	0.13	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.12	0.03	0.05	0.18	0.01	0.18	0.01	0.14	0.11	0.16	0.20	0.10	0.03	0.10	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00