Doublet Group distance statistics: 49452

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.004, 0.020, 0.037, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.003, 0.020, 0.037, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.003, 0.021, 0.039, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.002, 0.021, 0.040, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.008, 0.038, 0.067, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.038 std_dev=0.029
O4	A	0, 0.026, 0.105, 0.185, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.105 std_dev=0.080
C2'	A	0, 0.127, 0.318, 0.510, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.318 std_dev=0.191
O4'	A	0, 0.116, 0.311, 0.507, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.311 std_dev=0.196
O2'	A	0, 0.162, 0.390, 0.618, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.390 std_dev=0.228
N4	B	0, 0.106, 0.353, 0.600, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.353 std_dev=0.247
C4	B	0, 0.102, 0.354, 0.606, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.354 std_dev=0.252
C5	B	0, 0.091, 0.351, 0.612, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.351 std_dev=0.260
N3	B	0, 0.110, 0.373, 0.636, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.373 std_dev=0.263
C2'	B	0, 0.033, 0.308, 0.583, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.308 std_dev=0.275
C2	B	0, 0.101, 0.379, 0.657, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.379 std_dev=0.278
C6	B	0, 0.078, 0.362, 0.645, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.362 std_dev=0.283
O2'	B	0, 0.033, 0.318, 0.603, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.318 std_dev=0.285
N1	B	0, 0.081, 0.367, 0.653, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.367 std_dev=0.286
O2	B	0, 0.112, 0.404, 0.696, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.404 std_dev=0.292
C3'	A	0, 0.169, 0.469, 0.768, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.469 std_dev=0.299
C4'	A	0, 0.188, 0.488, 0.788, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.488 std_dev=0.300
C1'	B	0, 0.064, 0.367, 0.670, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.367 std_dev=0.303
C3'	B	0, 0.007, 0.332, 0.657, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.332 std_dev=0.325
O3'	B	0, 0.036, 0.363, 0.690, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.363 std_dev=0.327
O4'	B	0, 0.032, 0.395, 0.759, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.395 std_dev=0.364
O3'	A	0, 0.149, 0.514, 0.879, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.514 std_dev=0.365
C4'	B	0, -0.008, 0.368, 0.745, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.368 std_dev=0.377
O5'	A	0, 0.261, 0.646, 1.032, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.646 std_dev=0.385
P	A	0, -0.045, 0.389, 0.823, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.389 std_dev=0.434
OP1	A	0, 0.092, 0.540, 0.988, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.540 std_dev=0.448
C5'	B	0, -0.031, 0.431, 0.893, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.431 std_dev=0.462
OP2	A	0, 0.265, 0.758, 1.251, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.758 std_dev=0.493
O5'	B	0, -0.078, 0.480, 1.038, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.480 std_dev=0.558
C5'	A	0, 0.426, 1.027, 1.628, 1.477 max_d=1.477 avg_d=1.027 std_dev=0.601
P	B	0, 0.052, 0.881, 1.709, 2.184 max_d=2.184 avg_d=0.881 std_dev=0.829
OP2	B	0, 0.157, 1.044, 1.930, 2.407 max_d=2.407 avg_d=1.044 std_dev=0.887
OP1	B	0, 0.101, 1.043, 1.986, 2.518 max_d=2.518 avg_d=1.043 std_dev=0.942

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.04	0.29	0.10
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.00	0.01	0.11	0.13	0.39	0.19
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.06	0.09	0.00	0.01	0.07	0.00	0.10	0.11	0.21	0.08
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.03	0.04	0.02	0.07	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.14	0.15	0.15	0.10
C4	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.05	0.00	0.02	0.16	0.31	0.49	0.30
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.04	0.04	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.08	0.19	0.03
C5	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.03	0.18	0.33	0.50	0.31
C5'	0.02	0.07	0.02	0.03	0.12	0.00	0.13	0.00	0.12	0.07	0.10	0.06	0.01	0.04	0.13	0.01	0.01	0.06	0.20	0.01
C6	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.15	0.24	0.44	0.26
N1	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.11	0.13	0.38	0.18
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.08	0.00	0.01	0.14	0.22	0.45	0.24
O2	0.02	0.00	0.09	0.09	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.11	0.00	0.03	0.09	0.07	0.36	0.14
O2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.07	0.09	0.00	0.02	0.08	0.03	0.02	0.12	0.20	0.03
O3'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.05	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.08	0.11	0.02	0.00	0.07	0.01	0.10	0.17	0.09	0.08
O4	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.07	0.00	0.02	0.18	0.35	0.50	0.32
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.26	0.09
O5'	0.05	0.11	0.10	0.14	0.16	0.01	0.18	0.01	0.15	0.11	0.14	0.09	0.02	0.10	0.18	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.04	0.13	0.11	0.15	0.31	0.08	0.33	0.06	0.24	0.13	0.22	0.07	0.12	0.17	0.35	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.29	0.39	0.21	0.15	0.49	0.19	0.50	0.20	0.44	0.38	0.45	0.36	0.20	0.09	0.50	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.19	0.08	0.10	0.30	0.03	0.31	0.01	0.26	0.18	0.24	0.14	0.03	0.08	0.32	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.06	0.18	0.07	0.11	0.08	0.07	0.03	0.03	0.08	0.06	0.17	0.14	0.29	0.10	0.10	0.13	0.22	0.31	0.22
C2	0.23	0.22	0.24	0.15	0.07	0.13	0.07	0.03	0.13	0.20	0.16	0.04	0.27	0.31	0.17	0.16	0.07	0.17	0.26	0.17
C2'	0.15	0.06	0.16	0.07	0.09	0.08	0.08	0.05	0.04	0.07	0.05	0.16	0.13	0.29	0.11	0.10	0.15	0.26	0.36	0.26
C3'	0.13	0.03	0.17	0.11	0.10	0.11	0.09	0.11	0.06	0.07	0.06	0.15	0.07	0.29	0.15	0.10	0.18	0.29	0.40	0.29
C4	0.25	0.26	0.28	0.21	0.18	0.15	0.17	0.06	0.21	0.25	0.23	0.10	0.27	0.31	0.25	0.18	0.05	0.14	0.24	0.16
C4'	0.12	0.07	0.15	0.07	0.13	0.08	0.10	0.07	0.06	0.07	0.12	0.17	0.07	0.28	0.08	0.09	0.16	0.26	0.36	0.25
C5	0.20	0.17	0.25	0.18	0.08	0.11	0.10	0.05	0.14	0.17	0.11	0.08	0.19	0.28	0.25	0.12	0.11	0.20	0.33	0.23
C5'	0.17	0.12	0.20	0.15	0.12	0.16	0.09	0.15	0.09	0.12	0.12	0.13	0.14	0.31	0.15	0.16	0.19	0.30	0.38	0.28
C6	0.16	0.10	0.22	0.13	0.10	0.08	0.10	0.06	0.08	0.11	0.05	0.16	0.14	0.27	0.20	0.09	0.15	0.23	0.35	0.26
N1	0.19	0.13	0.22	0.12	0.06	0.10	0.05	0.03	0.07	0.13	0.03	0.13	0.19	0.29	0.16	0.12	0.12	0.21	0.31	0.22
N3	0.26	0.28	0.27	0.19	0.17	0.16	0.15	0.06	0.19	0.25	0.25	0.09	0.31	0.32	0.22	0.19	0.04	0.14	0.23	0.14
O2	0.23	0.22	0.22	0.13	0.07	0.13	0.07	0.04	0.13	0.19	0.15	0.04	0.28	0.30	0.14	0.17	0.06	0.16	0.24	0.16
O2'	0.17	0.06	0.16	0.06	0.11	0.10	0.07	0.03	0.04	0.08	0.07	0.17	0.14	0.30	0.06	0.13	0.12	0.22	0.33	0.22
O3'	0.12	0.02	0.15	0.10	0.10	0.10	0.08	0.10	0.06	0.06	0.07	0.15	0.05	0.28	0.13	0.10	0.18	0.29	0.40	0.29
O4	0.28	0.30	0.30	0.24	0.27	0.18	0.25	0.09	0.26	0.29	0.29	0.23	0.31	0.32	0.28	0.21	0.05	0.11	0.18	0.12
O4'	0.13	0.05	0.16	0.05	0.15	0.07	0.11	0.03	0.05	0.05	0.12	0.19	0.06	0.29	0.08	0.08	0.14	0.23	0.32	0.23
O5'	0.06	0.16	0.05	0.08	0.19	0.05	0.16	0.09	0.12	0.11	0.19	0.21	0.17	0.12	0.01	0.06	0.17	0.21	0.27	0.21
OP1	0.04	0.08	0.06	0.00	0.05	0.02	0.12	0.09	0.11	0.01	0.05	0.06	0.17	0.15	0.01	0.01	0.14	0.24	0.21	0.19
OP2	0.16	0.24	0.16	0.05	0.30	0.04	0.30	0.13	0.27	0.23	0.27	0.31	0.21	0.10	0.01	0.06	0.07	0.26	0.12	0.15
P	0.02	0.02	0.03	0.01	0.07	0.02	0.11	0.02	0.10	0.04	0.02	0.08	0.07	0.04	0.00	0.00	0.03	0.12	0.10	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01
C2	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.07	0.06	0.06
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.02	0.07	0.05	0.03
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.06	0.02	0.00	0.01	0.03	0.08	0.07	0.05
C4	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.07	0.07	0.07	0.08
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.03	0.05	0.05	0.05	0.06
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.03	0.03	0.05	0.06	0.04	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03
N3	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.08	0.07	0.08
N4	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.03	0.08	0.09	0.08	0.09
O2	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.00	0.06	0.09	0.07	0.06
O2'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.08	0.01	0.03	0.08	0.05	0.04
O3'	0.02	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.03	0.06	0.01	0.03	0.03	0.09	0.08	0.00	0.01	0.07	0.13	0.11	0.10
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03
O5'	0.01	0.06	0.02	0.03	0.07	0.01	0.05	0.00	0.03	0.03	0.07	0.08	0.06	0.03	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.07	0.07	0.08	0.07	0.03	0.05	0.02	0.03	0.04	0.08	0.09	0.09	0.08	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.01	0.06	0.05	0.07	0.07	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.07	0.08	0.07	0.05	0.11	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.01	0.06	0.03	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.04	0.03	0.08	0.09	0.06	0.04	0.10	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00