Doublet Group distance statistics: 49453

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.024 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.013, 0.031, 0.049, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.031 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.013, 0.032, 0.051, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.032 std_dev=0.019
C6	A	0, 0.014, 0.033, 0.053, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.033 std_dev=0.019
O4	A	0, 0.028, 0.067, 0.106, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.067 std_dev=0.039
O2	A	0, 0.029, 0.070, 0.111, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.070 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.107, 0.260, 0.413, 0.376 max_d=0.376 avg_d=0.260 std_dev=0.153
C2'	A	0, 0.135, 0.332, 0.529, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.332 std_dev=0.197
C4'	A	0, 0.181, 0.444, 0.708, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.444 std_dev=0.263
O2'	A	0, 0.177, 0.458, 0.740, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.458 std_dev=0.281
C3'	A	0, 0.199, 0.489, 0.779, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.489 std_dev=0.290
N1	B	0, 0.174, 0.495, 0.816, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.495 std_dev=0.321
C6	B	0, 0.179, 0.509, 0.840, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.509 std_dev=0.331
C2	B	0, 0.216, 0.555, 0.894, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.555 std_dev=0.339
C3'	B	0, 0.232, 0.623, 1.015, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.623 std_dev=0.391
C1'	B	0, 0.286, 0.688, 1.091, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.688 std_dev=0.402
O5'	A	0, 0.281, 0.686, 1.091, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.686 std_dev=0.405
C5	B	0, 0.164, 0.572, 0.979, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.572 std_dev=0.407
O4'	B	0, 0.302, 0.726, 1.150, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.726 std_dev=0.424
C5'	A	0, 0.296, 0.729, 1.161, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.729 std_dev=0.433
C4'	B	0, 0.294, 0.738, 1.181, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.738 std_dev=0.443
O3'	A	0, 0.299, 0.744, 1.188, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.744 std_dev=0.445
C2'	B	0, 0.327, 0.776, 1.226, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.776 std_dev=0.449
O3'	B	0, 0.299, 0.753, 1.208, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.753 std_dev=0.454
P	A	0, 0.282, 0.737, 1.192, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.737 std_dev=0.455
O2	B	0, 0.224, 0.679, 1.135, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.679 std_dev=0.456
C5'	B	0, 0.286, 0.754, 1.223, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.754 std_dev=0.469
N3	B	0, 0.134, 0.603, 1.072, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.603 std_dev=0.469
C4	B	0, 0.101, 0.607, 1.113, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.607 std_dev=0.506
OP2	A	0, 0.297, 0.811, 1.325, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.811 std_dev=0.514
O5'	B	0, 0.268, 0.803, 1.337, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.803 std_dev=0.534
OP1	A	0, 0.301, 0.845, 1.389, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.845 std_dev=0.544
P	B	0, 0.381, 0.972, 1.564, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.972 std_dev=0.592
OP2	B	0, 0.418, 1.037, 1.656, 1.634 max_d=1.634 avg_d=1.037 std_dev=0.619
O2'	B	0, 0.453, 1.087, 1.720, 1.568 max_d=1.568 avg_d=1.087 std_dev=0.633
OP1	B	0, 0.421, 1.104, 1.787, 1.787 max_d=1.787 avg_d=1.104 std_dev=0.683
N4	B	0, -0.007, 0.775, 1.556, 1.965 max_d=1.965 avg_d=0.775 std_dev=0.782

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.18	0.10
C2	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.04	0.01	0.02	0.05	0.09	0.21	0.12
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.03	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.11	0.06
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.02	0.07	0.01	0.02	0.08	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.06	0.05	0.04
C4	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.02	0.12	0.20	0.11
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.06	0.00	0.01	0.04	0.08	0.06
C5	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.03	0.02	0.13	0.20	0.11
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.11	0.01	0.13	0.00	0.11	0.06	0.08	0.05	0.02	0.02	0.11	0.01	0.01	0.08	0.05	0.02
C6	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.02	0.03	0.12	0.21	0.12
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.09	0.20	0.11
N3	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.01	0.02	0.04	0.10	0.20	0.11
O2	0.03	0.00	0.09	0.08	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.10	0.01	0.02	0.07	0.09	0.21	0.12
O2'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.11	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.06	0.10	0.08
O3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.02	0.09	0.02	0.08	0.02	0.03	0.10	0.02	0.00	0.06	0.02	0.09	0.12	0.03	0.07
O4	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.02	0.12	0.18	0.10
O4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.09	0.07	0.17	0.10
O5'	0.06	0.05	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.04	0.07	0.03	0.09	0.02	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.06	0.09	0.04	0.06	0.12	0.04	0.13	0.08	0.12	0.09	0.10	0.09	0.06	0.12	0.12	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.21	0.11	0.05	0.20	0.08	0.20	0.05	0.21	0.20	0.20	0.21	0.10	0.03	0.18	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.12	0.06	0.04	0.11	0.06	0.11	0.02	0.12	0.11	0.11	0.12	0.08	0.07	0.10	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.11	0.21	0.13	0.34	0.13	0.33	0.06	0.23	0.15	0.22	0.43	0.18	0.28	0.17	0.14	0.02	0.21	0.21	0.11
C2	0.15	0.15	0.20	0.12	0.33	0.09	0.37	0.05	0.23	0.11	0.07	0.50	0.35	0.26	0.15	0.11	0.08	0.25	0.28	0.17
C2'	0.17	0.15	0.19	0.11	0.35	0.11	0.32	0.05	0.22	0.15	0.25	0.45	0.15	0.28	0.17	0.13	0.04	0.28	0.26	0.16
C3'	0.10	0.08	0.14	0.08	0.24	0.07	0.23	0.09	0.15	0.09	0.16	0.31	0.09	0.23	0.14	0.06	0.10	0.38	0.33	0.25
C4	0.10	0.25	0.14	0.06	0.12	0.03	0.26	0.10	0.17	0.08	0.25	0.19	0.39	0.18	0.09	0.05	0.16	0.35	0.36	0.27
C4'	0.08	0.09	0.12	0.09	0.20	0.08	0.18	0.10	0.11	0.07	0.16	0.25	0.06	0.20	0.16	0.05	0.10	0.32	0.28	0.21
C5	0.11	0.26	0.14	0.07	0.16	0.06	0.23	0.12	0.17	0.12	0.28	0.18	0.36	0.17	0.08	0.09	0.17	0.37	0.37	0.28
C5'	0.01	0.07	0.03	0.07	0.11	0.08	0.11	0.16	0.08	0.06	0.10	0.13	0.07	0.12	0.09	0.05	0.17	0.42	0.37	0.31
C6	0.13	0.20	0.16	0.09	0.15	0.06	0.25	0.07	0.19	0.11	0.17	0.19	0.31	0.20	0.11	0.09	0.12	0.32	0.31	0.22
N1	0.15	0.13	0.19	0.11	0.27	0.09	0.33	0.02	0.22	0.11	0.08	0.37	0.29	0.25	0.14	0.10	0.06	0.25	0.26	0.16
N3	0.12	0.20	0.17	0.09	0.21	0.05	0.34	0.06	0.20	0.08	0.12	0.39	0.39	0.23	0.12	0.06	0.12	0.30	0.32	0.22
O2	0.19	0.15	0.23	0.15	0.42	0.14	0.41	0.08	0.26	0.15	0.19	0.62	0.33	0.30	0.18	0.15	0.07	0.20	0.25	0.15
O2'	0.20	0.23	0.21	0.15	0.43	0.16	0.36	0.11	0.24	0.20	0.37	0.54	0.19	0.32	0.22	0.17	0.04	0.22	0.21	0.12
O3'	0.10	0.13	0.12	0.08	0.25	0.07	0.22	0.11	0.14	0.10	0.20	0.33	0.11	0.22	0.16	0.05	0.13	0.42	0.36	0.28
O4	0.09	0.27	0.13	0.04	0.11	0.05	0.22	0.14	0.15	0.09	0.30	0.15	0.41	0.16	0.07	0.06	0.19	0.39	0.40	0.31
O4'	0.11	0.06	0.17	0.11	0.23	0.10	0.23	0.05	0.16	0.08	0.16	0.28	0.08	0.23	0.16	0.08	0.02	0.22	0.20	0.12
O5'	0.19	0.22	0.20	0.11	0.18	0.09	0.16	0.09	0.16	0.20	0.21	0.18	0.25	0.22	0.01	0.15	0.10	0.33	0.24	0.21
OP1	0.02	0.04	0.07	0.03	0.10	0.09	0.15	0.17	0.12	0.02	0.03	0.13	0.12	0.13	0.02	0.05	0.19	0.25	0.24	0.21
OP2	0.09	0.16	0.09	0.05	0.23	0.08	0.22	0.15	0.18	0.14	0.20	0.26	0.12	0.07	0.01	0.07	0.10	0.38	0.22	0.22
P	0.03	0.01	0.07	0.01	0.07	0.03	0.09	0.08	0.07	0.02	0.03	0.09	0.06	0.10	0.00	0.01	0.07	0.28	0.17	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.04	0.04
C2	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.13	0.14	0.14	0.14
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.06	0.04
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.05	0.03	0.05	0.08	0.05	0.02	0.00	0.01	0.04	0.15	0.06	0.06
C4	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.17	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.07	0.03	0.24	0.26	0.27	0.29
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.08	0.03	0.05	0.11	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.05	0.24	0.26	0.23	0.28
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.17	0.00	0.19	0.00	0.15	0.08	0.12	0.21	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.08	0.01	0.15	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.06	0.04	0.17	0.17	0.11	0.18
N1	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.12	0.12	0.09	0.11
N3	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.12	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.19	0.20	0.22	0.22
N4	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.11	0.02	0.21	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.09	0.04	0.28	0.33	0.35	0.36
O2	0.04	0.00	0.06	0.05	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.09	0.06	0.04	0.10	0.12	0.12	0.10
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.03	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.10	0.05	0.02
O3'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.06	0.03	0.05	0.09	0.06	0.01	0.00	0.01	0.06	0.20	0.07	0.09
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.04	0.04	0.01	0.00	0.05	0.05	0.07	0.05
O5'	0.05	0.13	0.03	0.04	0.24	0.01	0.24	0.00	0.17	0.12	0.19	0.28	0.10	0.01	0.06	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.07	0.14	0.12	0.15	0.26	0.06	0.26	0.04	0.17	0.12	0.20	0.33	0.12	0.10	0.20	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.04	0.14	0.06	0.06	0.27	0.03	0.23	0.01	0.11	0.09	0.22	0.35	0.12	0.05	0.07	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.14	0.04	0.06	0.29	0.01	0.28	0.01	0.18	0.11	0.22	0.36	0.10	0.02	0.09	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00