Doublet Group distance statistics: 49454

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.004, 0.009, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.004 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N3	A	0, -0.001, 0.005, 0.010, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.005 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, -0.002, 0.007, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.007 std_dev=0.009
C4	A	0, -0.002, 0.007, 0.017, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.007 std_dev=0.009
C1'	A	0, -0.001, 0.009, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.011
O4	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C4'	A	0, 0.019, 0.088, 0.158, 0.191 max_d=0.191 avg_d=0.088 std_dev=0.069
C2'	A	0, 0.001, 0.071, 0.141, 0.180 max_d=0.180 avg_d=0.071 std_dev=0.070
O3'	A	0, 0.000, 0.071, 0.142, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.071 std_dev=0.071
C3'	A	0, 0.005, 0.082, 0.159, 0.207 max_d=0.207 avg_d=0.082 std_dev=0.077
O4'	A	0, 0.000, 0.079, 0.157, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.079 std_dev=0.079
O2'	A	0, 0.008, 0.129, 0.250, 0.304 max_d=0.304 avg_d=0.129 std_dev=0.121
C5'	A	0, 0.024, 0.150, 0.276, 0.333 max_d=0.333 avg_d=0.150 std_dev=0.126
O5'	A	0, 0.015, 0.183, 0.352, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.183 std_dev=0.168
OP1	A	0, 0.030, 0.309, 0.587, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.309 std_dev=0.278
P	A	0, 0.002, 0.301, 0.600, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.301 std_dev=0.299
O2'	B	0, -0.066, 0.283, 0.632, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.283 std_dev=0.349
O2	B	0, -0.017, 0.343, 0.704, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.343 std_dev=0.360
N3	B	0, -0.045, 0.350, 0.745, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.350 std_dev=0.395
C2	B	0, -0.059, 0.353, 0.766, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.353 std_dev=0.413
C4	B	0, -0.073, 0.406, 0.884, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.406 std_dev=0.479
C2'	B	0, -0.113, 0.370, 0.853, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.370 std_dev=0.483
N4	B	0, -0.056, 0.431, 0.918, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.431 std_dev=0.487
N1	B	0, -0.116, 0.396, 0.908, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.396 std_dev=0.512
C1'	B	0, -0.139, 0.422, 0.982, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.422 std_dev=0.560
C5	B	0, -0.110, 0.461, 1.031, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.461 std_dev=0.570
C6	B	0, -0.136, 0.448, 1.032, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.448 std_dev=0.584
O4'	B	0, -0.182, 0.515, 1.212, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.515 std_dev=0.697
OP2	A	0, -0.152, 0.546, 1.244, 1.731 max_d=1.731 avg_d=0.546 std_dev=0.698
C5'	B	0, -0.171, 0.529, 1.230, 1.733 max_d=1.733 avg_d=0.529 std_dev=0.700
C4'	B	0, -0.203, 0.546, 1.296, 1.835 max_d=1.835 avg_d=0.546 std_dev=0.749
C3'	B	0, -0.307, 0.673, 1.654, 2.366 max_d=2.366 avg_d=0.673 std_dev=0.980
O5'	B	0, -0.326, 0.728, 1.782, 2.549 max_d=2.549 avg_d=0.728 std_dev=1.054
OP1	B	0, -0.259, 0.809, 1.877, 2.647 max_d=2.647 avg_d=0.809 std_dev=1.068
P	B	0, -0.316, 0.767, 1.850, 2.636 max_d=2.636 avg_d=0.767 std_dev=1.083
OP2	B	0, -0.340, 0.807, 1.954, 2.788 max_d=2.788 avg_d=0.807 std_dev=1.147
O3'	B	0, -0.394, 0.869, 2.132, 3.047 max_d=3.047 avg_d=0.869 std_dev=1.263

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.03	0.46	0.17
C2	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.04	0.08	0.38	0.19
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.19	0.03	0.54	0.15
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.09	0.54	0.12
C4	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.03	0.14	0.17	0.17
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.41	0.09
C5	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.05	0.14	0.10	0.15
C5'	0.03	0.06	0.05	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.07	0.06	0.07	0.05	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.22	0.01
C6	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.11	0.21	0.16
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.36	0.18
N3	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.29	0.18
O2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.02	0.02	0.04	0.06	0.06	0.45	0.19
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.06	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.07	0.09	0.00	0.03	0.06	0.01	0.22	0.04	0.57	0.16
O3'	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.14	0.11	0.55	0.11
O4	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.00	0.02	0.04	0.16	0.11	0.16
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.10	0.05	0.42	0.17
O5'	0.04	0.04	0.19	0.17	0.03	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.02	0.06	0.22	0.14	0.04	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.03	0.08	0.03	0.09	0.14	0.06	0.14	0.05	0.11	0.07	0.11	0.06	0.04	0.11	0.16	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.46	0.38	0.54	0.54	0.17	0.41	0.10	0.22	0.21	0.36	0.29	0.45	0.57	0.55	0.11	0.42	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.19	0.15	0.12	0.17	0.09	0.15	0.01	0.16	0.18	0.18	0.19	0.16	0.11	0.16	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.12	0.25	0.20	0.08	0.16	0.09	0.07	0.10	0.13	0.10	0.05	0.13	0.04	0.12	0.11	0.08	0.07	0.19	0.08
C2	0.27	0.20	0.36	0.43	0.10	0.33	0.14	0.20	0.21	0.25	0.13	0.05	0.21	0.04	0.24	0.27	0.19	0.12	0.11	0.05
C2'	0.10	0.09	0.23	0.15	0.05	0.14	0.04	0.05	0.06	0.10	0.08	0.03	0.11	0.06	0.15	0.08	0.05	0.09	0.27	0.15
C3'	0.08	0.10	0.21	0.09	0.09	0.10	0.08	0.04	0.08	0.10	0.11	0.09	0.11	0.03	0.28	0.05	0.06	0.08	0.23	0.12
C4	0.26	0.09	0.37	0.49	0.18	0.36	0.12	0.18	0.06	0.17	0.08	0.30	0.16	0.07	0.40	0.28	0.09	0.07	0.26	0.11
C4'	0.07	0.09	0.20	0.06	0.09	0.07	0.08	0.03	0.07	0.09	0.10	0.10	0.10	0.03	0.36	0.03	0.06	0.07	0.20	0.10
C5	0.13	0.03	0.27	0.28	0.22	0.22	0.19	0.07	0.08	0.03	0.14	0.28	0.09	0.07	0.14	0.13	0.08	0.11	0.37	0.22
C5'	0.05	0.07	0.19	0.08	0.07	0.04	0.05	0.03	0.04	0.06	0.08	0.07	0.08	0.09	0.45	0.03	0.07	0.07	0.24	0.13
C6	0.10	0.04	0.24	0.19	0.12	0.16	0.10	0.05	0.03	0.05	0.08	0.18	0.09	0.05	0.08	0.09	0.07	0.10	0.32	0.18
N1	0.17	0.12	0.29	0.27	0.02	0.22	0.04	0.10	0.09	0.15	0.06	0.06	0.15	0.04	0.07	0.16	0.08	0.07	0.21	0.09
N3	0.31	0.20	0.39	0.53	0.06	0.39	0.10	0.23	0.20	0.26	0.08	0.17	0.21	0.05	0.40	0.33	0.20	0.12	0.13	0.04
O2	0.30	0.25	0.37	0.47	0.21	0.36	0.25	0.23	0.28	0.29	0.21	0.13	0.23	0.04	0.27	0.31	0.26	0.17	0.05	0.10
O2'	0.11	0.10	0.23	0.20	0.06	0.17	0.06	0.06	0.08	0.11	0.08	0.03	0.12	0.11	0.06	0.11	0.04	0.09	0.27	0.15
O3'	0.13	0.15	0.25	0.15	0.17	0.14	0.16	0.07	0.15	0.15	0.17	0.18	0.14	0.01	0.22	0.10	0.09	0.08	0.14	0.05
O4	0.29	0.07	0.40	0.62	0.26	0.43	0.22	0.23	0.07	0.16	0.13	0.38	0.14	0.09	0.61	0.33	0.10	0.07	0.30	0.12
O4'	0.08	0.10	0.20	0.09	0.09	0.09	0.08	0.04	0.08	0.09	0.10	0.08	0.10	0.02	0.29	0.05	0.06	0.07	0.19	0.09
O5'	0.26	0.24	0.09	0.30	0.20	0.24	0.22	0.29	0.24	0.24	0.21	0.18	0.25	0.17	0.64	0.30	0.37	0.34	0.53	0.43
OP1	0.32	0.22	0.20	0.50	0.21	0.34	0.27	0.38	0.31	0.27	0.17	0.17	0.18	0.25	0.87	0.36	0.52	0.48	0.68	0.57
OP2	0.04	0.11	0.23	0.09	0.29	0.18	0.27	0.08	0.17	0.07	0.23	0.38	0.03	0.12	0.09	0.05	0.15	0.10	0.44	0.25
P	0.19	0.18	0.06	0.28	0.25	0.15	0.29	0.21	0.27	0.21	0.20	0.26	0.12	0.13	0.58	0.21	0.38	0.34	0.60	0.45

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.24	0.00	0.04	0.03	0.16	0.11
C2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.27	0.03	0.03	0.03	0.16	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.10	0.18	0.11	0.02	0.03	0.04	0.10	0.00	0.01	0.02	0.37	0.28	0.47	0.41
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.13	0.00	0.17	0.01	0.16	0.08	0.08	0.14	0.04	0.01	0.00	0.04	0.08	0.05	0.01	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.29	0.09	0.02	0.07	0.07	0.18	0.11
C4'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.22	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.01
C5	0.01	0.00	0.10	0.17	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.03	0.06	0.08	0.09	0.19	0.13
C5'	0.06	0.08	0.18	0.01	0.10	0.00	0.10	0.00	0.10	0.09	0.09	0.10	0.07	0.03	0.17	0.01	0.01	0.14	0.02	0.02
C6	0.00	0.00	0.11	0.16	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.32	0.02	0.07	0.06	0.08	0.19	0.13
N1	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.15	0.01	0.03	0.04	0.17	0.11
N3	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.01	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.21	0.02	0.05	0.04	0.17	0.09
N4	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.32	0.08	0.02	0.09	0.08	0.17	0.10
O2	0.01	0.00	0.10	0.04	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.40	0.07	0.01	0.02	0.15	0.07
O2'	0.03	0.08	0.00	0.01	0.29	0.22	0.36	0.03	0.32	0.15	0.18	0.32	0.09	0.00	0.05	0.12	0.32	0.23	0.59	0.40
O3'	0.24	0.27	0.01	0.00	0.09	0.01	0.03	0.17	0.02	0.15	0.21	0.08	0.40	0.05	0.00	0.15	0.09	0.36	0.21	0.18
O4'	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.07	0.12	0.15	0.00	0.17	0.17	0.07	0.09
O5'	0.04	0.03	0.37	0.08	0.07	0.01	0.08	0.01	0.06	0.03	0.05	0.09	0.01	0.32	0.09	0.17	0.00	0.00	0.03	0.00
OP1	0.03	0.03	0.28	0.05	0.07	0.11	0.09	0.14	0.08	0.04	0.04	0.08	0.02	0.23	0.36	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.16	0.16	0.47	0.01	0.18	0.01	0.19	0.02	0.19	0.17	0.17	0.17	0.15	0.59	0.21	0.07	0.03	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.09	0.41	0.05	0.11	0.01	0.13	0.02	0.13	0.11	0.09	0.10	0.07	0.40	0.18	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00