Doublet Group distance statistics: 49455

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.004, 0.007, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.003
C2	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C5	A	0, -0.001, 0.004, 0.009, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.004 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C4	A	0, -0.004, 0.010, 0.024, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.010 std_dev=0.014
C1'	A	0, -0.001, 0.013, 0.027, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.014
O4	A	0, -0.005, 0.015, 0.036, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.015 std_dev=0.021
O4'	A	0, 0.038, 0.124, 0.209, 0.230 max_d=0.230 avg_d=0.124 std_dev=0.085
C2'	A	0, 0.045, 0.130, 0.216, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.130 std_dev=0.086
C3'	A	0, 0.070, 0.170, 0.271, 0.255 max_d=0.255 avg_d=0.170 std_dev=0.101
O3'	A	0, 0.038, 0.157, 0.275, 0.330 max_d=0.330 avg_d=0.157 std_dev=0.118
O2'	A	0, 0.078, 0.216, 0.353, 0.380 max_d=0.380 avg_d=0.216 std_dev=0.137
C4'	A	0, 0.097, 0.239, 0.381, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.239 std_dev=0.142
N3	B	0, 0.131, 0.326, 0.521, 0.483 max_d=0.483 avg_d=0.326 std_dev=0.195
C4	B	0, 0.094, 0.303, 0.512, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.303 std_dev=0.209
N4	B	0, 0.066, 0.292, 0.518, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.292 std_dev=0.226
C5'	A	0, 0.165, 0.417, 0.670, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.417 std_dev=0.253
C2	B	0, 0.132, 0.386, 0.639, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.386 std_dev=0.254
P	A	0, 0.214, 0.516, 0.819, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.516 std_dev=0.302
N1	B	0, 0.158, 0.469, 0.780, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.469 std_dev=0.311
O2	B	0, 0.127, 0.455, 0.784, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.455 std_dev=0.329
OP2	A	0, 0.211, 0.543, 0.875, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.543 std_dev=0.332
C5	B	0, 0.065, 0.400, 0.736, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.400 std_dev=0.336
O5'	A	0, 0.154, 0.502, 0.850, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.502 std_dev=0.348
OP1	A	0, 0.238, 0.589, 0.940, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.589 std_dev=0.351
C6	B	0, 0.108, 0.490, 0.871, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.490 std_dev=0.382
O5'	B	0, 0.203, 0.634, 1.065, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.634 std_dev=0.431
C1'	B	0, 0.183, 0.625, 1.067, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.625 std_dev=0.442
C3'	B	0, 0.073, 0.522, 0.970, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.522 std_dev=0.448
P	B	0, 0.261, 0.716, 1.172, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.716 std_dev=0.456
C2'	B	0, 0.147, 0.619, 1.090, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.619 std_dev=0.472
OP2	B	0, 0.276, 0.760, 1.243, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.760 std_dev=0.483
C4'	B	0, 0.180, 0.677, 1.174, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.677 std_dev=0.497
O4'	B	0, 0.210, 0.710, 1.211, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.710 std_dev=0.501
O3'	B	0, 0.083, 0.633, 1.182, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.633 std_dev=0.550
C5'	B	0, 0.222, 0.907, 1.593, 1.763 max_d=1.763 avg_d=0.907 std_dev=0.685
O2'	B	0, 0.180, 0.875, 1.570, 1.765 max_d=1.765 avg_d=0.875 std_dev=0.695
OP1	B	0, 0.340, 1.082, 1.824, 1.959 max_d=1.959 avg_d=1.082 std_dev=0.742

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.06	0.21	0.14	0.08
C2	0.01	0.00	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.02	0.02	0.16	0.16	0.19	0.13
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.06	0.10	0.00	0.01	0.04	0.01	0.14	0.25	0.13	0.09
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.12	0.23	0.11	0.08
C4	0.03	0.01	0.04	0.05	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.17	0.15	0.22	0.17
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.00	0.17	0.10	0.06
C5	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.12	0.10	0.16	0.12
C5'	0.03	0.10	0.02	0.00	0.17	0.00	0.17	0.00	0.14	0.10	0.13	0.07	0.02	0.02	0.18	0.01	0.01	0.10	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.04	0.09	0.11	0.14	0.06
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.11	0.15	0.15	0.08
N3	0.02	0.00	0.06	0.04	0.00	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.02	0.02	0.18	0.17	0.23	0.16
O2	0.01	0.00	0.10	0.04	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.05	0.02	0.04	0.16	0.18	0.19	0.13
O2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.04	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.27	0.15	0.10
O3'	0.03	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.23	0.12	0.08
O4	0.03	0.02	0.04	0.05	0.00	0.07	0.01	0.18	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.17	0.17	0.25	0.20
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.03	0.00	0.07	0.20	0.18	0.11
O5'	0.06	0.16	0.14	0.12	0.17	0.00	0.12	0.01	0.09	0.11	0.18	0.16	0.16	0.09	0.17	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.21	0.16	0.25	0.23	0.15	0.17	0.10	0.10	0.11	0.15	0.17	0.18	0.27	0.23	0.17	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.19	0.13	0.11	0.22	0.10	0.16	0.02	0.14	0.15	0.23	0.19	0.15	0.12	0.25	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.13	0.09	0.08	0.17	0.06	0.12	0.01	0.06	0.08	0.16	0.13	0.10	0.08	0.20	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.10	0.16	0.21	0.07	0.16	0.15	0.37	0.17	0.14	0.11	0.05	0.17	0.35	0.26	0.12	0.30	0.13	0.44	0.13
C2	0.11	0.15	0.14	0.26	0.09	0.29	0.07	0.51	0.08	0.10	0.17	0.09	0.21	0.22	0.28	0.18	0.23	0.34	0.51	0.25
C2'	0.19	0.08	0.14	0.22	0.06	0.18	0.15	0.44	0.17	0.12	0.11	0.06	0.18	0.37	0.28	0.07	0.26	0.15	0.43	0.14
C3'	0.27	0.05	0.19	0.15	0.06	0.07	0.18	0.31	0.22	0.17	0.06	0.05	0.11	0.45	0.23	0.14	0.32	0.03	0.39	0.06
C4	0.19	0.23	0.20	0.31	0.07	0.42	0.08	0.66	0.11	0.17	0.21	0.05	0.31	0.23	0.29	0.33	0.19	0.40	0.50	0.30
C4'	0.32	0.05	0.21	0.10	0.08	0.06	0.22	0.19	0.26	0.21	0.04	0.06	0.08	0.48	0.19	0.22	0.39	0.11	0.34	0.03
C5	0.20	0.24	0.24	0.30	0.05	0.37	0.20	0.60	0.18	0.16	0.20	0.05	0.35	0.31	0.30	0.26	0.23	0.23	0.43	0.20
C5'	0.39	0.08	0.29	0.03	0.17	0.10	0.34	0.12	0.38	0.28	0.06	0.11	0.13	0.57	0.13	0.28	0.45	0.28	0.21	0.15
C6	0.21	0.19	0.22	0.26	0.07	0.27	0.21	0.49	0.21	0.16	0.17	0.04	0.31	0.34	0.29	0.17	0.26	0.15	0.42	0.15
N1	0.16	0.14	0.17	0.24	0.06	0.24	0.14	0.46	0.14	0.12	0.15	0.04	0.23	0.30	0.27	0.13	0.27	0.20	0.46	0.17
N3	0.14	0.19	0.16	0.28	0.11	0.36	0.06	0.60	0.10	0.14	0.20	0.09	0.25	0.20	0.28	0.27	0.19	0.43	0.52	0.30
O2	0.09	0.12	0.12	0.25	0.11	0.27	0.07	0.49	0.08	0.08	0.14	0.13	0.16	0.20	0.27	0.15	0.23	0.37	0.52	0.26
O2'	0.16	0.12	0.13	0.26	0.10	0.25	0.12	0.53	0.13	0.11	0.14	0.11	0.19	0.33	0.32	0.11	0.20	0.28	0.49	0.22
O3'	0.28	0.08	0.17	0.15	0.06	0.08	0.12	0.28	0.17	0.16	0.07	0.10	0.08	0.44	0.23	0.17	0.33	0.07	0.44	0.09
O4	0.25	0.26	0.22	0.33	0.08	0.50	0.06	0.76	0.14	0.22	0.21	0.06	0.32	0.22	0.30	0.44	0.18	0.53	0.53	0.38
O4'	0.26	0.05	0.16	0.17	0.07	0.09	0.19	0.25	0.21	0.17	0.05	0.06	0.12	0.39	0.24	0.16	0.35	0.03	0.40	0.04
O5'	0.10	0.21	0.04	0.29	0.05	0.22	0.22	0.43	0.21	0.05	0.20	0.05	0.45	0.27	0.38	0.05	0.22	0.09	0.34	0.08
OP1	0.26	0.14	0.25	0.13	0.03	0.08	0.21	0.36	0.26	0.13	0.20	0.09	0.32	0.57	0.20	0.09	0.27	0.18	0.26	0.07
OP2	0.15	0.29	0.18	0.33	0.10	0.35	0.22	0.61	0.23	0.12	0.29	0.10	0.51	0.37	0.38	0.21	0.18	0.13	0.31	0.15
P	0.23	0.14	0.21	0.18	0.05	0.13	0.27	0.38	0.30	0.13	0.16	0.02	0.36	0.49	0.26	0.07	0.27	0.19	0.23	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.00	0.00	0.11	0.02	0.61	0.21
C2	0.04	0.00	0.16	0.21	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.25	0.08	0.28	0.04	0.55	0.13
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.05	0.00	0.18	0.01	0.20	0.01	0.09	0.05	0.30	0.00	0.01	0.01	0.25	0.32	0.30	0.05
C3'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.00	0.23	0.01	0.17	0.02	0.34	0.01	0.00	0.01	0.38	0.51	0.10	0.24
C4	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.40	0.13	0.46	0.10
C4'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.07	0.05	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.18	0.45	0.10
C5	0.01	0.01	0.18	0.18	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.13	0.23	0.07	0.44	0.11	0.44	0.09
C5'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.13	0.00	0.08	0.00	0.04	0.06	0.14	0.15	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.21	0.39	0.00
C6	0.00	0.00	0.20	0.23	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.12	0.27	0.08	0.41	0.05	0.52	0.11
N1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.28	0.02	0.56	0.14
N3	0.03	0.00	0.09	0.17	0.00	0.07	0.00	0.14	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.04	0.33	0.10	0.52	0.12
N4	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.02	0.02	0.42	0.17	0.39	0.08
O2	0.08	0.00	0.30	0.34	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.14	0.43	0.16	0.24	0.02	0.55	0.12
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.07	0.02	0.13	0.02	0.12	0.02	0.01	0.08	0.14	0.00	0.01	0.05	0.02	0.24	0.41	0.11
O3'	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00	0.23	0.01	0.27	0.01	0.21	0.02	0.43	0.01	0.00	0.00	0.36	0.73	0.10	0.39
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.04	0.02	0.16	0.05	0.00	0.00	0.07	0.10	0.73	0.34
O5'	0.11	0.28	0.25	0.38	0.40	0.00	0.44	0.01	0.41	0.28	0.33	0.42	0.24	0.02	0.36	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.02	0.04	0.32	0.51	0.13	0.18	0.11	0.21	0.05	0.02	0.10	0.17	0.02	0.24	0.73	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.61	0.55	0.30	0.10	0.46	0.45	0.44	0.39	0.52	0.56	0.52	0.39	0.55	0.41	0.10	0.73	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.21	0.13	0.05	0.24	0.10	0.10	0.09	0.00	0.11	0.14	0.12	0.08	0.12	0.11	0.39	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00