Doublet Group distance statistics: 49457

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C5	A	0, 0.000, 0.032, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.000, 0.038, 0.075, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.038 std_dev=0.038
O2	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
O4	A	0, 0.000, 0.047, 0.093, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.047 std_dev=0.047
C4	B	0, 0.000, 0.063, 0.127, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.063 std_dev=0.063
O4'	A	0, 0.000, 0.094, 0.189, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.094 std_dev=0.094
N3	B	0, 0.000, 0.191, 0.381, 0.381 max_d=0.381 avg_d=0.191 std_dev=0.191
C5	B	0, 0.000, 0.201, 0.403, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.201 std_dev=0.201
N4	B	0, 0.000, 0.245, 0.491, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.245 std_dev=0.245
C3'	A	0, 0.000, 0.259, 0.519, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.259 std_dev=0.259
OP1	A	0, 0.000, 0.280, 0.560, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.280 std_dev=0.280
C4'	A	0, 0.000, 0.322, 0.644, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.322 std_dev=0.322
C6	B	0, 0.000, 0.328, 0.656, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.328 std_dev=0.328
C2	B	0, 0.000, 0.330, 0.660, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.330 std_dev=0.330
O2'	A	0, 0.000, 0.361, 0.722, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.361 std_dev=0.361
N1	B	0, 0.000, 0.385, 0.769, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.385 std_dev=0.385
C2'	B	0, 0.000, 0.398, 0.796, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.398 std_dev=0.398
O3'	A	0, 0.000, 0.481, 0.963, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.481 std_dev=0.481
O2	B	0, 0.000, 0.528, 1.056, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.528 std_dev=0.528
C1'	B	0, 0.000, 0.559, 1.117, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.559 std_dev=0.559
C5'	A	0, 0.000, 0.621, 1.242, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.621 std_dev=0.621
O5'	A	0, 0.000, 0.709, 1.418, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.709 std_dev=0.709
O4'	B	0, 0.000, 0.877, 1.753, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.877 std_dev=0.877
P	A	0, 0.000, 0.996, 1.992, 1.992 max_d=1.992 avg_d=0.996 std_dev=0.996
O2'	B	0, 0.000, 1.050, 2.100, 2.100 max_d=2.100 avg_d=1.050 std_dev=1.050
OP1	B	0, 0.000, 1.083, 2.166, 2.166 max_d=2.166 avg_d=1.083 std_dev=1.083
C4'	B	0, 0.000, 1.216, 2.433, 2.433 max_d=2.433 avg_d=1.216 std_dev=1.216
C3'	B	0, 0.000, 1.327, 2.654, 2.654 max_d=2.654 avg_d=1.327 std_dev=1.327
C5'	B	0, 0.000, 1.337, 2.674, 2.674 max_d=2.674 avg_d=1.337 std_dev=1.337
P	B	0, 0.000, 1.370, 2.739, 2.739 max_d=2.739 avg_d=1.370 std_dev=1.370
O5'	B	0, 0.000, 1.533, 3.066, 3.066 max_d=3.066 avg_d=1.533 std_dev=1.533
OP2	B	0, 0.000, 1.820, 3.641, 3.641 max_d=3.641 avg_d=1.820 std_dev=1.820
O3'	B	0, 0.000, 2.076, 4.153, 4.153 max_d=4.153 avg_d=2.076 std_dev=2.076
OP2	A	0, 0.000, 2.289, 4.579, 4.579 max_d=4.579 avg_d=2.289 std_dev=2.289

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.12	0.09	0.04
C2	0.02	0.00	0.00	0.09	0.03	0.06	0.03	0.15	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.07	0.04	0.04	0.20	0.14	0.55	0.26
C2'	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.07	0.06	0.03
C3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.16	0.01	0.17	0.02	0.14	0.09	0.12	0.07	0.04	0.02	0.18	0.00	0.07	0.02	0.00	0.06
C4	0.04	0.03	0.02	0.16	0.00	0.15	0.01	0.29	0.02	0.03	0.02	0.03	0.09	0.18	0.01	0.08	0.35	0.18	0.98	0.47
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.15	0.00	0.17	0.00	0.15	0.08	0.10	0.03	0.08	0.01	0.17	0.00	0.02	0.12	0.21	0.04
C5	0.03	0.03	0.03	0.17	0.01	0.17	0.00	0.32	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.20	0.03	0.07	0.35	0.19	0.95	0.48
C5'	0.02	0.15	0.03	0.02	0.29	0.00	0.32	0.00	0.27	0.16	0.22	0.09	0.07	0.01	0.33	0.01	0.00	0.30	0.34	0.01
C6	0.02	0.02	0.02	0.14	0.02	0.15	0.01	0.27	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.17	0.03	0.06	0.27	0.17	0.67	0.35
N1	0.00	0.01	0.00	0.09	0.03	0.08	0.03	0.16	0.02	0.00	0.01	0.02	0.07	0.09	0.04	0.04	0.17	0.15	0.45	0.22
N3	0.02	0.01	0.00	0.12	0.02	0.10	0.02	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.12	0.03	0.05	0.28	0.17	0.78	0.37
O2	0.03	0.01	0.01	0.07	0.03	0.03	0.04	0.09	0.03	0.02	0.01	0.00	0.19	0.02	0.04	0.04	0.15	0.12	0.42	0.19
O2'	0.01	0.15	0.00	0.04	0.09	0.08	0.03	0.07	0.01	0.07	0.14	0.19	0.00	0.01	0.08	0.08	0.08	0.09	0.02	0.01
O3'	0.00	0.07	0.00	0.02	0.18	0.01	0.20	0.01	0.17	0.09	0.12	0.02	0.01	0.00	0.21	0.00	0.11	0.19	0.09	0.07
O4	0.05	0.04	0.03	0.18	0.01	0.17	0.03	0.33	0.03	0.04	0.03	0.04	0.08	0.21	0.00	0.09	0.39	0.17	1.13	0.54
O4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.05	0.04	0.08	0.00	0.09	0.00	0.09	0.07	0.10	0.01
O5'	0.01	0.20	0.05	0.07	0.35	0.02	0.35	0.00	0.27	0.17	0.28	0.15	0.08	0.11	0.39	0.09	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.12	0.14	0.07	0.02	0.18	0.12	0.19	0.30	0.17	0.15	0.17	0.12	0.09	0.19	0.17	0.07	0.03	0.00	0.05	0.02
OP2	0.09	0.55	0.06	0.00	0.98	0.21	0.95	0.34	0.67	0.45	0.78	0.42	0.02	0.09	1.13	0.10	0.01	0.05	0.00	0.01
P	0.04	0.26	0.03	0.06	0.47	0.04	0.48	0.01	0.35	0.22	0.37	0.19	0.01	0.07	0.54	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.09	0.03	0.33	0.04	0.21	0.01	0.15	0.02	0.07	0.08	0.02	0.13	0.57	0.32	0.13	0.06	0.56	0.48	0.29
C2	0.06	0.06	0.04	0.19	0.04	0.10	0.05	0.10	0.01	0.03	0.03	0.08	0.09	0.68	0.04	0.03	0.17	0.46	0.44	0.19
C2'	0.05	0.07	0.05	0.32	0.04	0.22	0.02	0.15	0.02	0.07	0.06	0.03	0.10	0.55	0.39	0.13	0.01	0.58	0.37	0.29
C3'	0.07	0.11	0.03	0.40	0.08	0.29	0.07	0.21	0.07	0.11	0.10	0.08	0.13	0.50	0.59	0.18	0.00	0.62	0.17	0.24
C4	0.03	0.03	0.03	0.36	0.04	0.25	0.12	0.29	0.11	0.04	0.06	0.03	0.08	0.58	0.22	0.15	0.45	0.30	0.15	0.07
C4'	0.08	0.11	0.01	0.47	0.06	0.32	0.04	0.24	0.06	0.11	0.08	0.04	0.14	0.43	0.69	0.21	0.00	0.62	0.21	0.27
C5	0.09	0.01	0.06	0.47	0.00	0.34	0.11	0.37	0.13	0.09	0.04	0.06	0.01	0.51	0.40	0.23	0.52	0.29	0.04	0.12
C5'	0.10	0.15	0.03	0.50	0.12	0.36	0.11	0.29	0.12	0.15	0.14	0.12	0.17	0.38	0.78	0.24	0.06	0.67	0.07	0.19
C6	0.11	0.05	0.08	0.49	0.01	0.36	0.08	0.35	0.12	0.11	0.00	0.05	0.05	0.50	0.46	0.24	0.43	0.37	0.13	0.02
N1	0.03	0.02	0.02	0.34	0.03	0.22	0.04	0.20	0.05	0.05	0.01	0.02	0.02	0.60	0.27	0.13	0.23	0.47	0.36	0.15
N3	0.05	0.08	0.03	0.22	0.04	0.13	0.08	0.16	0.04	0.02	0.06	0.08	0.13	0.65	0.05	0.05	0.29	0.39	0.33	0.08
O2	0.12	0.09	0.08	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.08	0.01	0.11	0.14	0.72	0.14	0.06	0.03	0.51	0.57	0.30
O2'	0.02	0.00	0.08	0.25	0.03	0.19	0.03	0.13	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.50	0.31	0.10	0.08	0.47	0.42	0.30
O3'	0.01	0.05	0.06	0.28	0.06	0.19	0.04	0.13	0.03	0.04	0.06	0.08	0.06	0.54	0.53	0.10	0.15	0.65	0.14	0.30
O4	0.03	0.05	0.03	0.36	0.04	0.25	0.14	0.31	0.12	0.04	0.07	0.04	0.11	0.57	0.20	0.15	0.52	0.24	0.08	0.13
O4'	0.15	0.16	0.09	0.52	0.05	0.36	0.02	0.27	0.08	0.16	0.11	0.01	0.20	0.40	0.59	0.26	0.14	0.56	0.38	0.25
O5'	0.04	0.10	0.08	0.45	0.08	0.29	0.05	0.23	0.05	0.08	0.10	0.09	0.12	0.46	0.69	0.17	0.10	0.78	0.07	0.20
OP1	0.25	0.05	0.19	0.88	0.17	0.75	0.09	0.80	0.08	0.15	0.10	0.30	0.11	0.14	1.22	0.49	0.71	0.04	0.89	0.51
OP2	0.12	0.19	0.35	0.06	0.40	0.07	0.30	0.17	0.12	0.09	0.33	0.54	0.16	0.66	0.31	0.04	0.28	1.29	0.09	0.49
P	0.23	0.28	0.05	0.60	0.30	0.50	0.32	0.49	0.31	0.29	0.28	0.30	0.27	0.33	0.84	0.41	0.40	0.52	0.61	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.20	0.01	0.03	0.14	0.81	0.28
C2	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.31	0.18	0.02	0.20	0.23	0.72	0.20
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.12	0.08	0.00	0.04	0.02	0.15	0.00	0.02	0.01	0.29	0.39	0.86	0.50
C3'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.20	0.00	0.24	0.01	0.22	0.14	0.15	0.22	0.04	0.06	0.01	0.03	0.09	0.11	0.30	0.09
C4	0.00	0.01	0.02	0.20	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.42	0.00	0.05	0.34	0.33	0.60	0.14
C4'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.10	0.00	0.14	0.01	0.13	0.08	0.07	0.11	0.03	0.25	0.02	0.01	0.01	0.27	0.43	0.07
C5	0.01	0.02	0.07	0.24	0.00	0.14	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.39	0.10	0.08	0.39	0.32	0.59	0.11
C5'	0.02	0.05	0.12	0.01	0.11	0.01	0.13	0.00	0.12	0.06	0.07	0.12	0.03	0.13	0.15	0.02	0.01	0.41	0.26	0.01
C6	0.01	0.02	0.08	0.22	0.00	0.13	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.33	0.08	0.08	0.34	0.26	0.70	0.16
N1	0.00	0.01	0.00	0.14	0.00	0.08	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.27	0.07	0.04	0.21	0.21	0.75	0.21
N3	0.01	0.00	0.04	0.15	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.37	0.11	0.03	0.27	0.29	0.67	0.17
N4	0.01	0.00	0.02	0.22	0.00	0.11	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.45	0.02	0.05	0.37	0.36	0.52	0.10
O2	0.05	0.01	0.15	0.04	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.17	0.31	0.01	0.13	0.17	0.72	0.21
O2'	0.04	0.31	0.00	0.06	0.42	0.25	0.39	0.13	0.33	0.27	0.37	0.45	0.17	0.00	0.09	0.12	0.18	0.27	0.85	0.41
O3'	0.20	0.18	0.02	0.01	0.00	0.02	0.10	0.15	0.08	0.07	0.11	0.02	0.31	0.09	0.00	0.13	0.04	0.48	0.04	0.16
O4'	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.08	0.02	0.08	0.04	0.03	0.05	0.01	0.12	0.13	0.00	0.18	0.12	0.66	0.12
O5'	0.03	0.20	0.29	0.09	0.34	0.01	0.39	0.01	0.34	0.21	0.27	0.37	0.13	0.18	0.04	0.18	0.00	0.06	0.07	0.01
OP1	0.14	0.23	0.39	0.11	0.33	0.27	0.32	0.41	0.26	0.21	0.29	0.36	0.17	0.27	0.48	0.12	0.06	0.00	0.01	0.00
OP2	0.81	0.72	0.86	0.30	0.60	0.43	0.59	0.26	0.70	0.75	0.67	0.52	0.72	0.85	0.04	0.66	0.07	0.01	0.00	0.01
P	0.28	0.20	0.50	0.09	0.14	0.07	0.11	0.01	0.16	0.21	0.17	0.10	0.21	0.41	0.16	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00