Doublet Group distance statistics: 49460

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 17, 14, 25, 14, 3, 4, 4, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.008, 0.021, 0.033, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.025 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.026, 0.054, 0.082, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.054 std_dev=0.028
O4	A	0, 0.020, 0.065, 0.111, 0.235 max_d=0.235 avg_d=0.065 std_dev=0.046
C2'	A	0, 0.060, 0.217, 0.373, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.217 std_dev=0.157
O4'	A	0, -0.003, 0.171, 0.344, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.171 std_dev=0.173
C2'	B	0, 0.189, 0.395, 0.601, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.395 std_dev=0.206
N9	B	0, 0.172, 0.384, 0.596, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.384 std_dev=0.212
C4	B	0, 0.169, 0.383, 0.597, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.383 std_dev=0.214
C1'	B	0, 0.213, 0.428, 0.643, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.428 std_dev=0.215
C8	B	0, 0.212, 0.439, 0.666, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.439 std_dev=0.227
N3	B	0, 0.212, 0.441, 0.671, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.441 std_dev=0.229
C3'	B	0, 0.190, 0.428, 0.665, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.428 std_dev=0.238
C5	B	0, 0.173, 0.412, 0.651, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.412 std_dev=0.239
N7	B	0, 0.209, 0.456, 0.702, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.456 std_dev=0.247
O2'	B	0, 0.249, 0.496, 0.743, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.496 std_dev=0.247
C2	B	0, 0.263, 0.511, 0.759, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.511 std_dev=0.248
N1	B	0, 0.276, 0.533, 0.790, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.533 std_dev=0.257
O4'	B	0, 0.255, 0.515, 0.774, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.515 std_dev=0.260
C6	B	0, 0.218, 0.483, 0.748, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.483 std_dev=0.265
O3'	B	0, 0.213, 0.481, 0.748, 1.523 max_d=1.523 avg_d=0.481 std_dev=0.267
O2'	A	0, 0.053, 0.336, 0.618, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.336 std_dev=0.283
C4'	B	0, 0.239, 0.532, 0.825, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.532 std_dev=0.293
O5'	A	0, 0.128, 0.429, 0.731, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.429 std_dev=0.302
P	A	0, 0.160, 0.468, 0.776, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.468 std_dev=0.308
C4'	A	0, 0.017, 0.331, 0.645, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.331 std_dev=0.314
N6	B	0, 0.251, 0.569, 0.887, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.569 std_dev=0.318
OP2	A	0, 0.185, 0.510, 0.835, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.510 std_dev=0.325
C5'	A	0, 0.102, 0.451, 0.799, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.451 std_dev=0.348
C5'	B	0, 0.323, 0.675, 1.027, 2.042 max_d=2.042 avg_d=0.675 std_dev=0.352
C3'	A	0, 0.031, 0.406, 0.781, 1.950 max_d=1.950 avg_d=0.406 std_dev=0.375
OP1	A	0, 0.181, 0.557, 0.932, 1.818 max_d=1.818 avg_d=0.557 std_dev=0.376
O5'	B	0, 0.295, 0.741, 1.187, 2.331 max_d=2.331 avg_d=0.741 std_dev=0.446
P	B	0, 0.425, 0.993, 1.560, 2.912 max_d=2.912 avg_d=0.993 std_dev=0.568
O3'	A	0, 0.024, 0.674, 1.324, 3.240 max_d=3.240 avg_d=0.674 std_dev=0.650
OP2	B	0, 0.447, 1.102, 1.758, 3.414 max_d=3.414 avg_d=1.102 std_dev=0.655
OP1	B	0, 0.542, 1.202, 1.862, 3.490 max_d=3.490 avg_d=1.202 std_dev=0.660

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.15	0.03	0.01	0.12	0.12	0.19	0.11
C2	0.02	0.00	0.09	0.13	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.12	0.02	0.06	0.14	0.13	0.17	0.12
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.10	0.08	0.03	0.08	0.15	0.00	0.02	0.07	0.01	0.24	0.28	0.30	0.25
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.22	0.00	0.23	0.02	0.20	0.13	0.18	0.11	0.02	0.01	0.24	0.02	0.13	0.18	0.11	0.10
C4	0.03	0.01	0.06	0.22	0.00	0.10	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.19	0.17	0.01	0.04	0.21	0.19	0.21	0.18
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.12	0.06	0.06	0.05	0.16	0.03	0.11	0.01	0.01	0.08	0.13	0.03
C5	0.02	0.01	0.07	0.23	0.01	0.13	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.20	0.01	0.05	0.22	0.19	0.20	0.19
C5'	0.05	0.08	0.10	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.13	0.08	0.10	0.08	0.07	0.11	0.15	0.02	0.01	0.08	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.20	0.01	0.12	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.16	0.01	0.06	0.18	0.14	0.17	0.14
N1	0.01	0.01	0.03	0.13	0.02	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.07	0.02	0.02	0.14	0.12	0.17	0.11
N3	0.02	0.01	0.08	0.18	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.13	0.01	0.05	0.17	0.15	0.19	0.15
O2	0.04	0.01	0.15	0.11	0.02	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.21	0.02	0.09	0.13	0.12	0.17	0.11
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.19	0.16	0.19	0.07	0.16	0.11	0.16	0.12	0.00	0.05	0.21	0.11	0.16	0.21	0.32	0.19
O3'	0.15	0.12	0.02	0.01	0.17	0.03	0.20	0.11	0.16	0.07	0.13	0.21	0.05	0.00	0.20	0.10	0.18	0.29	0.22	0.21
O4	0.03	0.02	0.07	0.24	0.01	0.11	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.21	0.20	0.00	0.05	0.22	0.22	0.24	0.21
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.05	0.09	0.11	0.10	0.05	0.00	0.07	0.07	0.18	0.10
O5'	0.12	0.14	0.24	0.13	0.21	0.01	0.22	0.01	0.18	0.14	0.17	0.13	0.16	0.18	0.22	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.13	0.28	0.18	0.19	0.08	0.19	0.08	0.14	0.12	0.15	0.12	0.21	0.29	0.22	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.17	0.30	0.11	0.21	0.13	0.20	0.15	0.17	0.17	0.19	0.17	0.32	0.22	0.24	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.12	0.25	0.10	0.18	0.03	0.19	0.02	0.14	0.11	0.15	0.11	0.19	0.21	0.21	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.27	0.18	0.13	0.18	0.13	0.20	0.15	0.23	0.20	0.26	0.24	0.26	0.21	0.18	0.28	0.13	0.16	0.33	0.47	0.39	0.35
C2	0.16	0.23	0.15	0.13	0.16	0.14	0.19	0.22	0.21	0.20	0.20	0.21	0.28	0.23	0.16	0.22	0.12	0.15	0.44	0.58	0.54	0.47
C2'	0.17	0.29	0.16	0.16	0.17	0.15	0.18	0.20	0.23	0.19	0.27	0.24	0.27	0.21	0.16	0.26	0.19	0.15	0.37	0.54	0.44	0.41
C3'	0.16	0.25	0.15	0.10	0.16	0.10	0.20	0.14	0.23	0.21	0.24	0.22	0.27	0.23	0.16	0.25	0.12	0.12	0.32	0.47	0.38	0.36
C4	0.18	0.26	0.19	0.19	0.17	0.22	0.12	0.32	0.15	0.19	0.23	0.24	0.18	0.18	0.17	0.22	0.18	0.20	0.54	0.69	0.65	0.58
C4'	0.16	0.27	0.15	0.08	0.17	0.09	0.18	0.10	0.21	0.19	0.25	0.23	0.24	0.20	0.15	0.25	0.10	0.12	0.25	0.40	0.28	0.28
C5	0.21	0.26	0.22	0.21	0.19	0.23	0.15	0.30	0.17	0.19	0.22	0.26	0.19	0.18	0.19	0.24	0.19	0.21	0.51	0.64	0.57	0.53
C5'	0.20	0.29	0.20	0.12	0.21	0.14	0.20	0.12	0.22	0.20	0.26	0.28	0.23	0.20	0.18	0.29	0.13	0.17	0.23	0.37	0.24	0.26
C6	0.21	0.24	0.22	0.17	0.17	0.18	0.14	0.23	0.15	0.19	0.19	0.25	0.18	0.19	0.18	0.27	0.16	0.18	0.42	0.56	0.47	0.44
N1	0.18	0.24	0.17	0.13	0.16	0.14	0.16	0.19	0.18	0.19	0.20	0.23	0.23	0.20	0.16	0.25	0.13	0.15	0.40	0.53	0.47	0.42
N3	0.16	0.24	0.16	0.16	0.15	0.18	0.15	0.27	0.13	0.20	0.18	0.22	0.22	0.22	0.16	0.21	0.14	0.16	0.50	0.65	0.62	0.55
O2	0.17	0.24	0.14	0.12	0.19	0.13	0.24	0.20	0.28	0.22	0.26	0.21	0.35	0.26	0.18	0.22	0.11	0.16	0.43	0.56	0.54	0.46
O2'	0.21	0.32	0.17	0.12	0.19	0.12	0.21	0.15	0.25	0.21	0.29	0.28	0.29	0.23	0.18	0.31	0.13	0.16	0.33	0.52	0.44	0.39
O3'	0.16	0.30	0.15	0.13	0.16	0.12	0.18	0.18	0.22	0.19	0.27	0.26	0.25	0.21	0.14	0.25	0.17	0.12	0.33	0.49	0.39	0.37
O4	0.21	0.29	0.20	0.21	0.21	0.26	0.18	0.37	0.22	0.22	0.29	0.26	0.24	0.21	0.20	0.21	0.20	0.24	0.58	0.75	0.73	0.65
O4'	0.18	0.27	0.17	0.14	0.17	0.14	0.19	0.15	0.22	0.20	0.25	0.22	0.25	0.21	0.16	0.27	0.16	0.16	0.27	0.40	0.30	0.29
O5'	0.15	0.24	0.17	0.07	0.17	0.06	0.20	0.10	0.22	0.22	0.23	0.22	0.25	0.24	0.16	0.23	0.02	0.10	0.29	0.38	0.30	0.30
OP1	0.05	0.19	0.09	0.03	0.10	0.07	0.13	0.16	0.16	0.17	0.18	0.17	0.19	0.19	0.08	0.14	0.03	0.05	0.23	0.37	0.30	0.30
OP2	0.08	0.20	0.09	0.06	0.16	0.13	0.21	0.24	0.22	0.24	0.21	0.17	0.26	0.27	0.14	0.10	0.02	0.12	0.36	0.45	0.35	0.37
P	0.04	0.18	0.08	0.01	0.10	0.06	0.14	0.13	0.16	0.18	0.17	0.15	0.19	0.19	0.08	0.12	0.01	0.03	0.25	0.36	0.26	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.14	0.13	0.19	0.13
C2	0.03	0.00	0.11	0.12	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.13	0.15	0.04	0.28	0.31	0.37	0.28
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.07	0.09	0.11	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.15	0.22	0.14	0.13
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.09	0.11	0.11	0.11	0.09	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.19	0.26	0.12	0.17
C4	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.28	0.28	0.34	0.26
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.05	0.07	0.08	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.10	0.15	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03	0.34	0.34	0.43	0.34
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.10	0.01	0.14	0.00	0.15	0.15	0.12	0.08	0.17	0.17	0.09	0.05	0.03	0.01	0.01	0.13	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.03	0.35	0.38	0.47	0.36
C8	0.02	0.02	0.07	0.11	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.13	0.05	0.34	0.29	0.35	0.31
N1	0.03	0.01	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.13	0.03	0.32	0.35	0.44	0.33
N3	0.03	0.01	0.11	0.11	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.12	0.14	0.04	0.24	0.26	0.32	0.23
N6	0.02	0.02	0.06	0.09	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.08	0.12	0.04	0.38	0.42	0.52	0.40
N7	0.02	0.02	0.06	0.10	0.01	0.08	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.13	0.04	0.38	0.36	0.45	0.37
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.26	0.23	0.28	0.23
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.05	0.06	0.05	0.09	0.04	0.12	0.12	0.08	0.05	0.02	0.00	0.04	0.05	0.06	0.16	0.13	0.07
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.11	0.13	0.13	0.14	0.12	0.13	0.05	0.04	0.00	0.02	0.17	0.30	0.17	0.20
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.04	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.11	0.07	0.22	0.13
O5'	0.14	0.28	0.15	0.19	0.28	0.02	0.34	0.01	0.35	0.34	0.32	0.24	0.38	0.38	0.26	0.06	0.17	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.31	0.22	0.26	0.28	0.10	0.34	0.13	0.38	0.29	0.35	0.26	0.42	0.36	0.23	0.16	0.30	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.19	0.37	0.14	0.12	0.34	0.15	0.43	0.21	0.47	0.35	0.44	0.32	0.52	0.45	0.28	0.13	0.17	0.22	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.28	0.13	0.17	0.26	0.03	0.34	0.02	0.36	0.31	0.33	0.23	0.40	0.37	0.23	0.07	0.20	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00