Doublet Group distance statistics: 49462

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 8, 14, 11, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.011, 0.021, 0.030, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.011, 0.023, 0.036, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.023 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.024, 0.057, 0.090, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.057 std_dev=0.033
O4	A	0, 0.031, 0.078, 0.124, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.078 std_dev=0.046
C4	B	0, 0.126, 0.250, 0.374, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.250 std_dev=0.124
O4'	A	0, 0.070, 0.206, 0.342, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.206 std_dev=0.136
C2'	A	0, 0.067, 0.212, 0.358, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.212 std_dev=0.146
N3	B	0, 0.194, 0.354, 0.514, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.354 std_dev=0.160
C5	B	0, 0.222, 0.386, 0.551, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.386 std_dev=0.165
N9	B	0, 0.188, 0.354, 0.520, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.354 std_dev=0.166
C2	B	0, 0.319, 0.506, 0.694, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.506 std_dev=0.188
C6	B	0, 0.355, 0.543, 0.730, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.543 std_dev=0.188
C2'	B	0, 0.336, 0.526, 0.716, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.526 std_dev=0.190
N1	B	0, 0.389, 0.586, 0.783, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.586 std_dev=0.197
C1'	B	0, 0.301, 0.508, 0.716, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.508 std_dev=0.207
C8	B	0, 0.294, 0.513, 0.733, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.513 std_dev=0.219
N7	B	0, 0.318, 0.540, 0.762, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.540 std_dev=0.222
C4'	A	0, 0.118, 0.360, 0.601, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.360 std_dev=0.241
N6	B	0, 0.527, 0.774, 1.022, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.774 std_dev=0.247
C3'	A	0, 0.086, 0.379, 0.672, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.379 std_dev=0.293
C3'	B	0, 0.393, 0.698, 1.004, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.698 std_dev=0.306
O2'	A	0, -0.004, 0.316, 0.636, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.316 std_dev=0.320
O4'	B	0, 0.423, 0.759, 1.096, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.759 std_dev=0.336
C5'	A	0, 0.205, 0.555, 0.905, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.555 std_dev=0.350
C4'	B	0, 0.567, 0.936, 1.306, 2.053 max_d=2.053 avg_d=0.936 std_dev=0.369
O2'	B	0, 0.321, 0.761, 1.201, 2.419 max_d=2.419 avg_d=0.761 std_dev=0.440
O3'	B	0, 0.374, 0.818, 1.262, 2.444 max_d=2.444 avg_d=0.818 std_dev=0.444
O5'	A	0, 0.093, 0.549, 1.005, 2.236 max_d=2.236 avg_d=0.549 std_dev=0.456
O5'	B	0, 0.719, 1.189, 1.658, 2.525 max_d=2.525 avg_d=1.189 std_dev=0.469
C5'	B	0, 0.735, 1.228, 1.720, 2.751 max_d=2.751 avg_d=1.228 std_dev=0.492
O3'	A	0, 0.082, 0.611, 1.140, 2.662 max_d=2.662 avg_d=0.611 std_dev=0.529
P	B	0, 0.851, 1.549, 2.247, 3.447 max_d=3.447 avg_d=1.549 std_dev=0.698
OP2	B	0, 0.894, 1.664, 2.435, 3.620 max_d=3.620 avg_d=1.664 std_dev=0.770
P	A	0, -0.195, 0.614, 1.424, 3.999 max_d=3.999 avg_d=0.614 std_dev=0.810
OP1	B	0, 0.880, 1.766, 2.653, 4.138 max_d=4.138 avg_d=1.766 std_dev=0.887
OP1	A	0, -0.260, 0.692, 1.644, 4.310 max_d=4.310 avg_d=0.692 std_dev=0.952
OP2	A	0, -0.186, 0.774, 1.735, 4.703 max_d=4.703 avg_d=0.774 std_dev=0.961

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.12	0.02	0.01	0.12	0.08	0.15	0.11
C2	0.01	0.00	0.07	0.12	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.09	0.01	0.03	0.18	0.12	0.23	0.18
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.06	0.02	0.09	0.07	0.10	0.03	0.06	0.13	0.01	0.03	0.07	0.01	0.18	0.20	0.33	0.20
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.19	0.00	0.20	0.03	0.17	0.12	0.16	0.10	0.03	0.01	0.21	0.02	0.06	0.18	0.33	0.16
C4	0.01	0.01	0.06	0.19	0.00	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.16	0.01	0.03	0.28	0.32	0.46	0.35
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.00	0.12	0.01	0.11	0.05	0.06	0.03	0.15	0.03	0.10	0.00	0.02	0.11	0.17	0.06
C5	0.02	0.01	0.09	0.20	0.01	0.12	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.19	0.01	0.05	0.31	0.37	0.52	0.41
C5'	0.04	0.08	0.07	0.03	0.16	0.01	0.19	0.00	0.17	0.09	0.12	0.04	0.09	0.09	0.18	0.02	0.01	0.08	0.10	0.01
C6	0.02	0.01	0.10	0.17	0.01	0.11	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.15	0.01	0.05	0.28	0.29	0.38	0.33
N1	0.00	0.01	0.03	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.07	0.01	0.01	0.19	0.14	0.22	0.19
N3	0.01	0.00	0.06	0.16	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.11	0.01	0.03	0.23	0.20	0.33	0.25
O2	0.03	0.01	0.13	0.10	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.14	0.16	0.02	0.05	0.13	0.08	0.19	0.11
O2'	0.02	0.14	0.01	0.03	0.19	0.15	0.19	0.09	0.16	0.11	0.17	0.14	0.00	0.07	0.20	0.10	0.11	0.24	0.38	0.19
O3'	0.12	0.09	0.03	0.01	0.16	0.03	0.19	0.09	0.15	0.07	0.11	0.16	0.07	0.00	0.19	0.08	0.16	0.39	0.57	0.36
O4	0.02	0.01	0.07	0.21	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.20	0.19	0.00	0.03	0.30	0.36	0.53	0.39
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.02	0.05	0.01	0.03	0.05	0.10	0.08	0.03	0.00	0.09	0.11	0.13	0.11
O5'	0.12	0.18	0.18	0.06	0.28	0.02	0.31	0.01	0.28	0.19	0.23	0.13	0.11	0.16	0.30	0.09	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.08	0.12	0.20	0.18	0.32	0.11	0.37	0.08	0.29	0.14	0.20	0.08	0.24	0.39	0.36	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.23	0.33	0.33	0.46	0.17	0.52	0.10	0.38	0.22	0.33	0.19	0.38	0.57	0.53	0.13	0.03	0.02	0.00	0.02
P	0.11	0.18	0.20	0.16	0.35	0.06	0.41	0.01	0.33	0.19	0.25	0.11	0.19	0.36	0.39	0.11	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.16	0.23	0.21	0.14	0.13	0.14	0.19	0.14	0.16	0.15	0.17	0.16	0.16	0.15	0.23	0.13	0.17	0.26	0.53	0.38	0.36
C2	0.15	0.15	0.17	0.24	0.12	0.15	0.14	0.24	0.15	0.15	0.13	0.14	0.19	0.17	0.14	0.23	0.12	0.15	0.31	0.71	0.45	0.43
C2'	0.13	0.18	0.23	0.29	0.12	0.20	0.14	0.31	0.15	0.17	0.16	0.16	0.17	0.18	0.13	0.19	0.21	0.14	0.37	0.66	0.48	0.50
C3'	0.15	0.14	0.26	0.29	0.14	0.22	0.19	0.28	0.18	0.24	0.15	0.12	0.21	0.25	0.17	0.20	0.24	0.11	0.31	0.54	0.42	0.39
C4	0.18	0.11	0.15	0.30	0.13	0.26	0.15	0.36	0.11	0.21	0.09	0.12	0.16	0.22	0.17	0.35	0.21	0.21	0.41	0.87	0.52	0.52
C4'	0.13	0.16	0.30	0.27	0.11	0.21	0.15	0.25	0.15	0.19	0.15	0.13	0.17	0.19	0.14	0.20	0.20	0.11	0.26	0.44	0.34	0.31
C5	0.19	0.10	0.15	0.31	0.12	0.27	0.14	0.37	0.11	0.21	0.09	0.12	0.16	0.20	0.17	0.40	0.24	0.21	0.42	0.78	0.49	0.51
C5'	0.18	0.20	0.36	0.36	0.20	0.34	0.24	0.39	0.22	0.29	0.21	0.18	0.25	0.29	0.22	0.22	0.33	0.21	0.37	0.53	0.41	0.41
C6	0.18	0.12	0.15	0.28	0.12	0.21	0.14	0.29	0.13	0.19	0.10	0.13	0.16	0.19	0.16	0.35	0.18	0.16	0.35	0.65	0.44	0.44
N1	0.16	0.14	0.18	0.24	0.13	0.15	0.14	0.23	0.14	0.16	0.13	0.14	0.17	0.17	0.15	0.25	0.13	0.15	0.30	0.63	0.42	0.41
N3	0.15	0.13	0.15	0.27	0.12	0.20	0.15	0.29	0.14	0.18	0.11	0.13	0.19	0.20	0.15	0.28	0.16	0.17	0.36	0.82	0.49	0.48
O2	0.15	0.17	0.19	0.21	0.13	0.12	0.15	0.21	0.17	0.15	0.17	0.16	0.21	0.17	0.14	0.21	0.10	0.17	0.29	0.69	0.44	0.41
O2'	0.17	0.22	0.25	0.22	0.15	0.13	0.16	0.25	0.19	0.15	0.20	0.21	0.23	0.18	0.14	0.28	0.14	0.16	0.34	0.67	0.48	0.50
O3'	0.13	0.20	0.28	0.32	0.10	0.27	0.16	0.33	0.16	0.23	0.19	0.14	0.20	0.23	0.14	0.19	0.30	0.13	0.35	0.59	0.46	0.42
O4	0.20	0.14	0.17	0.32	0.16	0.30	0.18	0.40	0.13	0.25	0.13	0.14	0.18	0.25	0.21	0.38	0.24	0.26	0.44	0.97	0.55	0.56
O4'	0.16	0.16	0.26	0.21	0.11	0.15	0.13	0.17	0.15	0.16	0.16	0.12	0.16	0.16	0.14	0.22	0.16	0.14	0.22	0.40	0.33	0.28
O5'	0.29	0.29	0.43	0.51	0.34	0.50	0.39	0.56	0.36	0.43	0.32	0.29	0.39	0.44	0.36	0.23	0.50	0.37	0.54	0.68	0.56	0.59
OP1	0.57	0.37	0.66	0.82	0.49	0.93	0.53	1.07	0.46	0.66	0.38	0.41	0.49	0.64	0.57	0.51	0.90	0.75	0.99	1.26	1.01	1.08
OP2	0.64	0.47	0.67	1.01	0.65	1.06	0.73	1.26	0.66	0.89	0.53	0.50	0.70	0.87	0.73	0.23	0.99	0.88	1.26	1.46	1.31	1.36
P	0.57	0.42	0.66	0.90	0.54	0.94	0.59	1.06	0.53	0.70	0.44	0.45	0.55	0.68	0.61	0.35	0.97	0.76	1.00	1.15	0.97	1.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.14	0.01	0.14	0.16	0.24	0.16
C2	0.02	0.00	0.20	0.16	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.15	0.12	0.15	0.45	0.41	0.23
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.05	0.11	0.09	0.11	0.15	0.20	0.07	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.24	0.24	0.35	0.27
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.14	0.00	0.18	0.03	0.19	0.20	0.17	0.15	0.21	0.22	0.12	0.03	0.01	0.02	0.09	0.15	0.14	0.08
C4	0.01	0.01	0.10	0.14	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.06	0.07	0.14	0.38	0.39	0.21
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.15	0.05	0.06	0.10	0.14	0.06	0.15	0.03	0.00	0.02	0.16	0.12	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.10	0.04	0.16	0.48	0.49	0.24
C5'	0.05	0.12	0.11	0.03	0.11	0.01	0.15	0.00	0.15	0.18	0.13	0.11	0.18	0.20	0.10	0.06	0.11	0.02	0.01	0.24	0.22	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.19	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.09	0.06	0.17	0.55	0.52	0.26
C8	0.02	0.01	0.11	0.20	0.01	0.15	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.19	0.18	0.09	0.18	0.35	0.44	0.23
N1	0.02	0.00	0.15	0.17	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.10	0.09	0.16	0.52	0.47	0.25
N3	0.02	0.01	0.20	0.15	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.16	0.12	0.15	0.37	0.36	0.21
N6	0.02	0.01	0.07	0.21	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.15	0.14	0.06	0.19	0.62	0.58	0.29
N7	0.02	0.01	0.07	0.22	0.01	0.14	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.19	0.18	0.06	0.19	0.48	0.53	0.26
N9	0.01	0.01	0.02	0.12	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.06	0.02	0.13	0.28	0.35	0.19
O2'	0.02	0.17	0.00	0.03	0.09	0.15	0.13	0.06	0.12	0.19	0.13	0.17	0.15	0.19	0.09	0.00	0.08	0.12	0.19	0.20	0.37	0.22
O3'	0.14	0.15	0.03	0.01	0.06	0.03	0.10	0.11	0.09	0.18	0.10	0.16	0.14	0.18	0.06	0.08	0.00	0.11	0.18	0.36	0.25	0.21
O4'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.07	0.00	0.04	0.02	0.06	0.09	0.09	0.12	0.06	0.06	0.02	0.12	0.11	0.00	0.11	0.15	0.13	0.11
O5'	0.14	0.15	0.24	0.09	0.14	0.02	0.16	0.01	0.17	0.18	0.16	0.15	0.19	0.19	0.13	0.19	0.18	0.11	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.16	0.45	0.24	0.15	0.38	0.16	0.48	0.24	0.55	0.35	0.52	0.37	0.62	0.48	0.28	0.20	0.36	0.15	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.24	0.41	0.35	0.14	0.39	0.12	0.49	0.22	0.52	0.44	0.47	0.36	0.58	0.53	0.35	0.37	0.25	0.13	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.23	0.27	0.08	0.21	0.03	0.24	0.02	0.26	0.23	0.25	0.21	0.29	0.26	0.19	0.22	0.21	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00