Doublet Group distance statistics: 49464

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 5, 7, 16, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.012, 0.025, 0.039, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.025 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.021 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.022, 0.059, 0.097, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.059 std_dev=0.037
O4	A	0, 0.026, 0.083, 0.140, 0.224 max_d=0.224 avg_d=0.083 std_dev=0.057
O4'	A	0, 0.032, 0.125, 0.219, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.125 std_dev=0.093
C2'	A	0, 0.059, 0.157, 0.254, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.157 std_dev=0.098
C4	B	0, 0.182, 0.340, 0.499, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.340 std_dev=0.158
N3	B	0, 0.481, 0.659, 0.837, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.659 std_dev=0.178
C5	B	0, 0.172, 0.357, 0.542, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.357 std_dev=0.185
C4'	A	0, 0.026, 0.213, 0.400, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.213 std_dev=0.187
N9	B	0, 0.390, 0.577, 0.765, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.577 std_dev=0.187
C6	B	0, 0.348, 0.554, 0.761, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.554 std_dev=0.206
O5'	A	0, 0.248, 0.459, 0.670, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.459 std_dev=0.211
N1	B	0, 0.653, 0.864, 1.075, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.864 std_dev=0.211
C5'	A	0, 0.130, 0.348, 0.565, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.348 std_dev=0.217
C3'	A	0, 0.053, 0.278, 0.504, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.278 std_dev=0.226
C2	B	0, 0.670, 0.898, 1.126, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.898 std_dev=0.228
C2'	B	0, 0.418, 0.661, 0.905, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.661 std_dev=0.244
O2'	A	0, 0.007, 0.250, 0.494, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.250 std_dev=0.244
C1'	B	0, 0.531, 0.785, 1.038, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.785 std_dev=0.253
N7	B	0, 0.433, 0.704, 0.976, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.704 std_dev=0.271
O2'	B	0, 0.523, 0.798, 1.073, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.798 std_dev=0.275
N6	B	0, 0.478, 0.754, 1.030, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.754 std_dev=0.276
C8	B	0, 0.531, 0.819, 1.107, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.819 std_dev=0.288
P	A	0, 0.323, 0.633, 0.942, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.633 std_dev=0.310
C3'	B	0, 0.451, 0.766, 1.081, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.766 std_dev=0.315
O3'	B	0, 0.376, 0.712, 1.049, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.712 std_dev=0.336
OP1	A	0, 0.283, 0.639, 0.995, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.639 std_dev=0.356
OP2	A	0, 0.414, 0.780, 1.145, 1.535 max_d=1.535 avg_d=0.780 std_dev=0.365
O4'	B	0, 0.663, 1.070, 1.478, 1.669 max_d=1.669 avg_d=1.070 std_dev=0.408
O3'	A	0, 0.046, 0.480, 0.913, 2.704 max_d=2.704 avg_d=0.480 std_dev=0.434
C4'	B	0, 0.624, 1.058, 1.492, 1.716 max_d=1.716 avg_d=1.058 std_dev=0.434
C5'	B	0, 0.808, 1.348, 1.887, 2.347 max_d=2.347 avg_d=1.348 std_dev=0.540
O5'	B	0, 0.678, 1.324, 1.969, 3.202 max_d=3.202 avg_d=1.324 std_dev=0.646
P	B	0, 0.858, 1.691, 2.525, 3.671 max_d=3.671 avg_d=1.691 std_dev=0.833
OP2	B	0, 0.855, 1.711, 2.566, 3.492 max_d=3.492 avg_d=1.711 std_dev=0.856
OP1	B	0, 0.982, 1.934, 2.887, 4.263 max_d=4.263 avg_d=1.934 std_dev=0.953

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.12	0.03	0.01	0.09	0.09	0.15	0.11
C2	0.02	0.00	0.07	0.12	0.02	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.03	0.03	0.12	0.14	0.21	0.15
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.08	0.06	0.03	0.07	0.12	0.01	0.02	0.09	0.01	0.18	0.20	0.24	0.20
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.19	0.00	0.19	0.02	0.16	0.10	0.16	0.11	0.02	0.01	0.21	0.01	0.06	0.14	0.10	0.08
C4	0.02	0.02	0.07	0.19	0.00	0.09	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.15	0.18	0.01	0.03	0.17	0.21	0.27	0.20
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.06	0.06	0.12	0.02	0.10	0.00	0.01	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.19	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.18	0.02	0.03	0.18	0.21	0.25	0.20
C5'	0.04	0.08	0.08	0.02	0.14	0.01	0.15	0.00	0.12	0.08	0.11	0.08	0.05	0.09	0.15	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.02	0.02	0.10	0.14	0.02	0.03	0.15	0.16	0.20	0.16
N1	0.00	0.01	0.03	0.10	0.02	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.08	0.03	0.01	0.11	0.12	0.18	0.13
N3	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.01	0.00	0.02	0.14	0.14	0.02	0.03	0.15	0.18	0.24	0.18
O2	0.04	0.01	0.12	0.11	0.02	0.06	0.02	0.08	0.02	0.03	0.02	0.00	0.14	0.17	0.04	0.05	0.12	0.13	0.21	0.15
O2'	0.02	0.12	0.01	0.02	0.15	0.12	0.13	0.05	0.10	0.08	0.14	0.14	0.00	0.05	0.16	0.09	0.13	0.16	0.26	0.16
O3'	0.12	0.12	0.02	0.01	0.18	0.02	0.18	0.09	0.14	0.08	0.14	0.17	0.05	0.00	0.22	0.08	0.13	0.26	0.20	0.17
O4	0.03	0.03	0.09	0.21	0.01	0.10	0.02	0.15	0.02	0.03	0.02	0.04	0.16	0.22	0.00	0.04	0.19	0.24	0.29	0.22
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.09	0.08	0.04	0.00	0.06	0.06	0.12	0.09
O5'	0.09	0.12	0.18	0.06	0.17	0.01	0.18	0.01	0.15	0.11	0.15	0.12	0.13	0.13	0.19	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.14	0.20	0.14	0.21	0.07	0.21	0.06	0.16	0.12	0.18	0.13	0.16	0.26	0.24	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.21	0.24	0.10	0.27	0.03	0.25	0.02	0.20	0.18	0.24	0.21	0.26	0.20	0.29	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.15	0.20	0.08	0.20	0.02	0.20	0.02	0.16	0.13	0.18	0.15	0.16	0.17	0.22	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.25	0.24	0.17	0.16	0.17	0.17	0.24	0.21	0.20	0.24	0.22	0.25	0.20	0.18	0.42	0.16	0.19	0.40	0.41	0.54	0.40
C2	0.18	0.24	0.19	0.18	0.14	0.18	0.19	0.34	0.20	0.23	0.18	0.20	0.28	0.26	0.17	0.33	0.16	0.16	0.45	0.50	0.69	0.51
C2'	0.21	0.25	0.21	0.18	0.15	0.17	0.18	0.30	0.20	0.21	0.22	0.22	0.26	0.23	0.17	0.40	0.18	0.16	0.37	0.45	0.50	0.39
C3'	0.18	0.26	0.20	0.09	0.12	0.09	0.16	0.20	0.18	0.23	0.22	0.21	0.23	0.23	0.15	0.37	0.08	0.11	0.38	0.37	0.52	0.36
C4	0.19	0.23	0.18	0.22	0.14	0.30	0.18	0.48	0.13	0.31	0.20	0.17	0.17	0.32	0.21	0.23	0.20	0.27	0.51	0.60	0.79	0.61
C4'	0.19	0.31	0.19	0.10	0.14	0.11	0.14	0.14	0.20	0.17	0.27	0.25	0.22	0.16	0.13	0.38	0.11	0.14	0.33	0.35	0.39	0.28
C5	0.21	0.22	0.20	0.23	0.16	0.31	0.17	0.47	0.15	0.29	0.20	0.19	0.17	0.28	0.21	0.24	0.20	0.28	0.51	0.56	0.72	0.57
C5'	0.17	0.33	0.18	0.08	0.18	0.09	0.17	0.12	0.22	0.18	0.29	0.28	0.22	0.18	0.14	0.32	0.08	0.12	0.29	0.34	0.29	0.23
C6	0.18	0.22	0.20	0.20	0.13	0.22	0.15	0.37	0.15	0.24	0.18	0.18	0.17	0.23	0.18	0.29	0.18	0.19	0.46	0.49	0.62	0.49
N1	0.19	0.23	0.21	0.18	0.14	0.18	0.17	0.31	0.18	0.22	0.19	0.20	0.23	0.23	0.17	0.35	0.16	0.16	0.44	0.46	0.62	0.47
N3	0.15	0.23	0.17	0.19	0.12	0.23	0.19	0.41	0.15	0.27	0.17	0.18	0.24	0.30	0.17	0.27	0.17	0.19	0.48	0.56	0.76	0.57
O2	0.21	0.26	0.20	0.17	0.17	0.17	0.21	0.31	0.24	0.22	0.21	0.23	0.33	0.26	0.18	0.36	0.16	0.16	0.44	0.48	0.69	0.50
O2'	0.26	0.27	0.24	0.16	0.18	0.17	0.20	0.26	0.25	0.21	0.26	0.25	0.32	0.24	0.19	0.48	0.15	0.20	0.35	0.41	0.47	0.36
O3'	0.16	0.37	0.18	0.10	0.17	0.10	0.19	0.21	0.26	0.22	0.34	0.29	0.30	0.23	0.14	0.36	0.12	0.10	0.38	0.35	0.54	0.36
O4	0.23	0.23	0.19	0.25	0.18	0.36	0.22	0.55	0.16	0.36	0.23	0.18	0.19	0.38	0.25	0.22	0.22	0.35	0.54	0.67	0.86	0.68
O4'	0.24	0.30	0.24	0.18	0.15	0.19	0.15	0.20	0.21	0.17	0.28	0.23	0.23	0.16	0.16	0.43	0.18	0.20	0.39	0.38	0.46	0.35
O5'	0.16	0.30	0.20	0.06	0.18	0.06	0.19	0.18	0.22	0.22	0.27	0.26	0.23	0.22	0.16	0.29	0.02	0.09	0.33	0.34	0.37	0.29
OP1	0.05	0.27	0.09	0.03	0.13	0.09	0.14	0.19	0.18	0.19	0.23	0.23	0.19	0.20	0.08	0.15	0.02	0.05	0.28	0.41	0.28	0.28
OP2	0.10	0.25	0.13	0.07	0.18	0.20	0.23	0.37	0.25	0.28	0.25	0.21	0.28	0.30	0.17	0.12	0.03	0.15	0.43	0.45	0.43	0.41
P	0.06	0.24	0.11	0.02	0.12	0.09	0.15	0.20	0.17	0.20	0.21	0.20	0.19	0.21	0.10	0.14	0.01	0.05	0.31	0.35	0.29	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.13	0.20	0.21	0.12
C2	0.05	0.00	0.13	0.17	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.13	0.21	0.04	0.30	0.27	0.54	0.33
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.08	0.11	0.14	0.07	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.20	0.26	0.18	0.14
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.09	0.01	0.07	0.03	0.10	0.13	0.14	0.16	0.09	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.27	0.27	0.18	0.18
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.02	0.32	0.27	0.51	0.34
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.09	0.07	0.07	0.08	0.09	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.24	0.16	0.11
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.41	0.39	0.68	0.48
C5'	0.02	0.13	0.02	0.03	0.11	0.01	0.15	0.00	0.16	0.15	0.15	0.11	0.18	0.17	0.08	0.05	0.05	0.01	0.01	0.11	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.12	0.02	0.42	0.41	0.73	0.51
C8	0.02	0.02	0.08	0.13	0.01	0.09	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.05	0.14	0.06	0.42	0.38	0.59	0.46
N1	0.03	0.00	0.11	0.14	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.12	0.17	0.03	0.36	0.34	0.66	0.43
N3	0.05	0.01	0.14	0.16	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.19	0.05	0.26	0.23	0.45	0.27
N6	0.03	0.02	0.07	0.09	0.01	0.08	0.02	0.18	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.09	0.12	0.04	0.46	0.51	0.84	0.60
N7	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.09	0.01	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.13	0.06	0.46	0.48	0.75	0.56
N9	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.29	0.23	0.43	0.29
O2'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.07	0.05	0.07	0.05	0.09	0.05	0.12	0.12	0.09	0.05	0.03	0.00	0.06	0.04	0.08	0.38	0.11	0.17
O3'	0.02	0.21	0.02	0.01	0.10	0.02	0.09	0.05	0.12	0.14	0.17	0.19	0.12	0.13	0.05	0.06	0.00	0.02	0.23	0.34	0.16	0.19
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.06	0.03	0.05	0.04	0.06	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.19	0.19	0.11
O5'	0.13	0.30	0.20	0.27	0.32	0.02	0.41	0.01	0.42	0.42	0.36	0.26	0.46	0.46	0.29	0.08	0.23	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.20	0.27	0.26	0.27	0.27	0.24	0.39	0.11	0.41	0.38	0.34	0.23	0.51	0.48	0.23	0.38	0.34	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.54	0.18	0.18	0.51	0.16	0.68	0.23	0.73	0.59	0.66	0.45	0.84	0.75	0.43	0.11	0.16	0.19	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.33	0.14	0.18	0.34	0.11	0.48	0.02	0.51	0.46	0.43	0.27	0.60	0.56	0.29	0.17	0.19	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00