Doublet Group distance statistics: 49467

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 4, 7, 0, 3, 1, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, -0.001, 0.010, 0.021, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.010 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.007, 0.019, 0.032, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.017 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.005, 0.020, 0.036, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.004, 0.024, 0.044, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.024 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.018, 0.043, 0.069, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.043 std_dev=0.026
O4	A	0, 0.017, 0.071, 0.125, 0.206 max_d=0.206 avg_d=0.071 std_dev=0.054
C2'	A	0, 0.093, 0.179, 0.265, 0.358 max_d=0.358 avg_d=0.179 std_dev=0.086
O4'	A	0, 0.039, 0.144, 0.248, 0.384 max_d=0.384 avg_d=0.144 std_dev=0.104
O2'	A	0, 0.090, 0.211, 0.332, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.211 std_dev=0.121
C3'	A	0, 0.124, 0.274, 0.424, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.274 std_dev=0.150
C4'	A	0, 0.076, 0.239, 0.401, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.239 std_dev=0.163
C4'	B	0, 0.182, 0.350, 0.517, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.350 std_dev=0.168
C3'	B	0, 0.216, 0.395, 0.574, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.395 std_dev=0.179
C5'	B	0, 0.277, 0.457, 0.636, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.457 std_dev=0.179
N9	B	0, 0.169, 0.351, 0.532, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.351 std_dev=0.181
C1'	B	0, 0.220, 0.419, 0.618, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.419 std_dev=0.199
O4'	B	0, 0.192, 0.393, 0.594, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.393 std_dev=0.201
C8	B	0, 0.176, 0.383, 0.589, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.383 std_dev=0.206
O5'	A	0, 0.163, 0.375, 0.587, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.375 std_dev=0.212
C4	B	0, 0.113, 0.325, 0.537, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.325 std_dev=0.212
C2'	B	0, 0.256, 0.478, 0.699, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.478 std_dev=0.221
O3'	A	0, 0.204, 0.426, 0.649, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.426 std_dev=0.222
N7	B	0, 0.147, 0.373, 0.599, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.373 std_dev=0.226
O3'	B	0, 0.285, 0.518, 0.751, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.518 std_dev=0.233
N3	B	0, 0.137, 0.376, 0.614, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.376 std_dev=0.239
C5	B	0, 0.098, 0.339, 0.580, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.339 std_dev=0.241
P	A	0, 0.261, 0.508, 0.755, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.508 std_dev=0.247
C5'	A	0, 0.141, 0.399, 0.657, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.399 std_dev=0.258
OP2	A	0, 0.313, 0.595, 0.877, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.595 std_dev=0.282
C6	B	0, 0.108, 0.400, 0.692, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.400 std_dev=0.292
C2	B	0, 0.140, 0.435, 0.729, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.435 std_dev=0.294
OP1	A	0, 0.331, 0.627, 0.923, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.627 std_dev=0.296
N6	B	0, 0.142, 0.465, 0.787, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.465 std_dev=0.323
O2'	B	0, 0.319, 0.642, 0.966, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.642 std_dev=0.324
N1	B	0, 0.130, 0.454, 0.778, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.454 std_dev=0.324
O5'	B	0, 0.608, 1.452, 2.295, 2.666 max_d=2.666 avg_d=1.452 std_dev=0.844
P	B	0, 0.644, 1.576, 2.508, 3.435 max_d=3.435 avg_d=1.576 std_dev=0.932
OP2	B	0, 0.539, 1.584, 2.629, 4.627 max_d=4.627 avg_d=1.584 std_dev=1.045
OP1	B	0, 0.591, 1.935, 3.278, 4.897 max_d=4.897 avg_d=1.935 std_dev=1.344

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.04	0.01	0.05	0.09	0.08	0.06
C2	0.03	0.00	0.08	0.10	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.03	0.11	0.13	0.15	0.12
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.01	0.04	0.04	0.09	0.10	0.00	0.02	0.09	0.01	0.03	0.12	0.06	0.04
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.12	0.01	0.09	0.01	0.06	0.06	0.12	0.11	0.02	0.01	0.13	0.02	0.03	0.14	0.07	0.05
C4	0.04	0.01	0.08	0.12	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.03	0.01	0.02	0.07	0.15	0.00	0.05	0.15	0.17	0.21	0.18
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.06	0.05	0.04	0.02	0.08	0.00	0.02	0.09	0.02	0.03
C5	0.03	0.02	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.12	0.02	0.05	0.14	0.16	0.19	0.17
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.09	0.01	0.09	0.00	0.07	0.05	0.08	0.05	0.05	0.04	0.10	0.01	0.01	0.09	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.08	0.02	0.05	0.11	0.12	0.13	0.13
N1	0.01	0.01	0.04	0.06	0.03	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.03	0.02	0.10	0.11	0.12	0.10
N3	0.03	0.01	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.02	0.00	0.02	0.08	0.15	0.01	0.03	0.14	0.16	0.19	0.16
O2	0.04	0.01	0.10	0.11	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.09	0.12	0.03	0.04	0.10	0.13	0.14	0.11
O2'	0.03	0.07	0.00	0.02	0.07	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.08	0.09	0.00	0.06	0.08	0.05	0.04	0.12	0.05	0.05
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.15	0.02	0.12	0.04	0.08	0.06	0.15	0.12	0.06	0.00	0.18	0.02	0.06	0.19	0.11	0.09
O4	0.04	0.02	0.09	0.13	0.00	0.08	0.02	0.10	0.02	0.03	0.01	0.03	0.08	0.18	0.00	0.05	0.16	0.20	0.24	0.21
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.05	0.02	0.05	0.00	0.04	0.08	0.09	0.08
O5'	0.05	0.11	0.03	0.03	0.15	0.02	0.14	0.01	0.11	0.10	0.14	0.10	0.04	0.06	0.16	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.09	0.13	0.12	0.14	0.17	0.09	0.16	0.09	0.12	0.11	0.16	0.13	0.12	0.19	0.20	0.08	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.15	0.06	0.07	0.21	0.02	0.19	0.02	0.13	0.12	0.19	0.14	0.05	0.11	0.24	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.12	0.04	0.05	0.18	0.03	0.17	0.02	0.13	0.10	0.16	0.11	0.05	0.09	0.21	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.31	0.25	0.15	0.16	0.15	0.13	0.21	0.18	0.20	0.26	0.27	0.22	0.18	0.19	0.36	0.15	0.18	0.66	0.88	0.87	0.64
C2	0.24	0.36	0.25	0.19	0.20	0.20	0.14	0.27	0.21	0.23	0.34	0.30	0.22	0.19	0.21	0.31	0.16	0.22	0.81	1.15	1.19	0.91
C2'	0.22	0.31	0.23	0.11	0.16	0.11	0.13	0.22	0.16	0.20	0.25	0.27	0.20	0.19	0.18	0.35	0.10	0.15	0.65	0.87	0.91	0.64
C3'	0.19	0.30	0.22	0.07	0.14	0.08	0.12	0.22	0.17	0.19	0.25	0.26	0.19	0.17	0.15	0.34	0.07	0.11	0.60	0.76	0.82	0.56
C4	0.24	0.34	0.27	0.23	0.22	0.24	0.19	0.31	0.30	0.20	0.36	0.29	0.32	0.12	0.21	0.29	0.21	0.24	0.90	1.34	1.39	1.11
C4'	0.20	0.32	0.20	0.08	0.17	0.07	0.17	0.17	0.23	0.18	0.29	0.28	0.24	0.19	0.15	0.35	0.11	0.12	0.51	0.68	0.63	0.44
C5	0.24	0.30	0.29	0.24	0.19	0.23	0.16	0.30	0.26	0.17	0.30	0.26	0.29	0.12	0.18	0.31	0.21	0.22	0.88	1.20	1.23	0.99
C5'	0.22	0.33	0.23	0.08	0.22	0.08	0.21	0.15	0.25	0.21	0.30	0.30	0.25	0.21	0.19	0.35	0.08	0.13	0.44	0.60	0.50	0.35
C6	0.25	0.28	0.31	0.21	0.16	0.20	0.12	0.26	0.21	0.20	0.27	0.25	0.24	0.16	0.18	0.34	0.18	0.21	0.79	1.01	1.03	0.81
N1	0.25	0.32	0.28	0.18	0.17	0.19	0.11	0.24	0.18	0.21	0.29	0.28	0.22	0.17	0.20	0.34	0.15	0.20	0.76	1.02	1.04	0.79
N3	0.25	0.37	0.26	0.21	0.23	0.23	0.17	0.30	0.27	0.23	0.37	0.31	0.27	0.17	0.22	0.30	0.18	0.24	0.87	1.28	1.34	1.04
O2	0.23	0.36	0.23	0.17	0.20	0.19	0.16	0.26	0.20	0.23	0.33	0.29	0.22	0.22	0.21	0.29	0.15	0.21	0.79	1.14	1.17	0.88
O2'	0.25	0.32	0.23	0.13	0.18	0.13	0.16	0.19	0.19	0.20	0.27	0.28	0.23	0.19	0.20	0.37	0.14	0.18	0.62	0.84	0.85	0.60
O3'	0.19	0.32	0.21	0.08	0.15	0.09	0.12	0.23	0.17	0.19	0.27	0.27	0.19	0.17	0.14	0.34	0.09	0.10	0.57	0.73	0.80	0.53
O4	0.24	0.35	0.27	0.24	0.25	0.26	0.25	0.34	0.35	0.20	0.38	0.30	0.39	0.16	0.22	0.27	0.23	0.26	0.92	1.47	1.53	1.22
O4'	0.21	0.31	0.21	0.13	0.16	0.12	0.18	0.18	0.23	0.18	0.29	0.27	0.26	0.18	0.15	0.35	0.17	0.14	0.55	0.75	0.68	0.49
O5'	0.20	0.29	0.25	0.08	0.19	0.07	0.18	0.18	0.21	0.22	0.26	0.26	0.22	0.21	0.18	0.32	0.02	0.11	0.50	0.59	0.60	0.41
OP1	0.05	0.25	0.12	0.03	0.12	0.11	0.13	0.25	0.18	0.14	0.23	0.21	0.19	0.16	0.06	0.17	0.03	0.06	0.23	0.66	0.36	0.31
OP2	0.10	0.27	0.05	0.07	0.18	0.25	0.20	0.41	0.24	0.19	0.26	0.23	0.26	0.22	0.13	0.05	0.02	0.21	0.39	0.61	0.52	0.41
P	0.04	0.24	0.11	0.02	0.13	0.11	0.14	0.23	0.18	0.15	0.23	0.21	0.19	0.16	0.07	0.14	0.01	0.06	0.34	0.55	0.42	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.18	0.46	0.32	0.15
C2	0.05	0.00	0.14	0.21	0.03	0.10	0.02	0.14	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.09	0.25	0.06	0.43	0.80	0.67	0.46
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.02	0.06	0.02	0.08	0.07	0.12	0.15	0.07	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.28	0.45	0.30	0.20
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.12	0.01	0.09	0.03	0.13	0.10	0.18	0.19	0.12	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.38	0.42	0.33	0.26
C4	0.02	0.03	0.08	0.12	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.13	0.03	0.44	0.77	0.65	0.46
C4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.07	0.08	0.09	0.09	0.07	0.07	0.03	0.04	0.03	0.00	0.02	0.35	0.27	0.13
C5	0.02	0.02	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.03	0.56	0.96	0.84	0.65
C5'	0.02	0.14	0.02	0.03	0.10	0.01	0.12	0.00	0.14	0.13	0.14	0.12	0.15	0.14	0.07	0.05	0.06	0.01	0.01	0.25	0.34	0.02
C6	0.03	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.16	0.04	0.57	1.03	0.91	0.69
C8	0.01	0.03	0.07	0.10	0.01	0.08	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.55	0.85	0.74	0.61
N1	0.05	0.00	0.12	0.18	0.02	0.09	0.02	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.08	0.22	0.06	0.51	0.94	0.82	0.59
N3	0.05	0.01	0.15	0.19	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.22	0.06	0.36	0.70	0.56	0.37
N6	0.03	0.02	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.15	0.04	0.63	1.15	1.04	0.81
N7	0.02	0.02	0.06	0.09	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.11	0.03	0.61	1.04	0.92	0.75
N9	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.40	0.67	0.55	0.40
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.04	0.04	0.05	0.05	0.06	0.04	0.08	0.09	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.03	0.08	0.52	0.19	0.21
O3'	0.02	0.25	0.01	0.01	0.13	0.03	0.11	0.06	0.16	0.11	0.22	0.22	0.15	0.11	0.05	0.02	0.00	0.02	0.30	0.50	0.32	0.26
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.06	0.04	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.10	0.38	0.36	0.16
O5'	0.18	0.43	0.28	0.38	0.44	0.02	0.56	0.01	0.57	0.55	0.51	0.36	0.63	0.61	0.40	0.08	0.30	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.46	0.80	0.45	0.42	0.77	0.35	0.96	0.25	1.03	0.85	0.94	0.70	1.15	1.04	0.67	0.52	0.50	0.38	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.67	0.30	0.33	0.65	0.27	0.84	0.34	0.91	0.74	0.82	0.56	1.04	0.92	0.55	0.19	0.32	0.36	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.46	0.20	0.26	0.46	0.13	0.65	0.02	0.69	0.61	0.59	0.37	0.81	0.75	0.40	0.21	0.26	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00